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Schistosoma mansoni
cluster # 6716 cluster # 6716       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6716#0 length = 1832 sequences # 4  

consensusID : consensus_6716#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1832
fasta sequence
                              [ATTCGGCACGAGCNAGTGCGCTACAATTAGNTTTGAACTGTGACAGTCATTCTCTCTACATACTGTGCATCATATGGAAATGTATTTGTATTTGTTTTATTGGGTTTATCACAAACCTCGCGATCAGGCCTAGCAAACGATAGCCTTGGTCAATAAAAAGTGATNCAGTTTTCTCAAATGGAAAGACCTGTGCCATTTTCACGTTCCAAACTGCCTAAATCTAAGCATCGTTTTGTCTCATGGTCTGTGAAGCAAAAACAGAAAAGTAGTTATCTGTACTCTCATTCTTGTTTTCTATAGAATTCAATCAGGCCTTATCAGCGAACAGTTCAAATATCCCTCTTAATTGTCCTTTAATTGGATGTTCTGGGATTGGTCATATTAATGGCCGAGATACTGCACACGTGACCCTATCTGGATGCCCTTTGTATCACAATATGGGCTTTGTGAAATGGGCGGAGATGCGTGCTCGGGAAGAAGGTCTTGTTGTTCCAGAATCCATTAGACGGATATCTCAAAACTCACCATCGCCTTCTAAAGTTAAACATAGGGTCGACCGTTCACATCA-GTTTAAGACTACACAAAGGGAACCTATGCTTGATGATTTAGCTAGTCAAGTGGAGTTGTATCAGTTTCGTCGTGCTCAACAAAGATTGGTTTCAACTTACGAGACGGATGCCCGGGAACATTTGCTTCTGTGTGCACGAGTAGCTTCGAATTCAGGAAATGTACCCAATAATGCATTTTCCGAAAATATCGAGTTCGCTACAGAACAGCGCATACGTTCTGTTATTTTTGGGACATGGGATTNTAC-ACCGTGGTACCACAGTAATTATCCTGCCGATTTGAGTTGTCTACCTACCATATACATTTGTGAATTCTGTCTATCTGGAATGCGCCATACAGTTGCATATAATCGTCATAAAATTAATTGTGATCGAACGTTTCCTCCAGGTAATGAGATATATCGTAAAGAGAATTTATCGTTCTTTGAAATTGATGGACAAAAACATCAGGAATACTGTCGAAATTTATGTTTATTAGCTAAATTATTTCTGAAACAAAAAACAGTTCATGAATTAGATCAAGTTCCTGCATTTTTATTCTATGTATTAACTGAAACAGATCAAGATGGTTCACATATTATTGGTTATTTCTCAAAACAAAAAGCTGATGATCAACGTGACAACTCCGTCAATGCTGTGTACAATAATCTTTCGTGTATTCTCATTTTACCACCGTATCAATGTCGTGGTTTTGGTCGTATGCTTATTGAGATGAGTTATATTTTAAGTCGACTAGAACAACGTATTGGTACACCAGAACGTCCATTATCAGATTTGGGCATCATCATTTACAGAAGATATTGGCGTTTTGAAATTTTAAAATACCTATCGTCATTCACAGCTAAGTCAATTAATATTCGAAGTATGAGTCAAGAATTAGGAATAGCAGTTCCTGATATTGTAAGCACTTTATTAGATATGAAGATGCTTGTTTGCTATCGGACACAATATTACATAATCAATAATAAACCTGATGTAGACGCTCTTTTGAGTACAATTAAACCGCCTGCTACTGATCGTTGTATTGATTCTACATGCCTTCATTGGACTCCTAATGTTAGTAATGTCAGTCAGTTGAGTAAATCGCCTAGTAGTAGTACTCTTAGTATTAGTAGTACTATTAATCAAAAGCTTCATAAATCTAGTCTTATGTCACCAAATGATTCAATTGGAGCAAATATTTGAAGATTTTTCTAGTTTAATTATTGTACATTGAAATATTGTAAGGAGTTTTGTTGTGTACAATCTAATAATATGACTATTATT]

