cluster # 6643

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Schistosoma mansoni
cluster # 6643 cluster # 6643 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_6643#0 length = 1381 sequences # 4
consensusID : consensus_6643#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1381
fasta sequence
                              [GTCGAATTGTGACAGTATTTGCCAGTAATTCTCCAGAACTTAGTACATTCGTTTCGCATACCTTTTAATCACCGATTCCTTCGGGAGGAAATATTGTGAACTCTGCAAATATTTTCACCAAGTATGGAGCTCTGTCAAAAGAGATATGAAGTAATCAGTGCTGCAATGTATCATATAGTAGCCTTTTGTGTGCTAATGTGTGCGAGCCTCATTTTGATTATTATCCAAACAGTATTTTCATATTGTGTTTCTGCAGAATCAGATCTTTCTTGGCCTTCAGTTTTAATCCCGTTCGCTTATATTGCTGCGTTTTTATTAATTTTAACGGCTGGTGCAACCTTGACTGCTGGATTAGCGAACTCAGATGAATGGGATACAGCCAGTGTTGTTAGTTGCATATTTCCACTAATAGTAACAACTGCGATCGCATGCACAACTATACAACAGTATGTGGATGGATCTCTACCTAAATCAAGCATGTTAATTATGGGTATTATTAACAGTATGATAGCATTTTTATGCTTTATCCATGGTATTTTATTATGTGCTGATTTTCGCTTATGTATAAATGTAAAAGCTCATGACTCGCCCCCAGCAATGGAAGTCCCCATATGTAAAATAACCTTAGAAGATGGATCTGTTTTATTGGACGACACTAACTGTATGGATTCGAATGATGTCTGACACATCTTTTAGTCGATAACCAATAAATTACGTAGTACATTTGTCTAACTTTTATTCATATCCATCTTATAAAGTACTAATCAGATGTCAGTATGTAAAAGTACTTAATAGTAAAAATTATCTTAGAAAGTAGTAGTAATTGTTTGACTTCTTTAAACTAGTATGGTTTGGTCTGTATACTCTACGTGTGAAATGATCTTGGTTTTAGCAATTTGATCAAATCAATTTTATCTGTGATTATATTCACCTTCATCATCCTTTTGGTGCATTTATAAGAGTGAGTTACTTCTGTAAATATTATAAATAAAATGTACCTTAACTTATTTTATGAATTCCTTTGGGGATTCCTTCGATCATTCATAATCTTTTTATATTCACATTTAATATTACTCGAAGTATAAAGGATCAACCTGTACAAGTTTTTCTTTTACATACCTGTTAATAAATGGTTTGAACTTAGTACCTTGAAATTGGGTGAGAACATATTTAAGAGAATATTCTTGATTTATGTACCTGTATTTCAATGTAATCGGGTTTTCTTAAACATTAACTAGAATATTTTTGAATTGCGTCTACCATTGGAAAGAAGAATATGCGTTTCTTTATATTTAAGACTTATCAGTTAGATCTATGTACATACTATTGTTGATGCCTACAGGGAAATGCAAACTCGATTCACGCTGTTTTAAATAAATAT]

