These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6759#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1133 fasta sequence [GGAGCCTGAATTCGGCACCAGGGAGCAAGTTTTTAACGCAACTGCTTTGGCTTTATCTTCTAAAAGAATCACGCGACAATTAACCCGCAATATATCTATAAAAACCCCTCGCCGCCTGCCAGCTTCTGCCAAACGCCAGTTCGGGGCACAGCCTCCACAGCCCCCTAGCACTCCAACTTCCCACAGATTGCACGTTCCCATTGAGATGGATGAAAGCCAAACAACAGACATGTATCTTATCCCAAGTCCTCGACGTTCAATGCTTGGTTCATTTCTGGGATCATCTTGTACATCACTAAGCAATTTTCTAAACACAGCCTTGCGTACTAATAACAATCTAAATAATATTAATCATGGAAATTCCGCGCTCAATCGTGCCATGCTACCTCCTAGTCGTTTAGCTATGACACCCAAACCGATTCGACGTCTTCTACCTCGTTCATCCAGACAAAATTCATTCGATGATCTTGATTTAAATGATGATGAAGATGATGTTCCTTTCTCTCAACTTGGAAGTTCTCTTCTTAGTTTAACAAGTCTAGACAGTCTCTCTACACTGGATAATCCTGTTAATCGAGTCGATGTTATTTCTAACCGCAATACTCCAAATCTTAAGTGCCGTGCCGGTAGTGCTGTTTGGGAATCAGCAAGTCATCTTGGTTTTAGTACATCAGATGATGTTCGTCATTCATTCAGATCGCCATCTGGATCGTTTCTTGGCGGTTTTGATGAAGGTTGCTCTAGAAAGCATGGTAAAAAGCAGAAAAAACCGAAGCTTCGCGCTGTAAGTCAAATGTTCCAGAGATCTTCCATTATGGTTAAAGCAAAAGAGTCAAGGAAAATAGGCTCTGACAAAATTAACACTGAGTTAAATTCTCAAAGTTCTCTACCTAGTTCCCGGCGTGACAGCTTA-TTTCGTGGTCTATTTTTCAGAAAGAATTAATTTCTTATGCTGCCGTGTACACATTAATATTCTTAGCTTGTTTGGCCGAACACATTTGTTCACTTGTATAAAGTTTCATTTAAGACAAATTTTTCTAACACTAATACTACACATTATTTACATTTTACCATATAGTGATATATGTAATTAATTACAATGGTTTATTTTTCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL CD081526 [GGAGCCTGAATTCGGCACCAGGGAGCAAGTTTTTAACGCAACTGCTTTGGCTTTATCTTCTAAAAGAATCACGCGACAATTAACCCGCAATATATCTATAAAAACCCCTCGCCGCCTGCCAGCTTCTGCCAAACGCCAGTTCGGGGCACAGCCTCCACAGCCCCCTAGCACTCCAACTTCCCACAGATTGCACGTTCCCATTGAGATGGATGAAAGCCAAACAACAGACATGTATCTTATCCCAAGTCCTCGACGTTCAATGCTTGGTTCATTTCTGGGATCATCTTGTACATCACTAAGCAATTTTCTAAACACAGCCTTGCGTACTAATAACAATCTAAATAATATTAATCATGGAAATTCCGCGCTCAATCGTGCCATGCTACCTCCTAGTCGTTTAGCTATGACACCCAAACCGATTCGACGTCTTCTACCTCGTTCATCCAGACAAAATTCATTCGATGATCTTGATTTAAATGATGATGAAGATGATGTTCCTTTCTCTCAACTTGGAAGTTCTCTTCTTAGTTTAACAAGTCTAGACAGTCTCTCTACACTGGATAATCCTGTTAATCGAGTCGATGTTATTTCTAACCGCAATACTCCAAATCTTAAGTGCCGTGCCGGTAGTGCTGTTTGGGAATCAGCAAGTCATCTTGGTTTTAGTACATCAGATGATGTTCGTCATTCATTCAGATCGCCATCTGGATCGTTTCTTGGCGGTTNTGATGAAGGTTGCTCTAGAAAGCATGGTAAAAAGCAGAAAAAACCGAAGCTTCGCGCTGTAAGTCANATGTTCCAGAGATCTTCCATTATGGTTAAAGCAAAAGAGTCAAGGAAAATAGGCTCTGACAAANTTAACACTGAGTTAAATTCTC