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Schistosoma mansoni
cluster # 6279 cluster # 6279       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6279#0 length = 893 sequences # 4  

consensusID : consensus_6279#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 893
fasta sequence
                              [GATATTTTTCAAAGACTACCAGGTTTTAATAATATTGTCGTCGGGATTTCCGTAGTCGATATTTCTCGTGTAGATGGAGAATGTCTCGTTGAACCATTATCTAATTTGGAATGCCGCTCAGATTGTACAGATATATTAGATTGTTTGTTATTGAAACTCTCAGGTTGACTTATTGGACACTCTCCCGGGGATCTATTGATTTCAGTGGGCTTTTTCAAGTTGCCAGTCATTACACGTTTAAGTTGATGATTATTTGCAGCCTTCCGGTTTGCTTTACGTAACTTCTTGTTAGCCGGTGT-AATTTATGGGGATCGTTTATTGGTTTATTTAAATTAGATGTGAGTGAAGATGGTGAACTCATACCATTATCAGTATTATTACTGGTAATCTTGATAGTCGTTTTCCAAAACGCATCTGTATCCGACTGTGGTGGGTTAAATGGGGATATAAGCATGTCATTTTCTAACTGATATGAGTGAATTTCATCTCTGGTTGTCTTGGAGACAC-TCGATGATAGACATTCATTGTCTTTATTGGACTTATCGTGTTGGACAAAATCCGTAGGGGGGAAATGAAGCTTGTCAGTAGGTATATTTTGACTTATTTCTTCACTATTATTTTCCGCCTTATCATTGTTATTTTCCGTATTTTCAGTAGATTTTGAAAACTGATGAGTTCCAAAATTCTGGTCTCTATTTGTATTACTTTTAACTAATAATTCTGCTGATTCTAAACTTATGCTAGTTGGGTTATCCGTACAAATTTTCAAGTTTGTTTTATTTGTTTCTGCATCTTGTTCAGTTTTTAATGTAGTACACGCCTCGACAATAGATGGAGTTTTTTCGGGACTAAATGAATTACTGCAAGTATTAGGAGGGTAACTCTTATCATTT]

