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Schistosoma mansoni
cluster # 6312 cluster # 6312       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6312#0 length = 819 sequences # 4  

consensusID : consensus_6312#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 819
fasta sequence
                              [TAGTTTTTATTCTGCCATATTAAATGTGCCTTGTTTCATATTTATCTTTCTCCTTTTTTAGGTTGTTACTCTCGCGTCACTGCTTTCTTTATATTCTTCCTTTAGTTCTTGTAGAATTTTTTTCTGTTCCTATCTGATCTGTTTTGTTCTGCCCAATTCTAATGTTTCGTCTACTGCTTAGCTTTTTTGCTTTAATTAACTACATTAAGGTACTGTAATTTTAATTCAGACTTAGTTATTTCAATACTAAGTTGACTAATGTCTGTTTGTATATTTATCTGGTGTTCAGTCCATCTATTGTCTGTAATTACCTATTAGTTTACTATTTCTACAAAGAGATTATTATTATTCATTTAAACCAAAAGGTATATATTTTTGTCTACTACTACTACTATAAATAATAGTACTTCAACAACTTATACCATTGA-AGTGAACAAACTAAATCTTCTTTACACTTTTTGGTAGCTCCAATGTTTTCTTAGAGTTAATAATCACACCACTCAAAAAAGACAACTTTCTCTCTCTCTAAACTTCTAGTTCATATTCTGCTTCTTTTTCAAGTTCTCCATATACCGCTAATTACCACAACATCGGAAATCATTGGTGTAGACGTGTCAAATCAGTTTTTACTATATTATTAATATATTCTATAAATAATGCTCAGAAACAGAGATTTTCGTCCTGTTTATACAGAAAAAAAACATTTGAAATTTGCGCGCATCAATTGTTTTTTATTGTTACGATTGAAATATTCAACCGGTTGTTGATGATGATCTATCTATTCTAAAAGAACAAAAGGTTGAGTGGTAAAACCATAGA]

[+] EMBL CD128382             [TAGTTTTTATTCTGCCATATTAAATGTGCCTTGTTTCATATTTATCTTTCTCCTTTTTTAGGTTGTTACTCTCGCGTCACTGCTTTCTTTATATTCTTCCTTTAGTTCTTGTAGAATTTTTTTCTGTTCCTATCTGATCTGTTTTGTTCTGCCCAATTCTAATGTTTCGTCTACTGCTTAGCTTTTTTGCTTTAATTAACTACATTAAGGTACTGTAATTTTAATTCAGACTTAGTTATTTCAATACTAAGTTGACTAATGTCTGTTTGTATATTTATCTGGTGTTCAGTCCATCTATTGTCTGTAATTACCTATTAGTTTACTATTTCTACAAAGAGATTATTATTATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD128410             [TAGTTTTTATTCTGCCATATTAAATGTGCCTTGTTTCATATTTATCTTTCTCCTTTTTTAGGTTGTTACTCTCGCGTCACTGCTTTCTTTATATTCTTCCTTTAGTTCTTGTAGAATTTTTTTCTGTTCCTATCTGATCTGTTTTGTTCTGCCCAATTCTAATGTTTCGTCTACTGCTTAGCTTTTTTGCTTTAATTAACTACATTAAGGTACTGTAATTTTAATTCAGACTTAGTTATTTCAATACTAAGTTGACTAATGTCTGTTTGTATATTTATCTGGTGTTCAGTCCATCTATTGTCTGTAATTACCTATTAGTTTACTATTTCTACAAAGAGATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD157458             [                                                                                                                                                                                      TTTTTTGCTTTAATTAACTACATTAAGGTACTGTAATTTTGATTCAGACTTAGTTATTTCAATACTAAGTTGACTAATGTCTGTTTGTATATTTATCTGGTGTTCAGTCCATCTATTGTCTGTAATTACCTATTAGTTTACTATTTCTACAAAGAGATTATTATTATTCATTTAAACCAAAAGGTATATATTTTTGTCTACTACTACTACTATAAATAATAGTACTTCAACAACTTATACCATTGA AGTGAACAAACTAAATCTTCTTTACACTTTTTGGTAGCTCCAATGTTTTCTTAGAGTTAATAATCACACCACTCAAAAAAGACAACTTTCTCTCTCTCTAAACTTCTAGTTCATATTCTGCTTCTTTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD084351             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gATTCATTTAAACCAAAAGGTATATATTTTTGTCTACTACTACTACTATAAATAATAGTACTTCAACAACTTATACCATTGAGAGTGAACAAACTAAATTTTCTTTACACTTTTTGGTAGTTCCAATGTTTTCTTAGAGTTAATAATCACACCACTCAAAAAAGACAACTTTCTCTCTCTCTAAACTTCTAGTTCATATTCTGCTTCTTTTTCAAGTTCTCCATATACCGCTAATTACCACAACATCGGAAATCATTGGTGTAGACGTGTCAAATCAGTTTTTACTATATTATTAATATATTCTATAAATAATGCTCAGAAACAGAGATTTTCGTCCTGTTTATACAGAAAAAAAACATTTGAAATTTGCGCGCATCAATTGTTTTTTATTGTTACGATTGAAATATTCAACCGGTTGTTGATGATGATCTATCTATTCTAAAAGAACAAAAGGTTGAGTGGTAAAACCATAGA]


>consensus_6312#0 TAGTTTTTATTCTGCCATATTAAATGTGCCTTGTTTCATATTTATCTTTCTCCTTTTTTA GGTTGTTACTCTCGCGTCACTGCTTTCTTTATATTCTTCCTTTAGTTCTTGTAGAATTTT TTTCTGTTCCTATCTGATCTGTTTTGTTCTGCCCAATTCTAATGTTTCGTCTACTGCTTA GCTTTTTTGCTTTAATTAACTACATTAAGGTACTGTAATTTTAATTCAGACTTAGTTATT TCAATACTAAGTTGACTAATGTCTGTTTGTATATTTATCTGGTGTTCAGTCCATCTATTG TCTGTAATTACCTATTAGTTTACTATTTCTACAAAGAGATTATTATTATTCATTTAAACC AAAAGGTATATATTTTTGTCTACTACTACTACTATAAATAATAGTACTTCAACAACTTAT ACCATTGAAGTGAACAAACTAAATCTTCTTTACACTTTTTGGTAGCTCCAATGTTTTCTT AGAGTTAATAATCACACCACTCAAAAAAGACAACTTTCTCTCTCTCTAAACTTCTAGTTC ATATTCTGCTTCTTTTTCAAGTTCTCCATATACCGCTAATTACCACAACATCGGAAATCA TTGGTGTAGACGTGTCAAATCAGTTTTTACTATATTATTAATATATTCTATAAATAATGC TCAGAAACAGAGATTTTCGTCCTGTTTATACAGAAAAAAAACATTTGAAATTTGCGCGCA TCAATTGTTTTTTATTGTTACGATTGAAATATTCAACCGGTTGTTGATGATGATCTATCT ATTCTAAAAGAACAAAAGGTTGAGTGGTAAAACCATAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)