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Schistosoma mansoni
cluster # 6235 cluster # 6235       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6235#0 length = 653 sequences # 4  

consensusID : consensus_6235#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 653
fasta sequence
                              [TGTGTGTGAATCGTTGTTGTGTCAGTGGATGGGGAGTGTTGGTGTCTGGACTGATGTGGATTGAAGGAGTTGGTATTGCGCTTACCTCTGGACATGTGATTTAAATTATTTTTGTTGTTGTGATTAGTGTTGGCGTTAGTATCAGTATCATTAGTATTCTAATGTTTAGTCTAACAATCGTAAGTGTTTTGACGCGGTGTTTTTGTTGTTCAGTGTGTGAATCGTTGTTGTGGACAGGGATTGCGCGAAGTGGTTTGTCCGTTAGCAATTTGCGTGACTTTTTGGGATAGGTGAGATGTCGGTGTGCCAACCGGTGTGATTATTTAGCGTTAGTGTAGACAGATGTAGGTTGGTTTAAAGTTAGGTGTGGCCGAACGAAAACTTCGCATTGGTCCATGAAGTGGTCGACTGTTGGTGTTGGCCATTCTGGCAGTAGATGCAGATGACCTACATGGTTTGGGTGAGTGTGATAACAGGGATCAGTGGTCAGATACATTGACTGTTTGTCTTGTTGCAGATGTCGAGTTGCGGTATTGTTTCATGTGTAGCCTTTCACCCTGTTCTTGCTGGCGAAGTTTTCAATGTTTAGTGTTTCAACTATTAACATTGATACGGGATTGATTCGATTGGATTGCTACAGATGTTTGTGATGC]

