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Schistosoma mansoni
cluster # 6216 cluster # 6216       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6216#0 length = 750 sequences # 4  

consensusID : consensus_6216#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 750
fasta sequence
                              [ACTTACACTCGCATACAATCCATCAGAGTCCGATGTTGGATCATCAGCATCATCGTCACATAGTGAATAGCATCGGTTGTTTGTATCAGAAACGCTTGTTAATGAATTTTTTTTAATTGATTGTAATAATTTAGGGATGGTGACATCATATAAGTGATGCTTATTACTAATTGGTTGTTTCACTGTTGCGATTGAATAATAATAACATGTTAAGTGATCAATGTTATCTTCTGGTAATGGTGCATGATCAACATTGATTTGTTTATTCTCCGTAAATGCCGCATCGAAATATGTCGGTACTGGTGGAAGTTCACAATTCCTATGCGTATTACTGTCCTGATGCAGTAATGGATAACCACTAGGAGATAGAATATCCGTACTATTCATATTTGTATTTAGTCCAATTGTGGTAGCATATGCCAAATCATCTTCATTGACGAATAAATTACAATTTTTAATTAATACATGATTGGTGGTATCATGATTGATGTTAACCTTGGTAGTAGGGGTAGTTTTAGTTTCAACAGTAGTAGTGGCAACGGTATCAAGTACATATTTATGCGGTCGACTCAGTCTAACTGTGAAACGTTTATGGTGATTGTACGTGATTTCTTGGCAGGAAGTAACACTGGCATCAGGACTAGGATTGTGTCGTTTTTGAGTTAAACCTTGTTTTTTATTCCAACAGAAACATAGCAATAGGATGAATAATAGTAATAGTCCAGAAACAAATGAACTGATATAATTTAA]

[-] EMBL CD164749             [ACTTACACTCGCATACAATCCATCAGAGTCCGATGTTGGATCATCAGCATCATCGTCACATAGTGAATAGCATCGGTTGTTTGTATCAGAAACGCTTGTTAATGAATTTTTTTTAATTGATTGTAATAATTTAGGGATGGTGACATCATATAAGTGATGCTTATTACTAATTGGTTGTTTCACTGTTGCGATTGAATAATAATAACATGTTAATTGATCAATGTTATCTTCTGGTAATGGTGCATGATCAACATTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD157145             [                                                                                                                                                            ATGCTTATTACTAATTGGTTGTTTCACTGTTGCGATTGAATAATAATAACATGTTAAGTGATCAATGTTATCTTCTGGTAATGGTGCATGATCAACATTGATTTGTTTATTCTCCGTAAATGCCGCATCGAAATATGTCGGTACTGGTGGAAGTTCACAATTCCTATGCGTATTACTGTCCTGATGCAGTAATGGATAACCACTAGGAGATAGAATATCCGTACTATTCATATTTGTATTTAGTCCAATTGTGGTAGCATATGCCAAATCATCTTCATTGACGAATAAATTACAATTTTTAATTAATACATGATTGGTGGTATCATGATTGATGTTAACCTTGGTAGTAGGGGTAGTTTTAGTTTCAACAGTAGTAGTGGCAACGGTATCAAGTACATATTTATGCGG                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD192044             [                                                                                                                                                            ATGCTTATTACTAATTGGTTGTTTCACTGTTGCGATTGAATAATAATAACATGTTAAGTGATCAATGTTATCTTCTGGTAATGGTGCATGATCAACATTGATTTGTTTATTCTCCGTAAATGCCGCATCGAAATATGTCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD148014             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAGTTTTAGTTTCAACAGTAGTAGTGGCAACGGTATCAAGTACATATTTATGCGGTCGACTCAGTCTAACTGTGAAACGTTTATGGTGATTGTACGTGATTTCTTGGCAGGAAGTAACACTGGCATCAGGACTAGGATTGTGTCGTTTTTGAGTTAAACCTTGTTTTTTATTCCAACAGAAACATAGCAATAGGATGAATAATAGTAATAGTCCAGAAACAAATGAACTGATATAATTTAA]


>consensus_6216#0 ACTTACACTCGCATACAATCCATCAGAGTCCGATGTTGGATCATCAGCATCATCGTCACA TAGTGAATAGCATCGGTTGTTTGTATCAGAAACGCTTGTTAATGAATTTTTTTTAATTGA TTGTAATAATTTAGGGATGGTGACATCATATAAGTGATGCTTATTACTAATTGGTTGTTT CACTGTTGCGATTGAATAATAATAACATGTTAAGTGATCAATGTTATCTTCTGGTAATGG TGCATGATCAACATTGATTTGTTTATTCTCCGTAAATGCCGCATCGAAATATGTCGGTAC TGGTGGAAGTTCACAATTCCTATGCGTATTACTGTCCTGATGCAGTAATGGATAACCACT AGGAGATAGAATATCCGTACTATTCATATTTGTATTTAGTCCAATTGTGGTAGCATATGC CAAATCATCTTCATTGACGAATAAATTACAATTTTTAATTAATACATGATTGGTGGTATC ATGATTGATGTTAACCTTGGTAGTAGGGGTAGTTTTAGTTTCAACAGTAGTAGTGGCAAC GGTATCAAGTACATATTTATGCGGTCGACTCAGTCTAACTGTGAAACGTTTATGGTGATT GTACGTGATTTCTTGGCAGGAAGTAACACTGGCATCAGGACTAGGATTGTGTCGTTTTTG AGTTAAACCTTGTTTTTTATTCCAACAGAAACATAGCAATAGGATGAATAATAGTAATAG TCCAGAAACAAATGAACTGATATAATTTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)