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Schistosoma mansoni
cluster # 6418 cluster # 6418       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6418#0 length = 865 sequences # 4  

consensusID : consensus_6418#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 865
fasta sequence
                              [AGTAAACAATTGACTTGGAGTAAATTGATAACGCCAAATTAAAAAATTTCTTGTTAAACGGAAACAAGTTAAATAGGCTGACTGGAAGTCTGATGCATTGGAATTGTAACCTTGAGCAGATAATAATAATGCTCTTAAATAAATTACAAACTGTTGTCTTATCCAAGCATCTAAAATAGTTTGAGACGGAAATCTTAGTAAGGCTGTTTTTTGGATTAATGTGAGCTGTTCCAAAGTTTCTGCATCCAATTGGTCTAATCTATGGAAGCTATGGGATGTTACCAATTCGCCTTTTTTGGCAGACAATTGTTGGCAGTAGTCTATTTGTGCACCGTACCATGTATTGACAGTCATTACCAAATGATCAATAAACAATCTATCAATACGACTTAGCTGTAATGCACGGTTTAGCGGGACAGGCATAGAACGTGAGTTGACAGGATACATATCAGTAATGTTTTCTGAATTTATTTGAATGATTGGTTGTGATCTTTTGGGCAAAGAAAATGGTCGTGAAAAATTCGAAACTTTAGATCCAGTGTTTTGTGTATTCTTCTCACTATCAACATTAATGGAATAAGAAGTTTTCGTCAAATTTTCAGTCAGTGAGAGATTCGACATAGAATCTGTTTCTATTCCAAAGGCCGATTTTCCAAATGCACCGGTTAGTTCAGACAGATGTGGGAAGTAGTTTTCACAAATATCCTTAACAGGCGATAAGGATGACACAAAAACCTCAGTTAGTTGTTTGTTCGATTGTAATAAGGGATTGGTTGCACCAGCTACAAAACCACGTACTGATCGATCGGTTAAGGTCAGACTCTGATTTCCAGATGATGGTAAATTAATACTTGATCTGGATGAC]

[+] EMBL CD183568             [AGTAAACAATTGACTTGGAGTAAATTGATAACGCCAAATTAAAAAATTTCTTGTTAAACGGAAACAAGTTAAATAGGCTGACTGGAAGTCTGATGCATTGGAATTGTAACCTTGAGCAGATAATAATAATGCTCTTAAATAAATTACAAACTGTTGTCTTATCCAAGCATCTAAAATAGTTTGAGACGGAAATCTTAGTAAGGCTGTTTTTTGGATTAATGTGAGCTGTTCCAAAGTTTCTGCATCCAATTGGTCTAATCTATGGAAGCTATGGGATGTTACCAATTCGCCTTTTTTGGCAGACAATTGTTGGCAGTAGTCTATTTGTGCACCGTACCATGTATTGACAGTCATTACCAAATGATCAATAAACAATCTATCAATACGACTTAACTGTAATGCACGGTTTAGCGGGACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD121686             [                                                                                                                                                                                                                      ATTAATGTGAGCTGTTCCAAAGTTTCTGCATCCAATTGGTCTAATCTATGAAAGCTATGGGATGTTACCAATTCGCCTTTTTTGGCAGACAATTGTTGGCAGTAGTCTATTTGTGCACCGTACCATGTATTGACAGTCATTACCAAATGATCAATAAACAATCTATCAATACGACTTAGCTGTAATGCACGGTTTAGCGGGACAGGCATAGAACGTGAGTTGACAGGATACATATCAGTAATGTTTTCTGAATTTATTTGGATGATTGGTTGTGATCTTTTGGGCAAAGAAAATGGTCGTGAAAAATTCGAAACTTTAGATCCAGTGTTTTGTGTATTCTTCTCACTATCAACATTAATGGAATCAGAAGTTTTCGTCAAATTTTCAGTCAGTGAGAGATTCGACATAGAATCTGTTT                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD121661             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTATTTGTGCACCGTACCATGTATTGACAGTCATTACCAAATGATCAATAAAGAATCTATCAATACGACTTAGCTGTAATGCACGGTTTAGCGGGACAGGCATAGAACGTGAGTTGACAGGATACATATCAGTAATGTTTTCTGAATTTATTTGAATGATTGGTTGTGATCTTTTGGGCAAAGAAAATGGTCGTGAAAAATTCGAAACTTTAGATCCAGTGTTTTGTGTATTCTTCTCACTATCAACATTAATGGAATAAGAAGTTTTCGTCAAATTTTCAGTCAGTGAGAGATTCGACATAGAATCTGTTTCTATTCCAAAGGCCGATTTTCCAAATGCACCGGTTAGTTCAGACAGATGTGGGAAGTAGTTTTCACAAATATCCTTAACAGGCGATAAGGATGACACAAAAACCTCAGTTAGTTGTTTGTTCGATTG                                                                                                          ]
[+] EMBL CD121989             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTGAATGATTGGTTGTGATCTTTTGGGCAAAGAAAATGGTCGTGAAAAATTCGAAACTTTAGATCCAGTGTTTTGTGTATTCTTCTCACTATCAACATTAATGGAATAAGAAGTTTTCGTCAAATTTTCAGTCAGTGAGAGATTCGACATAGAATCTGTTTCTATTCCAAAGGCCGATTTTCCAAATGCACCGGTTAGTTCAGACAGATGTGGGAAGTAGTTTTCACAAATATCCTTAACAGGCGATAAGGATGACACAAAAACCTCAGTTAGTTGTTTGTTTGATTGTAATAAGGGATTGGTTGCACCAGCTACAAAACCACGTACTGATCGATCGGTTAAGGTCAGACTCTGATTTCCAGATGATGGTAAATTAATACTTGATCTGGATGAC]


>consensus_6418#0 AGTAAACAATTGACTTGGAGTAAATTGATAACGCCAAATTAAAAAATTTCTTGTTAAACG GAAACAAGTTAAATAGGCTGACTGGAAGTCTGATGCATTGGAATTGTAACCTTGAGCAGA TAATAATAATGCTCTTAAATAAATTACAAACTGTTGTCTTATCCAAGCATCTAAAATAGT TTGAGACGGAAATCTTAGTAAGGCTGTTTTTTGGATTAATGTGAGCTGTTCCAAAGTTTC TGCATCCAATTGGTCTAATCTATGGAAGCTATGGGATGTTACCAATTCGCCTTTTTTGGC AGACAATTGTTGGCAGTAGTCTATTTGTGCACCGTACCATGTATTGACAGTCATTACCAA ATGATCAATAAACAATCTATCAATACGACTTAGCTGTAATGCACGGTTTAGCGGGACAGG CATAGAACGTGAGTTGACAGGATACATATCAGTAATGTTTTCTGAATTTATTTGAATGAT TGGTTGTGATCTTTTGGGCAAAGAAAATGGTCGTGAAAAATTCGAAACTTTAGATCCAGT GTTTTGTGTATTCTTCTCACTATCAACATTAATGGAATAAGAAGTTTTCGTCAAATTTTC AGTCAGTGAGAGATTCGACATAGAATCTGTTTCTATTCCAAAGGCCGATTTTCCAAATGC ACCGGTTAGTTCAGACAGATGTGGGAAGTAGTTTTCACAAATATCCTTAACAGGCGATAA GGATGACACAAAAACCTCAGTTAGTTGTTTGTTCGATTGTAATAAGGGATTGGTTGCACC AGCTACAAAACCACGTACTGATCGATCGGTTAAGGTCAGACTCTGATTTCCAGATGATGG TAAATTAATACTTGATCTGGATGAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)