Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6238 cluster # 6238       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6238#0 length = 783 sequences # 4  

consensusID : consensus_6238#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 783
fasta sequence
                              [GGTGGTGATGGTGAAGATAATGATGATGATGCGATGGATCTAGGTGAGATTGATAATCATGATCTGTAATAGTCTGACAAGTTAATGTGTTGTAATTTGTCGAATCTTTATGATACACACTTGAGCTACAATCAACATTATCTATATTGATCTTTCTTTGATTAAGCATAGGTCTATGTGAGGTATCAGAAGACCAAGTAGATTTCTCTCCGATAGAATTTTGGTGAGGAAGATGAGAAACTATTACAGGCTGAGGTGAATTATGAGAAGTGTTAGGGGTATGATGATGACGGACATAATGGTGATGATGATGGTGATTGTTGGTAGTTGATGTTACTGCTGTGCCATCGTGAATTTCATTAGGATGATGGTGATGACAATGTGTAAGGTGAACATGATGATGATGAGGTAATACAAGGGGTGATGATGGTGGTGGCGAAATTGAGTTAAAAACCAATTTCTGCCCACCAGTAACAGATGGATCAGGTGAACCAATATATGAAAGACAAGTACCAGTGGATAGAGGATTTTTACTACTACCATTGGATGGTTCATCGATTCGGTAATGATCATTTGCAGTAGACATGATTAAGTGTGACGATATTGGGTTTTCACAAACAGATGAAGAAGGAATAACAACAGTATTTTTAAATGAATTAGAACAATTTGTTTCAGTTAAATCCATAGACAAAGTGGATTGTGCAATGGCTTTCTTAAGACATATTGATGCATTCGAACCAGTGGATTCTACATTTTGATCACATCCACGAAGATTATGATAAT]

[+] EMBL CD197770             [GGTGGTGATGGTGAAGATAATGATGATGATGCGATGGATCTAGGTGAGATTGATAATCATGATCTGTAATAGTCTGACAAGTTAATGTGTTGTAATTTGTCGAATCTTTATGATACACACTTGAGCTACAATCAACATTATCTATATTGATCTTTCTTTGATTAAGCATAGGTCTATGTGAGGTATCAGAAGACCAAGTAGATTTCTCTCCGATAGAATTTTGGTGAGGAAGATGAGAAACTATTACAGGCTGAGGTGAATTATGAGAAGTGTTAGGGGTATGATGATGACGGACATAATGGTGATGATGATGGTGATTGTTGGTAGTTGATGTTACTGCTGTGCCATCGTGAATTTCATTAGGATGATGGTGATGACAATGTGTAAGGTGAACATGATGATGATGAGGTAATACAAGGGGTGATGATGGTGGTGGCGAAATTGAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD197673             [ GTGGTGATGGTGAAGATAATGATGATGATGCGATGGATCTAGGTGAGATTGATAATCATGATCTGTAATAGTCTGACAAGTTAATGTGTTGTAATTTGTCGAATCTTTATGATACACACTTGAGCTACAATCAACATTATCTATATTGATCTTTCTTTGATTAAGCATAGGTCTATGTGAGGTATCAGAAGACCAAGTAGATTTCTCTCCGATAGAATTTTGGTGAGGAAGATGAGAAACTATTACAGGCTGAGGTGAATTATGAGAAGTGTTAGGGGTATGATGATGACGGACATAATGGTGATGATGATGGTGATTGTTGGTAGTTGATGTTACTGCTGTGCCATCGTGAATTTCATTAGGATGATcccatat                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD197533             [ tTGTTGATGGTGAAGATAATGATGATGATGCGATGGATCTAGGTGAGATTGATAATCATGATCTGTAATAGTCTGACAAGTTAATGTGTTGTAATTTGTCGAATCTTTATGATACACACTTGAGCTACAATCAACATATTCTATATTGATCTTTCTTTGATTAAGCATAGGTCTATGTGAGGTATCAGAAGACCAAGTAGATTTCTCTCCGATAGAATTTTGGTGAGGAAGATGAGAAACTATTACAGGCTGAGGTGAATTATGAGAAGTGTTAGGGGTATGATGATGACGGACATAATGGTGATGATGATGGTGATTGTTGGTAGTTGATGTTACTGCTGTGCCATCGTGAATTTCATTAGGATGATGGTGATGACAATGTGTGAGGTGAACATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD197336             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GAACATGATGATGATGAGGTAATACAAGGGGTGATGATGGTGGTGGCGAAATTGAGTTAAAAACCAATTTCTGCCCACCAGTAACAGATGGATCAGGTGAACCAATATATGAAAGACAAGTACCAGTGGATAGAGGATTTTTACTACTACCATTGGATGGTTCATCGATTCGGTAATGATCATTTGCAGTAGACATGATTAAGTGTGACGATATTGGGTTTTCACAAACAGATGAAGAAGGAATAACAACAGTATTTTTAAATGAATTAGAACAATTTGTTTCAGTTAAATCCATAGACAAAGTGGATTGTGCAATGGCTTTCTTAAGACATATTGATGCATTCGAACCAGTGGATTCTACATTTTGATCACATCCACGAAGATTATGATAAT]


>consensus_6238#0 GGTGGTGATGGTGAAGATAATGATGATGATGCGATGGATCTAGGTGAGATTGATAATCAT GATCTGTAATAGTCTGACAAGTTAATGTGTTGTAATTTGTCGAATCTTTATGATACACAC TTGAGCTACAATCAACATTATCTATATTGATCTTTCTTTGATTAAGCATAGGTCTATGTG AGGTATCAGAAGACCAAGTAGATTTCTCTCCGATAGAATTTTGGTGAGGAAGATGAGAAA CTATTACAGGCTGAGGTGAATTATGAGAAGTGTTAGGGGTATGATGATGACGGACATAAT GGTGATGATGATGGTGATTGTTGGTAGTTGATGTTACTGCTGTGCCATCGTGAATTTCAT TAGGATGATGGTGATGACAATGTGTAAGGTGAACATGATGATGATGAGGTAATACAAGGG GTGATGATGGTGGTGGCGAAATTGAGTTAAAAACCAATTTCTGCCCACCAGTAACAGATG GATCAGGTGAACCAATATATGAAAGACAAGTACCAGTGGATAGAGGATTTTTACTACTAC CATTGGATGGTTCATCGATTCGGTAATGATCATTTGCAGTAGACATGATTAAGTGTGACG ATATTGGGTTTTCACAAACAGATGAAGAAGGAATAACAACAGTATTTTTAAATGAATTAG AACAATTTGTTTCAGTTAAATCCATAGACAAAGTGGATTGTGCAATGGCTTTCTTAAGAC ATATTGATGCATTCGAACCAGTGGATTCTACATTTTGATCACATCCACGAAGATTATGAT AAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)