AAGNTCTCTACCTAGTTCCCGGCGTGACAGCTTATTTTCGT GTCTATTTTTCAGAAAGAATTAATTTCTTATGCTGCCGTGTACACATT ATATNCTTAGCTTGGTTGGCCG ACACATTTG TCACTTGTATAAAG TTCA TTAAGAC AATTTTTCT ACACT ATACTAC CATTA TTAC TTTTACC TATAGGGA ATATGTAA TAA TACAATG ] [-] EMBL CD139285 [ GCCAAACAACAGACATGTATCTTATCCCAAGTCCTCGACGTTCAATGCTTGGTTCATTTCTGGGATCATCTTGTACATCATTAAGCAATTTTCTAAACACAGCCTTGCGTACTAATAACAATCTAAATAATATTAATCATGGAAATTCCGCGCTCAATCGTGCCATGCTACCTCCTAGTCGTTCAGCTATGACACCCAAACCGATTCGACGTCTTCTACCTCGTTCATCCAGACAAAATTCATTCGATGATCTTGATTTAAATGATGATGAAGATGATGTTCCTTTCTCTCAACTTGGAAGTTCTCTTC ] [-] EMBL CD075349 [ AGTTTAACAAGTCTAGACAGTCTCTCTACACTGGATAATCCTGTTAATCGAGTCGATGTTATTTCTAACCGCAATACTCCAAATCTTAAGTGCCGTGCCGGTAGTGCTGTTTGGGAATCAGCAAGTCATCTTGGTTTTAGTACATCAGATGATGTTCGTCATTCATTCAGATCGCCATCTGGATCGTTTCTTGGCGGTTTTGATGAAGGTTGCTCTAGAAAGCATGGTAAAAAGCAGAAAAAACCGAAGCTTCGCGCTGTAAGTCAAATGTTCCAGAGATCTTCCATTATGGTTAAAGCAAAAGAGTCAAGGAAAATAGGCTCTGACAAAATTAACACTGAGTTAAATTCTCAAAGTTCTCTACCTAGTTCCCGGCGTGACAGCTTA TTTCGTGGTCTATTTTTCAGAAAGAATTAATTTCTTATGCTGCCGTGTACACATTAATATTCTTAGCTTGTTTGGCCGAACACATTTGTTCACTTGTATAAAGTTTCATTTAAGACAAATTTTTCTAACACTAATACTACACATTATTTACATTTTACCATATAGTGATATATGTAATTAATTACAATGGTT ] [-] EMBL AI394792 [ tnAAGTGCCGTGCCGGTAGTGCTGTTTGGGAATCAGCAAGTC TTTTGGTTTTAGTACATCAGATGATGTTCGTCATTCATTCAGATCGCCATCTGGATCGTTTCTTGGCGGTTTTGATGAAGGTTGCTCTAGAAAGCATGGTAAAAAGCAGAAAAAACCGAAACTTCGCGCTGTAAGTCAAATGTTCCAGAGATCTTCCATTATGGTTAAAGCAAAAGAGTCAAGGAAAATAGGCTCTGACAAAATTAACACTGAGTTAAATTCTCAAAGTTCTCTACCTAGTTCCCGGCGTTACAGCTTA TTTCGTGGTCTATTTTTCAGAAAGAATTAATTTCTTATGCTGCCGTGTACACATTAATATTCTTAGCTTGTTTGGCCGAACACATTTGTTCGCTTGTATAAAGTTTCATTTAAGACAAATTTTTCTAACACTAATACTACACATTATTTGCATTTTACCATATAGTGATATATGTAATTAATTACAATGGTTTATTTTTCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||