cluster # 6481

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Schistosoma mansoni
cluster # 6481 cluster # 6481 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6481#0 length = 730 sequences # 4

consensusID : consensus_6481#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 730
fasta sequence

                              [ATTTAGCCCAGCAGATTTCAGCTATTTGTAATGCTGATGAAGACACAGCTAATGCCATCCTGCGTGAATATCCAAAATCAGAAGTTTGTTTTCGATGTCTCGGTATTAATGATGACACTATACAGGGTCTTCTTCGTATTCGGGGTATTGGCTTTCTACAATTGCTAGATATGCCTGACAGTGAAGTGAGAACAATCTTACAAAATTATGGAGACTATGGTGAGGAAGTTGATCATGTACTTGCTGGCCTTGCAAAAATACGCGGAAATATTGATCTTATTGAAAGTGACTTGGCATTTGAAGATGATACCAGGAACTTAATCAAATTGGTGATGCGTTTGTCTGATGATGATTCTCAAGTTGAAGAACTAAACAATATCCTTAACGCTCAAATTTACGAAGAACGAAAGGATCCTCGTATACCTCCTTTATATGTTACTGGTCCTGAAGATCCTCCTTTAGTTAACAAAGAAATTTCTGTACAGAACTCATCCCATAAAAATACTAAAGTAGTTGTTTGCTCTCATTTAGAGCACGACACATCCTGTGGAAATCTTACTGGCCATTCAAATCCGGATAATATTAATACATTTAAAATTGGTTGCGATGTCAATTACAATGGCCGTAGTTCGTTTACTTCCCCACATGCTTCCAGTTGTATCACCATAAATAGTCCACAGAACGTCACAAATAAATTTCATTCTGCAAAATTGTGCAAAACTGATTTTAA]

