These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6392#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 942 fasta sequence [AGTGGGATAACAGAGAATAAAACTTCGGAAACTACAGAATTGACAAAAGAAAATATTAATGGTTCAGAGAAAGAAATTAAAACTTATAAATGTGTAACACTTGGAGCATTTGGTGGTTCAAAACATATTAGAATAGATATGAATGAAGTGAAACCAATAGGAAAGAATGAAGTTGCAATTGATGTACAAGCATGTGGTATTAACTTTCTTGATATAATGACAAGACAAGGTTTAATTGATCAAGCAATGAAACCTCCATTCACTTTGGGCTCTGAATGTACTGGAATTATTAGTGAAGTCGGTGAAAAAGTGACAACCTATAAGGTTGGTGATCCAGTTATAGTTCTACTTAACAATGGTGCTTGGAGTGAACGTCTTGTA-TTACCAATTATAGAAAAAGTTAATACAGATCAAACAAATTCAACAACACAATCTGAAGATGTTGAATGTACAGAGTCAAATGAATTTGGAATGATTAAGTCAATTATATTACCAAGACCTAAAACATTAGATGTTAATAAAGCTGCAATTATTAGTTTTGCTTATATTCCAGCTTATATATTAACTTATCATATACTTAATATTCATTCTGGTGATATAATTTTGATATTTTCAGCTGGTGGTGGAATTGGAACTGCTTTACGACAGTTAATGAAATTAATACCGAATGTAACCTTAATTGGTATTGCATCTAACGCAAAACATGAAAAAGTGACAAACATCTATGATATATTATTAAAACCTGATCAAAATTGTGTAACAGAAATTAAAAAGTTAGCTTTATCCTAATGGAATCGATGCAATTTTGGATTGTATAAGTGGACCAGATACAAATAAACTATATGGAACATTAAAACCTTTAGGAAAGCATGTAATTTATGGTATGTCAAACTTAGTTACTGGAGACAGGANAAACTTTCTCAACTTAGCANAACATTGGTT] [+] EMBL CD179949 [AGTGGGATAACAGAGAATAAAACTTCGGAAACTACAGAATTGACAAAAGAAAATATTAATGGTTCAGAGAAAGAAATTAAAACTTATAAATGTGTAACACTTGGAGCATTTGGTGGTTCAAAACATATTAGAATAGATATGAATGAAGTGAAACCAATAGGAAAGAATGAAGTTGCAATTGATGTACAAGCATGTGGTATTAACTTTCTTGATATAATGACAAGACAAGGTTTAATTGATCAAGCAATGAAACCTCCATTCACTTTGGGCTCTGAATGTACTGGAATTATTAGTGAAGTCGGTGAAAAAGTGACAACCTATAAGGTTGGTGATCCAGTTATAGTTCTACTTAACAATGGTGCTTGGAGTGAACGTCTTGTATTTACC ATTATAGA ] [-] EMBL CD146873 [ TTGATCAAGCAATGAAACCTCCATTCACTTTGGGCTCTGAATGTACTGGAATTATTAGTGAAGTCGGTGAAAAAGTGATAACCTATAAGGTTGGTGATCCAGTTATAGTTCTACTTAACAATGGTGCTTGGAGTGAACGTCTTGTA TTACCAATTATAGAAAAAGTTAATACAGATCAAACAAATTCAACAACACAATCTGAAGATGTTGAATGTACAGAGTCGAATGAATTTGGAATGATTAAGTCAATTATATTACCAAGACCTAAAACATTAGATGTTAATAAAGCTGCAATTATTAGTTTTGCTTATATTCCAGCTTATATATTAACTTATCATATACTTAATATTCATTCTGGTGATATAATTTTGATATT ] [+] EMBL CD118233 [ ttcactCAATGGTGCTTGGAGTGAACGTCTTGTA TTACCAATTATAGAAAAAGTTAATACAGATCAAACAAATTCAACAACACAATCTGAAGATGTTGAATGTACAGAGTCAAATGAATTTGGAATGATTAAGTCAATTATATTACCAAGACCTAAAACATTAGATGTTAATAAAGCTGCAATTATTAGTTTTGCTTATATTCCAGCTTATATATTAACTTATCATATACTTAATATTCATTCTGGTGATATAATTGTGATATTTTCAGCTGGTGGTGGAATTGGAACTGCTTTACGACAGTTAATGAAATTAATACCGAATGTAACCTTAATTGGTATTGCATCTAACGCAAAACATGAAAAAGTGACAAACATCTATGATATATTATTAAAACCTGATCAAAATTGTGTAACAGAAATTAAAAAGTTAGCTTTATCCTAATGGAATCGATGCAATTT ] [+] EMBL CD118667 [ AATACAGATCAAACAAATTCAACAACACAATCTGAAGATGTTGAATGTACCGAGTCAAATGAATTTGGAATGATTAAGTCAATTATATTACCAAGACCTAAAACATTAGATGTTAATAAAGCTGCAATTATTAGTTTTGCTTATATTCCAGCTTATATATTAACTTATCATATACTTAATATTCATTCTGGTGATATAATTTTGATATTTTCAGCTGGTGGTGGAATTGGAACTGCTTTAGGACAGTTAATGAAATTAATACCGAATGTAACCTTAATCGGTATTGCTTCTAAGGCAAAACATGAAAAGTTGACAAACATCTATGATATATTATTAGAACCTGATCAAGATTGTGTAACAGAAATTAAAA AGCTTTATCCTAATGGAATTGATGCAATTTTGGATTGTATAAGTGGACCAGATACAAATAAACTATATGGAACATTAAAACCTTTAGGAAAGCATGTAATTTATGGTATGTCAAACTTAGTTACTGGAGACAGGANAAACTTTCTCAACTTAGCANAACATTGGTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||