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Schistosoma mansoni
cluster # 6819 cluster # 6819       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6819#0 length = 2247 sequences # 4  

consensusID : consensus_6819#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 2247
fasta sequence
                              [TGATGTGCTTTATATATTTTGAGTAAAACACAATCAATGAGACAACTGAAGTTCTTTTTGCCATATTGTATCATAACTTTGGGGAGTTCGTTTCCTTTTGGATATCACACTGGAGTGATAAATGCACCTGCTGATCTGATTAAAAGCTTCATAAATACTACTCTAGCTGCTAGGTCAGTCACATGTGATGAACGTTTCATCGACTTGTTATGGTCACTCTGTGTTACGTCCTTCCTTCTTGGTGGGTTTTTTGGAGGCTTGATTGGTGGCGTTTTGGCTAACAAGTTGGGCCGAAAAAATTCACTATTCCTGCTGTCTATCCCAACAGTAATTGGATCACTCCTAATGATGTTTTCGAAAATGGCACAATCTTTCGAAATGATTATTATTGGGAGATTTACAATTGGGATCGCTTGTGGTGCTCATACGGTCGTTGGGCCTATGTTTCTGTCGGAAATAGCTCCAGTTAATTTCCGCGGAGCTGCGGGAACTTTCAATCAGTTTGTGATTGTTTCCGCTATATTGTTGTCACAAGTACTTAGTCTGCCTGAAGTGATGGGGACAACGGAATTATGGCCATATCTACTTGCTTTATGTACCGTTTCCAGCGTCATACATATTCTACTCCTGTTCACTTGTCCTGAAAGTCCTACTTACTTATACATTATTAAAGGTGATCGTCGAAGGTCAGAAAATGCATTAGTTTACCTTCGAGGGCAAGATTGTGATGTACATGCTGAATTAGAACTACTAAAATTGGAGACGGAACAGTCATCTACACACAAATCAAATGTTTGTGACCTACTGCGTATTCCATACTTGCGGTGGGGACTGATTGTAGCTTTGGTACCACATATTGGCCAACAGTTTTCCGGTATAAATGGAATTCTTTACTACTTTGTAAGTTTATTCATATCGAATGGGTTAACAAAACAAGTTGCAAGCTATGCAAATCTTGGAACTGGAGTTACAATTCTAATCGGTGCATTCGCATCCATATTTGTTATCGATCGGAAAGGCAGACGTCCTTTATTAATGTTTGGAACATCAGTTTGCCTTTTTAGCCTCTTACTATTCACCTTAACTTTGATTATTAAACAAGTGACTGAAATCAATAAACTTACAATTCTATCTATTGTACTGACGTATACGTTTTTATTTGGATTTTCAGTGAGTTTAGGTTCTATCCCATGGTTTTTGGTTTCTGAATTGTTTACGCAAGAAAATCGTGATGCTGCTGTCTCTATTGCTGCAGCAACTAACTGGTTATGCAATGCAATTGTAGCGTTAATATTCCCTCAGTTAGTTATCTATATTGGTATTTATGCTTTTATACCGTTTATATGTGCATTGTTAGTTGTATTAATATTTGTCGGATTGTATCTACCCGAAACGAAAGGAAAAACGCCGGCTTCCATCGAAGATTACTTTATGCGTGTTTGTGGTTTTCGTGGGACAGAAGCACATGAAAATCCAACATTTACAGATATAATAGATGATACAACACAATATTAGCTTAGCAACAGTCGCACTGGTAACTCAATTCATAATTCACATTGACAGGAATATATATATACATATGCACCAAATTAATCATTACTCATACCGAGTACTATCACTATTATTACTATTACCATTATTATTAATTTTATTATATACCACTACCTTTTTGTCTTACCTACATATTTCCATACTTTCTATATATACATATATGCACAAGATTATCAAATGTTTCAACATTGTTCTATTTTGTTTTATTTCCCATATAAATTATGTCAGTATATGTGAATATTCTTTTATTTTGAATTTTTCCCTAATTTCATTGATTCACTGTAATATCTTGTTGTTGTCGTCGTCGTCGTCATCTATCCAGTTATTATTTTCTACTCAGGGTTTATCTTATTATTTAAAACCATTACATCATATCTATTTCAATTGTATTCATTGATTTTCTTGTTTGAATCTTGATCG---TTTTTC-TTGGTGTC--TTCTGTTCCATCTCTCTAATATCTAGAA-TTTTTTCCTGGATTTTGTTTTAATAGATTATATAATATTACATGGAAACGATACATCAAAACGGTACTTATTTTTTTTATCTTCTTTTGTCTTAATATTCAACATACAACAAGTGTATTAATAATAATTCTGATTTCCTTTCTGTGAATTACTGATAACAGCTGATAACTGTTTTTTTCAGGCGCTCGTGTTTCATTCTCTTATTTTCATTGAAATAAAACACTTTTTCCACCG]

