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Schistosoma mansoni
cluster # 6611 cluster # 6611       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6611#0 length = 850 sequences # 4  

consensusID : consensus_6611#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 850
fasta sequence
                              [ATTTATTCGGGATATTTTGTGGTAAGCTAACATTGTGTCATAACACGGCATAGGTTATTCAAGACAGACAAAGAACGATGAATGCGATTGATAAGCGGCGTAGGACAAAATGCGATGCCTTTGTATTGACTCAAGGTTTGGAGACTTTTCGAAATTTGACTTAACATGTTTATAAGCGATTGTAATGGCCAGGAATGTATCAATACTGCACTTCTAACGAACTGATTTGGATCGCAAATAAGCTCATCATCAGTGCTCAATCTTCTCAAGTAGTGAACTAAGTAAGATAAACAGGTAGTTTCAGGAGATACCAGCCAGTCAACGAACAAATAAGACGAAAAGCCGACAGATTTCGCTAAATAAGCAAACAACCAATGGGCATTGGGAACAGCATGGGGAGTCATTTGCTGATATAACTCTGTGGATTTGATATGGTCCTCAATCTGTATCCATAGGTCCAATACTCGGAAAAGTTGTGCATCATCCTCAGAAAATAAGATAATTATTGAATTTTCATAACTATGTACCGTGTTTGATTTATCCAATTCAATATCCAGTAATAATTCATGAATAGAGCTTATTATTGACCAAAGTTGTAGATCATTAGGATCTAATTTTAAAGCATTTTCGAGACCACATGTAATAATAATGCGCAGAGATAAACAAATATCTGGTTCGAGCAAAGATACTTCGTCGCATTTAATCTTTTGAGTTTTTATAGTGCGCGCTATATGAGTAGTTAAACAACCACAGAAAGCGTTGGAATCAGATATTTCTATTATAGACCTTTGTGAACGGGAGTGTGAGCACAGTAATTCGTATATAAGTTTGTTAACGATAGGATGTAAAT]

[+] EMBL CD077320             [ATTTATTCGGGATATTTTGTGGTAAGCTAACATTGTGTCATAACACGGCATAGGTTATTCAAGACAGACAAAGAACGATGAATGCGATTGATAAGCGGCGTAGGACAAAATGCGATGCCTTTGTATTGACTCAAGGTTTGGAGACTTTTCGAAATTTGACTTAACATGTTTATAAGCGATTGTAATGGCCAGGAATGTATCAATACTGCACTTCTAACGAACTGATTTGGATCGCAAATAAGCTCATCATCAGTGCTCAATCTTCTCAAGTAGTGAACTAAGTAAGATAAACAGGTAGTTTCAGGAGATACCAGCCAGTCAACGAACAAATAAGACGAAAAGCCGACAGATTTCGCTAAATAAGCAAACAACCAATGGGCATTGGGAACAGCATGGGGAGTCATTTGCTGATATAACTCTGTGGATTTGATATGGTCCTCAATCTGTATCCATAGGTCCAATACTCGGAAAAGTTGTGCATCATCCTCAGAAAATAAGATAATTATTGAATTTTCATAACTATGTACCGTGTTTGATTTATCCAATTCAATATCCAGTAATAATTCATGAATAGAGCTTATTATTGACCAAAGTTGTAGATCATTAGGA                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD185901             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGCATGGGGAGTCATTTGCTGATATAACTCTGTGGATTTGATATGGTCCTCAATCTGTATCCATAGGTCCAATACTCGGAAAAGTTGTGCATCATCCTCAGAAAATAAGATAATTATTGAATTTTCATAACTATGTACCGTGTTTGATTTATCCAATTCAATATCCAGTAATAATTCATGAATAGAGCTTATTATTGACCAAAGTTGTAGATCATTAGGATCTAATTTTAAAGCATTTTCGAGACCA                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD071545             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGAGTCATTTGATGATATAACTCTGTGGATTTGATATGGTCGTCAATCTGTATCCATAGGTCCAATACTCGGAATAGTTGTGCATCATCCTCAGAAAATAAGATAATTATTGAATTTTCATAACTATGTACCGTGTTTGATTTATCCAATTCAATATCCAGTAATAATTCATGAATAGAGCTTATTATTGACCAAAGTTGTAGATCATTAGGATCTAATTTTAAAGCATTTTCGAGACCACATGTAATAATAATGCGCAGAGATAAACAAATATCTGGTTCGAGCAAAGATACTTCGTCGCATTTAATCTTTTGAGTTTTTATAGTGCGCGCTATATGAGTAGTTAAACAACCACAGAAAGCGTTGGAATCAGATATTTCTATTATAGACCTTTGTGAACGGGAGTGTGAGCACAGTAATTCGTATATAAGTTTGTTAACGATAGGATGTAAAT]
[-] EMBL CD147507             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aatctgtaGAGACCACATATAATAATAATGCGCAGAGATAAACAAATATCTGGTTCAAGCAAAGATACTTCGTCGCATTTAATCTTTTGAGTTTTTATAGTGCGCGCTATATGAGTAGTTAAACAACCACAAAAAGCGTTGGAATCAGATATTTCTATTGTAGACCTTTGTGAACGGGAGTGTGAGCACAGTAATTCGTATATAAGTTTGTTAACGATAGGAT      ]


>consensus_6611#0 ATTTATTCGGGATATTTTGTGGTAAGCTAACATTGTGTCATAACACGGCATAGGTTATTC AAGACAGACAAAGAACGATGAATGCGATTGATAAGCGGCGTAGGACAAAATGCGATGCCT TTGTATTGACTCAAGGTTTGGAGACTTTTCGAAATTTGACTTAACATGTTTATAAGCGAT TGTAATGGCCAGGAATGTATCAATACTGCACTTCTAACGAACTGATTTGGATCGCAAATA AGCTCATCATCAGTGCTCAATCTTCTCAAGTAGTGAACTAAGTAAGATAAACAGGTAGTT TCAGGAGATACCAGCCAGTCAACGAACAAATAAGACGAAAAGCCGACAGATTTCGCTAAA TAAGCAAACAACCAATGGGCATTGGGAACAGCATGGGGAGTCATTTGCTGATATAACTCT GTGGATTTGATATGGTCCTCAATCTGTATCCATAGGTCCAATACTCGGAAAAGTTGTGCA TCATCCTCAGAAAATAAGATAATTATTGAATTTTCATAACTATGTACCGTGTTTGATTTA TCCAATTCAATATCCAGTAATAATTCATGAATAGAGCTTATTATTGACCAAAGTTGTAGA TCATTAGGATCTAATTTTAAAGCATTTTCGAGACCACATGTAATAATAATGCGCAGAGAT AAACAAATATCTGGTTCGAGCAAAGATACTTCGTCGCATTTAATCTTTTGAGTTTTTATA GTGCGCGCTATATGAGTAGTTAAACAACCACAGAAAGCGTTGGAATCAGATATTTCTATT ATAGACCTTTGTGAACGGGAGTGTGAGCACAGTAATTCGTATATAAGTTTGTTAACGATA GGATGTAAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)