These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6804#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 681 fasta sequence [CCCTCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGGCGTTGCGTGACCTGCGTTCATACAGATATAAATGGATATAAACGCAGTCCTTTTGGGCTTGTATAATATCTCCTAGTTTCATACTGTGATTCATGAGCTAGTGAATTGGCCTTGATATCCGATAACACATCCCATCTAATAACTAG-GAAAAAAACGGGTCATGTTGTTGTACCCGAACGACTGACGTTAAACTATGGTGAGCCACAACATCATATATGTCTGGACTGATGACAATCCTGTGATTCAGCTTAAGAGACCGGGTAAGTTTTTATTTGTGATGATTTACACAGACCTGTATTGAATACACTACATGTAACAAAACCTTTCTGAATGTTTTAGCTAAACTAATGTCCCTGACTTTCTACGTTTTCAGATCATATTTGTCTGGACTGACGACAATCCTGTGATTCAGCTTAAGAGACCGGGTAAGTTTTTATTTGTGATGATTTACACAGACCTGTATTGAATACACTACATGTAACAAAACCTTTCTGAATGTTTTAGCTAAACTAATGTCTCTGACTTTCTATGTTTTCAGATATTTGGCTGACCTGGTGACTCCCATGTGGTCACGCCGAGGTCTGTTCG-TTTTTTC-ACATATGCATTTGTTTTAGCGCAACCTGTACATGCCTGCAT-GGCGTTTAAATAAACTT] [+] EMBL CD082553 [CCCTCGAGGCCANAATTCGGCACGAGGGCGTTGCGTGACCTGCGTTCATACAGATATAAATGGATATAAACGCAGTCCTTTTGGGCTTGTATAATATCTCCTAGTTTCATACTGTGATTCATGAGCTAGTGAATTGGCCTTGATATCCGATAACACATCCCATCTAATAACTAG GAAAAAAACGGGTCATGTTGTTGTACCCGAACGACTGACGTTAAACTATGGTGAGCCACAACATCATATATGTCTGGACTGATGACAATCCTGTGATTCAGCTTAAGAGACCGGGTAAGTTTTTATTTGTGATGATTTACACAGACCTGTATTGAATACACTACATGTAACAAAACCTTTCTGAATGTTTTAGCTAAACTAATGTCCCTGACTTTCTACGTTTTCAGATCATATTTGTCTGGACTGACGACAATCCTGTGATTCAGCTTAAGAGACCGGGTAAGTTTTTATTTGTGATGATTTACACAGACCTGTATTGAATACACTACATGTAACAAAACCTTTCTGAATGTTTTAGCTAAACTAATGTCTCTGACTTTCTATGTTTTCAGATATTTGGCTGACCTGGTGACTCCCATGTGGTCACGCCGAGGTCTGTTCG TTTTTTC ACATATGCATTTGTTTTAGCGCAACCTGTACATGCCTGCAT GGCGTTTAAATAAACTT] [-] EMBL CD122800 [ GTTGCGTGACCTGCGTTCATACAGATATAAATGGATATAAACGCAGTCCTTTTGGGCTTGTATAATATCTCCTAGTTTCATACTGTGATTCATGAGCTAGTGAATTGGCCTTGATATCCGATAACACATCCCATCTAATAACTAGAAAAAAAAACGGGTCATGTTGTTGTACCCGAACGACTGACGTTAAACTATGGTGAGCCACAACATCATATATGTCTG ] [-] EMBL CD076151 [ TAATATCTCCTAGTTTCATACTGTGATTCATGAGCTAGTGAATTGGCCTTGATATCCGATAACACATCCCATCTAATAACTAG GAAAAAAACGGGTCATGTTGTTGTACCCGAACGACTGACGTTAAACTATGGTGAGCCCCAACATCATATATGTCTGGACTGATGACAATCCTGTGATTCAGCTTAAGAGACCGGGTAAGTTTTTATTTGTGATGATTTACACAGACCTGTATTGAATACACTACATGTAACAAAACCTTTCTGAATGTTTTAGCTAAACTAATGTCCCTGACTTTTTACGTTTTCAGATCATATTTGTCTGGACTGACGACAATCCTGTGATTCAGCTTAAGAGACCGGGTAAGTTTTTATTTGTGATGATTTACACAGACCTGTATTGAATACCCTACATGTAACAAAACCTTTTTGAATGTTTTAGCTAAACTAATGTCTCTGACTTTCTATGTTTTCAGATATTTGGCTGACCTGGTGACTCCCATGTGGTCACGCCGAGGTCTGTTCG TTTTTTCAACATATGCATTTGTTTTAGCGCAACCTGTACATGCCTGCAT GGCGTTTAAATAAACTT] [+] EMBL CD079848 [ GGTGACTCCCATGTGGTCACGCCGAGGTCTGTTCGTTTTTTTA ACATATGCATTTGTTTTAACGCAACCTGTACATGCCTGCATGGGCGTTTAAATAAACTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||