[+] EMBL CD154540             [GATATTTTTCAAAGACTACCAGGTTTTAATAATATTGTCGTCGGGATTTCCGTAGTCGATATTTCTCGTGTAGATGGAGAATGTCTCGTTGAACCATTATCTAATTTGGAATGCCGCTCAGATTGTACAGATATATTAGATTGTTTGTTATTGAAACTCTCAGGTTGACTTATTGGACACTCTCCCGGGGATCTATTGATTTCAGTGGGCTTTTTCAAGTTGCCAGTCATTACACGTTTAAGTTGATGATTATTTGCAGCCTTCCGGTTTGCTTTACGTAACTTCTTGTTAGCCGGTGT AATTTATGGGGATCGTTTATTGGTTTATTTAAATTAGATGTGAGTGAAGATGGTGAACTCATACCATTATCAGTATTATTACTGGTAATCTTGATAGTCGCTTTCCAAAACGCATCTGTATCCGACTGTGGTGGGTTAAATGGGGATATAAGCATGTCATTTTCTAACTGATATGAGTGAATTTCATCTCTGGTTCGCTTGGAGACAC TCGATGATAGACATTCATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD198490             [                                                                                                                          TTGTACAGATATATTAGATTGTTTGTTATTGAAACTCTCAGGTTGACTTATTGGACACTCTCCCGGGGATCTATTGATTTCAGTGGGCTTTTTCAAGTTGCCAGTCATTACACGTTTAAGTTGATGATTATTTGCAGCCTTCCGGTTTGCTTTACGTAACTCCTTGTTAGCCGGTGTAAATTTATGGGGATCGTTTATTGGTTTATTTAAATTAGATGTGAGTGAAGATGGTGAACTCATACCATTATCAGTATTATTACTGGTAATCTTGATAGTCGTTTTCCAAAACGCATCTGTATCCGACTGTGGTGGGTTAAATGGGGATATAAGCATATCATTTTCTAACTGATATGAGTGAATTTCATCTCTGGTTGTCTTGGAGACAC TCGATGATAGACATTCATTGTCTTTATTGGACTTATCGTGTTGGACAAAATCCGTAGGGGGGAAATGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD098109             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATAGTCGTTTTCCAAAACGCATCTGTATCCGACTGTGGTGGGTTAAATGGGGATATAAGCATGTCATTTTCTAACTGATATGAGTGAATTTCATCTCTGGTTGTCTTGGAGACACATCGATGATAGACATTCATTGTCTTTATTGGACTTATCGTGTTGGACAAAATCCGTAGGGGGGAAATGAAGCTTGTCAGTAGGTATATTTTGACTTATTTCTTCACTATTATTTTCCGCCTTATCATTGTTATTTTCCGTATTTTCAGTAGATTTTGAAAACTGATGAGTTCCAAAATTCTGGTCTCTATTTGTATTA                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD091730             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AC TCGATGATAGACATTCATTGTCTTTATTGGACTTATCGTGTTGGACAAAATCCGTAGGGGGGAAATGAAGCTTGTCAGTAGGTATATTTTGACTTATTTCTTCACTATAATTTTCCGCCTTATCATTGTTATTTTCCGTATTTTCAGTAGATTTTGAAAACTGATGAGTTCCAAAATTCTGGTCTCTATTTGTATTACTTTTAACTAATAATTCTGCTGATTCTAAACTTATGCTAGTTGGGTTATCCGTACAAATTTTCAAGTTTGTTTTATTTGTTTCTGCATCTTGTTCAGTTTTTAATGTAGTACACGCCTCGACAATAGATGGAGTTTTTTCGGGACTAAATGAATTACTGCAAGTATTAGGAGGGTAACTCTTATCATTT]


>consensus_6279#0 GATATTTTTCAAAGACTACCAGGTTTTAATAATATTGTCGTCGGGATTTCCGTAGTCGAT ATTTCTCGTGTAGATGGAGAATGTCTCGTTGAACCATTATCTAATTTGGAATGCCGCTCA GATTGTACAGATATATTAGATTGTTTGTTATTGAAACTCTCAGGTTGACTTATTGGACAC TCTCCCGGGGATCTATTGATTTCAGTGGGCTTTTTCAAGTTGCCAGTCATTACACGTTTA AGTTGATGATTATTTGCAGCCTTCCGGTTTGCTTTACGTAACTTCTTGTTAGCCGGTGTA ATTTATGGGGATCGTTTATTGGTTTATTTAAATTAGATGTGAGTGAAGATGGTGAACTCA TACCATTATCAGTATTATTACTGGTAATCTTGATAGTCGTTTTCCAAAACGCATCTGTAT CCGACTGTGGTGGGTTAAATGGGGATATAAGCATGTCATTTTCTAACTGATATGAGTGAA TTTCATCTCTGGTTGTCTTGGAGACACTCGATGATAGACATTCATTGTCTTTATTGGACT TATCGTGTTGGACAAAATCCGTAGGGGGGAAATGAAGCTTGTCAGTAGGTATATTTTGAC TTATTTCTTCACTATTATTTTCCGCCTTATCATTGTTATTTTCCGTATTTTCAGTAGATT TTGAAAACTGATGAGTTCCAAAATTCTGGTCTCTATTTGTATTACTTTTAACTAATAATT CTGCTGATTCTAAACTTATGCTAGTTGGGTTATCCGTACAAATTTTCAAGTTTGTTTTAT TTGTTTCTGCATCTTGTTCAGTTTTTAATGTAGTACACGCCTCGACAATAGATGGAGTTT TTTCGGGACTAAATGAATTACTGCAAGTATTAGGAGGGTAACTCTTATCATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)