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Schistosoma mansoni
cluster # 653 cluster # 653       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_653#0 length = 1009 sequences # 2  

consensusID : consensus_653#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1009
fasta sequence
                              [ACCACGGATAAATTAAGATTTTACCATACATTCTATTGGTCGCTTATCATACGACGGAAAGTTTTTGGCAGTTGGGAACATTCTGATTAGTTTTTTGATTGTCAATGCAATAGTTAGTAATCTACATAGAATCCAAATGGATGAATATATTGTTTATGCTAAACAGATTTTGTCGTGGCAGTTCACATCAGATTCACACGTATCGACAAAAATTGGTCAAAATTCAGTCCTAAGCATCAAAAAATGAAACAATTTAGATCCTTACTGTTAATGATATGAATTCATCGAACTCGCAACTGTAGTCGATTAACCATAAATTACAAAGACTTATTAATTGAAGAACCTATTTCAAAGTATTGCAGAAACCTATCCAACCAAAACGATGTATCAGTATCGCTTCGATAACAATTGTTAATTCCAAAAGGTTGAAAATATCTCGCTAAAAGTAATGAAAGATATGCTAATCAACATAGTTTATCATCAAGACCTGGATATTTCGTAGAACATTTGACAAAAACTCTATTGTAAAACCAACATTTTCTATGGAGTTTTTAGATTTTTCGAAAAAATTGTTCTACAGATATTACACAAAAATTTCTCAAGATGAAAGCATAGAAATAATAAGTTNTTTTAAACTGTTGGTTTGCTGAAAATCTTCCGACATTNTTCTACATTAATAATCTCAAATTTACATTATGAATGCTTTCACGGGATTTAATAGATATGCATGATAAATGATTTGTAGTTTATACATTTACCAGGTATTCTTTCTGAAAGCTTTCATTGAAAGGAATGAGACATTCATCACTGTTTAAAGCACCTTAAAACTTACGAATGTCATTGGTCTTACTGATCAAAAACAATATCAGAATTCAGGGTATGTGTAAGATGAAATCACATATTTTCATTTACAATAATAAAACGATGCTCAGAACTAAAGAAAAATAAACTGATCATTATTTCTTCTTGCAAAGTGTTAACATTTTACACATAAATACATGTTTCATTT]

[+] EMBL CD081265             [ACCACGGATAAATTAAGATTTTACCATACATTCTATTGGTCGCTTATCATACGACGGAAAGTTTTTGGCAGTTGGGAACATTCTGATTAGTTTTTTGATTGTCAATGCAATAGTTAGTAATCTACATAGAATCCAAATGGATGAATATATTGTTTATGCTAAACAGATTTTGTCGTGGCAGTTCACATCAGATTCACACGTATCGACAAAAATTGGTCAAAATTCAGTCCTAAGCATCAAAAAATGAAACAATTTAGATCCTTACTGTTAATGATATGAATTCATCGAACTCGCAACTGTAGTCGATTAACCATAAATTACAAAGACTTATTAATTGAAGAACCTATTTCAAAGTATTGCAGAAACCTATCCAACCAAAACGATGTATCAGTATCGCTTCGATAACAATTGTTAATTCCAAAAGGTTGAAAATATCTCGCTAAAAGTAATGAAAGATATGCTAATCAACATAGTTTATCATCAAGACCTGGATATTTCGTAGAACATTTGACAAAAACTCTATTGTAAAACCAACATTTTCTATGGAGTTTTTAGATTTTTCGAAAAAATTGTTCTACAGATATTACACAAAAATTTCTCAAGATGAAAGCATAGAAATAATAAGTTNTTTTAAACTGTTGGTTTGCTGAAAATCTTCCGACATTNTTCTACATTAATAATCTCAAATTTACATTATGAATGCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD075095             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCGCTTCGATAACAATGTTTAATTCCAAAAGGTTGAAAATATCTCGCTAAAAGTAATGAAAGATATGCTAATCAACATAGTTTATCATCAAGACCTGGATATTTCGTAGAACATTTGACAAAAACTCTATTGTAAAACCAACATTTTCTATGGAGTTTTTAGATTTTTCGAAAAAATTGTTCTACAGATATTACACAAAAATTTCTCAAGATGAAAGCATAGAAATAATAAGTTTTTTTAAACTGTTGGTTTGCTGAAAATCTTCCGACATTTTTCTACATTAATAATCTCAAATTTACATTATGAATGCTTTCACGGGATTTAATAGATATGCATGATAAATGATTTGTAGTTTATACATTTACCAGGTATTCTTTCTGAAAGCTTTCATTGAAAGGAATGAGACATTCATCACTGTTTAAAGCACCTTAAAACTTACGAATGTCATTGGTCTTACTGATCAAAAACAATATCAGAATTCAGGGTATGTGTAAGATGAAATCACATATTTTCATTTACAATAATAAAACGATGCTCAGAACTAAAGAAAAATAAACTGATCATTATTTCTTCTTGCAAAGTGTTAACATTTTACACATAAATACATGTTTCATTT]


>consensus_653#0 ACCACGGATAAATTAAGATTTTACCATACATTCTATTGGTCGCTTATCATACGACGGAAA GTTTTTGGCAGTTGGGAACATTCTGATTAGTTTTTTGATTGTCAATGCAATAGTTAGTAA TCTACATAGAATCCAAATGGATGAATATATTGTTTATGCTAAACAGATTTTGTCGTGGCA GTTCACATCAGATTCACACGTATCGACAAAAATTGGTCAAAATTCAGTCCTAAGCATCAA AAAATGAAACAATTTAGATCCTTACTGTTAATGATATGAATTCATCGAACTCGCAACTGT AGTCGATTAACCATAAATTACAAAGACTTATTAATTGAAGAACCTATTTCAAAGTATTGC AGAAACCTATCCAACCAAAACGATGTATCAGTATCGCTTCGATAACAATTGTTAATTCCA AAAGGTTGAAAATATCTCGCTAAAAGTAATGAAAGATATGCTAATCAACATAGTTTATCA TCAAGACCTGGATATTTCGTAGAACATTTGACAAAAACTCTATTGTAAAACCAACATTTT CTATGGAGTTTTTAGATTTTTCGAAAAAATTGTTCTACAGATATTACACAAAAATTTCTC AAGATGAAAGCATAGAAATAATAAGTTNTTTTAAACTGTTGGTTTGCTGAAAATCTTCCG ACATTNTTCTACATTAATAATCTCAAATTTACATTATGAATGCTTTCACGGGATTTAATA GATATGCATGATAAATGATTTGTAGTTTATACATTTACCAGGTATTCTTTCTGAAAGCTT TCATTGAAAGGAATGAGACATTCATCACTGTTTAAAGCACCTTAAAACTTACGAATGTCA TTGGTCTTACTGATCAAAAACAATATCAGAATTCAGGGTATGTGTAAGATGAAATCACAT ATTTTCATTTACAATAATAAAACGATGCTCAGAACTAAAGAAAAATAAACTGATCATTAT TTCTTCTTGCAAAGTGTTAACATTTTACACATAAATACATGTTTCATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)