[+] EMBL SMGTP2A              [TGATGTGCTTTATATATTTTGAGTAAAACACAATCAATGAGACAACTGAAGTTCTTTTTGCCATATTGTATCATAACTTTGGGGAGTTCGTTTCCTTTTGGATATCACACTGGAGTGATAAATGCACCTGCTGATCTGATTAAAAGCTTCATAAATACTACTCTAGCTGCTAGGTCAGTCACATGTGATGAACGTTTCATCGACTTGTTATGGTCACTCTGTGTTACGTCCTTCCTTCTTGGTGGGTTTTTTGGAGGCTTGATTGGTGGCGTTTTGGCTAACAAGTTGGGCCGAAAAAATTCACTATTCCTGCTGTCTATCCCAACAGTAATTGGATCACTCCTAATGATGTTTTCGAAAATGGCACAATCTTTCGAAATGATTATTATTGGGAGATTTACAATTGGGATCGCTTGTGGTGCTCATACGGTCGTTGGGCCTATGTTTCTGTCGGAAATAGCTCCAGTTAATTTCCGCGGAGCTGCGGGAACTTTCAATCAGTTTGTGATTGTTTCCGCTATATTGTTGTCACAAGTACTTAGTCTGCCTGAAGTGATGGGGACAACGGAATTATGGCCATATCTACTTGCTTTATGTACCGTTTCCAGCGTCATACATATTCTACTCCTGTTCACTTGTCCTGAAAGTCCTACTTACTTATACATTATTAAAGGTGATCGTCGAAGGTCAGAAAATGCATTAGTTTACCTTCGAGGGCAAGATTGTGATGTACATGCTGAATTAGAACTACTAAAATTGGAGACGGAACAGTCATCTACACACAAATCAAATGTTTGTGACCTACTGCGTATTCCATACTTGCGGTGGGGACTGATTGTAGCTTTGGTACCACATATTGGCCAACAGTTTTCCGGTATAAATGGAATTCTTTACTACTTTGTAAGTTTATTCATATCGAATGGGTTAACAAAACAAGTTGCAAGCTATGCAAATCTTGGAACTGGAGTTACAATTCTAATCGGTGCATTCGCATCCATATTTGTTATCGATCGGAAAGGCAGACGTCCTTTATTAATGTTTGGAACATCAGTTTGCCTTTTTAGCCTCTTACTATTCACCTTAACTTTGATTATTAAACAAGTGACTGAAATCAATAAACTTACAATTCTATCTATTGTACTGACGTATACGTTTTTATTTGGATTTTCAGTGAGTTTAGGTTCTATCCCATGGTTTTTGGTTTCTGAATTGTTTACGCAAGAAAATCGTGATGCTGCTGTCTCTATTGCTGCAGCAACTAACTGGTTATGCAATGCAATTGTAGCGTTAATATTCCCTCAGTTAGTTATCTATATTGGTATTTATGCTTTTATACCGTTTATATGTGCATTGTTAGTTGTATTAATATTTGTCGGATTGTATCTACCCGAAACGAAAGGAAAAACGCCGGCTTCCATCGAAGATTACTTTATGCGTGTTTGTGGTTTTCGTGGGACAGAAGCACATGAAAATCCAACATTTACAGATATAATAGATGATACAACACAATATTAGCTTAGCAACAGTCGCACTGGTAACTCAATTCATAATTCACATTGACAGGAATATATATATACATATGCACCAAATTAATCATTACTCATACCGAGTACTATCACTATTATTACTATTACCATTATTATTAATTTTATTATATACCACTACCTTTTTGTCTTACCTACATATTTCCATACTTTCTATATATACATATATGCACAAGATTATCAAATGTTTCAACATTGTTCTATTTTGTTTTATTTCCCATATAAATTATGTCAGTATATGTGAATATTCTTTTATTTTGAATTTTTCCCTAATTTCATTGATTCACTGTAATATCTTGTTGTTGTTGTCGTCGTCGTCATCTATCCAGTTATTATTTTCTACTCAGGGTTTATCTTATTATTTAAAACCATTACATCATATCTATTTCAATTGTATTCATTGATTTTCTTGTTTGAATCTTGATCG   TTTTTC TTGGTGTC  TTCTGTTCCATCTCTCTAATATCTAGAA TTTTTTCCTGGATTTTGTTTTAATAGCTTATATAACATTACATGGAAACGATACATCAAAACGGTACTTATTTTTTTTATCTTCTTTTGTCTTAATATTCAACATACAACAAGTGTATTAATAATAATTCTGATTTCCTTTCTGTGAATTACTGATAACAGCTGATAACTGTTTTTTTCAGGCGCTCGTGTTTCATTCTCTTATTTTCATTGAAATAA                ]
