Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6396 cluster # 6396       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6396#0 length = 774 sequences # 4  

consensusID : consensus_6396#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 774
fasta sequence
                              [GTACTCAAATTTAAAACGTAAAAACACTATGCAAGTCTGGAAGGTTTTTTGAATGGACGTGACTAAAAGCTCTACGTACGACCACAAGTTTCTGAAATCTTTGGCATCTATCGAATGGCAGTGTGCAGTAGTTTTTTAGTCTTGGCCAACTCCTAGATCATTATGTAACTGGACAACAGGTATTTCACTGCTATGCACCGTGTATGTATCTGTACCTTGGTGACCAATATGCACCGTAATGCACTTGGAATGACTTATGAAAAACTGCCAAATTTTGACCATTTAGATCACTTTTCCAGGTCACCGTTGTTGACAGCAATATGTAAATCAAACCAGAATTTCACGGCCACTCTCGGCCGTACCAGGGCATTTGGGGGCACTTTATCAAATAGGTTACAGGATTGAATTCGACCCACTTAATTTAACACAGGCAACAGTATGGCTTAAATTCGAGTATATAAACAAGTTCTTAATAGATAAGTTATATATACAATCGATTGATTATTGAGAAGTGACCAATATCATTTATACCAAGTCTTTGTTAGCGTTGATCAAATTTCATCGATTGACTT-GCAATGTGATCACTAGTCTGACTCGATATCGCGTACACTGTTAGGTTGTAAGCTGGTGGTTTGAGATAATTGATAGGTAACCTTAGACTCAGTTTTCATGCTATTTGGCATTTGTCGGCAAAGTGTATCTGTGATATTAAGGGAACTGATACTTTCTGGCGGATTCGATCTCGTATCACTCAGCTTCACAGTCAGAGGCGTA]

