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Schistosoma mansoni
cluster # 6710 cluster # 6710       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6710#0 length = 1007 sequences # 4  
consensusID : consensus_6710#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1007
fasta sequence 
                              [TCCGAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGGACAATATTAAAATTTAATTTGAATTTACTAATTCCACTTTCAAAAGTTGATGAAAACATTGCAACAGCTTTAAAACGTGATGCTGTTCTTAATGAGAAATTCTATTTTAAACAAGGTCATTTAATAACCACAGATGGTACTCCAGTTGATTTAGCTAAATCGTGTTCCAAGTTTAAATTCAATCGTACCTATTCTACTCAGTGCGATTTTTCTGATTCAAACTGTACATTTTCTCGTGATGAACAATATGTAAACACATCGTCTTGTAATTCGACATCATCATTTGCTGAAGTAAATCCAGACGATTCCTATATGCTAATGTCGGTGAATGAAATTATCAATGGAACTAGTACTTTTCCAGGTCTTCTCCCTTTAATTCGACATTATGTTCAAGAAACTGGTGGACATCTTGAAACTATTGATCTTATTAATAGCTATTTGGATTTAATACAAAAAAGAGCATCAGGTGAGTTGATGACTACTGCCAAATGGATGAGAAGTCGTATCATGAAACATACTGACTACAAAAATGATTCGTATATATCTTCTCAAATAAATTCTGACATTATAAAAGAATGTTGGGATATTACTAGAGGTGTTATCCGACCGCCTGAACTTCTACCTCATGATTCAGTTATTGTTAACTGTTCTTCTCTATCTTGTAAATTAATGAAAAACTTCAGTGAATGTAATGAATCAAAAAAGTATACTGTTGCTGATCATAACAATGATCATTAACAAATATTGCATTTTTATTTTTGCCTCTGTGATTATAATCCCCAGTTCATTTGATTAAATTGTACCGCTCTTATTTTGTCTTGTAGTTAAGTAATTAGAGAACAGATAATTTAATTTTTTGATTTGCCCCATCATGTTGTAATAATTAACTGATAGTTTTTTAGACTTTCAATATTATTATCATTGTATATCATTATTTGATAACTTTTATTAACGATTTATTTTAATGACAATAAACCCT]

[+] EMBL CD080450             [TCCGAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGGACAATATTAAAATTTAATTTGAATTTACTAATTCCACTTTCAAAAGTTGATGAAAACATTGCAACAGCTTTAAAACGTGATGCTGTTCTTAATGAGAAATTCTATTTTAAACAAGGTCATTTAATAACCACAGATGGTACTCCAGTTGATTTAGCTAAATCGTGTTCCAAGTTTAAATTCAATCGTACCTATTCTACTCAGTGCGATTTTTCTGATTCAAACTGTACATTTTCTCGTGATGAACAATATGTAAACACATCGTCTTGTAATTCGACATCATCATTTGCTGAAGTAAATCCAGACGATTCCTATATGCTAATGTCGGTGAATGAAATTATCAATGGAACTAGTACTTTTCCAGGTCTTCTCCCTTTAATTCGACATTATGTTCAAGAAACTGGTGGACATCTTGAAACTATTGATCTTATTAATAGCTATTTGGATTTAATACAAAAAAGAGCATCAGGTGAGTTGATGACTACTGCCAAATGGATGAGAAGTCGTATCATGAAACATACTGACTACAAAAATGATTCGTATATATCTTCTCAAATAAATTCTGACATTATAAAAGAATGTTGGGATATTACTAGAGGTGTTATCCGACCGCCTGAACTTCTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD083072             [                                                        ctATTCC CTTTC AAAGTTGATGAAAACATTGCAACAGCTTTAAAACGTGATGCTGTTCTTAATGAGAAATTCTATTTTAAACAAGGTCATTTAATAACCACAGATGGTACTCCAGTTGATTTAGCTAAATCGTGTTCCAAGTTTAAATTCAATCGTACCTATTCTACTCAGTGCGATTTTTCTGATTCAAACTGTACATTTTCTCGTGATGAACAATATGTAAACACATCGTCTTGTAATTCGACATCATCATTTGCTGAAGTAAATCCAGACGATTCCTATATGCTAATGTCGGTGAATGAAATTATCAATGGAACTAGTACTTTTCCAGGTCTTCTCCCTTTAATTCGACATTATGTTCAAGAAACTGGTGGACATCTTGAAACTATTGATCTTATTAATAGCTATTTGGATTTAATACAAAAAAGAGCATCAGGTGAGTTGATGACTACTGCCAAATGGATGAGAAGTCGTATCATGAAACATACTGACTACAAAAATGATTCGTATATATCTTCTCAAATAAATTCTGACATTATAAAAGAATGTTGGGATATTACTAGAGGTGTTATCCGACCGCCTGAACTTCTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD074362             