These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6808#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 898 fasta sequence [GAGCCAGATTCGGCACGAGGGCCTTAGAAATTTATTTCCAAGTTCGTGGTTGCATAGAGAAGATTTTAGGCAGACCTCTGAAAGCCTTTGATGTTTACTGGGCTATTGTAGCGTGCAATATCCTGGTCTTTCTTGGTCTTAATAGTAAATTTTCCTCCACTCTTCTACCTTATTTCTGCAGCAGTCCATATGGGCCCACTCCTGTATTATCACTGGTGCTTAGTTTGTTTTCGCACAAAAGTCTATTCCATTTGGGTATCAATATGTATGTTTTGCACAGTTTCGCATCATCAGTTATATCGCTTGTCGGTGTTGAGGATTTTTTCAGTGTTTTTATTGCTGGTGGAATCTTCTCAAGTTATATCAGTTTGCTGAATAAATTACTGCGGAGATCTACATTTCCATCATTAGGTGCCAGTGGTGGTATATGCGCTATTATTGGTGCACTTTCTATGCTTCAACCAAATGCTAGGTTATGCGTACCATTTGTTGTTGACATTATACCTCATTCATTTCAAGCGAATAGTGCAGTTTGGATTATTCTTAGCATTGAAATATTTGGGCTTGTGTTCTTAAGTCGTCGTAGTGCATTAGATCACGCTGCACATGCTGGTGGTTTGGTCTTTGGCATGCTGTATGGTATGAATGGTGTCGAATCAATTTGGAAACGACACCGTGATGTATTATCTTGGTGGAAGAGTATTCGTGATCAAAAATTAAAAAAAAGATTACAATGATATCTTTAGGATATTCTCTATAGTTGTAATTCCATAGTAAACATTCAATAAAAAAGATGATTGTATTCTTTGAAGATTATTACGTTTTGTACAGTGAGTATATATATGTATCGTTTGTTTCAGTTATGTACGATATTATTATATTTATATAAAAGCCTTTT] [+] EMBL CD082664 [GAGCCAGATTCGGCACGAGGGCCTTAGAAATTTATTTCCAAGTTCGTGGTTGCATAGAGAAGATTTTAGGCAGACCTCTGAAAGCCTTTGATGTTTACTGGGCTATTGTAGCGTGCAATATCCTGGTCTTTCTTGGTCTTAATAGTAAATTTTCCTCCACTCTTCTACCTTATTTCTGCAGCAGTCCATATGGGCCCACTCCTGTATTATCACTGGTGCTTAGTTTGTTTTCGCACAAAAGTCTATTCCATTTGGGTATCAATATGTATGTTTTGCACAGTTTCGCATCATCAGTTATATCGCTTGTCGGTGTTGAGGATTTTTTCAGTGTTTTTATTGCTGGTGGAATCTTCTCAAGTTATATCAGTTTGCTGAATAAATTACTGCGGAGATCTACATTTCCATCATTAGGTGCCAGTGGTGGTATATGCGCTATTATTGGTGCACTTTCTATGCTTCAACCAAATGCTAGGTTATGCGTACCATTTGTTGTTGACATTATACCTCATTCATTTCAAGCGAATAGTGCAGTTTGGATTATTCTTAGCATTGAAATATTTGGGCTTGTGTTCTTAAGTCGTCGTAGTGCATTAGATCACGCTGCACATGCTGGTGGTTTGGTCTTTGGCATGCTGTATGGTATGAATGGTGTCGAATCAATTTGGAAACGACACCGTGATGTATTATCTTGG ] [-] EMBL CD077010 [ gTTGTTTTCGCACAAAAGTCTATTCCATTTGGGTATCAATATGTATGTTTTGCACAGTTTCGCATCATCAGTTATATCGCTTGTCGGTGTTGAGGATTTTTTCAGTGTTTTTATTGCTGGTGGAATCTTCTCAAGTTATATCAGTTTGCTGAATAAATTACTGCGGAGATCTACATTTCCATCATTAGGTGCCAGTGGTGGTATATGCGCTATTATTGGTGCACTTTCTATGCTTCAACCAAATGCTAGGTTATGCGTACCATTTGTTGTTGACATTATACCTCATTCATTTCAAGCGAATAGTGCAGTTTGGATTATTCTTAGCATTGAAATATTTGGGCTTGTGTTCTTAAGTCGTCGTAGTGCATTAGATCACGCTGCACATGCTGGTGGTTTGGTCTTTGGCATGCTGTATGGTATGAATGGTGTCGAATCAATTTGGAAACGACACCGTGATGTATTATCTTGGTGGAAGAGTATTCGTGATCAAAAATTAAAAAAAAGATTACAATGATATCTTTAGGATATTCTCTATAGTTGTAATTCCATAGTAAACATTCAATAAAAAAGATGATTGTATTCTTTGAAGATTATTACGTTTTGTACAGTGAGTATATATATGTATCGTTTGTTTCAGTTATGTACGATATTATTA ] [+] EMBL CD191585 [ TATTGCTGGTGGAGTCTTCTCAAGTTATATCAGTTTGCTGAATAAATTACTGCGGAGATCTACATTTCCATCATTAGGTGCCAGTGGTGGTATATGCGCTATTATTGGTGCACTTTCTATGCTTCAACCAAATGCTAGGTTATGCGTACCATTTGTTGTTGACGTTATACCTCATTCATTTCAAGCGAATAGTGCAGTTTGGATTATTCTTAGCATTGAAATATTTGGGCTTGTGTTCTTAAGTCGTCGTAGTGCATTAGATCACGCTGCACATGCTGGTGGTTTGGTCTTTGGCATGCTGTATGGTATGAATGGTGTCGAATCAATTTGGAAACGACACCGTGATGTATTATCTTGGTGGAAGAG ] [-] EMBL CD076260 [ GAATAAATTACTGCGGAGATCTACATTTCCATCATTAGGTGCCAGTGGTGGTATATGCGCTATTATTGGTGCACTTTTTATGCTTCAACCAAATGCTAGGTTATGCGTACCATTTGTTGTTGACATTATACCTCATTCATTTCAAGCGAATAGTGCAGTTTGGATTATTTTTAGCATTGAAATATTTGGGCTTGTGTTTTTAAGTCGTCGTAGTGCATTAGATCACGCTGCACATGCTGGTGGTTTGGTCTTTGGCATGCTGTATGGTATGAATGGTGTCGAATCAATTTGGAAACGACCCCGTGATGTATTATTTTGGTGGAAGAGTATTTGTGATCAAAAATTAAAAAAAAGATTACAATGATATCTTTAGGATATTCTCTATAGTTGTAATTCCATAGTAAACATTCAATAAAAAAGATGATTGTATTCTTTGAAGATTATTACGTGTTGTACAGTGAGTATATATATGTATCGTTTGTTTCAGTTATGTACAATATTATTATATTTATATAAAAGCCTTTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||