These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6611#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 850 fasta sequence [ATTTATTCGGGATATTTTGTGGTAAGCTAACATTGTGTCATAACACGGCATAGGTTATTCAAGACAGACAAAGAACGATGAATGCGATTGATAAGCGGCGTAGGACAAAATGCGATGCCTTTGTATTGACTCAAGGTTTGGAGACTTTTCGAAATTTGACTTAACATGTTTATAAGCGATTGTAATGGCCAGGAATGTATCAATACTGCACTTCTAACGAACTGATTTGGATCGCAAATAAGCTCATCATCAGTGCTCAATCTTCTCAAGTAGTGAACTAAGTAAGATAAACAGGTAGTTTCAGGAGATACCAGCCAGTCAACGAACAAATAAGACGAAAAGCCGACAGATTTCGCTAAATAAGCAAACAACCAATGGGCATTGGGAACAGCATGGGGAGTCATTTGCTGATATAACTCTGTGGATTTGATATGGTCCTCAATCTGTATCCATAGGTCCAATACTCGGAAAAGTTGTGCATCATCCTCAGAAAATAAGATAATTATTGAATTTTCATAACTATGTACCGTGTTTGATTTATCCAATTCAATATCCAGTAATAATTCATGAATAGAGCTTATTATTGACCAAAGTTGTAGATCATTAGGATCTAATTTTAAAGCATTTTCGAGACCACATGTAATAATAATGCGCAGAGATAAACAAATATCTGGTTCGAGCAAAGATACTTCGTCGCATTTAATCTTTTGAGTTTTTATAGTGCGCGCTATATGAGTAGTTAAACAACCACAGAAAGCGTTGGAATCAGATATTTCTATTATAGACCTTTGTGAACGGGAGTGTGAGCACAGTAATTCGTATATAAGTTTGTTAACGATAGGATGTAAAT] [+] EMBL CD077320 [ATTTATTCGGGATATTTTGTGGTAAGCTAACATTGTGTCATAACACGGCATAGGTTATTCAAGACAGACAAAGAACGATGAATGCGATTGATAAGCGGCGTAGGACAAAATGCGATGCCTTTGTATTGACTCAAGGTTTGGAGACTTTTCGAAATTTGACTTAACATGTTTATAAGCGATTGTAATGGCCAGGAATGTATCAATACTGCACTTCTAACGAACTGATTTGGATCGCAAATAAGCTCATCATCAGTGCTCAATCTTCTCAAGTAGTGAACTAAGTAAGATAAACAGGTAGTTTCAGGAGATACCAGCCAGTCAACGAACAAATAAGACGAAAAGCCGACAGATTTCGCTAAATAAGCAAACAACCAATGGGCATTGGGAACAGCATGGGGAGTCATTTGCTGATATAACTCTGTGGATTTGATATGGTCCTCAATCTGTATCCATAGGTCCAATACTCGGAAAAGTTGTGCATCATCCTCAGAAAATAAGATAATTATTGAATTTTCATAACTATGTACCGTGTTTGATTTATCCAATTCAATATCCAGTAATAATTCATGAATAGAGCTTATTATTGACCAAAGTTGTAGATCATTAGGA ] [-] EMBL CD185901 [ AGCATGGGGAGTCATTTGCTGATATAACTCTGTGGATTTGATATGGTCCTCAATCTGTATCCATAGGTCCAATACTCGGAAAAGTTGTGCATCATCCTCAGAAAATAAGATAATTATTGAATTTTCATAACTATGTACCGTGTTTGATTTATCCAATTCAATATCCAGTAATAATTCATGAATAGAGCTTATTATTGACCAAAGTTGTAGATCATTAGGATCTAATTTTAAAGCATTTTCGAGACCA ] [-] EMBL CD071545 [ GGAGTCATTTGATGATATAACTCTGTGGATTTGATATGGTCGTCAATCTGTATCCATAGGTCCAATACTCGGAATAGTTGTGCATCATCCTCAGAAAATAAGATAATTATTGAATTTTCATAACTATGTACCGTGTTTGATTTATCCAATTCAATATCCAGTAATAATTCATGAATAGAGCTTATTATTGACCAAAGTTGTAGATCATTAGGATCTAATTTTAAAGCATTTTCGAGACCACATGTAATAATAATGCGCAGAGATAAACAAATATCTGGTTCGAGCAAAGATACTTCGTCGCATTTAATCTTTTGAGTTTTTATAGTGCGCGCTATATGAGTAGTTAAACAACCACAGAAAGCGTTGGAATCAGATATTTCTATTATAGACCTTTGTGAACGGGAGTGTGAGCACAGTAATTCGTATATAAGTTTGTTAACGATAGGATGTAAAT] [-] EMBL CD147507 [ aatctgtaGAGACCACATATAATAATAATGCGCAGAGATAAACAAATATCTGGTTCAAGCAAAGATACTTCGTCGCATTTAATCTTTTGAGTTTTTATAGTGCGCGCTATATGAGTAGTTAAACAACCACAAAAAGCGTTGGAATCAGATATTTCTATTGTAGACCTTTGTGAACGGGAGTGTGAGCACAGTAATTCGTATATAAGTTTGTTAACGATAGGAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||