[+] EMBL CD068695             [TGTGTGTGAATCGTTGTTGTGTCAGTGGATGGGGAGTGTTGGTGTCTGGACTGATGTGGATTGAAGGAGTTGGTATTGCGCCTACCTCTGGACATGTGATTTAAATTATTTTTGTTGTTGTGATTAGTGTTGGCGTTAGTATCAGTATCATTAGTATTCTAATGTTCAGTCTAACAATCGTAAGTGTTTTGACGCGGTGTTTTTGTTGTTCAGTGTGTGAATCGTTGTTGTGGACAGGGATTGCGCGAAGTGGTTTGTCCGTTAGCAATTTGCGTGACTTTTTGGGATAGGTGAGATGTCGGTGTGCCAACCGGTGTGATTATTTAGCGTTAGTGTAGACAGATGTAGGTTGGTTTAAAGTTAGGTGTGGCCGAACGAAAACTTCGCATTGGTCCATGAAGTGGTCGACTGTTGGTGTTGGCCATTCTGGCAGTAGATGCAGATGACCTACATGGTTTGGGTGAGTGTGATAACAGGGATCAGTGGTCAGATACATTGACTGTTTGTCTTGTTG                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD068769             [   GTGTGAATCGTTGTTGTGTCAGTGGATGGGGAGTGTTGGTGTCTGGACTGATGTGGATTGAAGGAGTTGGTATTGCGCTTACCTCTGGACATGTGATTTAAATTATTTTTGTTGTTGTGATTAGTGTTGGCGTTAGTATCAGTATCATTAGTATTCTAATGTTTAGTCTAACAATCGTAAGTGTTTTGACGCGGTGTTGTTGTTGTTCAGTGTGTGATTCGTTGTTGTGGACAGGGATTGCGCGAAGTGGTTTGTCCGTTAGCAATTTGCGTGACTTTTTGGGATAGGTGAGATGTCGGTGTGCCGACCGGTGTGATTATTTAGCGTTAGTGTAGACAGATGTAGGTTGGTTTAAAGTTAGGTGTGGCCGAACGAAAACTTCGCATTGGTCCATGAAGTGGTCGACTGTTGGTGTTGGCCATTCTGGCAGTAGATGCAGATGACCT                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD115364             [          TCGTTGTTGTGTCAGTGGATGGGGAGTGTTGGTGTCTGGACTGATGTGGATTGAAGGAGTTGGTATTGCGCTTACCTCTGGACATGTGATTTAAATTATTTTTGTTGTTGTGATTAGTGTTGGCGTTAGTATCAGTATCATTAGTATTCTAATGTTTAGTCTAACAATCGTAAGTGTTTTGACGCGGTGTTTTTGTTGTTCAGTGTGTGAATCGTTGTTGTGGACAGGGATTGCGCGAAGTGGTTTGTCCGTTAGCAATTTGCGTGACTTTTTGGGATAGGTGAGATGTCGGTGTGCCAACCGGTGTGATTATTTAGCGTTAGTGTAGACAGATGTAGGTTGGTTTAAAGTTAGGTGTGGCCGAACGAAGACTTCGCATTGGTCCATGAAGTGGTCGACTGTTGGTGTTGGCCATTCTGGCAGTAGATGCAGATGACCTACATGGTTTGGGTGAGTGTGATAACAGGGATCAGTGGTCAGATACATTGACTGTTTGTCTTGTTGCAGATGTCGAGTTGCGGTATTGTTTCATGTGTAGCCTTTCAC                                                                                                 ]
[+] EMBL CD086819             [                                                                                                                                                          TATTCTGATGTTTAGTCTAACAATCGTAAGTGTTTTGACGCGGTGTTTTTGTTGTTCAGTGTGTGAATCGTTGTTGTGGACAGGGATTGCGCGAAGTGGTTTGTCCGTTAGCAATTTGCGTGACTTTTTGGGATAGGTGAGATGTCGGTGTGCCAACCGGTGTGATTATTTAGCGTTAGTGTAGACAGATGTAGGTTGGTTTAAAGTTAGGTGTGGCCGAACGAAAACTTCGCATTGGTCCATGAAGTGGTCGACTGTTGGTGTTGGCCATTCTGGCAGTAGATGCAGATGACCTACATGGTTTGGGTGAGTGTGATAACAGGGATCAGTGGTCAGATTCATTGACTGTTTGTCTTGTTGCAGATGTTGAGTTGCAGTATTGTTTCATGTGTAGCCTTTCACCCTGTTCTTGCTGGCGAAGTTTTCAATGTTTAGTGTTTCAACTATTAACATTGATACGGGATTGATTCGATTGGATTGCTACAGATGTTTGTGATGC]


>consensus_6235#0 TGTGTGTGAATCGTTGTTGTGTCAGTGGATGGGGAGTGTTGGTGTCTGGACTGATGTGGA TTGAAGGAGTTGGTATTGCGCTTACCTCTGGACATGTGATTTAAATTATTTTTGTTGTTG TGATTAGTGTTGGCGTTAGTATCAGTATCATTAGTATTCTAATGTTTAGTCTAACAATCG TAAGTGTTTTGACGCGGTGTTTTTGTTGTTCAGTGTGTGAATCGTTGTTGTGGACAGGGA TTGCGCGAAGTGGTTTGTCCGTTAGCAATTTGCGTGACTTTTTGGGATAGGTGAGATGTC GGTGTGCCAACCGGTGTGATTATTTAGCGTTAGTGTAGACAGATGTAGGTTGGTTTAAAG TTAGGTGTGGCCGAACGAAAACTTCGCATTGGTCCATGAAGTGGTCGACTGTTGGTGTTG GCCATTCTGGCAGTAGATGCAGATGACCTACATGGTTTGGGTGAGTGTGATAACAGGGAT CAGTGGTCAGATACATTGACTGTTTGTCTTGTTGCAGATGTCGAGTTGCGGTATTGTTTC ATGTGTAGCCTTTCACCCTGTTCTTGCTGGCGAAGTTTTCAATGTTTAGTGTTTCAACTA TTAACATTGATACGGGATTGATTCGATTGGATTGCTACAGATGTTTGTGATGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)