[+] EMBL CD081182             [ATTCGGCACGAGCNAGTGCGCTACAATTAGNTTTGAACTGTGACAGTCATTCTCTCTACATACTGTGCATCATATGGAAATGTATTTGTATTTGTTTTATTGGGTTTATCACAAACCTCGCGATCAGGCCTAGCAAACGATAGCCTTGGTCAATAAAAAGTGATNCAGTTTTCTCAAATGGAAAGACCTGTGCCATTTTCACGTTCCAAACTGCCTAAATCTAAGCATCGTTTTGTCTCATGGTCTGTGAAGCAAAAACAGAAAAGTAGTTATCTGTACTCTCATTCTTGTTTTCTATAGAATTCAATCAGGCCTTATCAGCGAACAGTTCAAATATCCCTCTTAATTGTCCTTTAATTGGATGTTCTGGGATTGGTCATATTAATGGCCGAGATACTGCACACGTGACCCTATCTGGATGCCCTTTGTATCACAATATGGGCTTTGTGAAATGGGCGGAGATGCGTGCTCGGGAAGAAGGTCTTGTTGTTCCAGAATCCATTAGACGGATATCTCAAAACTCACCATCGCCTTCTAAAGTTAAACATAGGGTCGACCGTTCACATCA GTTTAAGACTACACAAAGGGAACCTATGCTTGATGATTTAGCTAGTCAAGTGGAGTTGTATCAGTTTCGTCGTGCTCAACAAAGATTGGTTTCAACTTACGAGACGGATGCCCGGGAACATTTGCTTCTGTGTGCACGAGTAGCTTCGAATTCAGGAAATGTACCCAATAATGCATTTTCCGAAAATATCGAGTTCGCTACAGAACAGCGCATACGTTCTGTTATTTTTGGGACATGGGATTNTAC ACCGTGGTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD080525             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCGTTCACATCACGTTTAAGACTACACAAAGGGAACCTATGCTTGATGATTTAGCTAGTCAAGTGGAGTTGTATCAGTTTCGTCGTGCTCAACAAAGATTGGTTTCAACTTACGAGACGGATGCCCGGGAACATTTGCTTCTGTGTGCACGAGTAGCTTCGAATTCAGGAAATGTACCCAATAATGCATTTTCCGAAAATATCGAGTTCGCTACAGAACAGCGCATACGTTCTGTTATTTTTGGGACATGGGATT TACAACCGTGGTACCACAGTAATTATCCTGCCGATTTGAGTTGTCTACCTACCATATACATTTGTGAATTCTGTCTATCTGGAATGCGCCATACAGTTGCATATAATCGTCATAAAATTAATTGTGATCGAACGTTTCCTCCAGGTAATGAGATATATCGTAAAGAGAATTTATCGTTCTTTGAAATTGATGGACAAAAACATCAGGAATACTGTCGAAATTTATGTTTATTAGCTAAATTATTTCTGAAACAAAAAACAGTTCATGAATTAGATCAAGTTCCTGCATTTTTATTCTATGTATTAACTGAAACAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD075008             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGTTTATTAGCTAAATTATTTCTGAAACAAAAAACAGTTCATGAATTAGATCAAGTTCCTGCATTTTTATTCTATGTATTAACTGAAACAGATCAAGATGGTTCACATATTATTGGTTATTTCTCAAAACAAAAAGCTGATGATCAACGTGACAACTCCGTCAATGCTGTGTACAATAATCTTTCGTGTATTCTCATTTTACCACCGTATCAATGTCGTGGTTTTGGTCGTATGCTTATTGAGATGAGTTATATTTTAAGTCGACTAGAACAACGTATTGGTACACCAGAACGTCCATTATCAGATTTGGGCATCATCATTTACAGAAGATATTGGCGTTTTGAAATTTTAAAATACCTATCGTCATTCACAGCTAAGTCAATTAATATTCGAAGTATGAGTCAAGAATTAGGAATAGCAGTTCCTGATATTGTAAGCACTTTATTAGATATGAAGATGCTTGTTTGCTATCGGACACAATATTACATAATCAATAATAAACCTGATGTAGACGCTCTTTTGAGTACAATTAAACCGCCTGCTACTGATCGTTGTATTGATTCTACATGCCTTCATTGGACTCCTAATGTTAGTAATGTCAGTCAGTTGAGTAAATCGCCTAGTAGTAGTACTCTTAGTATTAGTAGTACTATTAATCAAAAGCTTCATAAATCTAGTCTTATGTCACCAAATGATTCAATTGGAGCAAATATTTGAAGATTTTTCTAGTTTAATTATTGTACATTGAAATATTGTAAGGAGTTTTGTTGTGTACAATCTAATAATATGACTATTATT]
