These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6220#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 560 fasta sequence [GTTGTGATCTTACTGATCTTTGTTTATCTATGGAATTTCTTCCATCTTCTAAGCTTTTTGGATTTTCATCTTATCCATTGAAAGATGTTTATGATTGGGAAGCAACAATAACAACAACACCAAGAACTACTAATAATTCTACAGAAGAATCATTGCATAAAAATGTGACAGAGAATTCACAATCTATTGTTGCGCCTGTTACAGTTCATAATATTGAAAAATATTTAGAATTAACGTTAGCTTTTTGTTTGGATAAAGGTATTCGTAAACAATTGGATGCATTCAAAGATGGTTTTGAGCGTGTATTACCACTTCGTTGGTTAGCATTATTTACAGCTACAGAATTAGGTGAATTAATTGCTGGTGATTCAGTAGTTCATTGGACACGTGAAGATCTTCTTGCATATACAGTACCAAGTTTAGGTTTTACTAAACAATCACCAACATATCAAATGTTAATTAATGTATTATGTAATTTTAAATCACCTGAACGTCGTGCTTTCTTACAATTTACTACTGGTTGTTCTAGTCTACCACCAGGTGGTTTAAAAAATCTACAT] [+] EMBL CD153418 [GTTGTGATCTTACTGATCTTTGTTTATCTATGGAATTTCTTCCATCTTCTAAGCTTTTTGGATTTTCATCTTATCCATTGAAAGATGTTTATGATTGGGAAGCAACAATAACAACAACACCAAGAACTACTAATAATTCTACAGAAGAATCATTGCATAAAAATGTGACAGAGAATTCACAATCTATTGTTGCGCCTGTTACAGTTCATAATATTGAAAAATATTTAGAATTAACGTTAGCTTTTTGTTTGGATAAAGGTATTCGTAAACAATTGGATGCATTCAAAGATGGTTTTGAGCGTGTATTACCACTTCGTTGGTTAGCATTATTTACAGCTACAGAATTAGGTGAATTAATTGCTGGCGATTCAGTAGTTCATTGGACACGTGAAGATCTTCTTGCATATACAGTACCAAGTTTACGTTTTACTAAACAATCACCAACATAT ] [+] EMBL CD188211 [ CAACAACACCAAGAACTACTAATAATTCTACAGAAGAATCATTGCATAAAAATGTGACAGAGAATTCACAATCTATTGTTGCGCCTGTTACAGTTCATAATATTGAAAAATATTTAGAATTAACGTTAGCTTTTTGTTTGGATAAAGGTATTCGTAAACAATTGGATGCATTCAAAGATGGTTTTGAGCGTGTATTACCACTTCGTTGGTTAGCATTATTTACAGCTACAGAATTAGGTGAATTAATTGCTGGTGATTCAGTAGTTCATTGGACACGTGAAGATCTT ] [-] EMBL CD133249 [ AACAACACCAAGAACTACTAATAATTCTACAGAAGAATCATTGCATAAAAATGTGACAGAGAATTCACAATCTATTGTTGCGCCTGTTACAGTTCATAATATTGAAAAATATTTAGAATTAACGTTAGCTTTTTGTTTGGATAAAGGTATTCGTAAACAATTGGATGCATTCAAAGATGGTTTTGAGCGTGTATTACCACTTCGTTGGTTAGCATTATTTACAGCTACAGAATTAGGTGAATTAATTGCTGGTGATTCAGTAGTTCATTGGACACGTGAAGATTTTTTTGCATATACAGTACCAAGTTTAGGTTTTACTTAACAATCACCCACATATCAAATGTTAATTAATGTATTATGTAATTTTAAATCACCTGAACG ] [-] EMBL CD194038 [ TGAATTAATTGCTGGTGATTCAGTAGTTCATTGGACACGTGAAGATCTTCTTGCATATACAGTACCAAGTTTAGGTTTTACTAAACAATCACCAACATATCAAATGTTAATTAATGTATTATGTAATTTTAATTCAACTGAACGTCGTGCTTTCTTACAATTTACTACTGGTTGTTCTAGTCTACCACCAGGTGGTTTAAAAAATCTACAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||