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Schistosoma mansoni
cluster # 6378 cluster # 6378       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6378#0 length = 984 sequences # 4  

consensusID : consensus_6378#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 984
fasta sequence
                              [AGAGCGCGTGAAAAAAGGGAACGTCATGGTGTGTTACTATGACTCTCAGCTCGATCCATCACATTTCCGTTTGATTCAAGCATCTGTTCCTGAAGTTTTAAAGTGGTTCAGCGATTTGTCCGCTTCTAAGCGTGTGGAATTTGTTTGTGGCTTACTTCAGTTATCTACACCACCAGAGCTAAGGTTCTACGGCAGCTGTTTGGAAGAGATTGCCCGTCAAGATTACGAAAGTCTCCATGATTCTGAAATACAAGCAAATGCACCTATGGAAAATTATGGTGTTTTAACTTTGTATAATACTGTGCCATTGAATTCTAGTATTTCCACTTTGGTAACTCCGATTTCTATCCCGATTCCTCCCTCATTTACAATATTAAATAACAACCCAACATTGCGATCTAAACTTATTATCAGTCTTTCACTACTTAATTCTACAAATATCCCAGCAGCTACAAGTTATTTTGAAATGTTGATGGCTGATGAGAGCGACACACATTCACCGAATGATCCACAATTACCGACTGCCATATTTAAAACATCTTCGCTTGTAAAATGTAAATCGTCTAAGAGTGGGTCTGTTTCATCAGACGATAGTGATGATGAATTGTCTTCAGCAGACATTTTAAGGACTATTAACCCGCAAGTCTTAGATGAAATCATGCTCATTTATACACTTGCTGCATTTCATCCTGCTTTCTCTTTTGACCAGCGACAACGTTTGTATAAGCGTTTTATCCATTGTAAAAGCTTTATCTGACCACTCCTTAAAAATCACTCAACTCGCCAATCAGTATCCAGATCCAAATAAACATGCCCTTGGCGGGTGGACAAATCCCCCTCGGAAATCACAGTCTCCATCTAACTATAAACACCATTCCTGTCTAAATTTTCCTGCCAGGTCTAATGTTCCGCTGTGTCCTGCATCAAGACAATGTCGCTCTTCACGGTTACCGAAGCTCCATCAATCAAAACTCCAATAATAAT]

