Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6320 cluster # 6320       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6320#0 length = 483 sequences # 4  

consensusID : consensus_6320#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 483
fasta sequence
                              [AAAAAAACACAAACAGACAGCTGCAATGGACCCTGAGATAGCAAGACGCGAATGGATAAAGGAGATGGTTGACTAGTGATCTGTGGTTGGGTCATCTACTGTCGTTGTTGTTGTTGTTTGTAGTTTGATAATGTCTGGGCGAAGAAAGACTTGATCGACTGATGATGTGTTCAAATGAAATGGGCGATTCATGTGTATGTGTGTATGTATGGATATGAATTGCAGATTTGATGATCCGTTACTGAATCATTCTTGTGCTGGACCAGCCAGCGAAATACTCTCGGAGGTATTCGTCGCGTGTTGATTCGATGGTGTTGTTTTCGGATCATTTTCATTGGCTGATGGCATGTTTTTATCAGTATTTGTTAGATTATATGGACGTGTTGGACGATATGAATGATTCGATGATGGATACATGGGCATGCGAGGTGTCGGTGATGTTCCATTGGGTGATTGAACTAACGGGCGTCCGATGAAATTTCT]

[+] EMBL CD143255             [AAAAAAACACAAACAGACAGCTGCAATGGACCCTGAGATAGCAAGACGCGAATGGATAAAGGAGATGGTTGACTAGTGATCTGTGGTTGGGTCATCTACTGTCGTTGTTGTTGTTGTTTGTAGTTTGATAATGTCTGGGCGAAGAAAGACTTGATCGACTGATGATGTGTTCAAATGAAATGGGCGATTCATGTGTATGTGTGTATGTATGGATATGAATTGCAGATTTGATGATCCGTTACTGAATCATTCTTGTGCTGGACCAGCCAGCGAAATACTCTCGGAGGTATTCGTCGCGTGTTGATTCGATGGTGTTGTTTTCGGATCATTTTCATTGGCTGATGGCATGTTTTTATCAGTATTTGTTAGATTATATGGACGTGTTGGACGATATGAATGATTCGAGGATGGATACATGGGCATGCGAGGGGTCGGGGATGTTCCATTGGGTGATTGAACTAACGGGCGTCCGAAGAAATTTC ]
[+] EMBL CD143387             [ AAAAAACACAAACAGACAGCTGCAATGGACCCTGAGATAGCAAGACGCAAATGGATAAAGGAGATGGTTGACTAGTGATCTGTGGTTGGGTCATCTACTGTCGTTGTTGTTGTTGTTTGTAGTTTGATAATGTCTGGGCGAAGAAAGACTTGATCGACTGATGATGTGTTCAAATGAAATGGGCGATTCATGTGTATGTGTGTATGTATGGATATGAATTGCAGATTTGATGATCCGTTACTGAATCATTCTTGTGCTGGACCAGCCAGCGAAATACTCTCGGAGGTATTCGTCGCGTGTTGATTCGATGGTGTTGTTTTCGGATCATTTTCATTGGCTGATGGCATGTTTTTATCAGTATTTGTTAGATTATATGGGCGTGTTGGACGATATGAATGATTCGATGATGGATACATGGGCATGCGAGGTGTCGGTGATGTTCCATTGGGTGATTGAACTAACGGCCGTCCGATGAAATTTC ]
[+] EMBL CD143405             [ AAAAAACACAAACAGACAGCAGCAATGGACCCTGAGATAGCAAGACGCGAATGGATAAAGGAGATGGTTGACTAGTGATCTGTGGTTGGGTCATCTACTGTCGTTGTTGTTGTTGTTTGTAGTTTGATAATGTCTGGGCGAAGAAAGACTTGATCGACTGATGATGTGTTCAAATGAAATGGGCGATTCATGTGTATGTGTGTATGTATGGATATGAATTGCAGATTTGATGATCCGTTACTGAATCATTCTTGTGCTGGACCAGCCAGCGAAATACTCTCGGAGGTATTCGTCGCGTGTTGATTCGATGGTGTTGTTTTCGGATCATTTTCATTGGCTGATGGCATGTTTTTATCAGTATTTGTTAGATTATATGGACGTGTTGGACGATATGAATGATTCGATGATGGATACATGGGCATGCGAGGTGTCGGTGATGTTCCATTGGGTGATTGAACTAACGGCCGTCCGATGAAATTTC ]
[+] EMBL CD143340             [ AAAAAACACAAACAGACAGCTGCAATGGACCCTGAGATAGCAAGACGCGAATGGATAAAGGAGATGGTTGACTAGTGATCTGTGGTTGGGTCATCTACTGTC   GTTGTTGTTGTTTGTAGTTTGATAATGTCTGGGCGAAGAAAGACTTGATCGACTGATGATGTGTTCAAATGAAATGGGCGATTCATGTGTATGTGTGTATGTATGGATATGAATTGCAGATTTGATGATCCGTTACTGAATCATTCTTGTGCTGGACCAGCCAGCGAAATACTCTCGGAGGTATTCGTCGCGTGTTGATTCGATGGTGTTGTTTTCGGATCATTTTCATTGGCTGATGGCATGTTTTTATCAGTATTTGTTAGATTATATGGACGTGTTGGACGATATGAATGATTCGATGATGGATACATGGGCATGCGAGGTGTCGGTGATGTTCCATTGGGTGATTGAACTAACGGGCGTCCGATGAAATTTCT]


>consensus_6320#0 AAAAAAACACAAACAGACAGCTGCAATGGACCCTGAGATAGCAAGACGCGAATGGATAAA GGAGATGGTTGACTAGTGATCTGTGGTTGGGTCATCTACTGTCGTTGTTGTTGTTGTTTG TAGTTTGATAATGTCTGGGCGAAGAAAGACTTGATCGACTGATGATGTGTTCAAATGAAA TGGGCGATTCATGTGTATGTGTGTATGTATGGATATGAATTGCAGATTTGATGATCCGTT ACTGAATCATTCTTGTGCTGGACCAGCCAGCGAAATACTCTCGGAGGTATTCGTCGCGTG TTGATTCGATGGTGTTGTTTTCGGATCATTTTCATTGGCTGATGGCATGTTTTTATCAGT ATTTGTTAGATTATATGGACGTGTTGGACGATATGAATGATTCGATGATGGATACATGGG CATGCGAGGTGTCGGTGATGTTCCATTGGGTGATTGAACTAACGGGCGTCCGATGAAATT TCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)