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Schistosoma mansoni
cluster # 654 cluster # 654       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_654#0 length = 1028 sequences # 2  

consensusID : consensus_654#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1028
fasta sequence
                              [GGAATTACTCCACCCGTAATCGCTTTCCGTTTGGGCACACTTGGATTTTTGACTCCGTTTCCTTTCAAGATGTTTAGAAACCAAATGAAGAGTGTTCTTGAAGGTTCATCTTATTGTGTATTACGAACTCGGCTTTGTTGTCAAGTTATTCGTAGTAGTGTTATAAATCATAATAGCAATAATAATTTCGACATTCAAAATACCTCAACTACCAGTAGTTGTAGTAGTGAGAATCAACCTCAAGCATCTAACTATTCTAACGATATTGGTTCACGTTCCAGTACACCAGATACTGAATATCATTTCCTAAATGACCTAGTTATTGATCGTGGCCTTTCTCCATTTATCTGTGATCTCCTCATTAAGGTGAACGGTAGAGAAGTAACTACTGTGGAAGGCGATGGTCTTATTATAAGTACACCTACTGGAAGTACAGCTTATTCAATGACAGCTGGTGCTAGTATGGTACATCCATGTGTACCTGCTCTAGTATTAACACCAATCAATTCATTAGCTTTAAGTTCACGTGCTATTGTTCTTCCTACATCCATAAAATTAGAAATCTCCATTGCCAGTAAAGCTCGTTGTTCAACTGTACACTTTTCTTTTGATGGACGTTCACGACACTCAAATTTATTGCATAAAGGTGATGTTATCTTAGTGAGTGCTTCACCGTTCCCTGTTCCATGCCTTTGTAGTGAAAATGAGGTCACAGATTGGTTTTGTGGATTGGCACATTGTCTTAATTGGAATTTACGTCGACGTCAAAATGCAGTGATCAATTGTTGTCCTACAGACAAATAATTTGTAGAGATGCTATGTCTCGTTTCTACTTACTAATTCCTTCTGTATTTTGTCCTGCCTTTCCTCAGGTCTATTTTATTGTGATTTAATTTTCCTTAAGATTTTGTTTACTCAAAAAACTACTTTTTGAACATTATTTTTCTTACTTAATCGTAAAAGGTTTCCATGATAACTTATTCATGCTTCTAGTGTATATTTTCGCAATTTCCAATAACAAATTGTGG]

[+] EMBL CD081271             [GGAATTACTCCACCCGTAATCGCTTTCCGTTTGGGCACACTTGGATTTTTGACTCCGTTTCCTTTCAAGATGTTTAGAAACCAAATGAAGAGTGTTCTTGAAGGTTCATCTTATTGTGTATTACGAACTCGGCTTTGTTGTCAAGTTATTCGTAGTAGTGTTATAAATCATAATAGCAATAATAATTTCGACATTCAAAATACCTCAACTACCAGTAGTTGTAGTAGTGAGAATCAACCTCAAGCATCTAACTATTCTAACGATATTGGTTCACGTTCCAGTACACCAGATACTGAATATCATTTCCTAAATGACCTAGTTATTGATCGTGGCCTTTCTCCATTTATCTGTGATCTCCTCATTAAGGTGAACGGTAGAGAAGTAACTACTGTGGAAGGCGATGGTCTTATTATAAGTACACCTACTGGAAGTACAGCTTATTCAATGACAGCTGGTGCTAGTATGGTACATCCATGTGTACCTGCTCTAGTATTAACACCAATCAATTCATTAGCTTTAAGTTCACGTGCTATTGTTCTTCCTACATCCATAAAATTAGAAATCTCCATTGCCAGTAAAGCTCGTTGTTCAACTGTACACTTTTCTTTTGATGGACGTTCACGACACTCAAATTTATTGCATAAAGGTGATGTTATCTTAGTGAGTGCTTCACCGTTCCCTGTTCCATGCCTTTGTAGTGAAAATGAGGTCACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD075101             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TACATCCATGTGTACCTGCTCTAGTATTAACACCAATCAATTCATTAGCTTTAAGTTCACGTGCTATTGTTCTTCCTACATCCATAAAATTAGAAATCTCCATTGCCAGTAAAGCTCGTTGTTCAACTGTACACTTTTCTTTTGATGGACGTTCACGACACTCAAATTTATTGCATAAAGGTGATGTTATCTTAGTGAGTGCTTCACCGTTCCCTGTTCCATGCCTTTGTAGTGAAAATGAGGTCACAGATTGGTTTTGTGGATTGGCACATTGTCTTAATTGGAATTTACGTCGACGTCAAAATGCAGTGATCAATTGTTGTCCTACAGACAAATAATTTGTAGAGATGCTATGTCTCGTTTCTACTTACTAATTCCTTCTGTATTTTGTCCTGCCTTTCCTCAGGTCTATTTTATTGTGATTTAATTTTCCTTAAGATTTTGTTTACTCAAAAAACTACTTTTTGAACATTATTTTTCTTACTTAATCGTAAAAGGTTTCCATGATAACTTATTCATGCTTCTAGTGTATATTTTCGCAATTTCCAATAACAAATTGTGG]


>consensus_654#0 GGAATTACTCCACCCGTAATCGCTTTCCGTTTGGGCACACTTGGATTTTTGACTCCGTTT CCTTTCAAGATGTTTAGAAACCAAATGAAGAGTGTTCTTGAAGGTTCATCTTATTGTGTA TTACGAACTCGGCTTTGTTGTCAAGTTATTCGTAGTAGTGTTATAAATCATAATAGCAAT AATAATTTCGACATTCAAAATACCTCAACTACCAGTAGTTGTAGTAGTGAGAATCAACCT CAAGCATCTAACTATTCTAACGATATTGGTTCACGTTCCAGTACACCAGATACTGAATAT CATTTCCTAAATGACCTAGTTATTGATCGTGGCCTTTCTCCATTTATCTGTGATCTCCTC ATTAAGGTGAACGGTAGAGAAGTAACTACTGTGGAAGGCGATGGTCTTATTATAAGTACA CCTACTGGAAGTACAGCTTATTCAATGACAGCTGGTGCTAGTATGGTACATCCATGTGTA CCTGCTCTAGTATTAACACCAATCAATTCATTAGCTTTAAGTTCACGTGCTATTGTTCTT CCTACATCCATAAAATTAGAAATCTCCATTGCCAGTAAAGCTCGTTGTTCAACTGTACAC TTTTCTTTTGATGGACGTTCACGACACTCAAATTTATTGCATAAAGGTGATGTTATCTTA GTGAGTGCTTCACCGTTCCCTGTTCCATGCCTTTGTAGTGAAAATGAGGTCACAGATTGG TTTTGTGGATTGGCACATTGTCTTAATTGGAATTTACGTCGACGTCAAAATGCAGTGATC AATTGTTGTCCTACAGACAAATAATTTGTAGAGATGCTATGTCTCGTTTCTACTTACTAA TTCCTTCTGTATTTTGTCCTGCCTTTCCTCAGGTCTATTTTATTGTGATTTAATTTTCCT TAAGATTTTGTTTACTCAAAAAACTACTTTTTGAACATTATTTTTCTTACTTAATCGTAA AAGGTTTCCATGATAACTTATTCATGCTTCTAGTGTATATTTTCGCAATTTCCAATAACA AATTGTGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)