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Schistosoma mansoni
cluster # 6706 cluster # 6706       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6706#0 length = 1134 sequences # 4  
consensusID : consensus_6706#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1134
fasta sequence 
                              [AATCCTCGGAATTTGTATTATTTATTCTCAAAAAAAAAAGATTCCGAGGGTTTTTTAACATCTCTTAACAATGTATGTAAAAAGAAACTGAGCACTTTGTACGATTGTCTACTGAGAAAAATTCAAGGGGAGTATATTACAAATTGTTGTTCAAATATGTACGTATATCATCAAAGTTTATACCATGACAACTATCCACGTGTGTGAATGCTAAGCATTTCAATAAAATAATATCATCTCACTATGTTAATCGTTTCTTTGGGTTGTTTAGTTACTTTTTTCATGCTTGTATCTCTCTGGATTTAGTTCTCATTGTTCTGATGCATTTATATACTTTACCTGTGTAGTCATGTACATCACCTCGTTTATTTTAATTAAATTATTCAAATTACGATATTGCTTGCTTTAATATTGTCCAAAATGTTCCGGTGCTATTTTTACTGATTCCGTTCTGAGAATCAACGAAATTCTATGAGAAATTGTATTAATTGGCTTTTGAACTCTTCCGTGTTAAGCAAAAAATAAGCGGTTTGCTTCATTCTTTTTCGGATGTTTGAATATTCGTTGAACAGTGTATCTTATTATGTGTTTTTTTCATGTTATTATTATCGTTGTTACTGCGCAATCTTTTCTCTTACTTCAAATAAAACAATAATCTATATAAAGAATTGTGTATTTCATTGTTTCCTTCCACATTTCATAATGCTTCAGCATTTTATATGGTTTTTGCTAAATGCTCTTGTAAAGTGATTGCCACAGATGATGCTAACTGGCGCAACTGTTCTCTTCGCCCTCCTTTTTGTCTAGCCCTATATATACATAAAATTGTATTTATTGTGTATAGTGATTTTCAAACAGTTATCAGTATAAATATTGAAAATTATAAGCTTATTATTATTACTACTAGTATCACTACTTCTGACATTACCACCACGACTTGAAAAAGACGTTCGATGAATAAACTTACTACTTTTTTTTGTATTTCAGTTTCCATTTTCCTCTCATCATTGTTTACATTTTCACTTATCTAATATATATACATATATCTATTTAACCGGAAAATTTCTTATTTCTCTATTATTATTTTATCACATCTATGTTTATACAATTTTATATTATTAAAATAAATAACTA]

[+] EMBL CD131267             [AATCCTCGGAATTTGTATTATTTATTCTCAAAAAAAAAAGATTCCGAGGGTTTTTTAACATCTCTTAACAATGTATGTAAAAAGAAACTGAGCACTTTGTACGATTGTCTACTGAGAAAAATTCAAGGGGAGTATATTACAAATTGTTGTTCAAATATGTACGTATATCATCAAAGTTTATACCATGACAACTATCCACGTGTGTGAATGCTAAGCATTTCAATAAAATAATATCATCTCACTATGTTAATCGTTTCTTTGGGTTGTTTAGTTACTTTTTTCATGCTTGTATCTCTCTGGATTTAGTTCTCATTGTTCTGATGCATTTATATACTTTACCTGTGTAGTCATGTACATCACCTCGTTTATTTTAATTAAATTATTCAAATTACGATATTGCTTGCTTTAATATTGTCCAAAATGTTCCGGTGCTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD080415             [                                                                     AATGTATGTAAAAAGAAACTGAGCACTTTGTACGATTGTCTACTGAGAAAAATTCAAGGGGAGTATATTACAAATTGTTGTTCAAATATGTACGTATATCATCAAAGTTTATACCATGACAACTATCCACGTGTGTGAATGCTAAGCATTTCAATAAAATAATATCAT TCACTATGTTAATCGTTTCTTTGGGTTGTTTAGTTACTTTTTTCATGCTTGTATCTCTCTGGATTTAGTTTTCATTGTTCTGATGCATTTATATACTTTACCTGTGTAGTCATGTACATCACCTCGTTTATTTTAATTAAATTATTCAAATTACGATATTGCTTGTTTTAATATTGTCCAAAATGTTCCGGTGCTATTTTTACTGATTCCGTTCTGAGAATCAACGAAATTCTATGAGAAATTGTATTAATTGGCTTTTGAACTCTTCCGTGTTAAGCAAAAAATAAGCGGTTTGCTTCATTCTTTTTCGGATGTTTGAATATTCGTTGAACAGTGTATCTTATTATGTGTTTTTTTCATGTTATTATTATCGTTGTTACTGCGCAATCTTTTCTCTTACTTCAAATAAAACAATAATCTATATAAAGAATTGTGTATTTCATTGTTTCCTTCCACATTTCATAATGCTTCAGCATTNTATATGGTTNTTGCTAAATGCTCTTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD074328             