[+] EMBL CD169698             [ATTTAGCCCAGCAGATTTCAGCTATTTGTAATGCTGATGAAGACACAGCTAATGCCATCCTGCGTGAATATCCAAAATCAGAAGTTTGTTTTCGATGTCTCGGTATTAATGATGACACTATACAGGGTCTTCTTCGTATTCGGGGTATTGGCTTTCTACAATTGCTAGATATGCCTGACAGTGAAGTGAGAACAATCTTACAAAATTATGGAGACTATGGTGAGGAAGTTGATCATGTACTTGCTGGCCTTGCAAAAATACGCGGAAATATTGATCTTATTGAAAGTGACTTGGCATTTGAAGATGATACCAGGAACTTAATCAAATTGGTGATGCGTTTGTCTGATGATGATTCTCAAGTTGAAGAACTAAACAATATCCTTAACGCTCAAATTTACGAAGAACGAAAGGATCCTCGTATACCTCCTTTATATGTTACTGGTCCTGAAGATCCTCCTTTAGTTAACAAAGAAATTTCTGTACAGAACTCATCCCATAAAAATACTAAAGTAGTTGTTTGCTCTCATTTAGAGCACGACACATCCTGTGGAAATCTTACTGGCCATTCAAATCCGGATAATATTAATACA                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD169369             [                                                                                                                                              GGGTATTGGCTTTCTACAATTGCTAGATATGCCTGACAGTGAAGTGAGAACAATCTTACAAAATTATGGAGACTATGGTGAGGAAGTTGATCATGTACTTGCTGGCCTTGCAAAAATACGCGGAAATATTGATCTTATTGAAAGTGACTTGGCATTTGAAGATGATACCAGGAACTTAATCAAATTGGTGATGCGTTTGTCTGATGATGATTCTCAAGTTGAAGAACTAAACAATATCCTTAACGCTCAAATTTACGAAGAACGAAAGGATCCTCGTATACCTCCTTTATATGTTACTGGTCCTGAAGATCCTCCTTTAGTTAACAAAGAAATTTCTGTACAGAACTCATCCCATAAAAATACTAAAGTAGTTGTTTGCTCTCATTTAGAGCACGACACATCCTGTGGAAATCTTACTGGCCATTCAAATCCGGATAATATTAATACATTTAAAATTGGTTGCGATGTCAATTACAATGGCCGTAGTTCGTTTACTTCCCCACATGCTTCCAGTTGTATCACCATAAATAGTCCACAGAACGTCACAAATAAATTTCATTCTGCAAAATTGTGCAAAACTGATTTTAA]
[-] EMBL CD169402             [                                                                                                                                                                                                                            TGAGGAAGTTGATCATGTACTTGCTGGCCTGCCAAAAATACGCGGAAATATTGATCTTATTGAAAGTGACTTGGCATTTGAAGATGATACCAGGAACTTAATCAAATTGGTGATGCGTTTGTCTGATGATGATTCTCAAGTTGAAGAACTAAACAATATCCTTAACGCTCAAATTTACGAAGAACGAAAGGATCCTCGTATACCTCCTTTATATGTTACTGGTCCTGAAGATCCTCCTTTAGTTAACAAAGAAATTTCTGTACAGAACTCATCCCATAAAAATACTAAAGTAGTTGTTTGCTCTCATTTAGAGCACGACACATCCCGTGGAAATCTTACTGGCCATTCAAATCCGGATAATATTAATACATTTAAAATTGGTTGCGATGTCAATTACAATGGCCGTAGTTCGTTTACTTCCCCACATGCTTCCAGTTGTATCACCATAAATAGTCCACAGAACGTCACAAATAAATTTCATTCTGCAAAATTGTGCAAAACTGATTTTAA]
[-] EMBL CD169370             [                                                                                                                                                                                                                                                                               TGATCTTATTGAAAGTGACTTGGCATTTGAAGATGATACCAGGAACTTAATCAAATTGGTGATGCGTTTGTCTGATGATGATTCTCAAGTTGAAGAACTAAACAATATCCTTAACGCTCAAATTTACGAAGAACGAAAGGATCCTCGTATACCTCCTTTATATGTTACTGGTCCTGAAGATCCTCCTTTAGTTAACAAAGAAATTTCTGTACAGAACTCATCCCATAAAAATACTAAAGTAGTTGTTTGCTCTCATTTAGAGCACGACACATCCTGTGGAAATCTTACTGGCCATTCAAATCCGGATAATATTAATACATTTAAAATTGGTTGCGATGTCAATTACAATGGCCGTAGTTCGTTTACTTCCCCACATGCTTCCAGTTGTATCACCATAAATAGTCCACAGAACGTCACAAATAAATTTCATTCTGCAAAATTGTGCAAAACTGATTTTAA]




>consensus_6481#0
ATTTAGCCCAGCAGATTTCAGCTATTTGTAATGCTGATGAAGACACAGCTAATGCCATCC
TGCGTGAATATCCAAAATCAGAAGTTTGTTTTCGATGTCTCGGTATTAATGATGACACTA
TACAGGGTCTTCTTCGTATTCGGGGTATTGGCTTTCTACAATTGCTAGATATGCCTGACA
GTGAAGTGAGAACAATCTTACAAAATTATGGAGACTATGGTGAGGAAGTTGATCATGTAC
TTGCTGGCCTTGCAAAAATACGCGGAAATATTGATCTTATTGAAAGTGACTTGGCATTTG
AAGATGATACCAGGAACTTAATCAAATTGGTGATGCGTTTGTCTGATGATGATTCTCAAG
TTGAAGAACTAAACAATATCCTTAACGCTCAAATTTACGAAGAACGAAAGGATCCTCGTA
TACCTCCTTTATATGTTACTGGTCCTGAAGATCCTCCTTTAGTTAACAAAGAAATTTCTG
TACAGAACTCATCCCATAAAAATACTAAAGTAGTTGTTTGCTCTCATTTAGAGCACGACA
CATCCTGTGGAAATCTTACTGGCCATTCAAATCCGGATAATATTAATACATTTAAAATTG
GTTGCGATGTCAATTACAATGGCCGTAGTTCGTTTACTTCCCCACATGCTTCCAGTTGTA
TCACCATAAATAGTCCACAGAACGTCACAAATAAATTTCATTCTGCAAAATTGTGCAAAA
CTGATTTTAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case