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Schistosoma mansoni
cluster # 6729 cluster # 6729       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6729#0 length = 777 sequences # 4  

consensusID : consensus_6729#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 777
fasta sequence
                              [CCAGGCCAANAATTTGGCACGAGGATCATTTCACTTTTTTTTACCCCTATTGATAGTTGGTTTGTACACTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGGTATTCTTCATGTTCAGTAAGCATTTCATCTAAACAGAGTTAAAAAATTTATTTGTTCACTTGTGTTCATTGTTGTATTATGACTGTTAATTCCATTCTTTTTTTTCTCTATCACTTCTTTATTCTACATCTGTTTGTATTATTACACCGCTACTGCTGTCTCCGCTGTATGTATGTATGTTTCATATGAAAGTGAATAACTATTGTAATTTGTTGTGATGTAATTAATCGGTCTTTCATAGCGCATTATTATAATGCAACAGTTAAAATCTACCTATTCGTAAGTCTGGTTTCTCTGTTTCTCTTCCTTCTTTTTTGTCGTTTTTTGTGGGCATATTGTTTCTTTCTCTCTCTGTCGCTTTCTGTGAACTTTGTCCATTCGCACACATACATACATACATACGTTTGTCTTTATTTCTATGTAAATATTATGATTATTTATTTTGGTGTTATGATTAAAATGGTGGTTCTATCTATATCTATGTGAATGTCAATTTCATATTGACTAAATTGATTTGGTTGCTTCTCCTTTTTTTCTCTATCTCTTTTTAACAATAAAACAATATTTTTTTGATGTTTATTCACACAATGAGGTATAAATAAATGTAAACAAACAGTTTCATACTTATGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATGTGGATAAAGATT]

