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Schistosoma mansoni
cluster # 6604 cluster # 6604       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6604#0 length = 896 sequences # 4  

consensusID : consensus_6604#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 896
fasta sequence
                              [GATGTTGCTGTGAGCATTATTGACGAAGATGATGATGATAAAGATGGTATAGATGAGGCAGTGTTATTATTATTATTACTACCTAAAAGTGTTTGTTGTGATTGTTGACTGACAACAACCGTCCTATCTCTTGACTGATTATAATTTATTAAATCTGTTGAATGATGGTGATGATGATTATTGCCAGTATTGATAACACCAGTGAAATCACTATTTATTGTATTTACATATTGTTGATGTAGAACTGCATATTCATCTGTGTTGAACGATTGTGGGTTGGGTGAAAATGAAGAAATTGGTAAGGATAAACTGTTATTATTGAAGGGTGTTGTTAAATAACCACCTTGACCAGTTGCCGTTGATACCCATAAGTTATTTGAATTCCAATATCCAGGATACCATGCACTGTTAGTTGGATCGTAGACACCGTCCATAGGAAGTGTTGTATATCCATTCAATTGATTATTTAATGGTGTACTGTTACTACTTGCATACGATGAAGCATTGGAATAATCGAACTGGTTGATTACAGATGGATCATTTATTTTAGACGATAGATTACTACTATTCATGGTAGTAGTAGTAGGAGAAGTAGCGATAGTGACAGATCGAGGCATAGGCATAATTAAAACTAGGCGGAGGAAACATTGTNGTAGGATTTTCAGATAACGATACTGAAGAAAAAGCATTTGGGTCTGCAGAATAATTTGCCTCAGTTTGATGTGTTTGATTTGGCAAAGATCCATGCATAGGATCTGGTCCCGATTGAACCATCATACATGTATTGGGAGATGCATGGTCTAGATTCAACTTAGACATAGCTAATTGAGTTTGATAATATTGTTTCTGGTATTCAGGATCCTGGTGTCCACCAAAAATAATATGGTATTTGAGAA]

[+] EMBL CD153920             [GATGTTGCTGTGAGCATTATTGACGAAGATGATGATGATAAAGATGGTATAGATGAGGCAGTGTTATTATTATTATTACTACCTAAAAGTGTTTGTTGTGATTGTTGACTGACAACAACCGTCCTATCTCTTGACTGATTATAATTTATTAAATCTGTTGAATGATGGTGATGATGATTATTGCCAGTATTGATAACACCAGTGAAATCACTATTTATTGTATTTACATATTGTTGATGTAGAACTGCATATTCATCTGTGTTGAACGATTGTGGGTTGGGTGAAAATGAAGAAATTGGTAAGGATAAACTGTTATTATTGAAGGGTGTTGTTAAATAACCACCTTGACCAGTTGCCGTTGATACCCATAAGTTATTTGAATTCCAATATCCAGGATACCATGCACTGTTAGTTGGATCGTAGACACCGTCCATAGGAAGTGTTGTATATCCATTCAATTGATTATTTAATGGTGTACTGTTACTACTTGCATACGATGAAGCATTGGAATAATCGAACTGGTTGATTACAGATGGATCATTTATTTTAGACGATAGATTACTACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD196019             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TACCATGCACTGTTAGTTGGATCGTAGACACCGTCCATAGGAAGTGTTGTATATCCATTCAATTGATTATTTAATGGTGTACTGTTACTACTTGCATACGATGAAGCATTGGAATAATCGAACTGGTTGATTACAGATGGATCATTTATTTTAGACGATAGATTACTACTATTCATGGTAGTAGTAGTAGGAGAAGTAGCGATAGTGACAGATCGAGGCATAGGCATAATTAAAACTAGGCGGAGGAAACATTGTNGTAGGATTTTCAGACAACGAT                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD193946             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGGAATAATCGAACTGGTTGATTACAGATGGATCATTTATTTTAGACGATAGATTACTACTATTCATGGTAGTAGTAGTAGGAGAAGTAGCGATAGTGACAGATCGAGGCATAGGCATAATT AAACTAGGCGGAGGAACAATTGTGTTAGGATTTTCAGATAACGATACTGAAGAAAAAGCATTTGGGTCTGCAGAATAATTTGCCTCAGTTTGATGTGTTTGATTTGGCAAAGATCCATGCATAGGA                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD059468             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATTTTCACATAACGATACTGAAGAAAAAGCATTTGGGTCTGCAGAATAATTTGCCTCAGTTTGATGTGTTTGATTTGGCAAAGATCCATGCATAGGATCTGGTCCCGATTGAACCATCATACATGTATTGGGAGATGCATGGTCTAGATTCAACTTAGACATAGCTAATTGAGTTTGATAATATTGTTTCTGGTATTCAGGATCCTGGTGTCCACCAAAAATAATATGGTATTTGAGAA]


>consensus_6604#0 GATGTTGCTGTGAGCATTATTGACGAAGATGATGATGATAAAGATGGTATAGATGAGGCA GTGTTATTATTATTATTACTACCTAAAAGTGTTTGTTGTGATTGTTGACTGACAACAACC GTCCTATCTCTTGACTGATTATAATTTATTAAATCTGTTGAATGATGGTGATGATGATTA TTGCCAGTATTGATAACACCAGTGAAATCACTATTTATTGTATTTACATATTGTTGATGT AGAACTGCATATTCATCTGTGTTGAACGATTGTGGGTTGGGTGAAAATGAAGAAATTGGT AAGGATAAACTGTTATTATTGAAGGGTGTTGTTAAATAACCACCTTGACCAGTTGCCGTT GATACCCATAAGTTATTTGAATTCCAATATCCAGGATACCATGCACTGTTAGTTGGATCG TAGACACCGTCCATAGGAAGTGTTGTATATCCATTCAATTGATTATTTAATGGTGTACTG TTACTACTTGCATACGATGAAGCATTGGAATAATCGAACTGGTTGATTACAGATGGATCA TTTATTTTAGACGATAGATTACTACTATTCATGGTAGTAGTAGTAGGAGAAGTAGCGATA GTGACAGATCGAGGCATAGGCATAATTAAAACTAGGCGGAGGAAACATTGTNGTAGGATT TTCAGATAACGATACTGAAGAAAAAGCATTTGGGTCTGCAGAATAATTTGCCTCAGTTTG ATGTGTTTGATTTGGCAAAGATCCATGCATAGGATCTGGTCCCGATTGAACCATCATACA TGTATTGGGAGATGCATGGTCTAGATTCAACTTAGACATAGCTAATTGAGTTTGATAATA TTGTTTCTGGTATTCAGGATCCTGGTGTCCACCAAAAATAATATGGTATTTGAGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)