These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6312#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 819 fasta sequence [TAGTTTTTATTCTGCCATATTAAATGTGCCTTGTTTCATATTTATCTTTCTCCTTTTTTAGGTTGTTACTCTCGCGTCACTGCTTTCTTTATATTCTTCCTTTAGTTCTTGTAGAATTTTTTTCTGTTCCTATCTGATCTGTTTTGTTCTGCCCAATTCTAATGTTTCGTCTACTGCTTAGCTTTTTTGCTTTAATTAACTACATTAAGGTACTGTAATTTTAATTCAGACTTAGTTATTTCAATACTAAGTTGACTAATGTCTGTTTGTATATTTATCTGGTGTTCAGTCCATCTATTGTCTGTAATTACCTATTAGTTTACTATTTCTACAAAGAGATTATTATTATTCATTTAAACCAAAAGGTATATATTTTTGTCTACTACTACTACTATAAATAATAGTACTTCAACAACTTATACCATTGA-AGTGAACAAACTAAATCTTCTTTACACTTTTTGGTAGCTCCAATGTTTTCTTAGAGTTAATAATCACACCACTCAAAAAAGACAACTTTCTCTCTCTCTAAACTTCTAGTTCATATTCTGCTTCTTTTTCAAGTTCTCCATATACCGCTAATTACCACAACATCGGAAATCATTGGTGTAGACGTGTCAAATCAGTTTTTACTATATTATTAATATATTCTATAAATAATGCTCAGAAACAGAGATTTTCGTCCTGTTTATACAGAAAAAAAACATTTGAAATTTGCGCGCATCAATTGTTTTTTATTGTTACGATTGAAATATTCAACCGGTTGTTGATGATGATCTATCTATTCTAAAAGAACAAAAGGTTGAGTGGTAAAACCATAGA] [+] EMBL CD128382 [TAGTTTTTATTCTGCCATATTAAATGTGCCTTGTTTCATATTTATCTTTCTCCTTTTTTAGGTTGTTACTCTCGCGTCACTGCTTTCTTTATATTCTTCCTTTAGTTCTTGTAGAATTTTTTTCTGTTCCTATCTGATCTGTTTTGTTCTGCCCAATTCTAATGTTTCGTCTACTGCTTAGCTTTTTTGCTTTAATTAACTACATTAAGGTACTGTAATTTTAATTCAGACTTAGTTATTTCAATACTAAGTTGACTAATGTCTGTTTGTATATTTATCTGGTGTTCAGTCCATCTATTGTCTGTAATTACCTATTAGTTTACTATTTCTACAAAGAGATTATTATTATTC ] [-] EMBL CD128410 [TAGTTTTTATTCTGCCATATTAAATGTGCCTTGTTTCATATTTATCTTTCTCCTTTTTTAGGTTGTTACTCTCGCGTCACTGCTTTCTTTATATTCTTCCTTTAGTTCTTGTAGAATTTTTTTCTGTTCCTATCTGATCTGTTTTGTTCTGCCCAATTCTAATGTTTCGTCTACTGCTTAGCTTTTTTGCTTTAATTAACTACATTAAGGTACTGTAATTTTAATTCAGACTTAGTTATTTCAATACTAAGTTGACTAATGTCTGTTTGTATATTTATCTGGTGTTCAGTCCATCTATTGTCTGTAATTACCTATTAGTTTACTATTTCTACAAAGAGATTA ] [+] EMBL CD157458 [ TTTTTTGCTTTAATTAACTACATTAAGGTACTGTAATTTTGATTCAGACTTAGTTATTTCAATACTAAGTTGACTAATGTCTGTTTGTATATTTATCTGGTGTTCAGTCCATCTATTGTCTGTAATTACCTATTAGTTTACTATTTCTACAAAGAGATTATTATTATTCATTTAAACCAAAAGGTATATATTTTTGTCTACTACTACTACTATAAATAATAGTACTTCAACAACTTATACCATTGA AGTGAACAAACTAAATCTTCTTTACACTTTTTGGTAGCTCCAATGTTTTCTTAGAGTTAATAATCACACCACTCAAAAAAGACAACTTTCTCTCTCTCTAAACTTCTAGTTCATATTCTGCTTCTTTTTC ] [+] EMBL CD084351 [ gATTCATTTAAACCAAAAGGTATATATTTTTGTCTACTACTACTACTATAAATAATAGTACTTCAACAACTTATACCATTGAGAGTGAACAAACTAAATTTTCTTTACACTTTTTGGTAGTTCCAATGTTTTCTTAGAGTTAATAATCACACCACTCAAAAAAGACAACTTTCTCTCTCTCTAAACTTCTAGTTCATATTCTGCTTCTTTTTCAAGTTCTCCATATACCGCTAATTACCACAACATCGGAAATCATTGGTGTAGACGTGTCAAATCAGTTTTTACTATATTATTAATATATTCTATAAATAATGCTCAGAAACAGAGATTTTCGTCCTGTTTATACAGAAAAAAAACATTTGAAATTTGCGCGCATCAATTGTTTTTTATTGTTACGATTGAAATATTCAACCGGTTGTTGATGATGATCTATCTATTCTAAAAGAACAAAAGGTTGAGTGGTAAAACCATAGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||