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Schistosoma mansoni
cluster # 6303 cluster # 6303       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6303#0 length = 669 sequences # 4  

consensusID : consensus_6303#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 669
fasta sequence
                              [GGCGCAATTCGGGGATTGGAGGTGGCGGGAATTCCTGTTTCATTGCGTAGGCGAGGAATACGCAGATGATTCGTTTCCCTAGTGGGACTGTTGACAGTCTCTCTTGCTTCTTATCTATCCCACATAACTTGCTTAATGCTTCTCCTCTTAGTCCAGGAGGGCTAACCATGCAAAGTATTGATGGCTCACCTTCTGGTCTTCCTTTTGCAGGATACGCCCCTTTCGTTAGGAACTTATGTTTGAGACTTAATTTACCTATCATAAATACCGCAAATATTATTCCTCTCCCGAATCCCGGGGTTGGCGTAATACCTTCTGTTTCTTATGCACCAACAGGATGCCCAAACCCAGTTTTGTGTTATCCTACCTCAGTGACCCAAACGACCCACTCAGTTATTGGTTCTGGTCCATCTGATCCATCTGTTCACACGATTGTTCGTGGTCCAGTCATGTACACAAGCGCCTTCAACGGCTGATTCACATTCGAATCGATTCATCTGCGCCTCTACTGGTTAATGAGTAGTCATGATTTGATTCAACGAAGCAATGGAATTCATTCCAGTGATACAAAAATTAAAGAAGAAAGTCCTCCTGATCGTATTGTGGCTTCTTATGCTGCTGCAGCACATGCAGCTGCACTGGCTTGTCATCAACCGATTTCCAGAGCTG]

[-] EMBL CD160945             [GGCGCAATTCGGGGATTGGAGGTGGCGGGAATTCCTGTTTCATTGCGTAGGCGAGGAATACGCAGATGATTCGTTTCCCTAGTGGGACTGTTGACAGTCTCTCTTGCTTCTTATCTATCCCACATAACTTGCTTAATGCTTCTCCTCTTAGTCCAGGAGGGCTAACCATGCAAAGTATTGATGGCTCACCTTCTGGTCTTCCTTTTGCAGGATACGCCCCTTTCGTTAGGAACTTATGTTTGAGACTTAATTTACCTATCATAAATACCGCAAATATTATTCCTCTCCCGAATCCCGGGGTTGGCGTAATACCTTCTGTTTCTTATGCACCAACAGGATGCCCAAACCCAGTTTTGTGTTATCCTACCTCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD170681             [                          GGGAATTCCTGTTTCATTGCGTAGGCGAGGAATACGCAGATGATTCGTTTCCCTAGTGGGACTGTTGACAGTCTCTCTTGCTTCTTATCTATCCCACATAACTTGCTTAATGCTTCTCCTCTTAGTCCAGGAGGGCTAACCATGCAAAGTATTGATGGCTCACCTTCTGGTCTTCCTTTTGCAGGATACGCCCCTTTCGTTAGGAACTTATGTTTGAGACTTAATTTACCTATCATAAATACCGCAAATATTATTCCTCTCCCGAATCCCGGGGTTGGCGTAATACCTTCTGTTTCTTATGCACCAACAGGATGCCCAAACCCAGTTTTGTGTTATCCTACCTCAGTGACCCAAACGACCCACTCAGTTATTGGTTCTGGTCCATCTGATCCATCTGTTCACACGATTGTTCGTGGTCCA                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD122218             [                                                                                                                                                                                        CTCACCTTCTGGTCTTCCTTTTGCAGGATACGCCCCTTTCGTTAGGAACTTATGTTTGAGACTTAATTTACCTATCATAAATACCGCAAATATTATTCCTCTCCCGAATCCCGGGGTTGGCGTAATACCTTCTGTTTCTTATGCACCAACAGGATGCCCAAACCCAGTTTTGTGATATCCTACCTCAGTGACCCAAACGACCCACTCAGTTATTGGTTCTGGTCCATCTGATCCATCTGTTCACACGATTGTTCGTGGTCCAGTCATGTACACAAGCGCCTTCAACGGCTGATTCACATTCGAATCGATTCATCTGCGCCTCTACTGGTTAATGAGTAGTCATGATTTGATTCAACGAAGCAATGGAATTCATTCCAGTGATACAAAAATTAAAGAAGAAAGTCCTCCTGATCGTATTGTGGCTTCTTATGCTGCTGCAGCACATGCAGCTGCACTGGCTTGTCATCAACCGATTTCCAGAGCTG]
[+] EMBL CD122179             [                                                                                                                                                                                        CTCACCTTCTGGTCTTCCTTTTGCAGGATACGCCCCTTTCGTTAGGAACTTATGTTTGAGACTTAATTTACCTATCATAAATACCGCAAATATTATTCCTCTCCCGAATCCCGGGGTTGGCGTAATACCTTCTGTTTCTTATGCACCAACAGGATGCCCAAACCCAGTTTTGTGTTATCCTACCTCAGTGACCCAAACGACCCACTCAGTTATTGGTTCTGGTCCATCTGATCCATCTGTTCACACGATTGTTCGTGGTCCAGTCATGTACACAAGCGCCTTCAACGGCTGATTCACATTCGAATCGATTCATCTGCGCCTCTACTGGTTAATGAGTAGTCATGATTTGATTCAACGAAGCAATGGAATTCATTCCAGTGATACAAAAATTAAAGAAGAAAGTCCTCCTGATCGTATTGTGGCTTCTTATGCTGCTGCAGCACATGCAGCTGCACTGGCTTGTCATCAACCGATTTCCAGAGCTG]


>consensus_6303#0 GGCGCAATTCGGGGATTGGAGGTGGCGGGAATTCCTGTTTCATTGCGTAGGCGAGGAATA CGCAGATGATTCGTTTCCCTAGTGGGACTGTTGACAGTCTCTCTTGCTTCTTATCTATCC CACATAACTTGCTTAATGCTTCTCCTCTTAGTCCAGGAGGGCTAACCATGCAAAGTATTG ATGGCTCACCTTCTGGTCTTCCTTTTGCAGGATACGCCCCTTTCGTTAGGAACTTATGTT TGAGACTTAATTTACCTATCATAAATACCGCAAATATTATTCCTCTCCCGAATCCCGGGG TTGGCGTAATACCTTCTGTTTCTTATGCACCAACAGGATGCCCAAACCCAGTTTTGTGTT ATCCTACCTCAGTGACCCAAACGACCCACTCAGTTATTGGTTCTGGTCCATCTGATCCAT CTGTTCACACGATTGTTCGTGGTCCAGTCATGTACACAAGCGCCTTCAACGGCTGATTCA CATTCGAATCGATTCATCTGCGCCTCTACTGGTTAATGAGTAGTCATGATTTGATTCAAC GAAGCAATGGAATTCATTCCAGTGATACAAAAATTAAAGAAGAAAGTCCTCCTGATCGTA TTGTGGCTTCTTATGCTGCTGCAGCACATGCAGCTGCACTGGCTTGTCATCAACCGATTT CCAGAGCTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)