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTGTATTAATTGGCTTTTGAACTCTTCCGTGTTAAGCAAAAAATAAGCGGTNTGCTTCATTCTTTTTCGGATGTTTGAATATTCGTTGAACAGTGTATCTTATTATGTGTTTTTTTCATGTTATTATTATCGTTGTTACTGCGCAATCTTTTCTCTTACTTCAAATAAAACAATAATCTATATAAAGAATTGTGTATTTCATTGTTTCCTTCCACATTTCATAATGCTTCAGCATTTTATATGGTTTTTGCTAAATGCTCTTGTAAAGTGATTGCCACAGATGATGCTAACTGGCGCAACTGTTCTCTTCGCCCTCCTTTTTGTCTAGCCCTATATATACATAAAATTGTATTTATTGTGTATAGTGATTTTCAAACAGTTATCAGTATAAATATTGAAAATTATAAGCTTATTATTATTACTACTAGTATCACTACTTCTGACATTACCACCACGACTTGAAAAAGACGTTCGATGAATAAACTTACTACTTTTTTTTGTATTTCAGTTTCCATTTTCCTCTCATCATTGTTTACATTTTCACTTATCTAATATATATACATATATCTATTTAACCGGAAAATTTCTTATTTCTCTATTATTATTTTATCACATCTATGTTTATACAATTTTATATTATTAAAATAAATAACTA]
[-] EMBL CD074506             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATTAA TGGC TTTGAACTCTTCCGTG TAAGCAAAAAATAAGCGGTTTGCTTCATTCTTTTTCGGATGTTTGAATATTCGTTGAACAGTGTATCTTATTATGTGTTTTTTTCATGTTATTATTATCGTTGTTACTGCGCAATCTTTTCTCTTACTTCAAATAAAACAATAATCTATATAAAGAATTGTGTATTTCATTGTTTCCTTCCACATTTCATAATGCTTCAGCATTTTATATGGTTTTTGCTAAATGCTCTTGTAAAGTGATTGCCACAGATGATGCTAACTGGCGCAACTGTTCTCTTCGCCCTCCTTTTTGTCTAGCCCTATATATACATAAAATTGTATTTATTGTGTATAGTGATTTTCAAACAGTTATCAGTATAAATATTGAAAATTATAAGCTTATTATTATTACTACTAGTATCACTACTTCTGACATTACCACCACGACTTGAAAAAGACGTTCGATGAATAAACTTACTACTTTTTTTTGTATTTCAGTTTCCATTTTCCTCTCATCATTGTTTACATTTTCACTTATCTAATATATATACATATATCTATTTAACCGGAAAATTTCTTATTTCTCTATTATTATTTTATCACATCTATGTTTATACAATTTTATATTATTAAAATAAATAACTA]




>consensus_6706#0
AATCCTCGGAATTTGTATTATTTATTCTCAAAAAAAAAAGATTCCGAGGGTTTTTTAACA
TCTCTTAACAATGTATGTAAAAAGAAACTGAGCACTTTGTACGATTGTCTACTGAGAAAA
ATTCAAGGGGAGTATATTACAAATTGTTGTTCAAATATGTACGTATATCATCAAAGTTTA
TACCATGACAACTATCCACGTGTGTGAATGCTAAGCATTTCAATAAAATAATATCATCTC
ACTATGTTAATCGTTTCTTTGGGTTGTTTAGTTACTTTTTTCATGCTTGTATCTCTCTGG
ATTTAGTTCTCATTGTTCTGATGCATTTATATACTTTACCTGTGTAGTCATGTACATCAC
CTCGTTTATTTTAATTAAATTATTCAAATTACGATATTGCTTGCTTTAATATTGTCCAAA
ATGTTCCGGTGCTATTTTTACTGATTCCGTTCTGAGAATCAACGAAATTCTATGAGAAAT
TGTATTAATTGGCTTTTGAACTCTTCCGTGTTAAGCAAAAAATAAGCGGTTTGCTTCATT
CTTTTTCGGATGTTTGAATATTCGTTGAACAGTGTATCTTATTATGTGTTTTTTTCATGT
TATTATTATCGTTGTTACTGCGCAATCTTTTCTCTTACTTCAAATAAAACAATAATCTAT
ATAAAGAATTGTGTATTTCATTGTTTCCTTCCACATTTCATAATGCTTCAGCATTTTATA
TGGTTTTTGCTAAATGCTCTTGTAAAGTGATTGCCACAGATGATGCTAACTGGCGCAACT
GTTCTCTTCGCCCTCCTTTTTGTCTAGCCCTATATATACATAAAATTGTATTTATTGTGT
ATAGTGATTTTCAAACAGTTATCAGTATAAATATTGAAAATTATAAGCTTATTATTATTA
CTACTAGTATCACTACTTCTGACATTACCACCACGACTTGAAAAAGACGTTCGATGAATA
AACTTACTACTTTTTTTTGTATTTCAGTTTCCATTTTCCTCTCATCATTGTTTACATTTT
CACTTATCTAATATATATACATATATCTATTTAACCGGAAAATTTCTTATTTCTCTATTA
TTATTTTATCACATCTATGTTTATACAATTTTATATTATTAAAATAAATAACTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)