[+] EMBL CD084038             [GTCGAATTGTGACAGTATTTGCCAGTAATTCTCCAGAACTTAGTACATTCGTTTCGCATACCTTTTAATCACCGATTCCTTCGGGAGGAAATATTGTGAACTCTGCAAATATTTTCACCAAGTATGGAGCTCTGTCAAAAGAGATATGAAGTAATCAGTGCTGCAATGTATCATATAGTAGCCTTTTGTGTGCTAATGTGTGCGAGCCTCATTTTGATTATTATCCAAACAGTATTTTCATATTGTGTTTCTGCAGAATCAGATCTTTCTTGGCCTTCAGTTTTAATCCCGTTCGCTTATATTGCTGCGTTTTTATTAATTTTAACGGCTGGTGCAACCTTGACTGCTGGATTAGCGAACTCAGATGAATGGGATACAGCCAGTGTTGTTAGTTGCATATTTCCACTAATAGTAACAACTGCGATCGCATGCACAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD078784             [                                                                                                                                                                                                                                                     TGTTTCTGCAGAATCAGATCTTTCTTGGCCTTCAGTTTTAATCCCGTTCGCTTATATTGCTGCGTTTTTATTAATTTTAACGGCTGGTGCAACCTTGACTGCTGGATTAGCGAACTCAGATGAATGGGATACAGCCAGTGTTGTTAGTTGCATATTTCCACTAATAGTAACAACTGCAATCGCATGCACAACTATACAACAGTATGTGGATGGATCTCTACCTAAATCAAGCATGTTAATTATGGGTATTATTAACAGTATGATAGCATTTTTATGCTTTATCCATGGTATTTTATTATGTGCTGATTTTCGCTTATGTATAAATGTAAAAGCTCATGACTCGCCCCCAGCAATGGAAGTCCCCATATGTAAAATAACCTTAGAAGATGGATCTGTTTTATTGGACGACACTAACTGTATGGATTCGAATGATGTCTGACACATCTTTTAGTCGATAACCAATAAATTACGTAGTACATTTGTCTAACTTTTATTCATATCCATCTTATAAAGTACTAATCAGATGTCAGTATGTAAAAGTACTTAATAGTANAAATTATCTTAGAAAGTAGTAGTAATTGTTTGACTTCTTTAAACTAGTATGGTTTGGTCTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD179154             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATGCACAACTATACAACAGTATGTGGATGGATCTCTACCTAAATCAAGCATGTTAATTATGGGTATTATTAACAGTATGATAGCATTTTTATGCTTTATCCATGATATTTTATTATGTGCTGATTTTCGCTTATGTATAAATGTAAAAGCTCATGACTCGCCCCCAGCAATGGAAGTCCCCATATGTAAAATAACCTTAGAAGATGGATCTGTTTTATTGGACGACACTAACTGTATGGATTCGAATGATGTCTGACACATCTTTTAGTCGATAACCAATAAATTACGTAGTACATTTGTCTAACTTTTATTCATATCCATCTTATAAAGTACTAATCAGATGTCGGTATGTAAAAGTACTTAATAGTAAAAATTATCTTAGAAAGTAGTAGTAATTGTTTGACTTCTTTAAACTAGTATGGTTTGGTCTGTATACTCTACGTGTGAAATGATCTTGGTTTTAGCAATTTGATCAAATCAATTTTATCTGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD073244             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGATGTCAGTATGTAAAAGTACTTAATAGTAAAAATTATCTTAGAAAGTAGTAGTAATTGTTTGACTTCTTTAAACTAGTATGGTTTGGTCTGTATACTCTACGTGTGAAATGATCTTGGTTTTAGCAATTTGATCAAATCAATTTTATCTGTGATTATATTCACCTTCATCATCCTTTTGGTGCATTTATAAGAGTGAGTTACTTCTGTAAATATTATAAATAAAATGTACCTTAACTTATTTTATGAATTCCTTTGGGGATTCCTTCGATCATTCATAATCTTTTTATATTCACATTTAATATTACTCGAAGTATAAAGGATCAACCTGTACAAGTTTTTCTTTTACATACCTGTTAATAAATGGTTTGAACTTAGTACCTTGAAATTGGGTGAGAACATATTTAAGAGAATATTCTTGATTTATGTACCTGTATTTCAATGTAATCGGGTTTTCTTAAACATTAACTAGAATATTTTTGAATTGCGTCTACCATTGGAAAGAAGAATATGCGTTTCTTTATATTTAAGACTTATCAGTTAGATCTATGTACATACTATTGTTGATGCCTACAGGGAAATGCAAACTCGATTCACGCTGTTTTAAATAAATAT]




>consensus_6643#0
GTCGAATTGTGACAGTATTTGCCAGTAATTCTCCAGAACTTAGTACATTCGTTTCGCATA
CCTTTTAATCACCGATTCCTTCGGGAGGAAATATTGTGAACTCTGCAAATATTTTCACCA
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GCCTTTTGTGTGCTAATGTGTGCGAGCCTCATTTTGATTATTATCCAAACAGTATTTTCA
TATTGTGTTTCTGCAGAATCAGATCTTTCTTGGCCTTCAGTTTTAATCCCGTTCGCTTAT
ATTGCTGCGTTTTTATTAATTTTAACGGCTGGTGCAACCTTGACTGCTGGATTAGCGAAC
TCAGATGAATGGGATACAGCCAGTGTTGTTAGTTGCATATTTCCACTAATAGTAACAACT
GCGATCGCATGCACAACTATACAACAGTATGTGGATGGATCTCTACCTAAATCAAGCATG
TTAATTATGGGTATTATTAACAGTATGATAGCATTTTTATGCTTTATCCATGGTATTTTA
TTATGTGCTGATTTTCGCTTATGTATAAATGTAAAAGCTCATGACTCGCCCCCAGCAATG
GAAGTCCCCATATGTAAAATAACCTTAGAAGATGGATCTGTTTTATTGGACGACACTAAC
TGTATGGATTCGAATGATGTCTGACACATCTTTTAGTCGATAACCAATAAATTACGTAGT
ACATTTGTCTAACTTTTATTCATATCCATCTTATAAAGTACTAATCAGATGTCAGTATGT
AAAAGTACTTAATAGTAAAAATTATCTTAGAAAGTAGTAGTAATTGTTTGACTTCTTTAA
ACTAGTATGGTTTGGTCTGTATACTCTACGTGTGAAATGATCTTGGTTTTAGCAATTTGA
TCAAATCAATTTTATCTGTGATTATATTCACCTTCATCATCCTTTTGGTGCATTTATAAG
AGTGAGTTACTTCTGTAAATATTATAAATAAAATGTACCTTAACTTATTTTATGAATTCC
TTTGGGGATTCCTTCGATCATTCATAATCTTTTTATATTCACATTTAATATTACTCGAAG
TATAAAGGATCAACCTGTACAAGTTTTTCTTTTACATACCTGTTAATAAATGGTTTGAAC
TTAGTACCTTGAAATTGGGTGAGAACATATTTAAGAGAATATTCTTGATTTATGTACCTG
TATTTCAATGTAATCGGGTTTTCTTAAACATTAACTAGAATATTTTTGAATTGCGTCTAC
CATTGGAAAGAAGAATATGCGTTTCTTTATATTTAAGACTTATCAGTTAGATCTATGTAC
ATACTATTGTTGATGCCTACAGGGAAATGCAAACTCGATTCACGCTGTTTTAAATAAATA
T
clustalw multiple alignements is not computed in this case