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Schistosoma mansoni
cluster # 6677 cluster # 6677       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6677#0 length = 766 sequences # 4  

consensusID : consensus_6677#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 766
fasta sequence
                              [CCACGTCTTTCAGAACTTTCAAAAGTTTATAGAAAGAAAGAGCAACTTC-GCA-AACGTATCGATGCTCTTACAGCTAATTTGAATAGTAAAGTTTCTTTAATTCAACTGGAAGAACTATCGGCTCGTAAACGTGTATTAAGACGATTAAATTTCGTTTCCGAATATGATGTAATCGAATTAAAGGGTTGTGTAGCCTGTGAAATCACCTCAGCAGATGAGTTATTATTAACAGAACTTTTATTTGATGGAGTATTCAATAGACTGTCATCTGAACATATTGCAGCATTACTTTCTTGTTTTGTATTTGAGGAGAGAGCTTCTGAAATGCCTAAATTAACTAAAGAGTTATCTGATGCTTTGCGTACATTACAAGATACAGCCAGACGTATTGCACGTATTAGTAACGAATGTCGTCTCCCAGTTGATGAAGATAATTACGTGGATTCATTTAAACCTCATTTAATGGATCTTGTTGATGCATGGACAAGAGGAGCATCCTTTGCTAGCGTTTGTTCTATGACAGACTTGTTCGAAGGCACAATTATTCGTACATTAAGATTACTTGAAGAGTTATTACGTCAAATGGCTAATGCAGCTAGAACAATTGGTAGCAATGTTTTGGAAAAGAAATTTGTTGAGGCTATCGAAAAAATCAAACGGGATATTGTTTTTGCAGCTAGTCTTTATCTTTGACCAATGGTGTTTACTGCATACATTATTTCTAAAGATTCTNTGTGCTTTTTTTAATCCCAATACAAATACATAT]

