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Schistosoma mansoni
cluster # 6608 cluster # 6608       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6608#0 length = 643 sequences # 4  

consensusID : consensus_6608#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 643
fasta sequence
                              [ATACCAAAATCAGCCAGCTACTATAAATCAGGAATTAATTACACTACTCAAGCTGAAGAGTTACACTCTAACACATTTGATACTTGTTGTAATATGTGGATTATTAACTGGAAGTTTAATAACAGTTATATTGTTTTGGTCATGTAGATGTCATCGTTGGTCATATGATGAGGATGATATTGCCAAGTTAACAAATAAAAATCATATAAAAACTATTTCCACTCATTGTAAAAGTCGTCTACCGTATGAAAGTCAACAAACTTGCTTAACAACTACTAGTGAACCGTTAAGTAAACATTCATGGAGTTTAATTGATGAAAAAGAACCTATTTGGTGTAATAAATCAGATATTATAGCACAAGCATCAACAGATACACGATATGAATATCTACCACCTACTCACATCACACCAGCTAATACCAGATTTAACAGATCAGTTAGTCGAAAGCCAACAAAAATACGTCATTTAAGCACCCCATATCATGATATATCGACAAGTGTATACTTACTATCCAATACACCATCACCAACATCAGTAACAAGTAACCCGTCAACAACTTCAACATTACTGAAAGACAAGTTTACATTTGATTCATTTGCTGAACAAAATTCAAATGTTTTAGGTGATTGTAAAACTAATCTA]

[+] EMBL CD195103             [ATACCAAAATCAGCCAGCTACTATAAATCAGGAATTAATTACACTACTCAAGCTGAAGAGTTACACTCTAACACATTTGATACTTGTTGTAATATGTGGATTATTAACTGGAAGTTTAATAACAGTTATATTGTTTTGGTCATGTAGATGTCATCGTTGGTCATATGATGAGGATGATATTGCCAAGTTAACAAATAAAAATCATATAAAAACTATTTCCACTCATTGTAAAAGTCGTCTACCGTATGAAAGTCAACAAACTTGCTTAACAACTACTAGTGAACCGTTAAGTAAACATTCATGGAGTTTAATTGATGAAAAAGAACCTATTTGGTGTAATAAATCAGATATTATAGCACAAGCATCAACAGATACACGATATGAATATCTACCACCTACTCACATCACACCAGCTAATACCAGATNTAACAGATCAGTTAGTCGAAAGCCAAC NAAATACGTCATTT AGCA CCCATATCATGATATATCG                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD070557             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATCTACCACCTACTCACATCACACCAGCTAATACCAGATTTAACAGATCAGTTAGTCGAAAGCCAACAAAAATACGTCATTTAAGCACCCCATATCATGATATATCGACAAGTGTATACTTACTATCCAATACACCATCACCAACATCAGTAACAAGTAACCCGTCAACAACTTCAACATTACTGANAGACAAGTTTACATTTGATTCATTTGCTGAACAAAATTCANATGTTTTAGGTGATTGTAAAACTAATCT ]
[+] EMBL CD070548             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATCTACCACCTACTCACATCACACCAGCTAATACCAGATTTAACAGATCAGTTAGTCGAAAGCCAACAAAAATACGTCATTTAAGCACCCCATATCATGATATATCGACAAGTGTATACTTACTATCCAATACACCATCACCAACATCAGTAACAAGTAACCCGTCAACAACTTCAACATTACTGAAAGACAAGTTTACATTTGATTCATTTGCTGAACAAAATTCAAATGTTTTAGGTGATTGTAAAACTAATCT ]
[-] EMBL CD070542             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCTTCCACCTACTCACATCACACCAGCTTATACCAGATTTNACAGATCAGTTAGTCGAAAGCCAACAAAAATACGTCATTTAAGCACCCCATATCATGATATATCGACAAGTGTATACTTACTATCCAATACACCATCACCAACATCAGTAACAAGTAACCCGTCAACAACTTCAACATTACTGAAAGACAAGTTTACATTTGATTCATTTGCTGAACAAAATTCAAATGTTTTAGGTGATTGTAAAACTAATCTA]


>consensus_6608#0 ATACCAAAATCAGCCAGCTACTATAAATCAGGAATTAATTACACTACTCAAGCTGAAGAG TTACACTCTAACACATTTGATACTTGTTGTAATATGTGGATTATTAACTGGAAGTTTAAT AACAGTTATATTGTTTTGGTCATGTAGATGTCATCGTTGGTCATATGATGAGGATGATAT TGCCAAGTTAACAAATAAAAATCATATAAAAACTATTTCCACTCATTGTAAAAGTCGTCT ACCGTATGAAAGTCAACAAACTTGCTTAACAACTACTAGTGAACCGTTAAGTAAACATTC ATGGAGTTTAATTGATGAAAAAGAACCTATTTGGTGTAATAAATCAGATATTATAGCACA AGCATCAACAGATACACGATATGAATATCTACCACCTACTCACATCACACCAGCTAATAC CAGATTTAACAGATCAGTTAGTCGAAAGCCAACAAAAATACGTCATTTAAGCACCCCATA TCATGATATATCGACAAGTGTATACTTACTATCCAATACACCATCACCAACATCAGTAAC AAGTAACCCGTCAACAACTTCAACATTACTGAAAGACAAGTTTACATTTGATTCATTTGC TGAACAAAATTCAAATGTTTTAGGTGATTGTAAAACTAATCTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)