cluster # 6299

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Schistosoma mansoni
cluster # 6299 cluster # 6299 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6299#0 length = 592 sequences # 4

consensusID : consensus_6299#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 592
fasta sequence

                              [GAATGGACAGTATATTATTTTCTACGAAATTGCTAATTTTCCGTATTTTTTAATTTCATAATAAACCTTAATTGATCGTCTTTAAATCCATATTTTAAACCCAAATTGATTTTGATAATCGAAATGTTAT-TCGAATTCATCTATAACT-TCTCTTCGTACATGTTCCCATCCATAATTTTTCAACTTTCATTTGTAACTTCCTTCCAGTTAAGAGAAGTAGAAAATTTCAAAGTCTTGATACTCTCAGGCCCTTAAGAAAACTAAGTGATAATTAATATAGTGATCTGACGCCCTCCTGTAACTGAATTATCTTTATGATGCTCAAGTCTATCTTAGATCATTTTGTCCTAAATTAGCGATATCCGAAAGTCTGTATTTTACCAGATCTCTACGGTAAAATCGAACGTCGGTAATGTAGTACGTAGCTATTAGATAGCTATCTATGATTTTTCAACTGTAAAAGACTATATCGATAGCGGAGTATGTTAAATTTTTATGTAAATTTAATTGCAAAGCACAATGCGTGATTCAATGGTTTCGAACGGTTAACACTTAGTTTGCATATCTCGTAGTGAATTTGAATAATCGAAAC]

[+] EMBL CD091995             [GAATGGACAGTATATTATTTTCTACGAAATTGCTAATTTTCCGTATTTTTTAATTTCATAATAAACCTTAATTGATCGTCTTTAAATCCATATTTTAAACCCAAATTGATTTTGATAATCGAAATGTTAT TCGAATTCATCTATAACT TCTCTTCGTACATGTTCCCATCCATAATTTTTCAACTTTCATTTGTAACTTCCTTCCAGTTAAGAGCAGTAGAAAATTTCAAAGTCTTGATACTCTCAGGCCCTTAAGAAAACTAAGTGATAATTAATATAGTGATCTGACGCCCTCCTGTAACTGAATTATCTTTATGATGCTCAAGTCTATCTTAGATCATTTTGTCCTAAATTAGCGATATCCGAAAGTCTGTATTTTACCAGATCTCTACGGTAAAATCGAACGTCGGTAATGTAGTACGTAGCTATTAGATAGCTATCTATGATTTTTCAACTGTAAAAGACTATATCGATAGCGGAGTATGTTAAATTTTTATGTAAATTTAATTGCAAAGCACAATGCGTGATTCAATGGTTTCGAACGGTTAACACTTAGTTTGCATATCTCGTAGTGAATTTGAATAATCGAAA ]
[+] EMBL CD091929             [GAATGGACAGTATATTATTTTCTACGAAATTGCTAATTTTCCGTATTTTTTAATTTCATAATAAACCTTAATTGATCGTCTTTAAATCCATATTTTAAGCCCAAATTGATTTTGATAATCGAAATGTTAT TCGAATTCATCTATAACT TCTCTTCGTACATGTCCCCATCCATAATTTTTCAACTTTCATTTGTAACTTCCTTCCAGTTAAGAGAAGTAGAAAATTTCAAAGTCTTGATACTCTCAGGCCCTTAAGAAAACTAAGTGATAATTAATATAGTGATCTGACGCCCTCCTGTAACTGAATTATCTTTATGATGCTCAAGTCTATCTTAGATCATTTTGTCCTAAATTAGCGATATCCGAAAGTCTGTATTTTACCAGATCTCTACGGTAAAATCGAACGTCGGTAATGTAGTACGTAGCTATTAGATAGCTATCTATGATTTTTCAACTGTAAAAGACTATATCGATAGCGGAGTATGTTAAATTTTTATGTAAATTTAATTGCAAAGCACAATGCGTGATTCAATGGTTTCGAACGGTTAACACTTAGTTT                                 ]
[+] EMBL CD091990             [GAATGGACAGTATATTATTTTCTACGAAATTGCTAATTCTCCGTATTTTTTAATTTCATAATAAACCTTAATTGATCGTCTTTAAATCCATATTTTAAACCCAAATTGATTGTGATAATCGAAATGTTATATCGAATTCATCTATAACTACCTCTTCGGACATGTTCCCATCCATAATTTTTCAACTTTCATTTGCAACTTCCTTGCAGTTAAAAGAAGTAAAAAATTTCAGAGTCTTGATACTCTCAGGCCCTTAACAAAACTAAGTGATAATTAATATAGTGATCTGACGCCCTCCTGTAACTGAATTATCTTTATGATGCTCAGGTCTATCTTAGATCATTTTGTCCTAAATTACCGATATCCGAAAGTCTGTATTTTACCAGATCTCTACGGTAAAAT                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD091977             [                                                                          ATCGTCTTTAAATCCATATTTTAAACCCAAATTGATTTTGATAATCGAAATGTTAT TCGAATTCATCTATAACT TCTCTTCGTACATGTTCCCATCCATAATTTTTCAACTTTCATTTGTAACTTCCTTCCAGTTAAGAGAAGTAGAAAATTTCAAAGTCTTGATACTCTCAGGCCCTTAAGAAAACTAAGTGATAATTAATATAGTGATCTGACGCCCTCCTGTAACTGAATTATCTTTATGATGCTCAAGTCTATCTTAGATCATTTTGTCCTAAATTAGCGATATCCGAAAGTCTGTATTTTACCAGATCTCTACGGTAAAATCGAACGTCGGTAATGTAGTACGTAGCTATTAGATAGCTATCTATGATTTTTCAACTGTAAAAGACTATATCGATAGCGGAGTATGTTAAATTTTTATGTAAATTTAATTGCAAAGCACAATGCGTGATTCAATGGTTTCGAACGGTTAACACTTAGTTTGCATATCTCGTAGTGAATTTGAATAATCGAAAC]




>consensus_6299#0
GAATGGACAGTATATTATTTTCTACGAAATTGCTAATTTTCCGTATTTTTTAATTTCATA
ATAAACCTTAATTGATCGTCTTTAAATCCATATTTTAAACCCAAATTGATTTTGATAATC
GAAATGTTATTCGAATTCATCTATAACTTCTCTTCGTACATGTTCCCATCCATAATTTTT
CAACTTTCATTTGTAACTTCCTTCCAGTTAAGAGAAGTAGAAAATTTCAAAGTCTTGATA
CTCTCAGGCCCTTAAGAAAACTAAGTGATAATTAATATAGTGATCTGACGCCCTCCTGTA
ACTGAATTATCTTTATGATGCTCAAGTCTATCTTAGATCATTTTGTCCTAAATTAGCGAT
ATCCGAAAGTCTGTATTTTACCAGATCTCTACGGTAAAATCGAACGTCGGTAATGTAGTA
CGTAGCTATTAGATAGCTATCTATGATTTTTCAACTGTAAAAGACTATATCGATAGCGGA
GTATGTTAAATTTTTATGTAAATTTAATTGCAAAGCACAATGCGTGATTCAATGGTTTCG
AACGGTTAACACTTAGTTTGCATATCTCGTAGTGAATTTGAATAATCGAAAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case