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Schistosoma mansoni
cluster # 6582 cluster # 6582       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6582#0 length = 808 sequences # 4  

consensusID : consensus_6582#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 808
fasta sequence
                              [TACAATACACTATCCTACCTTATCGTTAATTATTGCAACTGAAAGAAAAATAGGCATAAACATCTTTTTAAAAATCGTACACATGGCATAATAAACTCTAACAGTATTAATAATAGTAATAATGAAAATAAAATGTAAAAATAGTATAAGCACAAGAGTGAATCATTGTTGGTCAACTGAATCGCCCATCTACTCGCACACACACACAAATAAAAGCACATTTGATGAAAGGCTCTGGATAATACCACAAACAAGAACAATCATAACAACAATAATGATGACTAAAAGAGAATAATTTATTACACAAGAAGAGAGATATGACTTGTGCATACTTTTTTAAACGTTATACTTTGTTAATTAATGTAACTCAAGATAGATCCCAG-TTACATGTTCTGTTG-TTATCATTATGTTACTTATTCATTGTTATTCATTAGAGAAAGAATTTAACTATCAAAGTTAAAAGTGTAACAAATCTACATCGATAGTTTCTCTCTTTTTTCTTTAAGTAAAAAGAGTGATACATATTAATGGGAAACAATAATTATTATTCAAAGAGGGTAAAGATCTACGAGATGTGAATATAAATTAATTTGTTAATACACTATGATAAATATGATAGAATTATTTTGATGTAAAAGTTTAAGGAGAATGAAAATTAAAACTGGTGATAGGTGATGAAGTAGTGAATCGTACGAAGGAAACAAAGAAAGAGATGAACCTGAGTAATAAAAGACAAGTGAACACATAACAACATGACACAATCATTAAATTATAATACACNCGACATCTTGAGAAAATAATATGAATA]

[-] EMBL AI977209             [TACAATACACTATCCTACCTTATCGTTAATTATTGCAACTGAAAGAAAAATAGGCATAAACATCTTTTTAAAAATCGTACACATGGCATAATAAACTCTAACAGTATTAATAATAGTAATAATGAAAATAAAATGTAAAAATAGTATAAGCACAAGAGTGAATCATTGTTGGTCAACTGAATCGCCCATCTACTCGCACACACACACAAATAAAAGCACATTTGATGAAAGGCTCTGGATAATACCACAAACAAGAACAATCATAACAACAATAATGATGACTAAAAGAGAATAATTTATTACACAAGAAGAGAGATATGACTTGTGCATACTTTTTTAAACGTTATACTTTGTTAATTAATGTAACTCAAGATAGATCCCAG TTACATGTTCTGTTG TTATCATTATGTTACTTATTCATTGTTATTCATTAGAGAAAGAATTTAACTATCAAAGTTAAAAGTGTAACAAATCTACATCGATAGTTTCTCTCTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD168650             [                             TTATTGCAACTGAAAGAAAAATAGGCATAAACATCTTTTTAAAAATCGTACACATGGCATAATAAACTCTAACAGTATTAATAATAGTAATAATGAAAATAAAATGTAAAAATAGTATAAGCACAAGACTGAATCATTGTTGGTCAACTGAATCGCCCATCTACTCGCACACACACACAAATAAAAGCACATTTGATGAAAGGCTCTGGATAATACCACAAACAAGAACAATCATAACAACAATAATGATGA TTAAAGAGAATAATTTATTACACAAGAAGAGAGATATGACTTGTGCATACTTTTTTAAACGTTATACTTTGTTAATTAATGTAACTCAAGATAGATCCCAG TTACATGTTCTGTTG TTATCATTATGTTACTTATTCATTGTTATTCATTAGAGAAAGAATTTAACTATCAAAGTTAAAAGTGTAACAAATCTACATCGATAGTTTCTCTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD160512             [                                                                                                                                                                                                                                                               AACAATCATATCAACAATAATGATGACTAAAAGAGAATAATTTATTACACAAGAAGAGAGATATGACTTGTGCATACTTTTTTAAACGTTATACTTTGTTAATTAATGTAACTCAAGATAGATCCCAG TTACATGTTCTGTTG TTATCATTATGTTACTTATTCATTGTTATTCATTAGAGAAAGAATTTAACTATCAAAGTTAAAAGTGTAACAAATCTACATCGATAGTTTCTCTCTTTTTTCTTTAAGTAAAAAGAGTGATACATATTAATGGGAAACAATAATTATTATTCAAAGAGGGTAAAGATCTACGAGATGTGAATATAAATTAATTTGTTAATACACTATGATAAATATGATAGAATTATTTTGATGTAAAAGTTTAAGGAGAATGAAAATTAAAACTGGTGATAGGTGATGAAGTAGTGAATCGTACGAAGGAAACAAAGAAAGAGATGAACCTGAGTAATAAAAGACAAGTGAACACATAACAACATGACACAATCATTAAATTATAATACACNCGACATCTTGAGAAAATAATATGAATA]
[-] EMBL CD068330             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAATTTATTACACAAGAAGAGAGATATGACTTGTGCATACTTTTGTAAACGTTATACTTTGTTAATTAATGTAACTCAAGATAGATCCCAGTTTACATGTTCTGTTGTTTATCATTATGTTACTTATTCATTGTTATTCATTAGAGAAAGAATTTAACTATCAAAGTTAGAAGTGTTACAAATCTACATCGATAGTTTCTCTCTTGTTTCTTTAAGTAAAAAGAGTGATACATATTAATGGGAAACAATAATTATTATTCAAAGAGGGTAAAGATCTACGAGATGTGAATATAAATTAATTTGTTAATACACTATGATTAATATGATAGAATTATTTTGATGTAAAAGTTTAAGGAGAATGAAAATTAAAACTGGTGATAGGTGATGAAGTAGTGAct                                                                                                                        ]


>consensus_6582#0 TACAATACACTATCCTACCTTATCGTTAATTATTGCAACTGAAAGAAAAATAGGCATAAA CATCTTTTTAAAAATCGTACACATGGCATAATAAACTCTAACAGTATTAATAATAGTAAT AATGAAAATAAAATGTAAAAATAGTATAAGCACAAGAGTGAATCATTGTTGGTCAACTGA ATCGCCCATCTACTCGCACACACACACAAATAAAAGCACATTTGATGAAAGGCTCTGGAT AATACCACAAACAAGAACAATCATAACAACAATAATGATGACTAAAAGAGAATAATTTAT TACACAAGAAGAGAGATATGACTTGTGCATACTTTTTTAAACGTTATACTTTGTTAATTA ATGTAACTCAAGATAGATCCCAGTTACATGTTCTGTTGTTATCATTATGTTACTTATTCA TTGTTATTCATTAGAGAAAGAATTTAACTATCAAAGTTAAAAGTGTAACAAATCTACATC GATAGTTTCTCTCTTTTTTCTTTAAGTAAAAAGAGTGATACATATTAATGGGAAACAATA ATTATTATTCAAAGAGGGTAAAGATCTACGAGATGTGAATATAAATTAATTTGTTAATAC ACTATGATAAATATGATAGAATTATTTTGATGTAAAAGTTTAAGGAGAATGAAAATTAAA ACTGGTGATAGGTGATGAAGTAGTGAATCGTACGAAGGAAACAAAGAAAGAGATGAACCT GAGTAATAAAAGACAAGTGAACACATAACAACATGACACAATCATTAAATTATAATACAC NCGACATCTTGAGAAAATAATATGAATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)