These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6204#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 538 fasta sequence [ATACCAGCCAGCAAGCGTGAGTACTCGTCTATTAGCTCAAGCTGTTCTCCGGAAACCCGGTACCCCCACTCCTCCAATTGACGCCTGACGAGCCCTAAGGTTTCGTGTTTCACGTGGAACACAACCCCAAACGCAACGGCAACCTTAGCTTGCGACAAAAGTTTGCGCCCACAATCTCATGACGCACCTCGTTCTTTCCTTGCTGGTGAGGGCGTGTTTCACGTGAAACGTTTACCGCTTTGGTGCGACGGTCACCCTACGGTTTGCTCCGCTACCTTCGCTGAACGTGGTAACCCGCGGGTTATCTTTAAGGTAGACGTGGACGATGCGCCGCTCTGCGGGGCTCATTGGGGGGAGCTTGATTGAGCGCCGCTCCCGTATTGCTCTACGGGCACTCCGGTGGGCGATACCCTGTATCGCCTCTATCCTGCGCTGGCGGTAACCTTCGGAGTCCAGAACTATACGCTTTACGAATGGTCTGGTGCGGTAGACGGCGGAGTTGATCAGGTACTGGAGAGCGTCAATCGTCTCTCCCTTT] [+] EMBL CD086075 [ATACCAGCCAGCAAGCGTGAGTACTCGTCTATTAGCTCAAGCTGTTCTCCGGAAACCCGGTACCCCCACTCCTCCAATTGACGCCTGACGAGCCCTAAGGTTTCGTGTTTCACGTGGAACACAACCCCAAACGCAACGGCAACCTTAGCTTGCGACAAAAGTTTGCGCCCACAATCTCATGACGCACCTCGTTCTTTCCTTGCTGGTGAGGGCGTGTTTCACGTGAAACGTTTACCGCTTTGGTGCGACGGTCACCCTACGGTTTGCTCCGCTACCTTCGCTGAACGTGGTAACCCGCGGGTTATCTTTAAGGTAGACGTGGACGATGCGCCGCTCTGCGGGGCTCATTGGGGGGAGCTTGATTGAGCGCCGCTCCCGTATTGCTCTACGGGCACTCCGGTGGGCGATACCCTGTATCGCCTCTATCCTGCGCTGGCGGTAACCTTCGGAGTCCAGAACTATACGCTNTACGAATGGTCTGGTGCGGTAGACGGCGGAGTTGATCAGGTACTGGAGAGCGTCAATCGTCTCTCCCTT ] [+] EMBL CD086090 [ATACCAGCCAGCAAGCGTGAGTACTCGTCTATTAGCTCAAGCTGTTCTCCGGAAACCCGGTACCCCCACTCCTCCAATTGACGCCTGACGAGCCCTAAGGTTTCGTGTTCCACGTGGAACACAACCCCAAACGCAACGGCAACCTTAGCTTGCGACAAAAGTTTGCGCCCACAATCTCATGACGCACCTCGTTCTTTCCTTGCTGGTGAGGGCGTGTTTCACGTGAAACGTTTACCGCTTTGGTGCGACGGTCACCCTACGGTTTGCTCCGCTACCTTCGCTGAACGTGGTAACCCGCGGGTTATCTTTAAGGTAGACGTGGACGATGCGCCGCTCTGCGGGGCTCATTGGGGGGAGCTTGATTGAGCGCCGCTCCCGTATTGCTCTACGGGCACTCCGGTGGGCGATACCCTGTATCGCCTCTATCCTGCGCTGGCGGTAACCTTCGGAGTCCAGAACTATACGCTTTACGAATGGTCTGGTGCGGTAGACGGCGGAGTTGATCAGGTACTGGAGAGCGTCAATCGTCTCTCCCTT ] [-] EMBL CD086290 [ GAGTACTCGTCTATTAGCTCAAGCTGTTCTCCGGAAACCCGGTACCCCCACTCCTCCAATTGACGCCTGACGAGCCATAAGGTTTCGTGTTTCACGTGGAACACAACCCCAAACGCAACGGCAACCTTAGCTTGCGACAAAAGTTTGCGCCCACAATCTCATGACGCACCTCGTTCTTTCCTTGCTGGTGAGGGCGTGTTTCACGTGAAACGTTTACCGCTTTGGTGCGACGGTCACCCTACGGTTTGCTCCGCTACCTTCGCTGAACGTGGTAACCCGCGGGTTATCTTTAAGGTAGACGTGGACGATGCGCCGCTCTGCGGGGCTCATTGGGGGGAGCTTGATTGAGCGCCGCTCCCGTATTGCTCTACGGGCACTCCGGTGGGCGATACCCTGTATCGCCTCTATCCTGCGCTGGCGGTAACCTTCGGAGTCCAGAACTATACGCTTTACGAATGGTCTGGTGCGGTAGACGGCGGAGTTGATCAGGTACTGGAGAGCGTCAATCGTCTCTCCCTTT] [-] EMBL CD085989 [ TTGCGCCCACAATCTCATGACGCACCTCGTTCTTTCCANGCTGGTGAGGGCGTGAATCACGTGAAACGTTTACCGCTTAGGTGCGACGGTCACCCTACGGTNNGCTCCGCTACCTTCGCTGAACGTGGTAACCCGCGGGTTATCTTTAAGGTAGACGTGGACGATGCGCCGCTCTGCGGGGCTCATTGGGGGGAGCTTGATTGAGCGCCGCTCCCGTATTGCTCTACGGGCACTCCGGTGGGCGATACCCTGTATCGCCTCTATCCTGCGCTGGCGGTAGCCTTCGGAGTCCAGAACTATACGCTTTACGAATGGTCTGGTGCGGTAGACGGCGGAGTTGATCAGGTACTGGAGAGCGTCAATCGTCTCTCCCTTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||