[-] EMBL CD074436             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATTTTACCACCGTATCAATGTCGTGGTTTTGGTCGTATGCTTATTGAGATGAGTTATATTTTAAGTCGACTAGAACAACGTATTGGTACACCAGAACGTCCATTATCAGATTTGGGCATCATCATTTACAGAAGATATTGGCGTTTTGAAATTTTAAAATACCTATCGTCATTCACAGCTAAGTCAATTAATATTCGAAGTATGAGTCAAGAATTAGGAATAGCAGTTCCTGATATTGTAAGCACTTTATTAGATATGAAGATGCTTGTTTGCTATCGGACACAATATTACATAATCAATAATAAACCTGATGTAGACGCTCTTTTGAGTACAATTAAACCGCCTGCTACTGATCGTTGTATTGATTCTACATGCCTTCATTGGACTCCTAATGTTAGTAATGTCAGTCAGTTGAGTAAATCGCCTAGTAGTAGTACTCTTAGTATTAGTAGTACTATTAATCAAAAGCTTCATAAATCTAGTCTTATGTCACCAAATGATTCAATTGGAGCAAATATTTGAAGATTTTTCTAGTTTAATTATTGTACATTGAAATATTGTAAGGAGTTTTGTTGTGTACAATCTAATAATAATACTATTA  ]


>consensus_6716#0 ATTCGGCACGAGCNAGTGCGCTACAATTAGNTTTGAACTGTGACAGTCATTCTCTCTACA TACTGTGCATCATATGGAAATGTATTTGTATTTGTTTTATTGGGTTTATCACAAACCTCG CGATCAGGCCTAGCAAACGATAGCCTTGGTCAATAAAAAGTGATNCAGTTTTCTCAAATG GAAAGACCTGTGCCATTTTCACGTTCCAAACTGCCTAAATCTAAGCATCGTTTTGTCTCA TGGTCTGTGAAGCAAAAACAGAAAAGTAGTTATCTGTACTCTCATTCTTGTTTTCTATAG AATTCAATCAGGCCTTATCAGCGAACAGTTCAAATATCCCTCTTAATTGTCCTTTAATTG GATGTTCTGGGATTGGTCATATTAATGGCCGAGATACTGCACACGTGACCCTATCTGGAT GCCCTTTGTATCACAATATGGGCTTTGTGAAATGGGCGGAGATGCGTGCTCGGGAAGAAG GTCTTGTTGTTCCAGAATCCATTAGACGGATATCTCAAAACTCACCATCGCCTTCTAAAG TTAAACATAGGGTCGACCGTTCACATCAGTTTAAGACTACACAAAGGGAACCTATGCTTG ATGATTTAGCTAGTCAAGTGGAGTTGTATCAGTTTCGTCGTGCTCAACAAAGATTGGTTT CAACTTACGAGACGGATGCCCGGGAACATTTGCTTCTGTGTGCACGAGTAGCTTCGAATT CAGGAAATGTACCCAATAATGCATTTTCCGAAAATATCGAGTTCGCTACAGAACAGCGCA TACGTTCTGTTATTTTTGGGACATGGGATTNTACACCGTGGTACCACAGTAATTATCCTG CCGATTTGAGTTGTCTACCTACCATATACATTTGTGAATTCTGTCTATCTGGAATGCGCC ATACAGTTGCATATAATCGTCATAAAATTAATTGTGATCGAACGTTTCCTCCAGGTAATG AGATATATCGTAAAGAGAATTTATCGTTCTTTGAAATTGATGGACAAAAACATCAGGAAT ACTGTCGAAATTTATGTTTATTAGCTAAATTATTTCTGAAACAAAAAACAGTTCATGAAT TAGATCAAGTTCCTGCATTTTTATTCTATGTATTAACTGAAACAGATCAAGATGGTTCAC ATATTATTGGTTATTTCTCAAAACAAAAAGCTGATGATCAACGTGACAACTCCGTCAATG CTGTGTACAATAATCTTTCGTGTATTCTCATTTTACCACCGTATCAATGTCGTGGTTTTG GTCGTATGCTTATTGAGATGAGTTATATTTTAAGTCGACTAGAACAACGTATTGGTACAC CAGAACGTCCATTATCAGATTTGGGCATCATCATTTACAGAAGATATTGGCGTTTTGAAA TTTTAAAATACCTATCGTCATTCACAGCTAAGTCAATTAATATTCGAAGTATGAGTCAAG AATTAGGAATAGCAGTTCCTGATATTGTAAGCACTTTATTAGATATGAAGATGCTTGTTT GCTATCGGACACAATATTACATAATCAATAATAAACCTGATGTAGACGCTCTTTTGAGTA CAATTAAACCGCCTGCTACTGATCGTTGTATTGATTCTACATGCCTTCATTGGACTCCTA ATGTTAGTAATGTCAGTCAGTTGAGTAAATCGCCTAGTAGTAGTACTCTTAGTATTAGTA GTACTATTAATCAAAAGCTTCATAAATCTAGTCTTATGTCACCAAATGATTCAATTGGAG CAAATATTTGAAGATTTTTCTAGTTTAATTATTGTACATTGAAATATTGTAAGGAGTTTT GTTGTGTACAATCTAATAATATGACTATTATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)