These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6729#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 777 fasta sequence [CCAGGCCAANAATTTGGCACGAGGATCATTTCACTTTTTTTTACCCCTATTGATAGTTGGTTTGTACACTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGGTATTCTTCATGTTCAGTAAGCATTTCATCTAAACAGAGTTAAAAAATTTATTTGTTCACTTGTGTTCATTGTTGTATTATGACTGTTAATTCCATTCTTTTTTTTCTCTATCACTTCTTTATTCTACATCTGTTTGTATTATTACACCGCTACTGCTGTCTCCGCTGTATGTATGTATGTTTCATATGAAAGTGAATAACTATTGTAATTTGTTGTGATGTAATTAATCGGTCTTTCATAGCGCATTATTATAATGCAACAGTTAAAATCTACCTATTCGTAAGTCTGGTTTCTCTGTTTCTCTTCCTTCTTTTTTGTCGTTTTTTGTGGGCATATTGTTTCTTTCTCTCTCTGTCGCTTTCTGTGAACTTTGTCCATTCGCACACATACATACATACATACGTTTGTCTTTATTTCTATGTAAATATTATGATTATTTATTTTGGTGTTATGATTAAAATGGTGGTTCTATCTATATCTATGTGAATGTCAATTTCATATTGACTAAATTGATTTGGTTGCTTCTCCTTTTTTTCTCTATCTCTTTTTAACAATAAAACAATATTTTTTTGATGTTTATTCACACAATGAGGTATAAATAAATGTAAACAAACAGTTTCATACTTATGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATGTGGATAAAGATT] [+] EMBL CD081062 [CCAGGCCAANAATTTGGCACGAGGATCATTTCACTTTTTTTTACCCCTATTGATAGTTGGTTTGTACACTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGGTATTCTTCATGTTCAGTAAGCATTTCATCTAAACAGAGTTAAAAAATTTATTTGTTCACTTGTGTTCATTGTTGTATTATGACTGTTAATTCCATTCTTTTTTTTCTCTATCACTTCTTTATTCTACATCTGTTTGTATTATTACACCGCTACTGCTGTCTCCGCTGTATGTATGTATGTTTCATATGAAAGTGAATAACTATTGTAATTTGTTGTGATGTAATTAATCGGTCTTTCATAGCGCATTATTATAATGCAACAGTTAAAATCTACCTATTCGTAAGTCTGGTTTCTCTGTTTCTCTTCCTTCTTTTTTGTCGTTTTTTGTGGGCATATTGTTTCTTTCTCTCTCTGTCGCTTTCTGTGAACTTTGTCCATTCGCACACATACATACATACATACGTTTGTCTTTATTTCTATGTAAATATTATGATTATTTATTTTGGTGTTATGATTAAAATGGTGGTTCTATCTATATCTATGTGAATGTCAATTTCATATTGACTAAATTGATTTGGTTGCTTCTCCTTTTTTTCTCTATCTCTTTTTAACAATAAAACAATATTTTTTTGATGTTTATTCACACAATGAGGTATAAATAAATGTAAACAAACAGTTTCATACTTATGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATGTGGATAAAGAT ] [+] EMBL CD094361 [ CTCTGTGGTATTCTTCATGTTCAGTAAGCATTTCATCTAAACAGAGTTAAAAAATTTATTTGTTCACTTGTGTTCATTGTTGTATTATGACTGTTAATTCCATTCTTTTTTTTCTCTATCACTTCTTTATTCTACATCTGTTTGTATTATTACACCGCTACTGCTGTCTCCGCTGTATGTATGTATGTTTCATATGAAAGTGAATAACTATTGTAATTTGTTGTGATGTAATTAATCGGTCTTTCATAGCGCATTATTATAATGCAACAGTTAAAATCTACCTATTCGTAAGTCTGGTTTCTCTGTTTCTCTTCCTTCTTTTTTGTCGTTTTTTGTGGGCATATTGTTTCTTTCTCTCTCTGTCGCTTTCTGTGAACTTTGTCCATTCGCACACATACATACATACATACGTTTGTCTTTATTTCTATGTAAATATTATGATTATNTATTNTGGTGTTATGATTAAAATGGTGGTTCTATCTATATCTATGTGAATGTCAATTTCATATTGACTAAATTGATTTGGTTGCTTCTCCTTTTTTTCTCTATCTCTTTTT ACAATAAAAC ATATTTTTTTGATGTTT ] [-] EMBL CD074884 [ AGTAAGCATTTCATCTAAACAGAGTTAAANAATTTATTTGTTCACTTGTGTTCATTGTTGTATTATGACTGTTAATTCCATTCTTTTTTTTCTCTATCACTTCTTTATTCTACATCTGTTTGTATTATTACACCGCTACTGCTGTCTCCGCTGTATGTATGTATGTTTCATATGAAAGTGAATAACTATTGTAATTTGTTGTGATGTAATTAATCGGTCTTTCATAGCGCATTATTATAATGCAACAGTTAAAATCTACCTATTCGTAAGTCTGGTTTCTCTGTTTCTCTTCCTTCTTTTTTGTCGTTTTTTGTGGGCATATTGTTTCTTTCTCTCTCTGTCGCTTTCTGTGAACTTTGTCCATTCGCACACATACATACATACATACGTTTGTCTTTATTTCTATGTAAATATTATGATTATTTATTTTGGTGTTATGATTAAAATGGTGGTTCTATCTATATCTATGTGAATGTCAATTTCATATTGACTAAATTGATTTGGTTGCTTCTCCTTTTTTTCTCTATCTCTTTTTAACAATAAAACAATATTTTTTTGATGTTTATTCACACAATGAGGTATAAATAAATGTAAACAAACAGTTTCATACTTATGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATGTGAATAAAGATT] [-] EMBL CD089545 [ GAGTTAAAAAATTTATTTGTTCACTTGTGTTCATTGTTGTATTACGACTGTTAATTCCATTCTTTTTTTTCTCTATCACTTCTTTATTCTACATCTGTTTGTATTATTACGCCGCTACTGCTGTCTCCGCTGTATGTATGTATGTTTCATATGAAAGTGAATAACTATTGTAATTTGTTGTGATGTAATTAATCGGTCTTTCATAGCGCATTATTATAATGCAACAGTTAAAATCTACCTATTCGTAAGTCTGGTTTCTCTGCTTCTCTTCATTCTTTTTTG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||