cluster # 662

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Schistosoma mansoni
cluster # 662 cluster # 662 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_662#0 length = 782 sequences # 2

consensusID : consensus_662#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 782
fasta sequence

                              [AGAAAAGTTGCGGTATTTGCAAAGATACGAAAGTTTTGAAGACAAATTCATCCATGTCCAATAATAGGACTAGTGTAATTGTATCAAACAGGACAACAGAAATTGGTAAGATTATCAGTACTACAACAGTAGCTCCAACAAATTCTGTTACTTTTTCTACAACAAAAGATAGTTTAAATGGTATTGAAATGACGTCTACAATATCTAGAACAGCAGAAATCTCAAGCAGAAAACCATCATCGAAACATAAATTTGTAACTAAAAGAACGTATTTACCGTCAGAATATTCTGAGGACAAACAAGAATGTATCGATCGATACCCGAAGACATCATGTGTCGCTTGGAAAAACACAGGTTACTGTAATTTTCCACATGTTTCCAAATTATGCTTAAAAACATGTCACTTATGTAAAACTATTGAATTGTTAAGTAAATATCGACCACTGATAATTTAATTGTACTTTTACTCTATTCTAACTTTATATTTCATTGTATTTCCGTTTCATTTCTTATCCTTTGACAATGTTACATTGCATTCATCAATTATATTTTATACTAATGATTTGTATTATAACGGTTATCGAGGTGAGCGATTAACGAAGCACGGCACTACATATTAACAATATTCATGTTATGTCTAAATTGAATATCATCTGTTTCTTTT-ATAGGAAAAGTTTGTTGAATTACAATACGACTNTTCTTCCTTNT-AAAAAAG-AAGAC-CTATG-ACATGCTTCTATT--TAAATC-TTTAC-TTG-TATGTA--TATG-GTA-ATC-TTGCACAAAAGAAT]

[+] EMBL CD081283             [AGAAAAGTTGCGGTATTTGCAAAGATACGAAAGTTTTGAAGACAAATTCATCCATGTCCAATAATAGGACTAGTGTAATTGTATCAAACAGGACAACAGAAATTGGTAAGATTATCAGTACTACAACAGTAGCTCCAACAAATTCTGTTACTTTTTCTACAACAAAAGATAGTTTAAATGGTATTGAAATGACGTCTACAATATCTAGAACAGCAGAAATCTCAAGCAGAAAACCATCATCGAAACATAAATTTGTAACTAAAAGAACGTATTTACCGTCAGAATATTCTGAGGACAAACAAGAATGTATCGATCGATACCCGAAGACATCATGTGTCGCTTGGAAAAACACAGGTTACTGTAATTTTCCACATGTTTCCAAATTATGCTTAAAAACATGTCACTTATGTAAAACTATTGAATTGTTAAGTAAATATCGACCACTGATAATTTAATTGTACTTTTACTCTATTCTAACTTTATATTTCATTGTATTTCCGTTTCATTTCTTATCCTTTGACAATGTTACATTGCATTCATCAATTATATTTTATACTAATGATTTGTATTATAACGGTTATCGAGGTGAGCGATTAACGAAGCACGGCACTACATATTAACAATATTCATGTTATGTCTAAATTGAATATCATCTGTTTCTTTT ATAGGAAAAGTTTGTTGAATTACAATACGACTNTTCTTCCTTNT AAAAAAG AAGAC CTATG ACATGCTTCTATT  TAAATC TTTAC TTG TATGTA  TATG GTA ATC TTGCACAA      ]
[-] EMBL CD075112             [                                                                                                                                                                                                                                                                        GAACGTATTTACCGTCAGAATA TCTGAGGACAAACAAGAATGTATCGATCGATACCCGAAGACATCATGTGTCGCTTGGAAAAACACAGGTTACTGTAATTTTCCACATGTTTCCAAATTATGCTTAAAAACATGTCACTTATGTAAAACTATTGAATTGTTAAGTAAATATCGACCACTGATAATTTAATTGTACTTTTACTCTATTCTAACTTTATATTTCATTGTATTTCCGTTTCATTTCTTATCCTTTGACAATGTTACATTGCATTCATCAATTATATTTTATACTAATGATTTGTATTATAACGGTTATCGAGGTGAGCGATTAACGAAGCACGGCACTACATATTAACAATATTCATGTTATGTCTAAATTGAATATCATCTGTTTCTTTTCATAGGAAAAGTTTGTTGAATTACAATACGACTTTTCTTCCTTTTAAAAAAAGAAAGACACTATGTACATGCTTCTATTTGTAATTCTTTTACATTGTTATGTAATTATGTGTAGATCTTTGCACAAAAGAAT]




>consensus_662#0
AGAAAAGTTGCGGTATTTGCAAAGATACGAAAGTTTTGAAGACAAATTCATCCATGTCCA
ATAATAGGACTAGTGTAATTGTATCAAACAGGACAACAGAAATTGGTAAGATTATCAGTA
CTACAACAGTAGCTCCAACAAATTCTGTTACTTTTTCTACAACAAAAGATAGTTTAAATG
GTATTGAAATGACGTCTACAATATCTAGAACAGCAGAAATCTCAAGCAGAAAACCATCAT
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AAGAATGTATCGATCGATACCCGAAGACATCATGTGTCGCTTGGAAAAACACAGGTTACT
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AT

clustalw multiple alignements is not computed in this case