Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6818 cluster # 6818       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6818#0 length = 594 sequences # 4  

consensusID : consensus_6818#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 594
fasta sequence
                              [AATTATTATTTTCTTTTATTGATACATTTACACTTTATATTGTAGTTATTGGCTGAAGATATTCGTAAAGAACGTAATCAACTTATGCAATGTATTCGTTATATTGTTAAAGAGAATTTCTTTCAATAATAATAATGATATTCAAATGACATTGATATATTTTATGTATAATACGAGAGCTAAGAAATAAAGTGTATATAATATATATGAAGAAAATATTGTGTAAAGTTTGATCTGATCAATGTTTTGTGTATGGTGTCCATTCTGGATCTTTAAAATTAATATAGACTTGTTTTTTTCTTGGGCGACCGGCTTTACGTTGTACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAGATGTCGTTTTATACGAGTAAACTTATGATTTTTTCGTTTTCTTTTACGTCCATCTGATTTAAGTTCACCTGATGCAGAAAGTAATGGAAGTGATCTTGTATGAGCTTTATATTCTTTAGTTCTTCTTGATTGTTGAAAATCAGGGGGACATAAACTTTTTGATAAGTTTTCTATTGGATAAATTTTGGCTTGTTCTATTGACTTGGACTCTT]

[+] EMBL AW017345             [AATTATTATTTTCTTTTATTGATACATTTACACTTTATATTGTAGTTATTGGCTGAAGATATTCGTAAAGAACGTAATCAACTTATGCAATGTATTCGTTATATTGTTAAAGAGAATTTCTTTCAATAATAATAATGATATTCAAATGACATTGATATATTTTATGTATAATACGAGAGCTAAGAAATAAAGTGTATATAATATATATGAAGAAAATATTGTGTAAAGTTTGATCTGATCAATGTTTTGTGTATGGTGTCCATTCTGGATCTTTAAAATTAATATAGACTTGTTTTTTTCTTGGGCGACCGGCTTTACGTTGTACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAGATGTCGTTTTATACGAGTAAACTTATGATTTTTTCGTTTTCTTTTACGTCCATCTGATTTAAGTTCACCTGATGCAGAAAGTAATGGAAGTGATCTTGTATGAGCTTTATATTCTTTAGTTCTTCTTGATTGTTGAAAATCAGGGGGACATAAACTTTTTGATAAGTTTTCTATTGGATAAATTTTGGCTTGTTCTATTGACTTGGACTCTT]
[+] EMBL CD076447             [AATTATTATTTTCTTTTATTGATACATTTACACTTTATATTGTAGTTATTGGCTGAAAATATTCGTAAAGAACGTAATCAACTTATGCAATGTATTCGTTATATTGTTAAAGAAAATTTCTTTCAATAATAATAATGATATTCAAATGACATTGATATATTTTATGTATAATACGAGAGCTAAGAAATAAAGTGTATATAATATATATGAAAAAAATATTGGGTAAAGTTTGATCTGATCAATGTTTTGGGTATGGGGTCCATTCTGGATCTTTAAAATTAATATAAACTTGTTTTTTTCTTGGGCGACCGGCTTTACGTTGTACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAAATGTCGTTTTATACGAGTAAACTTATGATTTTTTCGTTTTCTTTTACGTCCATCTGATTTAAGTTCACCTGATGCAAAAAGTAATGGAAGTGATCTTGTATGACCTTTATATTCTTTAGTTCTTCTTGATTGTTGAAAATCAGGGGGACATAAACTTCTTGATAAGTTTTCTATTGta                                  ]
[+] EMBL AI976868             [AATTATTATTTTCTTTTATTGATACATTTACACTTTATATTGTAGTTATTGGCTGAAGATATTCGTAAAGAACGTAATCAACTTATGCAATGTATTCGTTATATTGTTAAAGAGAATTTCTTTCAATAATAATAATGATATTCAAATGACATTGATATATTTTATGTATAATACGAGAGCTAAGAAATAAAGTGTATATAATATATATGAAGAAAATATTGTGTAAAGTTTGATCTGATCAATGTTTTGTGTATGGTGTCCATTCTGGATCTTTAAAATTAATATAGACTTGTTTTTTTCTTGGGCGACCGGCTTTACGTTGTACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAGATGTCGTTTTATACGAGT                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD158578             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAGATGTCGTTTTATACGAGTAAACTTATGATTTTTTCGTTTTCTTTTACGTCCATCTGATTTAAGTTCACCTGATGCAGAAAGTAATGGAAGTGATCTTGTATGAGCTTTATATTCTTTAGTTC                                                                                          ]


>consensus_6818#0 AATTATTATTTTCTTTTATTGATACATTTACACTTTATATTGTAGTTATTGGCTGAAGAT ATTCGTAAAGAACGTAATCAACTTATGCAATGTATTCGTTATATTGTTAAAGAGAATTTC TTTCAATAATAATAATGATATTCAAATGACATTGATATATTTTATGTATAATACGAGAGC TAAGAAATAAAGTGTATATAATATATATGAAGAAAATATTGTGTAAAGTTTGATCTGATC AATGTTTTGTGTATGGTGTCCATTCTGGATCTTTAAAATTAATATAGACTTGTTTTTTTC TTGGGCGACCGGCTTTACGTTGTACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCC AAATTGAAGTTCCTTGAGGAAGATGTCGTTTTATACGAGTAAACTTATGATTTTTTCGTT TTCTTTTACGTCCATCTGATTTAAGTTCACCTGATGCAGAAAGTAATGGAAGTGATCTTG TATGAGCTTTATATTCTTTAGTTCTTCTTGATTGTTGAAAATCAGGGGGACATAAACTTT TTGATAAGTTTTCTATTGGATAAATTTTGGCTTGTTCTATTGACTTGGACTCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)