cluster # 6770

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Schistosoma mansoni
cluster # 6770 cluster # 6770 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6770#0 length = 617 sequences # 4

consensusID : consensus_6770#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 617
fasta sequence

                              [CGGAGCCATTAATTCGGCACGCAGGGAT-ATGCAGATTGTTCTAAATTATTCAGTAATCCTGCTTCTACTGGCAGCGAATGTGAGATAAATAGACTTGGTGATGACGAAGAGGACAATGATAGTTGTGATTCTTTTTCTCCCCATACACGTGCAGCCAGAAGTATGCACCGTTATGAACCTAAACAGGTTCATAAGCACACAGAATCATCAACCGTTGATGACCTTCCAAACGAATCATCTATGACTGTTTCTAGTGTATCAATTACGCAAAATTCGAAGTAAGAAGATATTTTATACTTAACATGTTCATTCCATGTTAAATTTTGCTTGCTAAAGTCAATCCTAGTCAAAATTATTCCGGTAGACTTTTAAAAATAAAAAAGTGCTGTGATACGCTAGATGTTAATTCATCATTTGCATTTCTGCTGTTTAATCAAAGTTGAATGAACCGACTGTAACTTATTCATAATCTATCTTTCGCTACATAAAATAATTCGTTTGCTATGTTTAGTTTATGAGCAGATACCTAATATTGAAATCAGTGTTGATTGTGCTGAATTTCGCGTTCTCGTTTTTATTGATCACAACTCCTATTACTAACTTTTAAATAGAATGTT]

[+] EMBL CD081784             [CGGAGCCATTAATTCGGCACGCAGGGAT ATGCAGATTGTTCTAAATTATTCAGTAATCCTGCTTCTACTGGCAGCGAATGTGAGATAAATAGACTTGGTGATGACGAAGAGGACAATGATAGTTGTGATTCTTTTTCTCCCCATACACGTGCAGCCAGAAGTATGCACCGTTATGAACCTAAACAGGTTCATAAGCACACAGAATCATCAACCGTTGATGACCTTCCAAACGAATCATCTATGACTGTTTCTAGTGTATCAATTACGCAAAATTCGAAGTAAGAAGATATTTTATACTTAACATGTTCATTCCATGTTAAATTTTGCTTGCTAAAGTCAATCCTAGTCAAAATTATTCCGGTAGACTTTTAAAAATAAAAAAGTGCTGTGATACGCTAGATGTTAATTCATCATTTGCATTTCTGCTGTTTAATCAAAGTTGAATGAACCGACTGTAACTTATTCATAATCTATCTTTCGCTACATAAAATAATTCGTTTGCTATGTTTAGTTTATGAGCAGATACCTAATATTGAAATCAGTGTTGATTGTGCTGAATTTCGCGTTCTCGTTTTTATTGATCACAACTCCTATTACTAACTTTTAAATAGAATGT ]
[+] EMBL CD137889             [                         GATAATGCAGATTGTTCTAAATTATTCAGTAATCCTGCTTCTACTGGCAGCGAATGTGAGATAAATAGACTTGGTGATGACGAAGAGGACAATGATAGTTGTGATTCTTTTTCTCCCCATACACGTGCAGCCAGAAGTATGCACCGTTATGAACCTAAACAGGTTCATAAGCACACAGAATCATCAACCGTTGATGACCTTCCAAACGAATCATCTATGACTGTTTCTAGTGTATCAATTACGCAAAATTCGAAGTAAGAAGATATTTTATACTTAACATGTTCATTCCATGTTAAATTTTGCTTGCTAAAGTCAATCCTAGTCAAAATTATTCCGGTAGACTTTTAAAAATAAAAAAGTGC                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD075515             [                         ata ATGCAGATTGTTCTAAATTATTCAGTAATCCTGCTTCTACTGGCAGCGAATGTGAGATAAATAGACTTGGTGATGACGAAGAGGACAATGATAGTTGTGATTCTTTTTCTCCCCATACACGTGCAGCCAGAAGTATGCCCCGTTATGAACCTAAACAGGTTCATAAGCACCCAGAATCATCAACCGTTGATGACCTTCCAAACGAATCATCTATGACTGTTTTTAGTGTATCAATTACGCAAAATTCGAAGTAAGAAGATATTTTATACTTAACATGTTCATTCCATGTTAAATTTTGCTTGCTAAAGTCAATCCTAGTCAAAATTATTCCGGTAGACTTTTAAAAATAAAAAAGTGCTGTGATACGCTAGATGTTAATTCATCATTTGCATTTCTGCTGTTTAATCAAAGTTGAATGAACCGACTGTAACTTATTCATAATCTATCTTTCGCTACATAAAATAATTCGTTTGCTATGTTTAGTTTATGAGCAGATACCTAATATTGAAAGCAGTGTTGATTGTGCTGAATTTCGCGTTCTCGTTTTTATTGATCCCAACTCCTATTACTAACTTTTAAATAGAAGGTT]
[+] EMBL AI390077             [                                                      cgagCCTGCTTCTACTGGCAGCGAATGTGAGATAAATAGACTTGGTGATGACGAAGAGGACAATGATAGTTGTGATTCTTTTTCTCCCCATACACGTGCAGCCAGAAGTATGCACCGTTATGAACCTAAACAGGTTCATAAGCACACAGAATCATCAACCGTTGATGACCTTCCAAACGAATCATCTATGACTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]




>consensus_6770#0
CGGAGCCATTAATTCGGCACGCAGGGATATGCAGATTGTTCTAAATTATTCAGTAATCCT
GCTTCTACTGGCAGCGAATGTGAGATAAATAGACTTGGTGATGACGAAGAGGACAATGAT
AGTTGTGATTCTTTTTCTCCCCATACACGTGCAGCCAGAAGTATGCACCGTTATGAACCT
AAACAGGTTCATAAGCACACAGAATCATCAACCGTTGATGACCTTCCAAACGAATCATCT
ATGACTGTTTCTAGTGTATCAATTACGCAAAATTCGAAGTAAGAAGATATTTTATACTTA
ACATGTTCATTCCATGTTAAATTTTGCTTGCTAAAGTCAATCCTAGTCAAAATTATTCCG
GTAGACTTTTAAAAATAAAAAAGTGCTGTGATACGCTAGATGTTAATTCATCATTTGCAT
TTCTGCTGTTTAATCAAAGTTGAATGAACCGACTGTAACTTATTCATAATCTATCTTTCG
CTACATAAAATAATTCGTTTGCTATGTTTAGTTTATGAGCAGATACCTAATATTGAAATC
AGTGTTGATTGTGCTGAATTTCGCGTTCTCGTTTTTATTGATCACAACTCCTATTACTAA
CTTTTAAATAGAATGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case