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Schistosoma mansoni
cluster # 6759 cluster # 6759       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6759#0 length = 1133 sequences # 4  

consensusID : consensus_6759#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1133
fasta sequence
                              [GGAGCCTGAATTCGGCACCAGGGAGCAAGTTTTTAACGCAACTGCTTTGGCTTTATCTTCTAAAAGAATCACGCGACAATTAACCCGCAATATATCTATAAAAACCCCTCGCCGCCTGCCAGCTTCTGCCAAACGCCAGTTCGGGGCACAGCCTCCACAGCCCCCTAGCACTCCAACTTCCCACAGATTGCACGTTCCCATTGAGATGGATGAAAGCCAAACAACAGACATGTATCTTATCCCAAGTCCTCGACGTTCAATGCTTGGTTCATTTCTGGGATCATCTTGTACATCACTAAGCAATTTTCTAAACACAGCCTTGCGTACTAATAACAATCTAAATAATATTAATCATGGAAATTCCGCGCTCAATCGTGCCATGCTACCTCCTAGTCGTTTAGCTATGACACCCAAACCGATTCGACGTCTTCTACCTCGTTCATCCAGACAAAATTCATTCGATGATCTTGATTTAAATGATGATGAAGATGATGTTCCTTTCTCTCAACTTGGAAGTTCTCTTCTTAGTTTAACAAGTCTAGACAGTCTCTCTACACTGGATAATCCTGTTAATCGAGTCGATGTTATTTCTAACCGCAATACTCCAAATCTTAAGTGCCGTGCCGGTAGTGCTGTTTGGGAATCAGCAAGTCATCTTGGTTTTAGTACATCAGATGATGTTCGTCATTCATTCAGATCGCCATCTGGATCGTTTCTTGGCGGTTTTGATGAAGGTTGCTCTAGAAAGCATGGTAAAAAGCAGAAAAAACCGAAGCTTCGCGCTGTAAGTCAAATGTTCCAGAGATCTTCCATTATGGTTAAAGCAAAAGAGTCAAGGAAAATAGGCTCTGACAAAATTAACACTGAGTTAAATTCTCAAAGTTCTCTACCTAGTTCCCGGCGTGACAGCTTA-TTTCGTGGTCTATTTTTCAGAAAGAATTAATTTCTTATGCTGCCGTGTACACATTAATATTCTTAGCTTGTTTGGCCGAACACATTTGTTCACTTGTATAAAGTTTCATTTAAGACAAATTTTTCTAACACTAATACTACACATTATTTACATTTTACCATATAGTGATATATGTAATTAATTACAATGGTTTATTTTTCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD081526             [GGAGCCTGAATTCGGCACCAGGGAGCAAGTTTTTAACGCAACTGCTTTGGCTTTATCTTCTAAAAGAATCACGCGACAATTAACCCGCAATATATCTATAAAAACCCCTCGCCGCCTGCCAGCTTCTGCCAAACGCCAGTTCGGGGCACAGCCTCCACAGCCCCCTAGCACTCCAACTTCCCACAGATTGCACGTTCCCATTGAGATGGATGAAAGCCAAACAACAGACATGTATCTTATCCCAAGTCCTCGACGTTCAATGCTTGGTTCATTTCTGGGATCATCTTGTACATCACTAAGCAATTTTCTAAACACAGCCTTGCGTACTAATAACAATCTAAATAATATTAATCATGGAAATTCCGCGCTCAATCGTGCCATGCTACCTCCTAGTCGTTTAGCTATGACACCCAAACCGATTCGACGTCTTCTACCTCGTTCATCCAGACAAAATTCATTCGATGATCTTGATTTAAATGATGATGAAGATGATGTTCCTTTCTCTCAACTTGGAAGTTCTCTTCTTAGTTTAACAAGTCTAGACAGTCTCTCTACACTGGATAATCCTGTTAATCGAGTCGATGTTATTTCTAACCGCAATACTCCAAATCTTAAGTGCCGTGCCGGTAGTGCTGTTTGGGAATCAGCAAGTCATCTTGGTTTTAGTACATCAGATGATGTTCGTCATTCATTCAGATCGCCATCTGGATCGTTTCTTGGCGGTTNTGATGAAGGTTGCTCTAGAAAGCATGGTAAAAAGCAGAAAAAACCGAAGCTTCGCGCTGTAAGTCANATGTTCCAGAGATCTTCCATTATGGTTAAAGCAAAAGAGTCAAGGAAAATAGGCTCTGACAAANTTAACACTGAGTTAAATTCTC AAGNTCTCTACCTAGTTCCCGGCGTGACAGCTTATTTTCGT GTCTATTTTTCAGAAAGAATTAATTTCTTATGCTGCCGTGTACACATT ATATNCTTAGCTTGGTTGGCCG ACACATTTG TCACTTGTATAAAG TTCA TTAAGAC AATTTTTCT ACACT ATACTAC CATTA TTAC TTTTACC TATAGGGA ATATGTAA TAA TACAATG                               ]
