cluster # 6808

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Schistosoma mansoni
cluster # 6808 cluster # 6808 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6808#0 length = 898 sequences # 4
consensusID : consensus_6808#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 898
fasta sequence
                              [GAGCCAGATTCGGCACGAGGGCCTTAGAAATTTATTTCCAAGTTCGTGGTTGCATAGAGAAGATTTTAGGCAGACCTCTGAAAGCCTTTGATGTTTACTGGGCTATTGTAGCGTGCAATATCCTGGTCTTTCTTGGTCTTAATAGTAAATTTTCCTCCACTCTTCTACCTTATTTCTGCAGCAGTCCATATGGGCCCACTCCTGTATTATCACTGGTGCTTAGTTTGTTTTCGCACAAAAGTCTATTCCATTTGGGTATCAATATGTATGTTTTGCACAGTTTCGCATCATCAGTTATATCGCTTGTCGGTGTTGAGGATTTTTTCAGTGTTTTTATTGCTGGTGGAATCTTCTCAAGTTATATCAGTTTGCTGAATAAATTACTGCGGAGATCTACATTTCCATCATTAGGTGCCAGTGGTGGTATATGCGCTATTATTGGTGCACTTTCTATGCTTCAACCAAATGCTAGGTTATGCGTACCATTTGTTGTTGACATTATACCTCATTCATTTCAAGCGAATAGTGCAGTTTGGATTATTCTTAGCATTGAAATATTTGGGCTTGTGTTCTTAAGTCGTCGTAGTGCATTAGATCACGCTGCACATGCTGGTGGTTTGGTCTTTGGCATGCTGTATGGTATGAATGGTGTCGAATCAATTTGGAAACGACACCGTGATGTATTATCTTGGTGGAAGAGTATTCGTGATCAAAAATTAAAAAAAAGATTACAATGATATCTTTAGGATATTCTCTATAGTTGTAATTCCATAGTAAACATTCAATAAAAAAGATGATTGTATTCTTTGAAGATTATTACGTTTTGTACAGTGAGTATATATATGTATCGTTTGTTTCAGTTATGTACGATATTATTATATTTATATAAAAGCCTTTT]

