Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 636 cluster # 636       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_636#0 length = 579 sequences # 2  
consensusID : consensus_636#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 579
fasta sequence 
                              [ATTTGAGATACATAGTAGGCTGACTCCTACTATGACTTGCACTAAAATATGTAGGTGCAAAAGTGGAGTTTATTTTTTTCTGAAATTTGTTGATTAAAAATGTTTACGATTTAGAAAACAAAATGTTCAAGATTTAAAAACTAAATATTTCTTCTATAGAGCTGCATATTGTCTATACTCTCAGATGTCACTTGAACATGACAGTACTTGTTTTCAATCAATAGTTTTATTTTTTTAGATCAGTTTCAGACTCACAGAGTGCCCTCTCTCCCTCTCTTCCTTCCATCTTTTTGGAGATGGAGACTCACTATGCACCCGTGGCTGCCATGCAACTTACTGTGTAAACAAGACTGACCTTGAACACACAGAGATACACCTACCTCCTGAGTGATGGGATTTAAAGGTGTATGCCACAGCATACATTTTTATACAAGGCTAGAATGGTCTTAAAGTGCTAAGGCTTAACTGCAGCTAATAACTTGTATTACTGGGTCAGTTAATTCACTAAGAGGAAAAGTGATTCTGGACACAACTTAGGAAAATACTGTTTTGGATTCTTTAAGCAGTCTTTGTACTTTA]

[+] EMBL CD129972             [ATTTGAGATACATAGTAGGCTGACTCCTACTATGACTTGCACTAAAATATGTAGGTGCAAAAGTGGAGTTTATTTTTTTCTGAAATTTGTTGATTAAAAATGTTTACGATTTAGAAAACAAAATGTTCAAGATTTAAAAACTAAATATTTCTTCTATAGAGCTGCATATTGTCTATACTCTCAGATGTCACTTGAACATGACAGTACTTGTTTTCAATCAATAGTTTTATTTTTTTAGATCAGTTTCAGACTCACAGAGTGCCCTCTCTCCCTCTCTTCCTTCCATCTTTTTGGAGATGGAGACTCACTATGCACCCGTGGCTGCCATGCAACTTACTGTGTAAACAAGACTGACCTTGAACACACAGAGATACACCTACCTCCTGAGTGATGGGATTTAAAGGTGTATGCCACAGCATACATTTTTATACAAGGCTAGAATGGTCTTAAAGTGCTAAGGCTTAACTGCAGCTAATAACTTGTATTACTGGGTCAGTTAATTCACTAAGAGGAAAAGTGATTCTGGACACAACTTAGGAAAATACTGTTTTGGATTCTTTAAGCAGTCTTTGTACTTTA]
[+] EMBL CD129905             [ATTTGAGATACATAGTAGGCTGACTCCTACTATGACTTGCACTAAAATATGTAGGTGCAAAAGTGGAGTTTATTTTTTTCTGAAATTTGTTGATTAAAAATGTTTACGATTTAGAAAACAAAATGTTCAAGATTTAAAAACTAAATATTTCTTCTATAGAGCTGCATATTGTCTATACTCTCAGATGTCACTTGAACATGACAGTACTTGTTTTCAATCAATAGTTTTATTTTTTTAGATCAGTTTCAGACTCACAGAGTGCCCTCTCTCCCTCTCTTCCTTCCATCTTTTTGGAGATGGAGACTCACTATGCACCCGTGGCTGCCATGCAACTTACTGTGTAAACAAGACTGACCTTGAACACACAGAGATACACCTACCTCCTGAGTGATGGGATTTAAAGGTGTATGCCACAGCATACATTTTTATACAAGGCTAGAATGGTCTTAAAGTGCTAAGGCTTAACTGCAGCTAATAACTTGTATTACTGGGTCAGTTAATTCACTAAGAGGAAAAGTGATTCTGGACACAACTTAGGAAAATACTGTTTTGGATTCTTTAAGCAGTCTTTGTACTTTA]




>consensus_636#0
ATTTGAGATACATAGTAGGCTGACTCCTACTATGACTTGCACTAAAATATGTAGGTGCAA
AAGTGGAGTTTATTTTTTTCTGAAATTTGTTGATTAAAAATGTTTACGATTTAGAAAACA
AAATGTTCAAGATTTAAAAACTAAATATTTCTTCTATAGAGCTGCATATTGTCTATACTC
TCAGATGTCACTTGAACATGACAGTACTTGTTTTCAATCAATAGTTTTATTTTTTTAGAT
CAGTTTCAGACTCACAGAGTGCCCTCTCTCCCTCTCTTCCTTCCATCTTTTTGGAGATGG
AGACTCACTATGCACCCGTGGCTGCCATGCAACTTACTGTGTAAACAAGACTGACCTTGA
ACACACAGAGATACACCTACCTCCTGAGTGATGGGATTTAAAGGTGTATGCCACAGCATA
CATTTTTATACAAGGCTAGAATGGTCTTAAAGTGCTAAGGCTTAACTGCAGCTAATAACT
TGTATTACTGGGTCAGTTAATTCACTAAGAGGAAAAGTGATTCTGGACACAACTTAGGAA
AATACTGTTTTGGATTCTTTAAGCAGTCTTTGTACTTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)