[-] EMBL CD139285             [                                                                                                                                                                                                                       GCCAAACAACAGACATGTATCTTATCCCAAGTCCTCGACGTTCAATGCTTGGTTCATTTCTGGGATCATCTTGTACATCATTAAGCAATTTTCTAAACACAGCCTTGCGTACTAATAACAATCTAAATAATATTAATCATGGAAATTCCGCGCTCAATCGTGCCATGCTACCTCCTAGTCGTTCAGCTATGACACCCAAACCGATTCGACGTCTTCTACCTCGTTCATCCAGACAAAATTCATTCGATGATCTTGATTTAAATGATGATGAAGATGATGTTCCTTTCTCTCAACTTGGAAGTTCTCTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD075349             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGTTTAACAAGTCTAGACAGTCTCTCTACACTGGATAATCCTGTTAATCGAGTCGATGTTATTTCTAACCGCAATACTCCAAATCTTAAGTGCCGTGCCGGTAGTGCTGTTTGGGAATCAGCAAGTCATCTTGGTTTTAGTACATCAGATGATGTTCGTCATTCATTCAGATCGCCATCTGGATCGTTTCTTGGCGGTTTTGATGAAGGTTGCTCTAGAAAGCATGGTAAAAAGCAGAAAAAACCGAAGCTTCGCGCTGTAAGTCAAATGTTCCAGAGATCTTCCATTATGGTTAAAGCAAAAGAGTCAAGGAAAATAGGCTCTGACAAAATTAACACTGAGTTAAATTCTCAAAGTTCTCTACCTAGTTCCCGGCGTGACAGCTTA TTTCGTGGTCTATTTTTCAGAAAGAATTAATTTCTTATGCTGCCGTGTACACATTAATATTCTTAGCTTGTTTGGCCGAACACATTTGTTCACTTGTATAAAGTTTCATTTAAGACAAATTTTTCTAACACTAATACTACACATTATTTACATTTTACCATATAGTGATATATGTAATTAATTACAATGGTT                            ]
[-] EMBL AI394792             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tnAAGTGCCGTGCCGGTAGTGCTGTTTGGGAATCAGCAAGTC TTTTGGTTTTAGTACATCAGATGATGTTCGTCATTCATTCAGATCGCCATCTGGATCGTTTCTTGGCGGTTTTGATGAAGGTTGCTCTAGAAAGCATGGTAAAAAGCAGAAAAAACCGAAACTTCGCGCTGTAAGTCAAATGTTCCAGAGATCTTCCATTATGGTTAAAGCAAAAGAGTCAAGGAAAATAGGCTCTGACAAAATTAACACTGAGTTAAATTCTCAAAGTTCTCTACCTAGTTCCCGGCGTTACAGCTTA TTTCGTGGTCTATTTTTCAGAAAGAATTAATTTCTTATGCTGCCGTGTACACATTAATATTCTTAGCTTGTTTGGCCGAACACATTTGTTCGCTTGTATAAAGTTTCATTTAAGACAAATTTTTCTAACACTAATACTACACATTATTTGCATTTTACCATATAGTGATATATGTAATTAATTACAATGGTTTATTTTTCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_6759#0 GGAGCCTGAATTCGGCACCAGGGAGCAAGTTTTTAACGCAACTGCTTTGGCTTTATCTTC TAAAAGAATCACGCGACAATTAACCCGCAATATATCTATAAAAACCCCTCGCCGCCTGCC AGCTTCTGCCAAACGCCAGTTCGGGGCACAGCCTCCACAGCCCCCTAGCACTCCAACTTC CCACAGATTGCACGTTCCCATTGAGATGGATGAAAGCCAAACAACAGACATGTATCTTAT CCCAAGTCCTCGACGTTCAATGCTTGGTTCATTTCTGGGATCATCTTGTACATCACTAAG CAATTTTCTAAACACAGCCTTGCGTACTAATAACAATCTAAATAATATTAATCATGGAAA TTCCGCGCTCAATCGTGCCATGCTACCTCCTAGTCGTTTAGCTATGACACCCAAACCGAT TCGACGTCTTCTACCTCGTTCATCCAGACAAAATTCATTCGATGATCTTGATTTAAATGA TGATGAAGATGATGTTCCTTTCTCTCAACTTGGAAGTTCTCTTCTTAGTTTAACAAGTCT AGACAGTCTCTCTACACTGGATAATCCTGTTAATCGAGTCGATGTTATTTCTAACCGCAA TACTCCAAATCTTAAGTGCCGTGCCGGTAGTGCTGTTTGGGAATCAGCAAGTCATCTTGG TTTTAGTACATCAGATGATGTTCGTCATTCATTCAGATCGCCATCTGGATCGTTTCTTGG CGGTTTTGATGAAGGTTGCTCTAGAAAGCATGGTAAAAAGCAGAAAAAACCGAAGCTTCG CGCTGTAAGTCAAATGTTCCAGAGATCTTCCATTATGGTTAAAGCAAAAGAGTCAAGGAA AATAGGCTCTGACAAAATTAACACTGAGTTAAATTCTCAAAGTTCTCTACCTAGTTCCCG GCGTGACAGCTTATTTCGTGGTCTATTTTTCAGAAAGAATTAATTTCTTATGCTGCCGTG TACACATTAATATTCTTAGCTTGTTTGGCCGAACACATTTGTTCACTTGTATAAAGTTTC ATTTAAGACAAATTTTTCTAACACTAATACTACACATTATTTACATTTTACCATATAGTG ATATATGTAATTAATTACAATGGTTTATTTTTCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)