Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6428 cluster # 6428       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6428#0 length = 208 sequences # 4  

consensusID : consensus_6428#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 208
fasta sequence
                              [TAATTAGATACAAAACTCTTGGAATTTAAAAACCTTCTACAGTCTTCATTTATCCATAGATGAAGTTTTGAATTGTGTTCGAAAATGTAATGAATGTGCAGAATGTGTTAGCCCAACCTAAGAATTTTGGCCACCAACCTTTGCTATTGGTACCGTTTGATC---CTTCGGTGCTCCCAGATGATCCACAATGACATGATTGAATTAAGAG]

[+] EMBL CD145775             [TAATTAGATACAAAACTCTTGGAATTTAAAAACCTTCTACAGTCTTCATTTATCCATAGATGAAGTTTTGAATTGTGTTCGAAAATGTAATGAATGTGCAGAATGTGTTAGCCCAACCTAAGAATTTTGGCCACCAACCTCTGCTATTGGTACCGTTTGATCCTGCTTCGGTGCTCCCAGATGATCCACAATGACATGATTGAATTAAGAG]
[+] EMBL CD145859             [TAATTAGATACAAAACTCTTGGAATTTAAAAACCTTCTACAGTCTTCATTTATCCATAGATGAAGTTTTGAATTGTGTTCGAAAATGTAATGAATGTGCAGAATGTGTTAGCCCAACCTAAGAATTTTGGCCACCAACCTTTGCTATTGGTACCGTTTGATC   CTTCGGTGCTCCCAGATGATCCATAATGACATGATTGAATTAAGAG]
[+] EMBL CD145870             [TAATTAGATACAAAACTCTTGGAATTTAAAAACCTTCTACAGTCTTCATTTATCCATAGATGAAGTTTTGAATTGTGTTCGAAAATGTAATGAATGTGCAGAATGTGTTAGCCCAACCTAAGAATTTTGGCCACCAACCTTTGCTATTGGTACCGTTTGATC   CTTCGGTGCTCCCAGATGATCCACAATGACATGATTGAATTAAGAG]
[+] EMBL CD145746             [TAATTAGATACAAAACTCTTGGAATTTAAAAACCTTCTACAGTCTTCATTTATCCATAGATGAAGTTTTGAATTGTGTTCGAAAATGTAATGAATGTGCAGAATGTGTTAGCCCAACCTAAGAATTTTGGCCACCAACCTTTGCTATTGGTACCGTTTGATC   CTTCGGTGCTCCCAGATGATCCACAATGACATGATTGAATTAAGAG]


>consensus_6428#0 TAATTAGATACAAAACTCTTGGAATTTAAAAACCTTCTACAGTCTTCATTTATCCATAGA TGAAGTTTTGAATTGTGTTCGAAAATGTAATGAATGTGCAGAATGTGTTAGCCCAACCTA AGAATTTTGGCCACCAACCTTTGCTATTGGTACCGTTTGATCCTTCGGTGCTCCCAGATG ATCCACAATGACATGATTGAATTAAGAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)