These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6739#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 772 fasta sequence [TATATGAT-ATTAATGAATTGAGAAAATTAGTATGAATATGATTATTATTATTTCTATTGTATGTTGGTTTAATGAAGAAATCACTTTTCGATGGTCTAAATGCATCAGACATTGATGTGATCGAATCAAAATTCACTCGTTCTCTTATTTGTACGGATTTAATATTCTCTTCATGATTATTAACTAAGATCAGTTGTTGATCATGATCAGCATCGTCGGTTGTTTCTGACCATTCCAATTGTTTAATGAATTGTTTTAAATCATTCTCTGACATATCCAAAAAACTCATTAGTAATGGTTTGGATATACGTTGATAGGTTTGTGAAATAATTTGTACAATAAATTTACATACGGATTCACGGAATCCAGGGATAGCAGAAAAAATTTTGGGATTTTCTTTAACTTTCGTCCAAAACTCAGAAAACCGACAAGTTTCCAGAAAAAGCCCAAGTTTCACAACCTGCGAAAGTGGCTCTTCATTGAGATGTTCCAGATGAATCAAGTACTTGCACAATGTAAAATCTGAGTGACTCATGCTTATAATTGCCTTTAGCAACACTAACCTCGCACACTCAGCATTGAAACGTTCTGGATAGAACTGATATAATCTAAGTAGAGCTAAATTAGCTTCGAAATCATAATCATTATTTATAATCTGCCACGAAAGATGTTCTTCAAGTGCTGCTATGTGTTCAGGGTTATAGCT--CT-CTATT-CCTTGTAGTTTGCTTTTGATGACTGCCTTACGATCCATAACGTGAAACACTTCAAGAAC] [+] EMBL CD074991 [TATATGAT ATTAATGAATTGAGAAAATTAGTATGAATATGATTATTATTATTTCTATTGTATGTTGGTTTAATGAAGAAATCACTTTTCGATGGTCTAAATGCATCAGACATTGATGTGATCGAATCAAAATTCACTCGTTCTCTTATTTGTACGGATTTAATATTCTCTTCATGATTATTAACTAAGATCAGTTGTTGATCATGATCAGCATCGTCGGTTGTTTCTGACCATTCCAATTGTTTAATGAATTGTTTTAAATCATTCTCTGACATATCCAAAAAACTCATTAGTAATGGTTTGGATATACGTTGATAGGTTTGTGAAATAATTTGTACAATAAATTTACATACGGATTCACGGAATCCAGGGATAGCAGAAAAAATTTTGGGATTTTCTTTAACTTTCGTCCAAAACTCAGAAAACCGACAAGTTTCCAGAAAAAGCCCAAGTTTCACAACCTGCGAAAGTGGCTCTTCATTGAGATGTTCCAGATGAATCAAGTACTTGCACAATGTAAAATCTGAGTGACTCATGCTTATAATTGCCTTTAGCAACACTAACCTCGCACACTCAGCATTGAAACGTTCTGGATAGAACTGATATAATCTAAGTAGAGCTAAATTAGCTTCGAAATCATAATCATTATTTATAATCTGCCACGAAAGATGTTCTTCAAGTGCTGCTATGTGTTCAGGGTTATAGCT CT CTATT CCTTGTAGTTTGCTTTTGATGACTGCCTTACGATCCATAAC ] [+] EMBL AW017182 [TATATGATAAATAATGAATTTATTTATTTAGTATGAATATGATTATTATTATGATTATTGTATGTTGTTTTAATGAAGAAATCACTTTTCGATGGTCTAAATGCATCAGACATTGATGTGATCGAATCAAAATTCACTCGTTCTCTTATTTGTACGGATTTAATATTCTCTTCATGATTATTAACTAAGATCAGTTGTTGATCATGATCAGCATCGTCGGTTGTTTCTGACCATTCCAATTGTTTAATGAATTGTTTTAAATCATTCTCTGACATATCCAAAAAACTCATTAGTAATGGTTTGGATATACGTTGATAGGTTTGTGAAATAATTTGTACAATAAATTTACATACGGATTCACGGAATCCAGGGATAGCAGAAAAAATTTTGGGATTTTCTTTAACTTTCGTCCAAAACTCAGAAAACCGACAAGTTTCCAGAAAAAGCCCAAGTTTCACAACCTGCGAAAGTGGCTCTTCATTGAGATGTTCCAGATGAATCAAGTACTTGCACAATGTAAAATCTGAGTGACTCATGCTTATAATTGCCTTTAGCAACACTAACCTTGCACACTCAGCATTGAAACGTTCTG ] [-] EMBL CD081170 [ ATGTAAAATCTGAGTGACTCATGCTTATAATTGCCTTTAGCAACACTAACCTCGCACACTCAGCATTGAAACGTTCTGGATAGAACTGATATAATCTAAGTAGAGCTAAATTAGCTTCGAAATCATAATCATTATTTATAATCTGCCACGAAAGATGTTCTTCAAGTGCTGCTATGTGTTCAGGGTTATAGCTNNCTNCTATTCCCTTGTAGTTTGCTTTTGATGACgaa ] [+] EMBL CD160811 [ GTTCTGGATAGAACTGATATAATCTAAGTAGAGCTAAATTAGCTTCGAAATCATAATCATTATTTATAATCTGCCACGAAAGATGTTCTTCAAGTGCTGCTATGTGTTCAGGGTTATAGCT CT CTATT CCTTGTAGTTTGCTTTTGATGACTGCCTTACGATCCATAACGTGAAACACTTCAAGAAC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||