These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6429#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 637 fasta sequence [TAGAATCATGGTTGGTCTAGCTTCTAATACCTCCAGGATCTTCATTATCACGTGA-TTTACTTCGCCTCCTGTATCTACCATTAGATGGTTCATTTCCCCAATCAATGAGTGGTGTTCATCGTATAAGTGCTCCTGTAACATCACTTAGTGATTTACGCACAGTGCTAGGAATGTCCGGATTTCGACGTTTAGTTTCATTATTAGATCCAAAAACTACCAAATGTCGATTAGCTTATGATCTATTAAATGCTGCTTTAGAACGTGATCAACGTCAGCGTCAAATGTTACAATTTACTCAAAGTATTAGCAAATATGATGCAAATAAAGGTTCATCATCATGTGCTCATTTTTCATCACGTTTAACTACTGAAGCAGATCTAGATAATTTATTTGAATTAATTGATGGATTGTTAACAACGGATCCTAATTCATGTGAAGATCCAAATGAATTCATTGATGCACAAAGTTTAATAGCTGGTATGCTGCATATTCTAGGACCAAGTCCTAAAAGTCTAGATCCAGATATATGTTTCAAATTGTTTACAAAAGCTCAATTACGTTTAGAACAAGCTGGACATGCAATTGTTCGTTTCAATTTTCCTGCACTTGTATTTCAGAGTCTTCATAATACAACATA] [+] EMBL CD167535 [TAGAATCATGGTTGGTCTAGCTTCTAATACCTCCAGGATCTTCATTATCACGTGA TTTACTTCGCCTCCTGTATCTACCATTAGATGGTTCATTTCCCCAATCAATGAGTGGTGTTCATCGTATAAGTGCTCCTGTAACATCACTTAGTGATTTACGCACAGTGCTAGGAATGTCCGGATTTCGACGTTTAGTTTCATTATTAGATCCAAAAACTACCAAATGTCGATTAGCTTATGATCTATTAAATGCTGCTTTAGAACGTGATCAACGTCAGCGTCAAATGTTACAATTTACTCAAAGTATTAGCAAATATGATGCAAATAAAGGTTCATCATCATGTGCTCATTTTTCATCACGTTTAACTACTGAAGCAGATCTAGATAATTTATTTGAATTAATTGATGGATTGTTAACAACGGATCCTAATTCATGTGAAGATCCAAATGAATTCATTGATGCACAAAGTTTAATAGCTGGTATGCTGCATATTCTAGGACCAAGTCCTAAAAGTCTAGATC ] [+] EMBL CD167544 [ tgATTATCACGTGACTTTACTTCGCCTCCTGTATCTACCATTAGATGGTTCATTTCCCCAATCAATGAGTGGTGTTCGTCGTATAAGTGCTCCTGTAACATCACTTAGTGATTTACGCACAGTGCTAGGAATGTCCGGATTTCGACGTTTAGTTTCATTATTAGATCCAAAAACTACCAAATGTCGATTAGCTTATGATCTATTAAATGCTGCTTTAGAACGTGATCAACGTCAGCGTCAAATGTTACAATTTACTCAAAGTATTAGCAAATATGATGCAAATAAAGGTTCATCATCATGTGCTCATTTTTCATCACGTTTAACTACTGAAGCAGATCTAGATAATTTATTTGAATTAATTGATGGATTGTTCACAACGGATCCTAATTCATGTGA ] [+] EMBL CD093232 [ TGGTTCATTTCCCCAATCAATGAGTGGTGTTCATCGTATAAGTGCTCCTGTAACATCACTTAGTGATTTACGCACAGTGCTAGGAATGTCCGGATTTCGACGTTTAGTTTCATTATTAGATCCAAAAACTACCAAATGTCGATCAGCTTATGATCTATTAAATGCTGC TTAGAACGTGATCAACGTCAGCGTCAAATGTTACAATTTACTCAAAGTATTAGCAAATATGATGCAAATAAAGGTTCATCATCATGTGCTCATTTTTCATCACGTTTAACTACTGAAGCAGATCTAGATAATTTATTTGAATTAATTGATGGATTGTTAACAACGGATCCTAATTCATGTGAAGATCCAAATGAATTCATTGATGCACAAAGTTTAATAGCTGGTATGCTGCATATTCTAGGACCAAGTCCT ] [-] EMBL CD167556 [ GTTTAGTTTCATTATTAGATCCAAGAACTACCAAATGTCGATTAGCTTATGATCTATTAAATGCTGCTTTAGAACGTGATCAACGTCAGCGTCAAATGTTACAATTTACTCAAAGTATTAGCAAATATGATGCAAATAAAGGTTCATCATCATGTACTCATTTTTCATCACGTTTAACTACTGAAGCAGATCTAGATAATTTATTTGAATTAATTGATGGATTGTTAACAACGGATCCTAATTCATGTGAAGATCCAAATGAATTCATTGATGCACAAAGTTTAATAGCTGGTACGCTGCATATTCTAGGACCAAGTCCTAAAAGTCTAGATCCAGATATATGTTTCAAATTGTTTACAAAAGCTCAATTACGTTTAGAACAAGCTGGACATGCAATTGTTCGTTTCAATTTTCCTGCACTTGTATTTCAGAGTCTTCATAATACAACATA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||