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Schistosoma mansoni
cluster # 6705 cluster # 6705       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6705#0 length = 1076 sequences # 4  

consensusID : consensus_6705#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1076
fasta sequence
                              [TAACAATGATTCTGAACAGGTCGCTATTGGAAATTCTGATAAAGGACAGTCGTTAGATCCTGATTCCACAGTATGTCATCGTCGTAGTTTAGTTGAAGGAATGTTAGAAAGTCTGGGACAATCTATTCAT-GTACCAATAC-TCAAT-GGTGGTGAAAGCGGAATATTAACTAATGACATGCTAGTAGATCTTAGTGTTAACTTCCCTGCACATTGGACTAGTTCTAACTTAAATTCAATCTACAAATCTGAAGATGATGGCTATAGTTTAAACACAGTGTACAGAAAATGTAAAGATGTTGAAGGTAGTGTTCTATTGCTTATACGTGATACAATGGGTGTTGTATTTGGTGCTGTTATGTCGGAAACAATGAAATGTAGTAAACATTTTTATGGGACTGGTGAAACATTTGTCTTTCATTGGAAACCAACATTTAAAAAATATTGTTGGACTAAGAAGAATTATTTTTTCATGAGAGGATCTCTTCATTCATTTCATATTGGTGGTCAAAGTGGACGAAATGCAATATGGTTTGATGAATCATTAAAATATGGTTGTAGTGAACCAACAGATACATTTGATA-ATCCTGTACTTAGTGGAAATTTACCAGATATACAATTTTCTTCTTTATCAATCAATAAATCTGATAAAAATGAAAATGTAATTATACAAAACAATTATCAAAATGTCCATAATAATCATAATTTTAATCCATTAAATCCAACTATAAATTATCCATCTACAATAAGTGACAGTGTCTCATTCATCATTGATACATTTGAATTGTGGCAATTAATCAGTTGTTAGTGATAAAAGTGTTATATATTTTCATTGTATTTGATCTATCTATTATCTTTTGTTATTCACTTATCTATATTTATGATTAATGACATACTGTATGTATATGAATGATGAATTATGTAATCATCATAAATAAAAATGATCAATCAACTATTCGGTTTCTTTAGTTTATGTTTGATAGATTTTAATTGTCATTCCATTAATTGATAAAATGTGTCCCTTTTTTTTGTAAAATAGTTTTTCTTGTTTTTCATTTACTTATAATATAAATAAACAA]