[+] EMBL CD082664             [GAGCCAGATTCGGCACGAGGGCCTTAGAAATTTATTTCCAAGTTCGTGGTTGCATAGAGAAGATTTTAGGCAGACCTCTGAAAGCCTTTGATGTTTACTGGGCTATTGTAGCGTGCAATATCCTGGTCTTTCTTGGTCTTAATAGTAAATTTTCCTCCACTCTTCTACCTTATTTCTGCAGCAGTCCATATGGGCCCACTCCTGTATTATCACTGGTGCTTAGTTTGTTTTCGCACAAAAGTCTATTCCATTTGGGTATCAATATGTATGTTTTGCACAGTTTCGCATCATCAGTTATATCGCTTGTCGGTGTTGAGGATTTTTTCAGTGTTTTTATTGCTGGTGGAATCTTCTCAAGTTATATCAGTTTGCTGAATAAATTACTGCGGAGATCTACATTTCCATCATTAGGTGCCAGTGGTGGTATATGCGCTATTATTGGTGCACTTTCTATGCTTCAACCAAATGCTAGGTTATGCGTACCATTTGTTGTTGACATTATACCTCATTCATTTCAAGCGAATAGTGCAGTTTGGATTATTCTTAGCATTGAAATATTTGGGCTTGTGTTCTTAAGTCGTCGTAGTGCATTAGATCACGCTGCACATGCTGGTGGTTTGGTCTTTGGCATGCTGTATGGTATGAATGGTGTCGAATCAATTTGGAAACGACACCGTGATGTATTATCTTGG                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD077010             [                                                                                                                                                                                                                               gTTGTTTTCGCACAAAAGTCTATTCCATTTGGGTATCAATATGTATGTTTTGCACAGTTTCGCATCATCAGTTATATCGCTTGTCGGTGTTGAGGATTTTTTCAGTGTTTTTATTGCTGGTGGAATCTTCTCAAGTTATATCAGTTTGCTGAATAAATTACTGCGGAGATCTACATTTCCATCATTAGGTGCCAGTGGTGGTATATGCGCTATTATTGGTGCACTTTCTATGCTTCAACCAAATGCTAGGTTATGCGTACCATTTGTTGTTGACATTATACCTCATTCATTTCAAGCGAATAGTGCAGTTTGGATTATTCTTAGCATTGAAATATTTGGGCTTGTGTTCTTAAGTCGTCGTAGTGCATTAGATCACGCTGCACATGCTGGTGGTTTGGTCTTTGGCATGCTGTATGGTATGAATGGTGTCGAATCAATTTGGAAACGACACCGTGATGTATTATCTTGGTGGAAGAGTATTCGTGATCAAAAATTAAAAAAAAGATTACAATGATATCTTTAGGATATTCTCTATAGTTGTAATTCCATAGTAAACATTCAATAAAAAAGATGATTGTATTCTTTGAAGATTATTACGTTTTGTACAGTGAGTATATATATGTATCGTTTGTTTCAGTTATGTACGATATTATTA                    ]
[+] EMBL CD191585             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATTGCTGGTGGAGTCTTCTCAAGTTATATCAGTTTGCTGAATAAATTACTGCGGAGATCTACATTTCCATCATTAGGTGCCAGTGGTGGTATATGCGCTATTATTGGTGCACTTTCTATGCTTCAACCAAATGCTAGGTTATGCGTACCATTTGTTGTTGACGTTATACCTCATTCATTTCAAGCGAATAGTGCAGTTTGGATTATTCTTAGCATTGAAATATTTGGGCTTGTGTTCTTAAGTCGTCGTAGTGCATTAGATCACGCTGCACATGCTGGTGGTTTGGTCTTTGGCATGCTGTATGGTATGAATGGTGTCGAATCAATTTGGAAACGACACCGTGATGTATTATCTTGGTGGAAGAG                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD076260             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAATAAATTACTGCGGAGATCTACATTTCCATCATTAGGTGCCAGTGGTGGTATATGCGCTATTATTGGTGCACTTTTTATGCTTCAACCAAATGCTAGGTTATGCGTACCATTTGTTGTTGACATTATACCTCATTCATTTCAAGCGAATAGTGCAGTTTGGATTATTTTTAGCATTGAAATATTTGGGCTTGTGTTTTTAAGTCGTCGTAGTGCATTAGATCACGCTGCACATGCTGGTGGTTTGGTCTTTGGCATGCTGTATGGTATGAATGGTGTCGAATCAATTTGGAAACGACCCCGTGATGTATTATTTTGGTGGAAGAGTATTTGTGATCAAAAATTAAAAAAAAGATTACAATGATATCTTTAGGATATTCTCTATAGTTGTAATTCCATAGTAAACATTCAATAAAAAAGATGATTGTATTCTTTGAAGATTATTACGTGTTGTACAGTGAGTATATATATGTATCGTTTGTTTCAGTTATGTACAATATTATTATATTTATATAAAAGCCTTTT]




>consensus_6808#0
GAGCCAGATTCGGCACGAGGGCCTTAGAAATTTATTTCCAAGTTCGTGGTTGCATAGAGA
AGATTTTAGGCAGACCTCTGAAAGCCTTTGATGTTTACTGGGCTATTGTAGCGTGCAATA
TCCTGGTCTTTCTTGGTCTTAATAGTAAATTTTCCTCCACTCTTCTACCTTATTTCTGCA
GCAGTCCATATGGGCCCACTCCTGTATTATCACTGGTGCTTAGTTTGTTTTCGCACAAAA
GTCTATTCCATTTGGGTATCAATATGTATGTTTTGCACAGTTTCGCATCATCAGTTATAT
CGCTTGTCGGTGTTGAGGATTTTTTCAGTGTTTTTATTGCTGGTGGAATCTTCTCAAGTT
ATATCAGTTTGCTGAATAAATTACTGCGGAGATCTACATTTCCATCATTAGGTGCCAGTG
GTGGTATATGCGCTATTATTGGTGCACTTTCTATGCTTCAACCAAATGCTAGGTTATGCG
TACCATTTGTTGTTGACATTATACCTCATTCATTTCAAGCGAATAGTGCAGTTTGGATTA
TTCTTAGCATTGAAATATTTGGGCTTGTGTTCTTAAGTCGTCGTAGTGCATTAGATCACG
CTGCACATGCTGGTGGTTTGGTCTTTGGCATGCTGTATGGTATGAATGGTGTCGAATCAA
TTTGGAAACGACACCGTGATGTATTATCTTGGTGGAAGAGTATTCGTGATCAAAAATTAA
AAAAAAGATTACAATGATATCTTTAGGATATTCTCTATAGTTGTAATTCCATAGTAAACA
TTCAATAAAAAAGATGATTGTATTCTTTGAAGATTATTACGTTTTGTACAGTGAGTATAT
ATATGTATCGTTTGTTTCAGTTATGTACGATATTATTATATTTATATAAAAGCCTTTT
clustalw multiple alignements is not computed in this case