cluster # 6327

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6327 cluster # 6327 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6327#0 length = 649 sequences # 4

consensusID : consensus_6327#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 649
fasta sequence

                              [GGTGTTGATGTCTAACTCCGAGCAATCCGCTATATTACACGACCATCTTCCACTGTTTTCGGTGGGTAACCGTCTCACCCAATACAATTCACAGCTTTTCACTAGGAATTTCGGTTACTTCTCGCAGCTAGTCACTAGTGAGAGCATAATAATTGTCAGTAAGGGGTTGTAGGGATTGTTGAACTTCATTGAAATGATGGACGGATCTAAGTTTTACGTGCTACTTATTGTAACGGAACGTAAATGGTTTGTCGACTCAAAAAGGAGAAAACAAGACTGTAGAAGACTGATTTATTCACATACCATTCAGGAGAATAATGATAACAAGTTACTTATCATTTTAAATGTTTGGTCGATCGACAAATTTGGATGAATTGGACTAGTAATCAACCGATTATCTCATATATGTGGTGACCTACTTTAATGATGAGAACGTGATTGATATAATCGAAATAATTATTGTTATAACCAATTGTACCAGTGATTGTTTTACTTTACCTGTTTGTTTAATTGTACAAAAAACACACACATTCTTCCGTTGTATGTGACTTTGCATGAACTCGCATGCGCTCAGTAGTTCCACTTGTAAACTTTTGCACGATCTCGGTATTCTTTCGATACCACGAGGTCGCCGACAACTATATCTTAT]

[+] EMBL CD092128             [GGTGTTGATGTCTAACTCCGAGCAATCCGCTATATTACACGACCATCTTCCACTGTTTTCGGTGGGTAACCGTCTCACCCAATACAATTCACAGCTTTTCACTAGGAATTTCGGTTACTTCTCGCAGCTAGTCACTAGTGAGAGCATAATAATTGTCAGTAAGGGGTTGTAGGGATTGTTGAACTTCATTGAAATGATGGACGGATCTAAGTTTTACGTGCTACTTATTGTAACGGAACGTAAATGGTTTGTCGACTCAAAAAGGAGAAAACAAGACTGTAGAAGACTGATTTATTCACATACCATTCAGGAGAATAATGATAACAAGTTACTTATCATTTTAAATGTTTGGTCGATCGACAAATTTGGATGAATTGGACTAGTAATCAACCGATTATCTCATATATGTGGTGACCTACTTTAATGATGAGAACGTGATTGATATAATCGAAATAATTATTGTTATAACCAATTGTACCAGTGATTGTTTTACTATACCTGTTTGTTTAATTGTACAAAAAACACACACATTCTTCCGTTGTATGTGACTTTGCATGAACTCGCATGCGCTCAGTAGTTCCACTTGTAAACTTTTGCACGATCTCGGTATCCTTTCGATACCACGAGGTCGCCGAC ACTATATC    ]
[-] EMBL CD092175             [                                                                                    CAATTCACAGCTTTTCACTAGGAATTTCGATTACTTCTCGCAGCTAGTCACTAGTGAGAGCATAATAATTGTCAGTAAGGGGTTGTAGGGATTGTTGAACTTCATTGAAATGATGGACGGATCTAAGTTTTACGTGCTACTTATTGTAACGGAACGTAAATGGTTTGTCGACTCAAAAAGGAGAAAACAAGACTGTAGAAGACTGATTTATTCACATACCATTCAGGAGAATAATGATAACAAGTTACTTATCATTTTAAATGTTTGGTCGATCGACAAATTTGGATGAATTGGACTAGTAATCAACCGATTATCTCATATATGTGGTGACCTACTTTAATGATGAGAACGTGATTGATATAATCGAAATAATTATTGTTATAACCAATTGTACCAGTGATTGTTTTACTTTACCTGTTTGTTTAATTGTACAAAAAACACACACATTCTTCCGTTGTATGTGACTTTGCATGAACTCGCATGCGCTCAGTAGTTCCACTTGTAAACTTTTGCACGATCTCGGTATTCTTTCGATACCACGAGGTCGCCGACAACTATATCTTAT]
[-] EMBL CD092271             [                                                                                                                           GCAGCTAGTCACTAGTGAGAGCATAATAATTGTCAGTAAGGGGTTGTAGGGATTGTTGAACTTCATTGAAATGATGGACGGATCTAAGTTTTACGTGCTACTTATTGTAACGGAACGTAAATGGTTTGTCGACTCAAAAAGGAGAAAACAAGACTGTAGAAGACTGATTTATTCACATACCATTCAGGAGAATAATGATAACAAGTTACTTATCATTTTAAATGTTTGGTCGATCGACAAATTTGGATGAATTGGACTAGTAATCAACCGATTATCTCATATATGTGGTGGCCTACTTTAATGATGAGAACGTGATTGATATAATCGAAATAATTATTGTTATAACCAATTGTACCAGTGATTGTTTTACTTTACCTGTTTGTTTAATTGTACAAAAAACACACACATTCTTCCGTTGTATGTGACTTTGCATGAACTCGCATGCGCTCAGTAGTTCCACTTGTAAACTTTTGCACGATCTCGGTATTCTTTCGATACCACGAGGTCGCCGACAACTATATCTTAT]
[+] EMBL CD094416             [                                                                                                                                                   AATAATTGTCAGTAAGGGGTTGTAGGGATTGTTGAACTTCATTGAAATGATGGACGGATCTAAGTTTTACGTGCTACTTATTGTAACGGAACGTAAATGGTTTGTCGACTC AAAAGGAGAAAACAAGACTGTAGAAGACTGATTTATTCATATACCATTCAGGAGAATAATGATAACAAGTTACTTATCATTTTAAATGTTTGGTCGATCGACAAATTTGGATGAATTGGACTAGTAATCAACCGATTATCTCATATATGTGGTGACCTACTTTAATGATGAGAACGTGATTGATATGATCGAAATAATTGTTGTTATAACCAATTGTACCAGTGATg                                                                                                                                                                   ]




>consensus_6327#0
GGTGTTGATGTCTAACTCCGAGCAATCCGCTATATTACACGACCATCTTCCACTGTTTTC
GGTGGGTAACCGTCTCACCCAATACAATTCACAGCTTTTCACTAGGAATTTCGGTTACTT
CTCGCAGCTAGTCACTAGTGAGAGCATAATAATTGTCAGTAAGGGGTTGTAGGGATTGTT
GAACTTCATTGAAATGATGGACGGATCTAAGTTTTACGTGCTACTTATTGTAACGGAACG
TAAATGGTTTGTCGACTCAAAAAGGAGAAAACAAGACTGTAGAAGACTGATTTATTCACA
TACCATTCAGGAGAATAATGATAACAAGTTACTTATCATTTTAAATGTTTGGTCGATCGA
CAAATTTGGATGAATTGGACTAGTAATCAACCGATTATCTCATATATGTGGTGACCTACT
TTAATGATGAGAACGTGATTGATATAATCGAAATAATTATTGTTATAACCAATTGTACCA
GTGATTGTTTTACTTTACCTGTTTGTTTAATTGTACAAAAAACACACACATTCTTCCGTT
GTATGTGACTTTGCATGAACTCGCATGCGCTCAGTAGTTCCACTTGTAAACTTTTGCACG
ATCTCGGTATTCTTTCGATACCACGAGGTCGCCGACAACTATATCTTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case