These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6226#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 710 fasta sequence [GATAAATATGGCTTGACTCCACTATATTATAATATACTTTATGATCCGGATACAAAAATATGCCATAGCTTACTGTATGAACATTCAAAAATCGGCATCAGTGATAAAGATGGTTTACAAGAAATACACCAGGCTACACGTTTAAATCGCGTTGAGCAAATAAATTTATTGTTAATGTATGGAGCTGATGTAAATGCACGATGTAAACGTCCAAAAGAAACTGTTAAAAACAACTTAACTCTTTCTATACGTCCACAGTCAGTCGATGGTGATACACCATTACATGTTGCAGCAAATCACAATCAGCGTGCAGCTGTTCTACGTTTGTTATCTTGGGGAGCTGATCCAACCCTAGTCAATGCTGAAAGTATGACACCTATACAAGTAGCACAGAATAATGGAAATTTAGAATTA-GCTGATTTAATTAAGTTATTTAGAGGTAGAAAAGAATCTAGTGATATATTCCTTCCAACACCCACGTATAATCCCCATAGACGTGTGAGACAACCTCCACCAAATTCTTACATTACTGAACCATCAATTTTACAAAATTATACTCCGAATGATATAAATGAAATTCACTTAAATGATCAGCAGTTAAATAGCACTAACAACAATACTAACGATTTATTAAGAGACTCAAATAAAGGTTCAACTAATTTTAATATCACTGAAAAAAGTGCTACGTGTACATGTTCGTATACGACAAC] [+] EMBL CD187463 [GATAAATATGGCTTGACTCCACTATATTATAATATACTTTATGATCCGGATACAAAAATATGCCATAGCTTACTGTATGAACATTCAAAAATCGGCATCAGTGATAAAGATGGTTTACAAGAAATACACCAGGCTACACGTTTAAATCGCGTTGAGCAAATNAATTTATTGTTAATGTATGGAGCTGATGTAAATGCACGATGTAAACGTCCAAAAGAAACTGTTAAAAACAACTTAACTCTTTCTATACGTCCACAGTCAGTCGATGGTGATACACCATTACATGTTGCAGCAAATCACAACCAGCGTGCAGCTGTTCTACGTTTGTTATCTTGGGGAGCTGATCCAACCCTAGTCAATGCTGAAAGTATGACACCTATTCCAGTAGCACAGAATTATGGAAATTTAGAACTAGGCTGA TTAATTAAGTTA TTAGAGGT ] [-] EMBL CD122388 [ CTGTATGAACATTCAAAAATCGGCATCAGTGATAAAGATGGTTTACAAGAAATACACCAGGTTACACGTTTAAATCGCGTTGAGCAAATAAATTTATTGTTAATGTATGGAGCTGATGTAAATGCACGATGTAAACGTCCAAAAGAAACTGTTAAAAACAACTTAACTCTTTCTATACGTCCACAGTCAGTCGATGGTGATACACCATTACATGTTGCAGCAAATCACAATCAGCGTGCAGCTGTTTTACGTTTGTTATCTTGGGGAGCTGATCCAACCCTAGTCAATGCTGAAAGTATGACACCTATACAAGTAGCACAGAATAATGGAAATTTAGAATTA GCTGATTTAATTAAGTTATTTAGAGGTAGAAAAGAATCTAG ] [+] EMBL CD117241 [ TTACAAGAAATACACCAGGCTACACGTTTAAATCGCGTTGAGCAAATAAATTTATTGTTAATGTATGGAACTGATGTAAATGCACGATGTAAACGTCCAAAAGAAACTGTTAAAAACAACTTAACTCTTTCTATACGTCCACAGTCAGTCGATGGTGATACACCATTACATGTTGCAGCAAATCACAATCAGTGTGCAGCTGTTCTACGTTTGTTATCTTGGGGAGCTGATCCAACCCTAGTCAATGCTGAAAATATGACACCTATACAAGTAGCACAGAATAATGGAAATTTAGAATTA GCTGATTTAATTAAGTTATTTAGAGGTAGAAAAGAATCTAGTGATATATTCCTTCCAACACCCACGTATAATCCCCATAGACGTGTGA ] [-] EMBL CD119313 [ ATA TCCTTCCAACACCCACGTATAATCCCCATAGACGTGTGAGACAACCTCCACCAAATTCTTACATTACTGAACCATCAATTTTACAAAATTATACTCCGAATGATATAAATGAAATTCACTTAAATGATCAGCAGTTAAATAGCACTAACAACAATACTAACGATTTATTAAGAGACTCAAATAAAGGTTCAACTAATTTTAATATCACTGAAAAAAGTGCTACGTGTACATGTTCGTATACGACAAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||