[+] EMBL CD082863             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GCCTCTTACTATTCACCTTAACTTTGATTATTAAACAAGTGACTGAAATCAATAAACTTACAATTCTATCTATTGTACTGACGTATACGTTTTTATTTGGATTTTCAGTGAGTTTAGGTTCTATCCCATGGTTTTTGGTTTCTGAATTGTTTACGCAAGAAAATCGTGATGCTGCTGTCTCTATTGCTGCAGCAACTAACTGGTTATGCAATGCAATTGTAGCGTTAATATTCCCTCAGTTAGTTATCTATATTGGTATTTATGCTTTTATACCGTTTATATGTGCATTGTTAGTTGTATTAATATTTGTCGGATTGTATCTACCCGAAACGAAAGGAAAAACGCCGGCTTCCATCGAAGATTACTTTATGCGTGTTTGTGGTTTTCGTGGGACAGAAGCACATGAAAATCCAACATTTACAGATATAATAGATGATACAACACAATATTAGCTTAGCAACAGTCGCACTGGTAACTCAATTCATAATTCACATTGACAGGAATATATATATACATATGCACCAAATTAATCATTACTCATACCGAGTACTATCACTATTATTACTATTACC   ATTATTAATTNTATTATATACCACTACCTTTTTGTCTTACCTACATATTTCCATACTTTCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD076449             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTTACCTACATATTTCCATACTTTCTATATATACATATATGCACAAGATTATCAAATGTTTCAACATTGTTCTATTTTGTTTTATTTCCCATATAAATTATGTCAGTATATGTGAATATTCTTTTATTTTGAATTTTTCCCTAATTTCATTGATTCACTGTAATATCTTGTTGTTGTCGTCGTCGTCGTCATCTATCCAGTTATTATTTTCTACTCAGGGTTTATCTTATTATTTAAAACCATTACATCATATCTATTTCAATTGTATTCATTGATTTTCTTGTTTGAATCTTGATCGTTTTTTTTCTTTGGTGTCTTTTCTGTTCCATCTCTCTAATATCTAGAATTTTTTTCCTGGATTTTGTTTTAATAGATTATATAATATTACATGGAAACGATACATCAAAACGGTACTTATTTTTTTTATCTTCTTTTGTCTTAATATTCAACATACAACAAGTGTATTAATAATAATTCTGATTTCCTTTCTGTGAATTACTGATAACAGCTGATAACTGTTTTTTTCAGGCGCTCGTGTTTCATTCTCTTATTTTCATTGAAATAAAACACTTTTTCCACCG]
[-] EMBL CD146061             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTTGTTGTTGTCGTCGTCGTCGTCATCTATCCAGTTATTATTTTCTACTCAGGGTTTATCTTATTATTTAAAACCATTACATCATATCTATTTCAATTGTATTCATTGATTTTCTTGTTTGAATCTTGATCGTTTTTTTTCTTTGGTGTCTTTTCTGTTCCATCTCTCTAATATCTAGAATTTTTTTCCTGGATCTTGTTTTAATAGATTATATAATATTACATGGAAACGATACATCAAAACGGTACTTATTTTTTTTATCTTCTTTTGTCTTAATATTCAACATACAACAAGTGTATTAATAATAATTCTGATTTCCT                                                                                               ]


