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Schistosoma mansoni
cluster # 6220 cluster # 6220       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6220#0 length = 560 sequences # 4  

consensusID : consensus_6220#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 560
fasta sequence
                              [GTTGTGATCTTACTGATCTTTGTTTATCTATGGAATTTCTTCCATCTTCTAAGCTTTTTGGATTTTCATCTTATCCATTGAAAGATGTTTATGATTGGGAAGCAACAATAACAACAACACCAAGAACTACTAATAATTCTACAGAAGAATCATTGCATAAAAATGTGACAGAGAATTCACAATCTATTGTTGCGCCTGTTACAGTTCATAATATTGAAAAATATTTAGAATTAACGTTAGCTTTTTGTTTGGATAAAGGTATTCGTAAACAATTGGATGCATTCAAAGATGGTTTTGAGCGTGTATTACCACTTCGTTGGTTAGCATTATTTACAGCTACAGAATTAGGTGAATTAATTGCTGGTGATTCAGTAGTTCATTGGACACGTGAAGATCTTCTTGCATATACAGTACCAAGTTTAGGTTTTACTAAACAATCACCAACATATCAAATGTTAATTAATGTATTATGTAATTTTAAATCACCTGAACGTCGTGCTTTCTTACAATTTACTACTGGTTGTTCTAGTCTACCACCAGGTGGTTTAAAAAATCTACAT]

[+] EMBL CD153418             [GTTGTGATCTTACTGATCTTTGTTTATCTATGGAATTTCTTCCATCTTCTAAGCTTTTTGGATTTTCATCTTATCCATTGAAAGATGTTTATGATTGGGAAGCAACAATAACAACAACACCAAGAACTACTAATAATTCTACAGAAGAATCATTGCATAAAAATGTGACAGAGAATTCACAATCTATTGTTGCGCCTGTTACAGTTCATAATATTGAAAAATATTTAGAATTAACGTTAGCTTTTTGTTTGGATAAAGGTATTCGTAAACAATTGGATGCATTCAAAGATGGTTTTGAGCGTGTATTACCACTTCGTTGGTTAGCATTATTTACAGCTACAGAATTAGGTGAATTAATTGCTGGCGATTCAGTAGTTCATTGGACACGTGAAGATCTTCTTGCATATACAGTACCAAGTTTACGTTTTACTAAACAATCACCAACATAT                                                                                                               ]
[+] EMBL CD188211             [                                                                                                               CAACAACACCAAGAACTACTAATAATTCTACAGAAGAATCATTGCATAAAAATGTGACAGAGAATTCACAATCTATTGTTGCGCCTGTTACAGTTCATAATATTGAAAAATATTTAGAATTAACGTTAGCTTTTTGTTTGGATAAAGGTATTCGTAAACAATTGGATGCATTCAAAGATGGTTTTGAGCGTGTATTACCACTTCGTTGGTTAGCATTATTTACAGCTACAGAATTAGGTGAATTAATTGCTGGTGATTCAGTAGTTCATTGGACACGTGAAGATCTT                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD133249             [                                                                                                                AACAACACCAAGAACTACTAATAATTCTACAGAAGAATCATTGCATAAAAATGTGACAGAGAATTCACAATCTATTGTTGCGCCTGTTACAGTTCATAATATTGAAAAATATTTAGAATTAACGTTAGCTTTTTGTTTGGATAAAGGTATTCGTAAACAATTGGATGCATTCAAAGATGGTTTTGAGCGTGTATTACCACTTCGTTGGTTAGCATTATTTACAGCTACAGAATTAGGTGAATTAATTGCTGGTGATTCAGTAGTTCATTGGACACGTGAAGATTTTTTTGCATATACAGTACCAAGTTTAGGTTTTACTTAACAATCACCCACATATCAAATGTTAATTAATGTATTATGTAATTTTAAATCACCTGAACG                                                                   ]
[-] EMBL CD194038             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGAATTAATTGCTGGTGATTCAGTAGTTCATTGGACACGTGAAGATCTTCTTGCATATACAGTACCAAGTTTAGGTTTTACTAAACAATCACCAACATATCAAATGTTAATTAATGTATTATGTAATTTTAATTCAACTGAACGTCGTGCTTTCTTACAATTTACTACTGGTTGTTCTAGTCTACCACCAGGTGGTTTAAAAAATCTACAT]


>consensus_6220#0 GTTGTGATCTTACTGATCTTTGTTTATCTATGGAATTTCTTCCATCTTCTAAGCTTTTTG GATTTTCATCTTATCCATTGAAAGATGTTTATGATTGGGAAGCAACAATAACAACAACAC CAAGAACTACTAATAATTCTACAGAAGAATCATTGCATAAAAATGTGACAGAGAATTCAC AATCTATTGTTGCGCCTGTTACAGTTCATAATATTGAAAAATATTTAGAATTAACGTTAG CTTTTTGTTTGGATAAAGGTATTCGTAAACAATTGGATGCATTCAAAGATGGTTTTGAGC GTGTATTACCACTTCGTTGGTTAGCATTATTTACAGCTACAGAATTAGGTGAATTAATTG CTGGTGATTCAGTAGTTCATTGGACACGTGAAGATCTTCTTGCATATACAGTACCAAGTT TAGGTTTTACTAAACAATCACCAACATATCAAATGTTAATTAATGTATTATGTAATTTTA AATCACCTGAACGTCGTGCTTTCTTACAATTTACTACTGGTTGTTCTAGTCTACCACCAG GTGGTTTAAAAAATCTACAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)