These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6818#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 594 fasta sequence [AATTATTATTTTCTTTTATTGATACATTTACACTTTATATTGTAGTTATTGGCTGAAGATATTCGTAAAGAACGTAATCAACTTATGCAATGTATTCGTTATATTGTTAAAGAGAATTTCTTTCAATAATAATAATGATATTCAAATGACATTGATATATTTTATGTATAATACGAGAGCTAAGAAATAAAGTGTATATAATATATATGAAGAAAATATTGTGTAAAGTTTGATCTGATCAATGTTTTGTGTATGGTGTCCATTCTGGATCTTTAAAATTAATATAGACTTGTTTTTTTCTTGGGCGACCGGCTTTACGTTGTACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAGATGTCGTTTTATACGAGTAAACTTATGATTTTTTCGTTTTCTTTTACGTCCATCTGATTTAAGTTCACCTGATGCAGAAAGTAATGGAAGTGATCTTGTATGAGCTTTATATTCTTTAGTTCTTCTTGATTGTTGAAAATCAGGGGGACATAAACTTTTTGATAAGTTTTCTATTGGATAAATTTTGGCTTGTTCTATTGACTTGGACTCTT] [+] EMBL AW017345 [AATTATTATTTTCTTTTATTGATACATTTACACTTTATATTGTAGTTATTGGCTGAAGATATTCGTAAAGAACGTAATCAACTTATGCAATGTATTCGTTATATTGTTAAAGAGAATTTCTTTCAATAATAATAATGATATTCAAATGACATTGATATATTTTATGTATAATACGAGAGCTAAGAAATAAAGTGTATATAATATATATGAAGAAAATATTGTGTAAAGTTTGATCTGATCAATGTTTTGTGTATGGTGTCCATTCTGGATCTTTAAAATTAATATAGACTTGTTTTTTTCTTGGGCGACCGGCTTTACGTTGTACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAGATGTCGTTTTATACGAGTAAACTTATGATTTTTTCGTTTTCTTTTACGTCCATCTGATTTAAGTTCACCTGATGCAGAAAGTAATGGAAGTGATCTTGTATGAGCTTTATATTCTTTAGTTCTTCTTGATTGTTGAAAATCAGGGGGACATAAACTTTTTGATAAGTTTTCTATTGGATAAATTTTGGCTTGTTCTATTGACTTGGACTCTT] [+] EMBL CD076447 [AATTATTATTTTCTTTTATTGATACATTTACACTTTATATTGTAGTTATTGGCTGAAAATATTCGTAAAGAACGTAATCAACTTATGCAATGTATTCGTTATATTGTTAAAGAAAATTTCTTTCAATAATAATAATGATATTCAAATGACATTGATATATTTTATGTATAATACGAGAGCTAAGAAATAAAGTGTATATAATATATATGAAAAAAATATTGGGTAAAGTTTGATCTGATCAATGTTTTGGGTATGGGGTCCATTCTGGATCTTTAAAATTAATATAAACTTGTTTTTTTCTTGGGCGACCGGCTTTACGTTGTACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAAATGTCGTTTTATACGAGTAAACTTATGATTTTTTCGTTTTCTTTTACGTCCATCTGATTTAAGTTCACCTGATGCAAAAAGTAATGGAAGTGATCTTGTATGACCTTTATATTCTTTAGTTCTTCTTGATTGTTGAAAATCAGGGGGACATAAACTTCTTGATAAGTTTTCTATTGta ] [+] EMBL AI976868 [AATTATTATTTTCTTTTATTGATACATTTACACTTTATATTGTAGTTATTGGCTGAAGATATTCGTAAAGAACGTAATCAACTTATGCAATGTATTCGTTATATTGTTAAAGAGAATTTCTTTCAATAATAATAATGATATTCAAATGACATTGATATATTTTATGTATAATACGAGAGCTAAGAAATAAAGTGTATATAATATATATGAAGAAAATATTGTGTAAAGTTTGATCTGATCAATGTTTTGTGTATGGTGTCCATTCTGGATCTTTAAAATTAATATAGACTTGTTTTTTTCTTGGGCGACCGGCTTTACGTTGTACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAGATGTCGTTTTATACGAGT ] [+] EMBL CD158578 [ ACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAGATGTCGTTTTATACGAGTAAACTTATGATTTTTTCGTTTTCTTTTACGTCCATCTGATTTAAGTTCACCTGATGCAGAAAGTAATGGAAGTGATCTTGTATGAGCTTTATATTCTTTAGTTC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||