[+] EMBL CD145216             [GTACTCAAATTTAAAACGTAAAAACACTATGCAAGTCTGGAAGGTTTTTTGAATGGACGTGACTAAAAGCTCTACGTACGACCACAAGTTTCTGAAATCTTTGGCATCTATCGAATGGCAGTGTGCAGTAGTTTTTTAGTCTTGGCCAACTCCTAGATCATTATGTAACTGGACAACAGGTATTTCACTGCTATGCACCGTGTATGTATCTGTACCTTGGTGACCAATATGCACCGTAATGCACTTGGGATGACTTATGAAAAACTGCCAAATTTTGACCATTTAGATCACTTTTCCAGGTCACCGTTGTTGACAGCAATATGTAAATCAAACCAGAATTTCACGGCCACTCTCGGCCGTACCAGGGCATTTGGGGGCACTTTATCAAATAGGTTACAGGATTGAATTCGACCCACTTAATTTAACACAGGCAACAGTATGGCTTAAATTCGAGTATATAAACAAGTTCTTAATAGATAAGTTATATATACAATCGATTGATTATTGAGAAGTGACCAATATCATTTATACCAAGTCTTTGTTAGCGTTGATCAAATTTCATCGATTGACTTNGC ATGTGATCACTANTCTGACTCGATATCGCGTACACTGGTAGGTTGTAAACTGGTGGTTTGAGATAATTGATAAGTAACCTTAAACTCATTTTNCATGCTATTGGGCATTGGTCGGCAAAATGTTTC GGGATATTAAAGG ACTGATACTTTCTGGC GATACAATCTC TATTACTCACCTTCA AGTCAAAGGCGTA]
[-] EMBL CD145307             [                                                                                                                                                                                       TTCACTGCTATGCACTGTGTATGTATCTGTACCTTGGTGACCAATATGCACCGTAATGCACTTGGAATGACTTATGAAAAACTGCCAAATTTTGACCATTTAGATCACTTTTCCAGGTCACCGTTGTTGACAGCAATATGTAAATCAAACCAGAATTTCACGGCCACTCTCGGCCGTACCAGGGCATTTGGGGGCACTTTATCAAATAGGTTACAGGATTGAATTCGACCCACTTAATTTAAC CAGGCAACAGTATGGCTTAAATTCGAGTATATAAACAAGTTCTTAATAGATAAGTTATATATACAATCGATTGATTATTGAGAAGTGGCCAATATCATTTATACCAAGTCTTTGTTAGCGTTGATCAAATTTCATCGATTGACTT GCAATGTGATCACTAGTCTGACTCGATATCGCGTACACCGTTAGGTTGTAAGCTGGTGGTTTGAGATAATTGATAGGTAACCTTAGACTCAGTTTTCATGCTATTTGGCATTTGTCGGCAAAGTGTATCTGTGATATTAAGGGAACTGATACTTTCTGGCGGATTCGATCTCGTATCACTCAGCTTCACAGTCAGAGGCG  ]
[-] EMBL CD145358             [                                                                                                                                                                                                                          GGTGACCAATATGCACCGTAATGCACTTGGAATGACTTATGAAAAACTGCCAAATTTTGACCATTTAGATCACTTTTCCAGGTCACCGTTGTTGACAGCAATATGTAAATCAAACCAGAATTTCACGGCCACTCTCGGCCGTACCAGGGCATTTGGGGGCACTTTATCAAATAGGTTACAGGATTGAATTCGACCCACTTAATTTAACACAGGCAACAGTATGGCTTAAATTCGAGTATATAAACAAGTTCTTAATAGATAAGTTATATATACAATCGATTGATTATTGAGAAGTGACCAATATCATTTATACCAAGTCTTTGTTAGCGTTGATCAAATTTCATCGATTGACTT GCAATGTGATCACTAGTCTGACTCGATATCGCGTACACTGTTAGGTTGTAAGCTGGTGGTTTGAGATAATTGATAGGTAACCTTAGACTCAGTTTTCATGCTATTTGGCATTTGTCGGCAAAGTGTATCTGTGATATTAAGGGAACTGATACTTTCTGGCGGATTCGATCTCGTATCACTCAGCTTCACAGTCAGAGGCG  ]
[-] EMBL CD145250             [                                                                                                                                                                                                                                        ACCGTAATGCACTTGGAATGACTTATGAAAAACTGCCANATTTTGACCATTTAGATCACTTTTCCAGGTCACCGTTGTTGACAGCAATATGTAAATCAAACCAGAATTTCACGGCCACTCTCGGCCGTACCAGGGCATTTGGGGGCACTTTATCAAATAGGTTACAGGATTGAATTCGACCCACTTAATTTAACACAGGCAACAGTATGGCTTAAATTCGAGTATATAAACAAGTTCTTAATAGATAAGTTATATATACAATCGATTGATTATTGAGAAGTGACCAATATCATTTATACCAAGTCTTTGTTAGCGTTGATCAAATTTCATCGATTGACTT GCAATGTGATCACTAGTCTGACTCGATATCGCGTACACTGTTAGGTTGTAAGCTGGTGGTTTGAGATAATTGATAGGTAACCTTAGACTCAGTTTTCATGCTATTTGGCATTTGTCGGCAAAGTGTATCTGTGATATTAAGGGAACTGATACTTTCTGGCGGATTCGATCTCGTATCACTCAGCTTCACAGTCAGAGGCGTt]


>consensus_6396#0 GTACTCAAATTTAAAACGTAAAAACACTATGCAAGTCTGGAAGGTTTTTTGAATGGACGT GACTAAAAGCTCTACGTACGACCACAAGTTTCTGAAATCTTTGGCATCTATCGAATGGCA GTGTGCAGTAGTTTTTTAGTCTTGGCCAACTCCTAGATCATTATGTAACTGGACAACAGG TATTTCACTGCTATGCACCGTGTATGTATCTGTACCTTGGTGACCAATATGCACCGTAAT GCACTTGGAATGACTTATGAAAAACTGCCAAATTTTGACCATTTAGATCACTTTTCCAGG TCACCGTTGTTGACAGCAATATGTAAATCAAACCAGAATTTCACGGCCACTCTCGGCCGT ACCAGGGCATTTGGGGGCACTTTATCAAATAGGTTACAGGATTGAATTCGACCCACTTAA TTTAACACAGGCAACAGTATGGCTTAAATTCGAGTATATAAACAAGTTCTTAATAGATAA GTTATATATACAATCGATTGATTATTGAGAAGTGACCAATATCATTTATACCAAGTCTTT GTTAGCGTTGATCAAATTTCATCGATTGACTTGCAATGTGATCACTAGTCTGACTCGATA TCGCGTACACTGTTAGGTTGTAAGCTGGTGGTTTGAGATAATTGATAGGTAACCTTAGAC TCAGTTTTCATGCTATTTGGCATTTGTCGGCAAAGTGTATCTGTGATATTAAGGGAACTG ATACTTTCTGGCGGATTCGATCTCGTATCACTCAGCTTCACAGTCAGAGGCGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)