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Schistosoma mansoni
cluster # 6453 cluster # 6453       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6453#0 length = 642 sequences # 4  

consensusID : consensus_6453#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 642
fasta sequence
                              [CATCATTATCAGACTGTGTAACTAATGTCACCATCAATGATAAAACACTAACAAGGTCTATTACTTCAGCGACAATAACAGACACTTCTGACTTATTTCATCCTAATTCACCAATACTATCTTTATCTACACTATTATGTAACAACACTGAGACCAATAGTAACAATGATAATGTTAATAGTAGTGATTGTGAATCTCTTATTATTCCTAATATACCTGATACTAAATTGATGATGAAGACTCCTATCGTTTCTACTTCTACTATAATTACTACTACTTCGACTGTTACTAATCAACATCTTGTTCATAATGACTGTAAACGATTGATTACATCATCTTCATCACCATTTTGTTTCAGTCAGTTGGTTAATAATAATAATTCACAAAA-TTTCCCAAGTAAACGTCAATGTATACGTCATTCCGACGATATAAATAATATCAATAATAGCACTGTGAATAATAATAATACTACTAATAATTTACCACCCATTTTAATTACACCGGATTCAAAGAAAAATCATGCCAATGAACATAATAATGAATTATTCTATGAAAATTTGCCAAGCTGTAAATTGTTTGAAAGGTAATACTAATAAAGATTCATGTTGCAACATGCATTGCAAATGGATGCATGCCTGCATG]

[+] EMBL CD096837             [CATCATTATCAGACTGTGTAACTAATGTCACCATCAATGATAAAACACTAACAAGGTCTATTACTTCAGCGACAATAACAGACACTTCTGACTTATTTCATCCTAATTCACCAATACTATCTTTATCTACACTATTATGTAACAACACTGAGACCAATAGTAACAATGATAATGTTAATAGTAGTGATTGTGAATCTCTTATTATTCCTAATATACCTGATACTAAATTGATGATGAAGACTCCTATCGTTTCTACTTCTACTATAATTACTACTACTTCGACTGTTACTAATCAACATCTTGTTCATAATGACTGTAAACGATTGATTACATCATCTTCATCACCATTTTGTTTCAGTCAGTTGGTTAATAATAATAATTCACAAAA TTTCCCAAGTAAACGTCAATGTATACGTCATTCCGACGATATAAATAATATCAATAATAGCACTGTGAATAATAATAATACTACTAATAATTTACCACCCATTTTAATTACACCGGATTCAAAGAAAAATCATGCCAATGAA                                                                                                                ]
[+] EMBL CD096878             [CATCATTATCAGACTGTGTAACTAATGTCACCATCAATGATAAAACACTAACAAGGTCTATTACTTCAGCGACAATAACAGACACTTCTGACTTATTTCATCCTAATTCACCAATACTATCTTTATCTACACTATTATGTAACAACACTGAGACCAATAGTAACGATGATAATGTTAATAGTAGTGATTGTGAGTCTCTTATTATTCCTAATATACCTGATACTAAATTGATGATGAAGACTCCTATCGTTTCTACTTCTACTATAATTACTACTACTTCGACTGTTACTAATCAACATCTTGTTCATAATGACTGTAAACGATTGATTACATCATCTTCATCACCATTTTGTTTCAGTCAGTTGGTTAATAATAATAATTCACAAAA TTTCCCAAGTAAACGTCAATGTATACGTCATTCCGACGATATAAATAATATCAATAATAGCACTGTGAATAATAATAATACTACTAATAATTTACCACCCATTTTAATTACACCGGATTCAAAGAAAAATC                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD096858             [CATCATTATCAGACTGTGTAACTAATGTCACCATCAATGATAAAACACTAACAAGGTCTATTACTTCAGCGACAATAACAGACACTTCTGACTTATTTCATCCTAATTCACCAATACTATCTTTATCTACACTATTATGTAACAACACTGAGACCAATAGTAACAATGATAATGTTAATAGTAGTGATTGTGAATCTCTTATTATTCCTAATATACCTGATACTAAATTGATGATGAAGACTCCTATCGTTTCTACTTCTACTATAATTACTACTACTTCGACTGTTACTAATCAACATCTTGTTCATAATGACTGTAAACGATTGATTACATCATCTTCATCACCATTTTGTTTCAGTCAGTTGGTTAATAATAATAATTCACAAAA TTTCCCAAGTAAACGTCAATGTATACGTCATTCCGACGATATAAATAATATCAATAATAGCACTGTGAATAATAATAATACTACTAATAATTTACCACCCATTTTAAT                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD065283             [                                                                                                                                                             TAGTAACAATGATAATGTTAATAGTAGTGATTGTGAATCTCTTATTATTCCTAATATACCTGATACTAAATTGATGATGAAGACTCCTATCGTTTCTACTTCTACTATAATTACTACTACTTCGACTGTTACTTATCAACATCTTGTTCATAATGACTGTAAACGATTGATTACATCATCGTCATCACTATTTTGTTTCAGTCAGTTGGTTAATAATAATAATTCACAAAAGTTGCCCAAGTAAACGTCAATGTATACGTCATTCCGACGATATAAATAATATCAATAATAGCACTGTGAATAATAATAATACTACTAATAATTTACCACCCATTTTAATTACACCGGATTCAAAGAAAAATCATGCCAATGAACATAATAATGAATTATTCTATGAAAATTTGCCAAGCTGTAAATTGTTTGAAAGGTAATACTAATAAAGATTCATGTTGCAACATGCATTGCAAATGGATGCATGCCTGCATG]


>consensus_6453#0 CATCATTATCAGACTGTGTAACTAATGTCACCATCAATGATAAAACACTAACAAGGTCTA TTACTTCAGCGACAATAACAGACACTTCTGACTTATTTCATCCTAATTCACCAATACTAT CTTTATCTACACTATTATGTAACAACACTGAGACCAATAGTAACAATGATAATGTTAATA GTAGTGATTGTGAATCTCTTATTATTCCTAATATACCTGATACTAAATTGATGATGAAGA CTCCTATCGTTTCTACTTCTACTATAATTACTACTACTTCGACTGTTACTAATCAACATC TTGTTCATAATGACTGTAAACGATTGATTACATCATCTTCATCACCATTTTGTTTCAGTC AGTTGGTTAATAATAATAATTCACAAAATTTCCCAAGTAAACGTCAATGTATACGTCATT CCGACGATATAAATAATATCAATAATAGCACTGTGAATAATAATAATACTACTAATAATT TACCACCCATTTTAATTACACCGGATTCAAAGAAAAATCATGCCAATGAACATAATAATG AATTATTCTATGAAAATTTGCCAAGCTGTAAATTGTTTGAAAGGTAATACTAATAAAGAT TCATGTTGCAACATGCATTGCAAATGGATGCATGCCTGCATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)