>consensus_6819#0 TGATGTGCTTTATATATTTTGAGTAAAACACAATCAATGAGACAACTGAAGTTCTTTTTG CCATATTGTATCATAACTTTGGGGAGTTCGTTTCCTTTTGGATATCACACTGGAGTGATA AATGCACCTGCTGATCTGATTAAAAGCTTCATAAATACTACTCTAGCTGCTAGGTCAGTC ACATGTGATGAACGTTTCATCGACTTGTTATGGTCACTCTGTGTTACGTCCTTCCTTCTT GGTGGGTTTTTTGGAGGCTTGATTGGTGGCGTTTTGGCTAACAAGTTGGGCCGAAAAAAT TCACTATTCCTGCTGTCTATCCCAACAGTAATTGGATCACTCCTAATGATGTTTTCGAAA ATGGCACAATCTTTCGAAATGATTATTATTGGGAGATTTACAATTGGGATCGCTTGTGGT GCTCATACGGTCGTTGGGCCTATGTTTCTGTCGGAAATAGCTCCAGTTAATTTCCGCGGA GCTGCGGGAACTTTCAATCAGTTTGTGATTGTTTCCGCTATATTGTTGTCACAAGTACTT AGTCTGCCTGAAGTGATGGGGACAACGGAATTATGGCCATATCTACTTGCTTTATGTACC GTTTCCAGCGTCATACATATTCTACTCCTGTTCACTTGTCCTGAAAGTCCTACTTACTTA TACATTATTAAAGGTGATCGTCGAAGGTCAGAAAATGCATTAGTTTACCTTCGAGGGCAA GATTGTGATGTACATGCTGAATTAGAACTACTAAAATTGGAGACGGAACAGTCATCTACA CACAAATCAAATGTTTGTGACCTACTGCGTATTCCATACTTGCGGTGGGGACTGATTGTA GCTTTGGTACCACATATTGGCCAACAGTTTTCCGGTATAAATGGAATTCTTTACTACTTT GTAAGTTTATTCATATCGAATGGGTTAACAAAACAAGTTGCAAGCTATGCAAATCTTGGA ACTGGAGTTACAATTCTAATCGGTGCATTCGCATCCATATTTGTTATCGATCGGAAAGGC AGACGTCCTTTATTAATGTTTGGAACATCAGTTTGCCTTTTTAGCCTCTTACTATTCACC TTAACTTTGATTATTAAACAAGTGACTGAAATCAATAAACTTACAATTCTATCTATTGTA CTGACGTATACGTTTTTATTTGGATTTTCAGTGAGTTTAGGTTCTATCCCATGGTTTTTG GTTTCTGAATTGTTTACGCAAGAAAATCGTGATGCTGCTGTCTCTATTGCTGCAGCAACT AACTGGTTATGCAATGCAATTGTAGCGTTAATATTCCCTCAGTTAGTTATCTATATTGGT ATTTATGCTTTTATACCGTTTATATGTGCATTGTTAGTTGTATTAATATTTGTCGGATTG TATCTACCCGAAACGAAAGGAAAAACGCCGGCTTCCATCGAAGATTACTTTATGCGTGTT TGTGGTTTTCGTGGGACAGAAGCACATGAAAATCCAACATTTACAGATATAATAGATGAT ACAACACAATATTAGCTTAGCAACAGTCGCACTGGTAACTCAATTCATAATTCACATTGA CAGGAATATATATATACATATGCACCAAATTAATCATTACTCATACCGAGTACTATCACT ATTATTACTATTACCATTATTATTAATTTTATTATATACCACTACCTTTTTGTCTTACCT ACATATTTCCATACTTTCTATATATACATATATGCACAAGATTATCAAATGTTTCAACAT TGTTCTATTTTGTTTTATTTCCCATATAAATTATGTCAGTATATGTGAATATTCTTTTAT TTTGAATTTTTCCCTAATTTCATTGATTCACTGTAATATCTTGTTGTTGTCGTCGTCGTC GTCATCTATCCAGTTATTATTTTCTACTCAGGGTTTATCTTATTATTTAAAACCATTACA TCATATCTATTTCAATTGTATTCATTGATTTTCTTGTTTGAATCTTGATCGTTTTTCTTG GTGTCTTCTGTTCCATCTCTCTAATATCTAGAATTTTTTCCTGGATTTTGTTTTAATAGA TTATATAATATTACATGGAAACGATACATCAAAACGGTACTTATTTTTTTTATCTTCTTT TGTCTTAATATTCAACATACAACAAGTGTATTAATAATAATTCTGATTTCCTTTCTGTGA ATTACTGATAACAGCTGATAACTGTTTTTTTCAGGCGCTCGTGTTTCATTCTCTTATTTT CATTGAAATAAAACACTTTTTCCACCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)