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCTTGAAACTATTGATCTTATTAATAGCTATTTGGATTTAATACAAAAAAGAGCATCAGGTGAGTTGATGACTACTGCCAAATGGATGAGAAGTCGTATCATGAAACATACTGACTACAAAAATGATTCGTATATATCTTCTCAAATAAATTTTGACATTATAAAAGAATGTTGGGATATTACTAAAGGTGTTATCCGACCGCCTGAACTTTTACCTCATGATTCAGTTATTGTTAACTGTTCTTCTCTATCTTGTAAATTAATGAAAAACTTCAGTGAATGTAATGAATCAAAAAAGTATACTGTTGCTGATCATAACAATGATCATTAACAAATATTGCATTTTTATTTTTGCCTCTGTGATTATAATCCCCAGTTCATTTGATTAAATTGTACCGCTCTTATTTTGTCTTGTAGTTAAGTAATTAGAGAACAGATAATTTAATTTTTTGATTTGCCCCATCATGTTGTAATAATTAACTGATAGTTTTTTAGACTTTCAATATTATTATCATTGTATATCATTATTTGATAACTTTTATTAACGATTTATTTTAATGACAATAAACCCT]
[-] EMBL CD076646             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCTTATTAATAGCTATTTGGATTTAATACAAAAAAGAGCATCAGGTGAGTTGATGACTACTGCCAAATGGATGAGAAGTCGTATCATGAAACATACTGACTACAAAAATGATTCGTATATATCTTCTCAAATAAATTCTGACATTATAAAAGAATGTTGGGATATTACTAGAGGTGTTATCCGACCGCCTGAACTTCTACCTCATGATTCAGTTATTGTTAACTGTTCTTCTCTATCTTGTAAATTAATGAAAAACTTCAGTGAATGTAATGAATCAAAAAAGTATACTGTTGCTGATCATAACAATGATCATTAACAAATATTGCATTTTTATTTCTGCCTCTGTGATTATAATCACCAGTTCATTTGATTAAATTGTACCGCTCTTATTTTGTCTTGTAGTTAAGTAATTAGAGAACAGATAATTTAATCTTTTGATTTGCCACATCATGTTGTAATAATTAACTGATAGTTTTTTAGACTTTCAATATTATTATCATTGTATATCATTATTTGATAACTTTTATTAACGATTTATTTTAATGACAATAAACACT]




>consensus_6710#0
TCCGAGGCCAAAAATTCGGCACGAGGGGACAATATTAAAATTTAATTTGAATTTACTAAT
TCCACTTTCAAAAGTTGATGAAAACATTGCAACAGCTTTAAAACGTGATGCTGTTCTTAA
TGAGAAATTCTATTTTAAACAAGGTCATTTAATAACCACAGATGGTACTCCAGTTGATTT
AGCTAAATCGTGTTCCAAGTTTAAATTCAATCGTACCTATTCTACTCAGTGCGATTTTTC
TGATTCAAACTGTACATTTTCTCGTGATGAACAATATGTAAACACATCGTCTTGTAATTC
GACATCATCATTTGCTGAAGTAAATCCAGACGATTCCTATATGCTAATGTCGGTGAATGA
AATTATCAATGGAACTAGTACTTTTCCAGGTCTTCTCCCTTTAATTCGACATTATGTTCA
AGAAACTGGTGGACATCTTGAAACTATTGATCTTATTAATAGCTATTTGGATTTAATACA
AAAAAGAGCATCAGGTGAGTTGATGACTACTGCCAAATGGATGAGAAGTCGTATCATGAA
ACATACTGACTACAAAAATGATTCGTATATATCTTCTCAAATAAATTCTGACATTATAAA
AGAATGTTGGGATATTACTAGAGGTGTTATCCGACCGCCTGAACTTCTACCTCATGATTC
AGTTATTGTTAACTGTTCTTCTCTATCTTGTAAATTAATGAAAAACTTCAGTGAATGTAA
TGAATCAAAAAAGTATACTGTTGCTGATCATAACAATGATCATTAACAAATATTGCATTT
TTATTTTTGCCTCTGTGATTATAATCCCCAGTTCATTTGATTAAATTGTACCGCTCTTAT
TTTGTCTTGTAGTTAAGTAATTAGAGAACAGATAATTTAATTTTTTGATTTGCCCCATCA
TGTTGTAATAATTAACTGATAGTTTTTTAGACTTTCAATATTATTATCATTGTATATCAT
TATTTGATAACTTTTATTAACGATTTATTTTAATGACAATAAACCCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)