[+] EMBL CD179925             [CCACGTCTTTCAGAACTTTCAAAAGTTTATAGAAAGAAAGAGCAACTTC GCA AACGTATCGATGCTCTTACAGCTAATTTGAATAGTAAAGTTTCTTTAATTCAACTGGAAGAACTATCGGCTCGTAAACGTGTATTAAGACGATTAAATTTCGTTTCCGAATATGATGTAATCGAATTAAAGGGTTGTGTAGCCTGTGAAATCACCTCAGCAGATGAGTTATTATTAACAGAACTTTTATTTGATGGAGTATTCAATAGACTGTCATCTGAACATATTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD128287             [                            ATAGAAAGAAAGAGCAACTTC GCA AACGTATCGATGCTCTTACAGCTAATTTGAATAGTAAAGTTTCTTTAATTCAACTGGAAGAACTATCGGCTCGTAAACGTGTATTAAGACGATTAAATTTCGTTTCCGAATATGATGTAATCGAATTAAAGGGTTGTGTAGCCTGTGAAATCACCTCAGCAGATGAGTTATTATTAACAGAACTTTTATTTGATGGAGTATTCAATAGACTGTCATCTGAACATATTGCAGCATTACTTTCCTGTTTTGTATTTGAGGAGAGAGCTTCTGAAATGCCTAAATTAACTAAAGAGTTATCTGATGCTTTGCGTACATTACAAGATACAGCCAGACGTATTGCACGTATTAGTAACGAATGTCGTCTCCCAGTTGATGAAGATAATTACGTGGATTCATTTAAACCTCATTTAATGGATCTTGTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD079719             [                                   accagccaAAATTCGGCACGAGGAACCGATGCTCTTACAGCTAATTTGAATAGTAAAGTTTCTTTAATTCAACTGGAAGAACTATCGGCTCGTAAACGTGTATTAAGACGATTAAATTTCGTTTCCGAATATGATGTAATCGAATTAAAGGGTTGTGTAGCCTGTGAAATCACCTCAGCAGATGAGTTATTATTAACAGAACTTTTATTTGATGGAGTATTCAATAGACTGTCATCTGAACATATTGCAGCATTACTTTCTTGTTTTGTATTTGAGGAGAGAGCTTCTGAAATGCCTAAATTAACTAAAGAGTTATCTGATGCTTTGCGTACATTACAAGATACAGCCAGACGTATTGCACGTATTAGTAACGAATGTCGTCTCCCAGTTGATGAAGATAATTACGTGGATTCATTTAAACCTCATTTAATGGATCTTGTTGATGCATGGACAAGAGGAGCATCCTTTGCTAGCGTTTGTTCTATGACAGACTTGTTCGAAGGCACAATTATTCGTACATTAAGATTACTTGAAGAGTTATTACGTCAAATGGCTAATGCAGCTAGAACAATTGGTAGCAATGTTTTGGAAAAGAAATTTGTTGAGGCTATCGAAAAAATCAAACGGGATATTGTTTTTGCAGCTAGTCTTTATCTTTGACCAATGGTGTTTACTGCATACATTATTTCTAAAGATTCTNTGTGCTTT                         ]
[-] EMBL CD073977             [                                                                                                                   ACTATCGGCTCGTAAACGTGTATTAAGACGATTAAATTTCGTTTCCGAATATGATGTAATCGAATTAAAGGGTTGTGTAGCCTGTGAAATCACCTCAGCAGATGAGTTATTATTAACAGAACTTTTATTTGATGGAGTATTCAATAGACTGTCATCTGAACATATTGCAGCATTACTTTCTTGTTTTGTATTTGAGGAGAGAGCTTCTGAAATGCCTAAATTAACTAAAGAGTTATCTGATGCTTTGCGTACATTACAAGATACAGCCAGACGTATTGCACGTATTAGTAACGAATGTCGTCTCCCAGTTGATGAAGATAATTACGTGGATTCATTTAAACCTCATTTAATGGATCTTGTTGATGCATGGACAAGAGGAGCATCCTTTGCTAGCGTTTGTTCTATGACAGACTTGTTCGAAGGCACAATTATTCGTACATTAAGATTACTTGAAGAGTTATTACGTCAAATGGCTAATGCAGCTAGAACAATTGGTAGCAATGTTTTGGAAAAGAAATTTGTTGAGGCTATCGAAAAAATCAAACGGGATATTGTTTTTGCAGCTAGTCTTTATCTTTGACCAATGGTGTTTACTGCATACATTATTTCTAAAGATTCTTTGTGCTGTTTTTAATCCCAATACAAATACATAT]


>consensus_6677#0 CCACGTCTTTCAGAACTTTCAAAAGTTTATAGAAAGAAAGAGCAACTTCGCAAACGTATC GATGCTCTTACAGCTAATTTGAATAGTAAAGTTTCTTTAATTCAACTGGAAGAACTATCG GCTCGTAAACGTGTATTAAGACGATTAAATTTCGTTTCCGAATATGATGTAATCGAATTA AAGGGTTGTGTAGCCTGTGAAATCACCTCAGCAGATGAGTTATTATTAACAGAACTTTTA TTTGATGGAGTATTCAATAGACTGTCATCTGAACATATTGCAGCATTACTTTCTTGTTTT GTATTTGAGGAGAGAGCTTCTGAAATGCCTAAATTAACTAAAGAGTTATCTGATGCTTTG CGTACATTACAAGATACAGCCAGACGTATTGCACGTATTAGTAACGAATGTCGTCTCCCA GTTGATGAAGATAATTACGTGGATTCATTTAAACCTCATTTAATGGATCTTGTTGATGCA TGGACAAGAGGAGCATCCTTTGCTAGCGTTTGTTCTATGACAGACTTGTTCGAAGGCACA ATTATTCGTACATTAAGATTACTTGAAGAGTTATTACGTCAAATGGCTAATGCAGCTAGA ACAATTGGTAGCAATGTTTTGGAAAAGAAATTTGTTGAGGCTATCGAAAAAATCAAACGG GATATTGTTTTTGCAGCTAGTCTTTATCTTTGACCAATGGTGTTTACTGCATACATTATT TCTAAAGATTCTNTGTGCTTTTTTTAATCCCAATACAAATACATAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)