[+] EMBL CD081062             [CCAGGCCAANAATTTGGCACGAGGATCATTTCACTTTTTTTTACCCCTATTGATAGTTGGTTTGTACACTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGGTATTCTTCATGTTCAGTAAGCATTTCATCTAAACAGAGTTAAAAAATTTATTTGTTCACTTGTGTTCATTGTTGTATTATGACTGTTAATTCCATTCTTTTTTTTCTCTATCACTTCTTTATTCTACATCTGTTTGTATTATTACACCGCTACTGCTGTCTCCGCTGTATGTATGTATGTTTCATATGAAAGTGAATAACTATTGTAATTTGTTGTGATGTAATTAATCGGTCTTTCATAGCGCATTATTATAATGCAACAGTTAAAATCTACCTATTCGTAAGTCTGGTTTCTCTGTTTCTCTTCCTTCTTTTTTGTCGTTTTTTGTGGGCATATTGTTTCTTTCTCTCTCTGTCGCTTTCTGTGAACTTTGTCCATTCGCACACATACATACATACATACGTTTGTCTTTATTTCTATGTAAATATTATGATTATTTATTTTGGTGTTATGATTAAAATGGTGGTTCTATCTATATCTATGTGAATGTCAATTTCATATTGACTAAATTGATTTGGTTGCTTCTCCTTTTTTTCTCTATCTCTTTTTAACAATAAAACAATATTTTTTTGATGTTTATTCACACAATGAGGTATAAATAAATGTAAACAAACAGTTTCATACTTATGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATGTGGATAAAGAT ]
[+] EMBL CD094361             [                                                                                  CTCTGTGGTATTCTTCATGTTCAGTAAGCATTTCATCTAAACAGAGTTAAAAAATTTATTTGTTCACTTGTGTTCATTGTTGTATTATGACTGTTAATTCCATTCTTTTTTTTCTCTATCACTTCTTTATTCTACATCTGTTTGTATTATTACACCGCTACTGCTGTCTCCGCTGTATGTATGTATGTTTCATATGAAAGTGAATAACTATTGTAATTTGTTGTGATGTAATTAATCGGTCTTTCATAGCGCATTATTATAATGCAACAGTTAAAATCTACCTATTCGTAAGTCTGGTTTCTCTGTTTCTCTTCCTTCTTTTTTGTCGTTTTTTGTGGGCATATTGTTTCTTTCTCTCTCTGTCGCTTTCTGTGAACTTTGTCCATTCGCACACATACATACATACATACGTTTGTCTTTATTTCTATGTAAATATTATGATTATNTATTNTGGTGTTATGATTAAAATGGTGGTTCTATCTATATCTATGTGAATGTCAATTTCATATTGACTAAATTGATTTGGTTGCTTCTCCTTTTTTTCTCTATCTCTTTTT ACAATAAAAC ATATTTTTTTGATGTTT                                                                                                             ]
[-] EMBL CD074884             [                                                                                                        AGTAAGCATTTCATCTAAACAGAGTTAAANAATTTATTTGTTCACTTGTGTTCATTGTTGTATTATGACTGTTAATTCCATTCTTTTTTTTCTCTATCACTTCTTTATTCTACATCTGTTTGTATTATTACACCGCTACTGCTGTCTCCGCTGTATGTATGTATGTTTCATATGAAAGTGAATAACTATTGTAATTTGTTGTGATGTAATTAATCGGTCTTTCATAGCGCATTATTATAATGCAACAGTTAAAATCTACCTATTCGTAAGTCTGGTTTCTCTGTTTCTCTTCCTTCTTTTTTGTCGTTTTTTGTGGGCATATTGTTTCTTTCTCTCTCTGTCGCTTTCTGTGAACTTTGTCCATTCGCACACATACATACATACATACGTTTGTCTTTATTTCTATGTAAATATTATGATTATTTATTTTGGTGTTATGATTAAAATGGTGGTTCTATCTATATCTATGTGAATGTCAATTTCATATTGACTAAATTGATTTGGTTGCTTCTCCTTTTTTTCTCTATCTCTTTTTAACAATAAAACAATATTTTTTTGATGTTTATTCACACAATGAGGTATAAATAAATGTAAACAAACAGTTTCATACTTATGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATGTGAATAAAGATT]
[-] EMBL CD089545             [                                                                                                                             GAGTTAAAAAATTTATTTGTTCACTTGTGTTCATTGTTGTATTACGACTGTTAATTCCATTCTTTTTTTTCTCTATCACTTCTTTATTCTACATCTGTTTGTATTATTACGCCGCTACTGCTGTCTCCGCTGTATGTATGTATGTTTCATATGAAAGTGAATAACTATTGTAATTTGTTGTGATGTAATTAATCGGTCTTTCATAGCGCATTATTATAATGCAACAGTTAAAATCTACCTATTCGTAAGTCTGGTTTCTCTGCTTCTCTTCATTCTTTTTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]


>consensus_6729#0 CCAGGCCAANAATTTGGCACGAGGATCATTTCACTTTTTTTTACCCCTATTGATAGTTGG TTTGTACACTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGGTATTCTTCATGTTCAGTAAGCATTTCATCT AAACAGAGTTAAAAAATTTATTTGTTCACTTGTGTTCATTGTTGTATTATGACTGTTAAT TCCATTCTTTTTTTTCTCTATCACTTCTTTATTCTACATCTGTTTGTATTATTACACCGC TACTGCTGTCTCCGCTGTATGTATGTATGTTTCATATGAAAGTGAATAACTATTGTAATT TGTTGTGATGTAATTAATCGGTCTTTCATAGCGCATTATTATAATGCAACAGTTAAAATC TACCTATTCGTAAGTCTGGTTTCTCTGTTTCTCTTCCTTCTTTTTTGTCGTTTTTTGTGG GCATATTGTTTCTTTCTCTCTCTGTCGCTTTCTGTGAACTTTGTCCATTCGCACACATAC ATACATACATACGTTTGTCTTTATTTCTATGTAAATATTATGATTATTTATTTTGGTGTT ATGATTAAAATGGTGGTTCTATCTATATCTATGTGAATGTCAATTTCATATTGACTAAAT TGATTTGGTTGCTTCTCCTTTTTTTCTCTATCTCTTTTTAACAATAAAACAATATTTTTT TGATGTTTATTCACACAATGAGGTATAAATAAATGTAAACAAACAGTTTCATACTTATGT TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATGTGGATAAAGATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)