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Schistosoma mansoni
cluster # 6434 cluster # 6434       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6434#0 length = 535 sequences # 4  

consensusID : consensus_6434#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 535
fasta sequence
                              [GGGGGATAATGTAAAACGTTTGATGGATGATTAAATGTTTTATCATTTACATCAAGTATATCAGTTGGTAAATGTAATTCATTTGGTTGTGATTGGTGATAAGTAAATGTTGGTGGTTCGTTACAACGATGATGACGACCACAACCGGTATCTAATTCACCCAAACTTTTTAAATAACTTCCAATCCTATCATGAGGTGGTATTGTAGAGAATTGTTCCATTAGTGGATTAACATTAAATTGAGTAGATGAGGCAGAAGAAATATGAGTAGTTGTGGTATTGATAGTAGTAGTTGTTATTCTTGTTGTAGAAGTATTAGTAGTTTGAAATAAGTATGGATAGGAATGTGGATGGTGAATAACAGAATTTGAAGTAGGAGTTATTATTTGTGCATGGTGGAAATGTTGAGAATGATCATCAATTGGCATGGACACTTCAAACGGCACATTAAAATGCCAATCAACTTGACTAGGTGCACTTGATAATATCGAATTCATAGTAGCAATTACACCAACACCGGCAGCATTACTCATTA]

[+] EMBL CD117568             [GGGGGATAATGTAAAACGTTTGATGGATGATTAAATGTTTTATCATTTACATCAAGTATATCAGTTGGTAAATGTAATTCATTTGGTTGTGATTGGTGATAAGTAAATGTTGGTGGTTCGTTACAACGATGATGACGACCACAACCGGTATCTAATTCACCCAAACTTTTTAAATAACTTCCAATCCTATCATGAGGTGGTATTGTAGAGAATTGTTCCATTAGTGGATTAACATTAAATTGAGTAGATGAGGCAGAAGAAATATGAGTAGTTGTGGTATTGATAGTAGTAGTTGTTATTCTTGTTGTAGAAGTATTAGTAGTTTGAAATAAGTATGGATAGGAATGTGGATGGTGAATAACAGAATTTGAAGTAGGAGTTATTATTTGTGCATGGTGGAAATGTTGAGAATGATCATCAATTGGCATGGACACTTCAAACGGCACATTAAAATGCCAATCAACTTGACTAGGTGCACTTGATAATATCGAATTCATAGTAGCAATTACACCAACACCGGCAGCATTACTCATTA]
[+] EMBL CD117509             [GGGGGATAATGTAAAACGTTTGATGGATGATTAAATGTTTTATCATTTACATCAAGTATATCAGTTGGTAAATGTAATTCATTTGGTTGTGATTGGTGATAAGTAAATGTTGGTGGTTCGTTACAACGATGATGACGACCACAACCGGTATCTAATTCACCCAAACTTTTTAAATAACTTCCAATCCTATCATGAGGTGGTATTGTAGAGAATTGTTCCATTAGTGGATTAACATTAAATTGAGTAGATGAGGCAGAAGAAATATGAGTAGTTGTGGTATTGATAGTAGTAGTTGTTATTCTTGTTGTAGAAGTATTAGTAGTTTGAAATAAGTATGGATAGGAATGTGGATGGTGAATAACAGAATTTGAAGTAGGAGTTATTATTTGTGCATGGTGGAAATGTTGAGAATGATCATCAATTGGCATGGACACTTCAAACGGCACATTAAAATGCCCATCAACTTGACTAGGTGCACTTGATAA                                                  ]
[+] EMBL CD117562             [GGGGGATAATGTAAAACGTTTGATGGATGATATAATGTTTTATCATTTACATCAAGTATATCAGTTGGTAAATGTAATTCATTTGGTTGTGATTGGTGATAAGTAAATGTTGGTGGTTCGTTACAACGATGATGACGACCACAACCGGTATCTAATTCACCCAAACTTTTTAAATAACTTCCAATCCTATCATGAGGTGGTATTGTAGAGAATTGTTCCATTAGTGGATTAACATTAAATTGAGTACATGAGGCACAAGAAATATGAGTAGTTGTGGTATTGATAGTAGTAGTTGTTATTCTTGTTGTACAAGTATTAGTAGTTTGAAATAAGTATGGATAGGAATGTGGATGGTGAATAACAGAATTTGAAGTATGAGTTATTATTTGTGCATGGTGGAAATGTTGAGAATGATCATCAATTGGCATGGACACTTCAAACGGCACATTAAAATG                                                                                ]
[+] EMBL CD117557             [GGGGGATAATGTAAAACGTTTGATGGATGATTAAATGTTTTATCATTTACATCAAGTATATCAGTTGGTAAATGTAATTCATTTGGTTGTGATTGGTGATAAGTAAATGTTGGTGGTTCGTTACAACGATGATGACGACCACAACCGGTATCTAATTCACCCAAACTTTTTAAATAACTTCCAATCCTATCATGAGGTGGTATTGTAGAGAATTGTTCCATTAGTGGATTAACATTAAATTGAGTAGATGAGGCAGAAGAAATATGAGTAGTTGTGGTATTGATAGTAGTAGTTGTTATTCTTGTTGTAGAAGTATTAGTAGTTTGAAATAAGTATGGATAGGAATGTGGATGGTGAATAACAGAATTTGAAGTAGGAGTTATTATTTGTGCATGGTGGAAATGTTGAGAATGATCATCAATTGGCATGGACA                                                                                                      ]


>consensus_6434#0 GGGGGATAATGTAAAACGTTTGATGGATGATTAAATGTTTTATCATTTACATCAAGTATA TCAGTTGGTAAATGTAATTCATTTGGTTGTGATTGGTGATAAGTAAATGTTGGTGGTTCG TTACAACGATGATGACGACCACAACCGGTATCTAATTCACCCAAACTTTTTAAATAACTT CCAATCCTATCATGAGGTGGTATTGTAGAGAATTGTTCCATTAGTGGATTAACATTAAAT TGAGTAGATGAGGCAGAAGAAATATGAGTAGTTGTGGTATTGATAGTAGTAGTTGTTATT CTTGTTGTAGAAGTATTAGTAGTTTGAAATAAGTATGGATAGGAATGTGGATGGTGAATA ACAGAATTTGAAGTAGGAGTTATTATTTGTGCATGGTGGAAATGTTGAGAATGATCATCA ATTGGCATGGACACTTCAAACGGCACATTAAAATGCCAATCAACTTGACTAGGTGCACTT GATAATATCGAATTCATAGTAGCAATTACACCAACACCGGCAGCATTACTCATTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)