[+] EMBL AW186598             [TAACAATGATTCTGAACAGGTCGCTATTGGAAATTCTGATAAAGGACAGTCGTTAGATCCTGATTCCACAGTATGTCATCGTCGTAGTTTAGTTGAAGGAATGTTAGAAAGTCTGGGACAATCTATTCATGGTACCAATACATCAATGGGTGGTGAAAGCGGGATATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD096900             [                                                                      GTATGTCATCGTCGTAGTTTAGTTGAAGAAATGTTAGAAAGTCTGGAACAATCTATTCAT GTACCAATAC TCAAT GGTGGTGAAAGCGGAATATTAACTAATGACATGCTAGTAGATCTTAGTGTTAACTTCCCTGCACATTGGACTAGTTCTAACTTAAATTCAATCTACAAATCTGAAGATGATGGCTATAGTTTAAACACAGTGTACAGAAAATGTAAAGATGTTGAAGGTAGTGTTCTATTGCTTATACGTGATACAATGGGTGTTGTATTTGGTGCTGTTATGTCGGAAACAATGAAATGTAGTAAACATTTTTATGGGACTGGTGAAACATTTGTCTTTCATTGGAAACCAACATTTAAAAAATATTGTTGGACTAAGAAGAATTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD080350             [                                                                                                                          CTATTCAT GTACCAATAC TCAAT GGTGGTGAAAGCGGAATATTAACTAATGACATGCTAGTAGATCTTAGTGTTAACTTCCCTGCACATTGGACTAGTTCTAACTTAAATTCAATCTACAAATCTGAAGATGATGGCTATAGTTTAAACACAGTGTACAGAAAATGTAAAGATGTTGAAGGTAGTGTTCTATTGCTTATACGTGATACAATGGGTGTTGTATTTGGTGCTGTTATGTCGGAAACAATGAAATGTAGTAAACATTTTTATGGGACTGGTGAAACATTTGTCTTTCATTGGAAACCAACATTTAAAAAATATTGTTGGACTAAGAAGAATTATTTTTTCATGAGAGGATCTCTTCATTCATTTCATATTGGTGGTCAAAGTGGACGAAATGCAATATGGTTTGATGAATCATTAAAATATGGTTGTAGTGAACCAACAGATACATTTGATA ATCCTGTACTTAGTGGAAATTTACCAGATATACAATTTTCTTCTTTATCAATCAATAAATCTGATAAAAATGAAAATGTAATTATACAAAACAATTATCAAAATGTCCATAATAATCATAATTTTAATCCATTAAATCCAACTATAAATTATCCATCTACAATAAGTGACAGTGTCTCATTCATCATTGATACATTTGAATTGTGGCAATTAATCAGTTGTTAGTGATAAAAGTGT                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD074267             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AATTATTTTTTCATGAGAGGATCTCTTCATTCATTTCATATTGGTGGTCAAAGTGGACGAAATGCAATATGGTTTGATGAATCATTAAAATATGGTTGTAGTGAACCAACAGATACATTTGATANATCCTGTACTTAGTGGAAATTTACCAGATATACAATTTTCTTCTTTATCAATCAATAAATCTGATAAAAATGAAAATGTAATTATACAAAACAATTATCAAAATGTCCATAATAATCATAATTTTAATCCATTAAATCCAACTATAAATTATCCATCTACAATAAGTGACAGTGTCTCATTCATCATTGATACATTTGAATTGTGGCAATTAATCAGTTGTTAGTGATAAAAGTGTTATATATTTTCATTGTATTTGATCTATCTATTATCTTTTGTTATTCACTTATCTATATTTATGATTAATGACATACTGTATGTATATGAATGATGAATTATGTAATCATCATAAATAAAAATGATCAATCAACTATTCGGTTTCTTTAGTTTATGTTTGATAGATTTTAATTGTCATTCCATTAATTGATAAAATGTGTCCCTTTTTTTTGTAAAATAGTTTTTCTTGTTTTTCATTTACTTATAATATAAATAAACAA]


>consensus_6705#0 TAACAATGATTCTGAACAGGTCGCTATTGGAAATTCTGATAAAGGACAGTCGTTAGATCC TGATTCCACAGTATGTCATCGTCGTAGTTTAGTTGAAGGAATGTTAGAAAGTCTGGGACA ATCTATTCATGTACCAATACTCAATGGTGGTGAAAGCGGAATATTAACTAATGACATGCT AGTAGATCTTAGTGTTAACTTCCCTGCACATTGGACTAGTTCTAACTTAAATTCAATCTA CAAATCTGAAGATGATGGCTATAGTTTAAACACAGTGTACAGAAAATGTAAAGATGTTGA AGGTAGTGTTCTATTGCTTATACGTGATACAATGGGTGTTGTATTTGGTGCTGTTATGTC GGAAACAATGAAATGTAGTAAACATTTTTATGGGACTGGTGAAACATTTGTCTTTCATTG GAAACCAACATTTAAAAAATATTGTTGGACTAAGAAGAATTATTTTTTCATGAGAGGATC TCTTCATTCATTTCATATTGGTGGTCAAAGTGGACGAAATGCAATATGGTTTGATGAATC ATTAAAATATGGTTGTAGTGAACCAACAGATACATTTGATAATCCTGTACTTAGTGGAAA TTTACCAGATATACAATTTTCTTCTTTATCAATCAATAAATCTGATAAAAATGAAAATGT AATTATACAAAACAATTATCAAAATGTCCATAATAATCATAATTTTAATCCATTAAATCC AACTATAAATTATCCATCTACAATAAGTGACAGTGTCTCATTCATCATTGATACATTTGA ATTGTGGCAATTAATCAGTTGTTAGTGATAAAAGTGTTATATATTTTCATTGTATTTGAT CTATCTATTATCTTTTGTTATTCACTTATCTATATTTATGATTAATGACATACTGTATGT ATATGAATGATGAATTATGTAATCATCATAAATAAAAATGATCAATCAACTATTCGGTTT CTTTAGTTTATGTTTGATAGATTTTAATTGTCATTCCATTAATTGATAAAATGTGTCCCT TTTTTTTGTAAAATAGTTTTTCTTGTTTTTCATTTACTTATAATATAAATAAACAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)