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Schistosoma mansoni
cluster # 6395 cluster # 6395       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6395#0 length = 452 sequences # 4  

consensusID : consensus_6395#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 452
fasta sequence
                              [CAGGTTTTCGTAATCCTGTTGTTAATTCAGTTGAAATGAGCTCAGATGGTTATTATCTAGCAGCTGTAACTGATAACAATCTTGTATGTATATGGCGTTATGCTCCACCGCAACAACAACAATACTCTCAAATAATTCAACAAACCACAACACCATCATTACATCAAACTACTACTATGCAACATAATAATAATCAATTAACAGCTATCAATAATTCTATGGTTACTGTTCCCAATGTTGCTAGCATAGTGGACGATGATACATCATCGTCAACGATAGCATGCATGGAGCTTTTAAACAATACTAATAATTCATCAATTGCTTTAAAATCTAGTGCCATAGAACTTGTTACTACCGGTCAACATTTGTTAGAATAAATATCATTATCATTATGATGATGTTATACTATTTGTTTTGTATTTTTGTTATTATTGTACCATGATTTATGTAGA]

[+] EMBL CD122290             [CAGGTTTTCGTAATCCTGTTGTTAATTCAGTTGAAATGAGCTCAAATGGTTGTTATCTAGCAGCTGTAACTGATAACAATCTTGTATGTATATGGCGTTATGCTCCACCGCAACAACAACAATACTCTCAAATAATTCAACAAACCACAACACCATCATTACATCAAACTACTACTATGCAACATAATAATAATCAATTAACAGCTATCAATAATTCTATGGTTACTGTTCCCAATGTTGCTAGCATAGTGGACGATGATACATCATCGTCAACGATAGCATGCATGGAGCTTTTAAACAATACTAATAATTCATCAATTGCTTTAAAATCTAGTGCCATAGAACTTGTTACTACCGGTCAACATTTGTTAGAATAAATATCATTATCATTATGATGATGTTATACTATTTGTTTTGTATTATTGTTATTATTGTACCATGATTTATGTAG ]
[+] EMBL CD122282             [CAGGTTTTCGTAATCCTGCTGTTAATTCAGTTGAAATGAGCTCAGATGGTTATTATCTAGCAGCTGTAACTGATAACAATCTTGTATGTATATGGCGTTATGCTCCACCGCAACAACAACAATACTCTCAAATAATTCAACAAACCACAACACCATCATTACATCAAACTACTACTATGCAACATAATAATAATCAATTAACAGCTATCAATAATTCTATGGTTACTGTTCCCAATGTTGCTAGCATAGTGGACGATGATACATCATCGTCAACGATAGCATGCATGGAGCTTTTAAACAATACTAATAATTCATCAATTGCTTTAAAATCTAGTGCCATAGAACTTGTTACTACCGGTCAACATTTGTTAGAATAAATATCATTATCATTATGATGATGTTATACTATTTGTTTTGTATTTTTGTTATTATTGTACCATGATTTATGTAG ]
[-] EMBL CD122369             [ AGGTTTTCGTAATCCTGTTGTTAATTCAGTTGAAATGAGCTCAGATGGTTATTATCTAGCAGCTGTAACTGATAACAATCTTGTATGTATATGGCGTTATGCTCCACCGCAACAACAACAATACTCTCAAATAATTCAACAAACCACAACACCATCATTACATCAAACTACTACTATGCAACATAATAATAATCAATTAACAGCTATCAATAATTCTATGGTTACTGTTCCCAATGTTGCTAGCATAGTGGACGATGATACATCGTCGTCAACGATAGCATGCATGGAGCTTTTAAACAATACTAATAATTCATCAATTGCTTAAAAATCTAGTGCCATAGAACTTGTTACTACCGGTCAACATTTGTTAGAATAAATATCATTATCATTATGATGATGTTATACTATTTGTTTCGTATTTTTGTTATTATTGTACCATGATTTATGTAGA]
[-] EMBL CD122339             [ AGGTTTTCGTAATCCTGTTGTTAATTCAGTTGAAATGAGCTCAGATGGTTATTATCTAGCAGCTGTAACTGATAACAATCTTGTATGTATATGGCGTTATGCTCCACCGCAACAACAACAATACTCTCAAATAATTCAACAAGCCACAACACCATCATTACATCAAACTACTACTATGCAACATAATAATAATCAATTAACAGCTATCAATAATTCTACGGTTACTGTTCCCAATGTTGCTAGCATAGTGGACGATGATACATCATCGTCAACGATAGCATGCATGGAGCTTTTAAACAATACTAATAATTCATCAATTGCTTTAAAATCTAGTGCCATAGAACTTGTTACTACCGGTCAACATTTGTTAGAATAAATATCATTATCATTATGATGATGTTATACTATTTGTTTTGTATTTTTGTTATTATTGTACCATGATTTATGTAGA]


>consensus_6395#0 CAGGTTTTCGTAATCCTGTTGTTAATTCAGTTGAAATGAGCTCAGATGGTTATTATCTAG CAGCTGTAACTGATAACAATCTTGTATGTATATGGCGTTATGCTCCACCGCAACAACAAC AATACTCTCAAATAATTCAACAAACCACAACACCATCATTACATCAAACTACTACTATGC AACATAATAATAATCAATTAACAGCTATCAATAATTCTATGGTTACTGTTCCCAATGTTG CTAGCATAGTGGACGATGATACATCATCGTCAACGATAGCATGCATGGAGCTTTTAAACA ATACTAATAATTCATCAATTGCTTTAAAATCTAGTGCCATAGAACTTGTTACTACCGGTC AACATTTGTTAGAATAAATATCATTATCATTATGATGATGTTATACTATTTGTTTTGTAT TTTTGTTATTATTGTACCATGATTTATGTAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)