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Schistosoma mansoni
cluster # 6465 cluster # 6465       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6465#0 length = 1034 sequences # 4  

consensusID : consensus_6465#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1034
fasta sequence
                              [ATCTATGGCTAAATGTAATAAAGAACTTTTATCAATATAGTGTGAAATCGAGCCGTATACAAATAACATAAATTTATCGAATGAAATGAGAACAGTTAATAAAATTGGGGATTCTTTTCTACTGTATGTTCATTCTTTGATTTGTCTTCGATTGGGAATAAAAGAAACTGCTACATCATTGTTAGTTCAAGCTATTAATTTAAATTTTTATCTTTGGCCTGCATGGTATGAATTGGTTGATCTTATAGAGAATAAAGAGAAAATGAATTGTTTAAATCTTCCTACAGATGATGAATGTTGGATGAGATATTTTTTTGAGGCTAAGGTGTTTTTGAAACTACATGAAGGCGAAAGAGCTTTAGAAATTCTATTAAAACTCTCGGAAAGTGGATTTAGTAGAAGTCACAATTTGCAAGCCGAAATCGGCTTAGCATACAATGAATTACGCGCTATGGAATTGGCTAGGAAACAATTCAAACAGTTATTCAATGCTTGCCCTTGTCGATTAGACAACGTGGATACTTATTCAAATGTTCTATTTGTATGTGAAGATTCAAATGAACTGGCTTATTTAGCACATCATTGCGTTAATTTAGATAGATATCGTGCAGAGACTTGTTGTGTTGTCGGAAACTTTTTTGGACTGCGTGGACAACATGAAAAAGCGGTTATTTATTTTCGGCGTGCTCTTAAATTAAAACCAGCTTATTCATTAGTCTGGACATTAATTGGTCATGAATTTATGGAACTTCGAAATACAAATGCTGCAATACATGCTTATAGACAAGCACTTGTTTATAATCGACATGATTACCGTGCATGGTATGGTCTTGGGCAAATGTATGAAGTATTAAATTTGCCATCATTTTCACTTTATTATTATAGAGAAGCTCAGTATCTTATGCCTACAGATTCACGTTTAATTGTAGCTTTGGGAGAGATTTATGGCAGACTTAAAAGATTTGATGAAGCTAAAAAGTGTTATTGGCGTGCATATTGTGTTGGTGATATAGAAGGTGAAGCATTGATGCGAT]

