These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6603#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 371 fasta sequence [AATCAAGTCAACAAATTTAATACAACTATTGTGCAAACGTACTTCAAATAGTCAGACAAGTACTTTAACAGATACTGACGATAAATCCAAGAGTGGTTCTTGCGGTAGTATGGTTGCTTCTACTACTAATGTTAGAGGAAGACGAAGTAGTAATAGTAGCACTGCCAACAATATGGGAGAGAATCTACACGAGTCTGGCGAACTAATCGATAGTTATCGAGGTAGGCCATATATACAGTTTACCAGTTTCCTTCTGGTAATTTTTATTTAATAATCTTAGTTGAATGTTAAGTTATATTGACTTTCTACTA-NATGA-ATATGTTTTATATNTGTAATACTATGCATTCCTNNTGAATCGNACAAACCATTNA] [+] EMBL CD198995 [AATCAAGTCAACAAATTTAATACAACTATTGTGCAAACGTACTTCAAATAGTCAGACAAGTACTTTAACAGATACTGACGATAAATCCAAGAGTGGTTCTTGCGGTAGTATGGTTGCTTCTACTACTAATGTTAGAGGAAGACGAAGTAGTAATAGTAGCACTGCCAACAATATGGGAGAGAATCTACACGAGTCTGGCGAACTAATCGATAGTTATCGAGGTAGGCCATATATACAGTTTACCAGTTTCCTTCTGGTAATTTTTATTTAATAATCTTAGTTGAATGTTAAGTTATATTGACTTTCTACTANNATGA ATATGTTTTATATNTGTAATACTATGCATTCCTNNTGAATCGNACAAACCATTNA] [+] EMBL CD070280 [AATCAAGTCAACAAATTTAATACAACTATTGTGCAAACGTACTTCAAATAGTCAGACAAGTACTTTAACAGATACTGACGATAAATCCAAGAGTGGTTCTTGCGGTAGTATGGTTGCTTCTACTACTAATGTTAGAGGAAGACGAAGTAGTAATAGTAGCACTGCCAACAATATGGGAGAGAATCTACACGAGTCTGGCGAACTAATCGATAGTTATCGAGGTAGGCCATATATACAGTTTACCAGTTTCCTTCTGGTAATTTTTATTTAATAATCTTAGTTGAATGTTAAGTTATATTGACTTTCTACTA NATGANATATGTTTTATATTTGTAATACTATGCATTCCT TTGAATCGACCNAAACATTa ] [+] EMBL CD070444 [AATCAAGTCAACAAATTTAATACAACTATTGTGCAAACGTACTTCAAATAGTCAGACAAGTACTTTAACAGGTACTGACGATAAATCCAAGAGTGGTTCTTGCGGTAGTATGGTTGCTTCTACTACTAATGTTAGAGGAAGACGAAGTAGTAATAGTAGCACTGCCAACAATATGGGAGAGAATCTACACGAGTCTGGCGAACTAATCGATAGTTATCGAGGTAGGCCATATATACAGTTTACCAGTTTCCTTCTGGTAATTTTTATTTAATAATCTTAGCTGAATGTTAAGTTATATTGACTTTCTACTA NATGA Aata ] [+] EMBL CD070408 [AATCAAGTCAACAAATTTAATACAACTATTGTGCAAACGTACTTCAAATAGTCAGACAAGTACTTTAACAGATACTGACGATAAATCCAAGAGTGGTTCTTGCGGTAGTATGGTTGCTTCTACTACTAATGTTAGAGGAAGACGAAGTAGTAATAGTAGCACTGCCAACAATATGGGAGAGAATCTACACGAGTCTGGCGAACTAATCGATAGTTATCGAGGTAGGCCATATATACAGTTTACCAGTTTCCTTCTGGTAATTTTTATTTAATAATCTTAGTTGAATGTNAAGNTATATTGACTTn ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||