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Schistosoma mansoni
cluster # 6695 cluster # 6695       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6695#0 length = 869 sequences # 4  

consensusID : consensus_6695#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 869
fasta sequence
                              [TCGGCACGAGGTGATTTGTTGCATGATGAATGATCATCCATCAGAACCTCTTGAAGTAGACAGTTTGAACAAATTAAATAGTATTAATTTAGGTCATTCTCCAGATAATTGGTCTGATTGGTTTTCCTATATGTCTTTACAGTTCGTATTATATGTAGCTAAAAGTCCGTGGGAATTTCTTACATCTGTATTGATAATCCTTACACCTCTCATGATAATTTGTGCTTATTGTTCATATAAGCTGGCTAAAGAATTGAAACGTCAAGAAGCGGATCAAAAGATGAAGGCTAGACGTACAGCTGCCATTAACAAATCTAAGAAGCAAGTCAAAGTGGACTAAATATGAGAGAACCTTAATAATCTGATGAACATCGTTGCGCCAACTCTCAGTTGTGTAGACTGTTCCAGAATATGTGATCTTTTCTCTTTTTTATAGAACTCTTTTCATTTGTGTAATAAACCGTTTTAATTTGTATTTATGTGTAAATTTGATGGAAATGTTTATTAAGATCGGGGCTAAACAATGTATGCACGTATACTGAATCGTCGTATTGTTAAACTCAATTTATAGTGTGTAATATTATGGATTTTTTAATCTTTATTTTATCCAATTTATTTTCTACGTGAAAAATTTTTGCTTTTGTTATTATCTCTGGTTGTTCTTTGCAGTTCTTTTACATAGTACATACTAATGATAATTTGGAATTTCGTATTTGTCCGATAAGAATGCGATGTTTGCTGTCCACAAGGATCACTTGTGCCGTCTAATACTTGGTAAAGTGCCCTATCAAGAATGAGGTTTCTAAGTCTCAGAGCAATATGTGGGGTAGCTGGCTACAACTACCATTCATAAAAATTTCCGGAATAAA]

