These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6817#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1119 fasta sequence [CAGTTTTAAATCACTCAGATGCAACAGTGTATTATATCAATTTTTCACCAAATAATTCAGGACGTAAATGTTTTGCAGACCCAACATCTGTTCAATTACCGATTTCCGATTCCTCTCTGGTGCCTCGTGTTCCAGCCTCACTACCTATTCTTTCAGGTCCTTTTCTGGACAGACCACCGACTCCACCAAGGCTGACGACATCTACGAATAATATTACTTCCGATGGTAATTCATCTATTCCCAAAACACCACAATTACATTACGCTCACCTTACACTATCTGACAAAGTAAATAGTTCAATGACAAATATGTGTCAACATAAAACATCAGATGATTTAACGAATGATGATGGTAATATTTGTCTTCACTCAACTCAATCTTTACAGTGTGCATTATCTTCTAATCCAAATTGTTCTGAAACTGAGTTCCTGGATCGTAGCTGTAACCTAGTTGGCAATAATTCTCATGACTGTTTCTCACAAGGAGTAAATTATGTAACTATAGATATGAGACAGACTAAAGCACTTTCTGAATTAGAACAAGAATTGCGCATCAGTACTGGATTAGTACGTAATGCTGGTTATCATATACCAAGGTCAGAATGTATCCTTCACAATCAGAATTGTGATAATGTGAAAACTGGTAATAAATTCACAGTGTTACGCAGGCATTTTACAATTTCATGCAACCTCCCCGCTTATTTTGCCAGAAAAAAAGGTGATACGGTTCATGCATTAACAAGCTCTCCAACAAATTCACAAGGAAAGAAACAAAATCATGAAAATATCACTTCCATGACCAATCGAGTTATAAAGCGTTTAATCCATTCATTTCACCTCCCACATCACCAAAATTAGCATTGTAGTAAAACTGTCTAAAGCCAAATCAGTTGTTTCTATTTTTTTTTGTATTTATCCCTACCCAATTTATTATTTAATTAAAGAATAGTACTAAATAACATCTGCTTTACACAAAGATTCATTTAATATGAATAACAAACTGTTTAATTTGACCAATGCGTGCACCATTATATTAGTGTTGCAGAAATATGTTATTTTTGTATTATTATCATACATATATGTATATTTCTTTATCAATCTTTTTTTTATAATAAAGTTA] [+] EMBL AI976725 [CAGTTTTAAATCACTCAGATGCAACAGTGTATTATATCAATTTTTCACCAAATAATTCAGGACGTAAATGTTTTGCAGACCCAACATCTGTTCAATTACCGATTTCCGATTCCTCTCTGGTGCCTCGTGTTCCAGCCTCACTACCTATTCTTTCAGGTCCTTTTCTGGACAGACCACCGACTCCACCAAGGCTGACGACATCTACGAATAATATTACTTCCGATGGTAATTCATCTATTCCCAAAACACCACAATTACATTACGCTCACCTTACACTATCTGACAAAGTAAATAGTTCAATGACAAATATGTGTCAACATAAAACATCAGATGATTTAACGAATGATGATGGTAATATTTGTCTTCACTCAACTCAATCTTTACAGTGTGCATTATCTTCTAATCCAAATTGTTCTGAAACTGAGTTCCTGGATCGTAGCTGTAACCTAGTTGGCAATAATTCTCATGACTGTTTCTCACAAGGAGTAAATTATGTAACTATAGATATGAGACAGACTAAAGCACTTTCTGAATTAGAACAAGAATTGCGCATCAGTACTGGATTAGTACGTAATGCTGGTTATCATATACCAAGGTCAGAATGTATCCTTCACAATCAGAATTGTGATAATGTGAAAACTGGTAATAAATTCACAGTGTTACGCAGGCATTTTACAATTTCATGCAACCTCCCCGCT ] [+] EMBL CD082836 [ AGTTTT AATCACTCAGATGCAACAGTGTATTATATCAATTTTTCACCAAATAATTCAGGACGTAAATGTTTTGCAGACCCAACATCTGTTCAATTACCGATTTCCGATTCCTCTCTGGTGCCTCGTGTTCCAGCCTCACTACCTATTCTTTCAGGTCCTTTTCTGGACAGACCACCGACTCCACCAAGGCTGACGACATCTACGAATAATATTACTTCCGATGGTAATTCATCTATTCCCAAAACACCACAATTACATTACGCTCACCTTACACTATCTGACAAAGTAAATAGTTCAATGACAAATATGTGTCAACATAAAACATCAGATGATTTAACGAATGATGATGGTAATATTTGTCTTCACTCAACTCAATCTTTACAGTGTGCATTATCTTCTAATCCAAATTGTTCTGAAACTGAGTTCCTGGATCGTAGCTGTAACCTAGTTGGCAATAATTCTCATGACTGTTTCTCACAAGGAGTAAATTATGTAACTATAGATATGAGACAGACTAAAGCACTTTCTGAATTAGAACAAGAATTGCGCATCAGTACTGGATTAGTACGTAATGCTGGTTATCATAT ] [+] EMBL CD113942 [ TGATGGTAATATTTGTCTTCACTCAACTCAATCTTTACAGTGTGCATTATCTTCTAATCCAAATTGTTCTGAAACTGAGTTCCTGGATCGTAGCTGTAACCTAGTTGGCAATAATTCTCATGACTGTTTCTCACAAGGAGTAAATTATGTAACTATAGATATGAGACAGACTAAAGCACTTTCTGAATTAGAACAAGAATTGCGCATCAGTACTGGATTAGTACGTAATGCTGGTTATCATATACCAAGGTCAGAATGTATCCTTCACAATCAGAATTGTGATAATGTGAAAACTGGTAATAAATTCACAGTGTTACGCAGGCATTTAACAATTTCATGCAACCTCCCCGCTTATTTTGCCAGAAAAAAAGGTGATACGGTTCATGCATTAACAAGCTCTC ] [-] EMBL CD076423 [ TTCTGAATTAGAACAAGAATTGCGCATCAGTACTGGATTAGTACGTAATGCTGGTTATCATATACCAAGGTCAGAATGTATCCTTCACAATCAGAATTGTGATAATGTGAAAACTGGTAATAAATTCACAGTGTTACGCAGGCATTTTACAATTTCATGCAACCTCCCCGCTTATTTTGCCAGAAAAAAAGGTGATACGGTTCATGCATTAACAAGCTCTCCAACAAATTCACAAGGAAAGAAACAAAATCATGAAAATATCACTTCCATGACCAATCGAGTTATAAAGCGTTTAATCCATTCATTTCACCTCCCACATCACCAAAATTAGCATTGTAGTAAAACTGTCTAAAGCCAAATCAGTTGTTTCTATTTTTTTTTGTATTTATCCCTACCCAATTTATTATTTAATTAAAGAATAGTACTAAATAACATCTGCTTTACACAAAGATTCATTTAATATGAATAACAAACTGTTTAATTTGACCAATGCGTGCACCATTATATTAGTGTTGCAGAAATATGTTATTTTTGTATTATTATCATACATATATGTATATTTCTTTATCAATCTTTTTTTTATAATAAAGTTA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||