These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6677#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 766 fasta sequence [CCACGTCTTTCAGAACTTTCAAAAGTTTATAGAAAGAAAGAGCAACTTC-GCA-AACGTATCGATGCTCTTACAGCTAATTTGAATAGTAAAGTTTCTTTAATTCAACTGGAAGAACTATCGGCTCGTAAACGTGTATTAAGACGATTAAATTTCGTTTCCGAATATGATGTAATCGAATTAAAGGGTTGTGTAGCCTGTGAAATCACCTCAGCAGATGAGTTATTATTAACAGAACTTTTATTTGATGGAGTATTCAATAGACTGTCATCTGAACATATTGCAGCATTACTTTCTTGTTTTGTATTTGAGGAGAGAGCTTCTGAAATGCCTAAATTAACTAAAGAGTTATCTGATGCTTTGCGTACATTACAAGATACAGCCAGACGTATTGCACGTATTAGTAACGAATGTCGTCTCCCAGTTGATGAAGATAATTACGTGGATTCATTTAAACCTCATTTAATGGATCTTGTTGATGCATGGACAAGAGGAGCATCCTTTGCTAGCGTTTGTTCTATGACAGACTTGTTCGAAGGCACAATTATTCGTACATTAAGATTACTTGAAGAGTTATTACGTCAAATGGCTAATGCAGCTAGAACAATTGGTAGCAATGTTTTGGAAAAGAAATTTGTTGAGGCTATCGAAAAAATCAAACGGGATATTGTTTTTGCAGCTAGTCTTTATCTTTGACCAATGGTGTTTACTGCATACATTATTTCTAAAGATTCTNTGTGCTTTTTTTAATCCCAATACAAATACATAT] [+] EMBL CD179925 [CCACGTCTTTCAGAACTTTCAAAAGTTTATAGAAAGAAAGAGCAACTTC GCA AACGTATCGATGCTCTTACAGCTAATTTGAATAGTAAAGTTTCTTTAATTCAACTGGAAGAACTATCGGCTCGTAAACGTGTATTAAGACGATTAAATTTCGTTTCCGAATATGATGTAATCGAATTAAAGGGTTGTGTAGCCTGTGAAATCACCTCAGCAGATGAGTTATTATTAACAGAACTTTTATTTGATGGAGTATTCAATAGACTGTCATCTGAACATATTGCA ] [+] EMBL CD128287 [ ATAGAAAGAAAGAGCAACTTC GCA AACGTATCGATGCTCTTACAGCTAATTTGAATAGTAAAGTTTCTTTAATTCAACTGGAAGAACTATCGGCTCGTAAACGTGTATTAAGACGATTAAATTTCGTTTCCGAATATGATGTAATCGAATTAAAGGGTTGTGTAGCCTGTGAAATCACCTCAGCAGATGAGTTATTATTAACAGAACTTTTATTTGATGGAGTATTCAATAGACTGTCATCTGAACATATTGCAGCATTACTTTCCTGTTTTGTATTTGAGGAGAGAGCTTCTGAAATGCCTAAATTAACTAAAGAGTTATCTGATGCTTTGCGTACATTACAAGATACAGCCAGACGTATTGCACGTATTAGTAACGAATGTCGTCTCCCAGTTGATGAAGATAATTACGTGGATTCATTTAAACCTCATTTAATGGATCTTGTTGA ] [+] EMBL CD079719 [ accagccaAAATTCGGCACGAGGAACCGATGCTCTTACAGCTAATTTGAATAGTAAAGTTTCTTTAATTCAACTGGAAGAACTATCGGCTCGTAAACGTGTATTAAGACGATTAAATTTCGTTTCCGAATATGATGTAATCGAATTAAAGGGTTGTGTAGCCTGTGAAATCACCTCAGCAGATGAGTTATTATTAACAGAACTTTTATTTGATGGAGTATTCAATAGACTGTCATCTGAACATATTGCAGCATTACTTTCTTGTTTTGTATTTGAGGAGAGAGCTTCTGAAATGCCTAAATTAACTAAAGAGTTATCTGATGCTTTGCGTACATTACAAGATACAGCCAGACGTATTGCACGTATTAGTAACGAATGTCGTCTCCCAGTTGATGAAGATAATTACGTGGATTCATTTAAACCTCATTTAATGGATCTTGTTGATGCATGGACAAGAGGAGCATCCTTTGCTAGCGTTTGTTCTATGACAGACTTGTTCGAAGGCACAATTATTCGTACATTAAGATTACTTGAAGAGTTATTACGTCAAATGGCTAATGCAGCTAGAACAATTGGTAGCAATGTTTTGGAAAAGAAATTTGTTGAGGCTATCGAAAAAATCAAACGGGATATTGTTTTTGCAGCTAGTCTTTATCTTTGACCAATGGTGTTTACTGCATACATTATTTCTAAAGATTCTNTGTGCTTT ] [-] EMBL CD073977 [ ACTATCGGCTCGTAAACGTGTATTAAGACGATTAAATTTCGTTTCCGAATATGATGTAATCGAATTAAAGGGTTGTGTAGCCTGTGAAATCACCTCAGCAGATGAGTTATTATTAACAGAACTTTTATTTGATGGAGTATTCAATAGACTGTCATCTGAACATATTGCAGCATTACTTTCTTGTTTTGTATTTGAGGAGAGAGCTTCTGAAATGCCTAAATTAACTAAAGAGTTATCTGATGCTTTGCGTACATTACAAGATACAGCCAGACGTATTGCACGTATTAGTAACGAATGTCGTCTCCCAGTTGATGAAGATAATTACGTGGATTCATTTAAACCTCATTTAATGGATCTTGTTGATGCATGGACAAGAGGAGCATCCTTTGCTAGCGTTTGTTCTATGACAGACTTGTTCGAAGGCACAATTATTCGTACATTAAGATTACTTGAAGAGTTATTACGTCAAATGGCTAATGCAGCTAGAACAATTGGTAGCAATGTTTTGGAAAAGAAATTTGTTGAGGCTATCGAAAAAATCAAACGGGATATTGTTTTTGCAGCTAGTCTTTATCTTTGACCAATGGTGTTTACTGCATACATTATTTCTAAAGATTCTTTGTGCTGTTTTTAATCCCAATACAAATACATAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||