[+] EMBL CD185835             [AGAGCGCGTGAAAAAAGGGAACGTCATGGTGTGTTACTATGACTCTCAGCTCGATCCATCACATTTCCGTTTGATTCAAGCATCTGTTCCTGAAGTTTTAAAGTGGTTCAGCGATTTGTCCGCTTCTAAGCGTGTGGAATTTGTTTGTGGCTTACTTCAGTTATCTACACCACCAGAGCTAAGGTTCTACGGCAGCTGTTTGGAAGAGATTGCCCGTCAAGATTACGAAAGTCTCCATGATTCTGAAATACAAGCAAATGCACCTATGGAAAATTATGGTGTTTTAACTTTGTATAATACTGTGCCATTGAATTCTAGTATTTCCACTTTGGTAACTCCGATTTCTATCCCGATTCCTCCCTCATTTACAATATTAAATAACAACCCAACATTGCGATCTAAACTTATTATCAGTCTTTCACTACTTAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD184211             [                                                                                  TCTGTTCCTGAAGTTTTAAAGTGGTTCAGCGATTTGTCCGCTTCTAAGCGTGTAGAATTTGTTTGTGGCTTACTTCAGTTATCTACACCACCAGAGCTAAGGTTCTACGGCAGCTGTTTGGAAGAGATTGCCCGTCAAGATTACGAAAGTCTCCATGATTCTGAAATACAAGCAAATGCACCTATGGAAAATTATGGTGTTTTAACTTTGTATAATACTGTGCCATTGAATTCTAGTATTTCCACTTTGGTAACTCCGATTTCTATCCCGATTCCTCCCTCATTTACAATATTAAATAACAACCCAACATTGCGATCTAAACTTATTATCAGTCTTTCACTACTTAATTCTACAAATATCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD183218             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATCCCGATTCCTCCCTCATTTACAATATTAAATAACAACCCAACATTGCGATCTAAACTTATTATCAGTCTTTCACTACTTAATTCTACAAATATCCCAGCAGCTACAAGTTATTTTGAAATGTTGATGGCTGATGAGAGCGACACACATTCACCGAATGATCCACAATTACCGACTGCCATATTTAAAACATCTTCGCTTGTAAAATGTAAATCGTCTAAGAGTGGGTCTGTTTCATCAGACGATAGTGATGATGAATTGTCTTCAGCAGACATTTTAAGGACTATTAACCCGCAAGTCTTAGATGAAATCATGCTCATTTATACACTTGCTGCATTTCATCCTGCTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD064734             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGGGTCTGTTTCATCAGACGATAGTGATGATGAATTGTCTTCAGCAGACATTTTAGGGACTATTAACCCGCAAGTCTTAGATGAAATCATGCTCATTTATACACTTGCTGCATTTCATCCTGCTTTCTCTTTTGACCAGCGACAACGTTTGTATAAGCGTTTTATCCATTGTAAAAGCTTTATCTGACCACTCCTTAAAAATCACTCAACTCGCCAATCAGTATCCAGATCCAAATAAACATGCCCTTGGCGGGTGGACAAATCCCCCTCGGAAATCACAGTCTCCATCTAACTATAAACACCATTCCTGTCTAAATTTTCCTGCCAGGTCTAATGTTCCGCTGTGTCCTGCATCAAGACAATGTCGCTCTTCACGGTTACCGAAGCTCCATCAATCAAAACTCCAATAATAAT]


>consensus_6378#0 AGAGCGCGTGAAAAAAGGGAACGTCATGGTGTGTTACTATGACTCTCAGCTCGATCCATC ACATTTCCGTTTGATTCAAGCATCTGTTCCTGAAGTTTTAAAGTGGTTCAGCGATTTGTC CGCTTCTAAGCGTGTGGAATTTGTTTGTGGCTTACTTCAGTTATCTACACCACCAGAGCT AAGGTTCTACGGCAGCTGTTTGGAAGAGATTGCCCGTCAAGATTACGAAAGTCTCCATGA TTCTGAAATACAAGCAAATGCACCTATGGAAAATTATGGTGTTTTAACTTTGTATAATAC TGTGCCATTGAATTCTAGTATTTCCACTTTGGTAACTCCGATTTCTATCCCGATTCCTCC CTCATTTACAATATTAAATAACAACCCAACATTGCGATCTAAACTTATTATCAGTCTTTC ACTACTTAATTCTACAAATATCCCAGCAGCTACAAGTTATTTTGAAATGTTGATGGCTGA TGAGAGCGACACACATTCACCGAATGATCCACAATTACCGACTGCCATATTTAAAACATC TTCGCTTGTAAAATGTAAATCGTCTAAGAGTGGGTCTGTTTCATCAGACGATAGTGATGA TGAATTGTCTTCAGCAGACATTTTAAGGACTATTAACCCGCAAGTCTTAGATGAAATCAT GCTCATTTATACACTTGCTGCATTTCATCCTGCTTTCTCTTTTGACCAGCGACAACGTTT GTATAAGCGTTTTATCCATTGTAAAAGCTTTATCTGACCACTCCTTAAAAATCACTCAAC TCGCCAATCAGTATCCAGATCCAAATAAACATGCCCTTGGCGGGTGGACAAATCCCCCTC GGAAATCACAGTCTCCATCTAACTATAAACACCATTCCTGTCTAAATTTTCCTGCCAGGT CTAATGTTCCGCTGTGTCCTGCATCAAGACAATGTCGCTCTTCACGGTTACCGAAGCTCC ATCAATCAAAACTCCAATAATAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)