Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6376 cluster # 6376       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6376#0 length = 324 sequences # 4  

consensusID : consensus_6376#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 324
fasta sequence
                              [TACTGCTAATACGTTGAGCAAGAAAAGCATTAGCTGCCAATTTAGATAATTCTGATGACCACGTCGATGTAATAAGTATACGTTCGGCTGGTACCCAATGTAAATATATCCAACGTAACATTTCAATTGCTAATTTACCAGATGATGAATGTGAATCACCACCAATTAAAATACGATCTGGATTACATAAATCATTGACAGCAGTACCTTCAGCTAAAAATTCCGGGTTCGATAAGACTACGAATTCATTAAGCTTATTATTA-TTAGTTGTTATTGTAAGATTGGATAGGCTACGACGAGACTTAG-CTTCCAATTGAAGTATTG]

[+] EMBL CD200174             [TACTGCTAATACGTAGAGCAAGAAAAGCATTAGCTGCCAATTTAGATAATTCTGATGACCACGTCGATGTAATAAGTATACGTTCGGCTGGTACCCAATGTAAATATATCCAACGTAACATTTCAATTGCTAATTTACCAGATGATGAATGTGAATCACCACCAATTAAAATACGATCTGGATTACATAAATCATTGACAGCAGTACCTTCAGCTAAAAATTCCGGGTACGATAAGACTACGAATTCATTAAGCTTATTATTATTTAGTCGTGATTGTAAGATTGGATAGGCTACGACGATACTTAG CTTCCATTTGAAGTATa ]
[+] EMBL CD200223             [TACTGCTAATACGTTGAGCAAGAAAAGCATTAGCTGCCAATTTAGATAATTCTGATGACCACGTCGATGTAATAAGTATACGTTCGGCTGGTACCCAATGTAAATATATCCAACGTAACATTTCAATTGCTAATTTACCAGATGATGAATGTGAATCACCACCAATTAAAATACGATCTGGATTACACAAATCATTGACAGCAGTACCTTCAGCTAAAAATACCGGGTTCGATAAGACTACGAATTCATTAAGCTTATTATTA TAAGTTGTTATTGTAAGATTGGATAGGCTACGACGAGACTTAGNCTT CAATTGAAGTATT ]
[-] EMBL CD200211             [ ACTGCTAATACGTTGAGCAAGAAAAGCATTAGCTGCCAATTTAGATAATTCTGATGACCACGTCGATGTAATAAGTATACGTTCGGCTGGTACCCAATGTAAATAAATCCAACGTAACATTTCAATTGCTAATTTACCAGATGATGAATGTGAATCACCACCAATTAAAATACGATCTGGATTACATAAATCATTGACAGCAGTACCTTCAGCTAAAAATTCCGGGTTCGATAAGACTACGAATTCATTAAGCTTATTATTA TTAGTTGTTATTGTAAGATTGGATAGGCTACGACGAGACTTAG CTTCAAATTGAAGTATTG]
[-] EMBL CD200234             [ ACTGCTAATACGTTGAGCAAGAAAAGCATTAGCTGCCAATTTAGATAATTCTGATGACCACGTCGATGTAATAAGTATACGTTCGGCTGGTACCCAATGTAAATATATCCAACGTAACATTTCAATTGCTAATTTACCAGATGATGAATGTGAATCACCACCAATTAAAATACGATCTGGATTACATAAATCATTGACAGCAGTACCTTCAGCTAAAAATTCCGGGTTCGATAAGACTACGAATTCATTAAGCTTATTATTA TTAGTTGTTATTGTAAGATTGGATAGGCTACGACGAGACTTAG CTTCAAATTGAAGTATTG]


>consensus_6376#0 TACTGCTAATACGTTGAGCAAGAAAAGCATTAGCTGCCAATTTAGATAATTCTGATGACC ACGTCGATGTAATAAGTATACGTTCGGCTGGTACCCAATGTAAATATATCCAACGTAACA TTTCAATTGCTAATTTACCAGATGATGAATGTGAATCACCACCAATTAAAATACGATCTG GATTACATAAATCATTGACAGCAGTACCTTCAGCTAAAAATTCCGGGTTCGATAAGACTA CGAATTCATTAAGCTTATTATTATTAGTTGTTATTGTAAGATTGGATAGGCTACGACGAG ACTTAGCTTCCAATTGAAGTATTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)