[+] EMBL CD079932             [TCGGCACGAGGTGATTTGTTGCATGATGAATGATCATCCATCAGAACCTCTTGAAGTAGACAGTTTGAACAAATTAAATAGTATTAATTTAGGTCATTCTCCAGATAATTGGTCTGATTGGTTTTCCTATATGTCTTTACAGTTCGTATTATATGTAGCTAAAAGTCCGTGGGAATTTCTTACATCTGTATTGATAATCCTTACACCTCTCATGATAATTTGTGCTTATTGTTCATATAAGCTGGCTAAAGAATTGAAACGTCAAGAAGCGGATCAAAAGATGAAGGCTAGACGTACAGCTGCCATTAACAAATCTAAGAAGCAAGTCAAAGTGGACTAAATATGAGAGAACCTTAATAATCTGATGAACATCGTTGCGCCAACTCTCAGTTGTGTAGACTGTTCCAGAATATGTGATCTTTTCTCTTTTTTATAGAACTCTTTTCATTTGTGTAATAAACCGTTTTAATTTGTATTTATGTGTAAATTTGATGGAAATGTTTATTAAGATCGGGGCTAAACAATGTATGCACGTATACTGAATCGTCGTATTGTTAAACTCAATTTATAGTGTGTAATATTATGGATTTTTTAATCTTTATTTTATCCAATTTATTTTCTACGTGAAAAATTTT                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AW016966             [         tGTGATTTGTTGCATGATGAATGATCATCCATCAGAACCTCTTGAAGTAGACAGTTTGAACAAATTAAATAGTATTAATTTAGGTCATTCTCCAGATAATTGGTCTGATTGGTTTTCCTATATGTCTTTACAGTTCGTATTATATGTAGCTAAAAGTCCGTGGGAATTTCTTACATCTGTATTGATAATCCTTACACCTCTCATGATAATTTGTGCTTATTGTTCATATAAGCTGGCTAAAGAATTGAAACGTCAAGAAGCGGATCAAAAGATGAAGGCTAGACGTACAGCTGCCATTAACAAATCTAAGAAGCAAGTCAAAGTGGACTAAATATGAGAGAACTTTAATAATCTGATGAACATCGTTGCGCCAACTCTCAGTTGTGTAGACTGTTCCAGAATATGTGATCTTTTCTCTTTTTTATAGAACTCTTTTCATTTGTGTAATAAACCGTTTTAATTTGTATTTATGTGTAAATTTGATGGAAATGTTTATTAAGATCGGGGCTAAACAATGTATGCACGTATACTGAATCGTCGTATTGTTAAACTCAATTTATAGTGTGTAATATTATGGATTTTTTAATCTTTATTTTGTCCAATTTATTTTCTACGTGAAAAATTTTTGC                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD074129             [            GATTTGTGNCATGATGAATGATCATCCATCAGAACCTCTTGAAGTAGACAGTTTGAACAAATTAAATAGTATTAATTTAGGTCATTCTCCAGATAATTGGTCTGATTGGTTTTCCTATATGTCTTTACAGTTCGTATTATATGTAGCTAAAAGTCCGTGGGAATTTCTTACATCTGTATTGATAATCCTTACACCTCTCATGATAATTTGTGCTTATTGTTCATATAAGCTGGCTAAAGAATTGAAACGTCAAGAAGCGGATCAAAAGATGAAGGCTAGACGTACAGCTGCCATTAACAAATCTAAGAAGCAAGTCAAAGTGGACTAAATATGAGAGAACCTTAATAATCTGATGAACATCGTTGCGCCAACTCTCAGTTGTGTAGACTGTTCCAGAATATGTGATCTTTTCTCTTTTTTATAGAACTCTTTTCATTTGTGTAATAAACCGTTTTAATTTGTATTTATGTGTAAATTTGATGGAAATGTTTATTAAGATCGGGGCTAAACAATGTATGCACGTATACTGAATCGTCGTATTGTTAAACTCAATTTATAGTGTGTAATATTATGGATTTTTTAATCTTTATTTTATCCAATTTATTTTCTACGTGAAAAATTTTT                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD118262             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGANAATGTTTATTAAGATCGGGGCTAAACAATGTATGCACGTATACTGAATCGTCGTATTGTTAAACTCAATTTATAGTGTGTAATATTATGGATTTTTTAATCTTTATTTTATCCAATTTATTTTCTACGTGAAAAATTTTTGCTTTTGTTATTATCTCTGGTTGTTCTTTGCAGTTCTTTTACATAGTACATACTAATGATAATTTGGAATTTCGTATTTGTCCGATAAGAATGCGATGTTTGCTGTCCACAAGGATCACTTGTGCCGTCTAATACTTGGTAAAGTGCCCTATCAAGAATGAGGTTTCTAAGTCTCAGAGCAATATGTGGGGTAGCTGGCTACAACTACCATTCATAAAAATTTCCGGAATAAA]


>consensus_6695#0 TCGGCACGAGGTGATTTGTTGCATGATGAATGATCATCCATCAGAACCTCTTGAAGTAGA CAGTTTGAACAAATTAAATAGTATTAATTTAGGTCATTCTCCAGATAATTGGTCTGATTG GTTTTCCTATATGTCTTTACAGTTCGTATTATATGTAGCTAAAAGTCCGTGGGAATTTCT TACATCTGTATTGATAATCCTTACACCTCTCATGATAATTTGTGCTTATTGTTCATATAA GCTGGCTAAAGAATTGAAACGTCAAGAAGCGGATCAAAAGATGAAGGCTAGACGTACAGC TGCCATTAACAAATCTAAGAAGCAAGTCAAAGTGGACTAAATATGAGAGAACCTTAATAA TCTGATGAACATCGTTGCGCCAACTCTCAGTTGTGTAGACTGTTCCAGAATATGTGATCT TTTCTCTTTTTTATAGAACTCTTTTCATTTGTGTAATAAACCGTTTTAATTTGTATTTAT GTGTAAATTTGATGGAAATGTTTATTAAGATCGGGGCTAAACAATGTATGCACGTATACT GAATCGTCGTATTGTTAAACTCAATTTATAGTGTGTAATATTATGGATTTTTTAATCTTT ATTTTATCCAATTTATTTTCTACGTGAAAAATTTTTGCTTTTGTTATTATCTCTGGTTGT TCTTTGCAGTTCTTTTACATAGTACATACTAATGATAATTTGGAATTTCGTATTTGTCCG ATAAGAATGCGATGTTTGCTGTCCACAAGGATCACTTGTGCCGTCTAATACTTGGTAAAG TGCCCTATCAAGAATGAGGTTTCTAAGTCTCAGAGCAATATGTGGGGTAGCTGGCTACAA CTACCATTCATAAAAATTTCCGGAATAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)