[-] EMBL CD118067             [ATCTATGGCTAAATGTAATAAAGAACTTTTATCAATATAGTGTGAAATCGAGCCGTATACAAATAACATAAATTTATCGAATGAAATGAGAACAGTTAATAAAATTGGGGATTCTTTTCTACTGTATGTTCATTCTTTGATTTGTCTTCGATTGGGAATAAAAGAAACTGCTACATCATTGTTAGTTCAAGCTATTAATTTAAATTTTTATCTTTGGCCTGCATGGTATGAATTGGTTGATCTTATAGAGAATAAAGAGAAAATGAATTGTTTAAATCTTCCTACAGATGATGAATGTTGGATGAGATATTTTTTTGAGGCTAAGGTGTTTTTGAAACTACATGAAGGCGAAAGAGCTTTAGAAATTCTATTAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD135782             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGGATGAGATATTTTTTTGAGGCTAAGGTGTTTTTGAAACTACATGAAGGCGAAAGAGCTTTAGAAATTCTATTGAAACTCTCGGAAAGTGGATTTAGTAGAAGTCACAATTTGCAAGCCGAAATCGGCTTAGCATACAATGAATTACGCGCTATGGAATTGGCTAGGAAACAATTCAAACAGTTATTCAATGCTTGCCCTTGTCGATTAGACAACGTGGATACTTATTCAAATGTTCTATTTGTATGTGAAGATTCAAATGAACTGGCTTATTTAGCACATCATTGCGTTAATTTAGATAGATATCGTGCAGAGACTTGTTGTGTTGTCGGAAACTTTTTTGGACTGCGTGGACAACATGAAAAAGCGGTTATTTATTTTCGGCGTGCTCTTAAATTAAAACCAGCTTATTCATTAGTCTGGACATTAATTGGTCATGAATTTATGGAACTTCGAAATACAAATGCTGCAATACATGCTTATAGACAAGCACTTGTTTATAATCGACATGATTACCGTGCATGGTATGGTCTTGGGCAAATGTATGAAGTATTAAATTTGCCAT                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD163424             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTTAGTAGAAGTCACAATTTGCAAGCCGAAATCGGCTTAGCATACAATGAATTACGCGCTATGGAATTGGCTAAGAAACAATTCAAACAGTTATTCAATGCTTGCCCTTGTCGATTAGACAACGTGGATACTTATTCAAATGTTTTATTTGTATGTGAAGATTCAAATGAACTGGCTTATTTAGCACATCATTGCGTTAATTTAGATAGATATCGTGCAGAGACTTGTTGTGTTGTCGGAAACTTTTTTGGACTGCGTGGACAACATGAAAAAGCGGTTATTTATTTTCGGCGTGCTCTTAAATTAAAACCAGCTTATTCATTAGTCTGGACATTAATTGGTCATGAATTTATGGAACTTCGAAATACAAATGCTGCAATACATGCTTATAGACCAGCACTTGTTTATAATCGACATGATTACCGTGCATGATATGGTCTTGGGCCAATGTATGAAG                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD118929             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATTTAGATAGATATCGTGCAGAGACTTGTTGTGTTGTCGGAAACTTTTTTGGACTGCGTGGACAACATGAAAAAGCGGTTATTTATTTTCGGCGTGCTCTTAAATTAAAACCAGCTTATTCATTAGTCTGGACATTAATTGGTCATGAATTTATGGAACTTCGAAATACAAATGCTGCAATACATGCTTATAGACAAGCACTTGTTTATAATCGACATGATTACAGTGCATGGTATGGTCTTGGGCAAATGTATGAAGTATTAAATTTGCCATCATTTTCACTTTATTATTATAGAGAAGCTCAGTATCTTATGCCTACAGATTCACGTTTAATTGTAGCTTTGGGAGAGATTTATGGCAGACTTAAAAGATTTGATGAAGCTAAAAAGTGTTATTGGCGTGCATATTGTGTTGGTGATATAGAAGGTGAAGCATTGATGCGAT]


>consensus_6465#0 ATCTATGGCTAAATGTAATAAAGAACTTTTATCAATATAGTGTGAAATCGAGCCGTATAC AAATAACATAAATTTATCGAATGAAATGAGAACAGTTAATAAAATTGGGGATTCTTTTCT ACTGTATGTTCATTCTTTGATTTGTCTTCGATTGGGAATAAAAGAAACTGCTACATCATT GTTAGTTCAAGCTATTAATTTAAATTTTTATCTTTGGCCTGCATGGTATGAATTGGTTGA TCTTATAGAGAATAAAGAGAAAATGAATTGTTTAAATCTTCCTACAGATGATGAATGTTG GATGAGATATTTTTTTGAGGCTAAGGTGTTTTTGAAACTACATGAAGGCGAAAGAGCTTT AGAAATTCTATTAAAACTCTCGGAAAGTGGATTTAGTAGAAGTCACAATTTGCAAGCCGA AATCGGCTTAGCATACAATGAATTACGCGCTATGGAATTGGCTAGGAAACAATTCAAACA GTTATTCAATGCTTGCCCTTGTCGATTAGACAACGTGGATACTTATTCAAATGTTCTATT TGTATGTGAAGATTCAAATGAACTGGCTTATTTAGCACATCATTGCGTTAATTTAGATAG ATATCGTGCAGAGACTTGTTGTGTTGTCGGAAACTTTTTTGGACTGCGTGGACAACATGA AAAAGCGGTTATTTATTTTCGGCGTGCTCTTAAATTAAAACCAGCTTATTCATTAGTCTG GACATTAATTGGTCATGAATTTATGGAACTTCGAAATACAAATGCTGCAATACATGCTTA TAGACAAGCACTTGTTTATAATCGACATGATTACCGTGCATGGTATGGTCTTGGGCAAAT GTATGAAGTATTAAATTTGCCATCATTTTCACTTTATTATTATAGAGAAGCTCAGTATCT TATGCCTACAGATTCACGTTTAATTGTAGCTTTGGGAGAGATTTATGGCAGACTTAAAAG ATTTGATGAAGCTAAAAAGTGTTATTGGCGTGCATATTGTGTTGGTGATATAGAAGGTGA AGCATTGATGCGAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)