These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6819#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 2247 fasta sequence [TGATGTGCTTTATATATTTTGAGTAAAACACAATCAATGAGACAACTGAAGTTCTTTTTGCCATATTGTATCATAACTTTGGGGAGTTCGTTTCCTTTTGGATATCACACTGGAGTGATAAATGCACCTGCTGATCTGATTAAAAGCTTCATAAATACTACTCTAGCTGCTAGGTCAGTCACATGTGATGAACGTTTCATCGACTTGTTATGGTCACTCTGTGTTACGTCCTTCCTTCTTGGTGGGTTTTTTGGAGGCTTGATTGGTGGCGTTTTGGCTAACAAGTTGGGCCGAAAAAATTCACTATTCCTGCTGTCTATCCCAACAGTAATTGGATCACTCCTAATGATGTTTTCGAAAATGGCACAATCTTTCGAAATGATTATTATTGGGAGATTTACAATTGGGATCGCTTGTGGTGCTCATACGGTCGTTGGGCCTATGTTTCTGTCGGAAATAGCTCCAGTTAATTTCCGCGGAGCTGCGGGAACTTTCAATCAGTTTGTGATTGTTTCCGCTATATTGTTGTCACAAGTACTTAGTCTGCCTGAAGTGATGGGGACAACGGAATTATGGCCATATCTACTTGCTTTATGTACCGTTTCCAGCGTCATACATATTCTACTCCTGTTCACTTGTCCTGAAAGTCCTACTTACTTATACATTATTAAAGGTGATCGTCGAAGGTCAGAAAATGCATTAGTTTACCTTCGAGGGCAAGATTGTGATGTACATGCTGAATTAGAACTACTAAAATTGGAGACGGAACAGTCATCTACACACAAATCAAATGTTTGTGACCTACTGCGTATTCCATACTTGCGGTGGGGACTGATTGTAGCTTTGGTACCACATATTGGCCAACAGTTTTCCGGTATAAATGGAATTCTTTACTACTTTGTAAGTTTATTCATATCGAATGGGTTAACAAAACAAGTTGCAAGCTATGCAAATCTTGGAACTGGAGTTACAATTCTAATCGGTGCATTCGCATCCATATTTGTTATCGATCGGAAAGGCAGACGTCCTTTATTAATGTTTGGAACATCAGTTTGCCTTTTTAGCCTCTTACTATTCACCTTAACTTTGATTATTAAACAAGTGACTGAAATCAATAAACTTACAATTCTATCTATTGTACTGACGTATACGTTTTTATTTGGATTTTCAGTGAGTTTAGGTTCTATCCCATGGTTTTTGGTTTCTGAATTGTTTACGCAAGAAAATCGTGATGCTGCTGTCTCTATTGCTGCAGCAACTAACTGGTTATGCAATGCAATTGTAGCGTTAATATTCCCTCAGTTAGTTATCTATATTGGTATTTATGCTTTTATACCGTTTATATGTGCATTGTTAGTTGTATTAATATTTGTCGGATTGTATCTACCCGAAACGAAAGGAAAAACGCCGGCTTCCATCGAAGATTACTTTATGCGTGTTTGTGGTTTTCGTGGGACAGAAGCACATGAAAATCCAACATTTACAGATATAATAGATGATACAACACAATATTAGCTTAGCAACAGTCGCACTGGTAACTCAATTCATAATTCACATTGACAGGAATATATATATACATATGCACCAAATTAATCATTACTCATACCGAGTACTATCACTATTATTACTATTACCATTATTATTAATTTTATTATATACCACTACCTTTTTGTCTTACCTACATATTTCCATACTTTCTATATATACATATATGCACAAGATTATCAAATGTTTCAACATTGTTCTATTTTGTTTTATTTCCCATATAAATTATGTCAGTATATGTGAATATTCTTTTATTTTGAATTTTTCCCTAATTTCATTGATTCACTGTAATATCTTGTTGTTGTCGTCGTCGTCGTCATCTATCCAGTTATTATTTTCTACTCAGGGTTTATCTTATTATTTAAAACCATTACATCATATCTATTTCAATTGTATTCATTGATTTTCTTGTTTGAATCTTGATCG---TTTTTC-TTGGTGTC--TTCTGTTCCATCTCTCTAATATCTAGAA-TTTTTTCCTGGATTTTGTTTTAATAGATTATATAATATTACATGGAAACGATACATCAAAACGGTACTTATTTTTTTTATCTTCTTTTGTCTTAATATTCAACATACAACAAGTGTATTAATAATAATTCTGATTTCCTTTCTGTGAATTACTGATAACAGCTGATAACTGTTTTTTTCAGGCGCTCGTGTTTCATTCTCTTATTTTCATTGAAATAAAACACTTTTTCCACCG] [+] EMBL SMGTP2A [TGATGTGCTTTATATATTTTGAGTAAAACACAATCAATGAGACAACTGAAGTTCTTTTTGCCATATTGTATCATAACTTTGGGGAGTTCGTTTCCTTTTGGATATCACACTGGAGTGATAAATGCACCTGCTGATCTGATTAAAAGCTTCATAAATACTACTCTAGCTGCTAGGTCAGTCACATGTGATGAACGTTTCATCGACTTGTTATGGTCACTCTGTGTTACGTCCTTCCTTCTTGGTGGGTTTTTTGGAGGCTTGATTGGTGGCGTTTTGGCTAACAAGTTGGGCCGAAAAAATTCACTATTCCTGCTGTCTATCCCAACAGTAATTGGATCACTCCTAATGATGTTTTCGAAAATGGCACAATCTTTCGAAATGATTATTATTGGGAGATTTACAATTGGGATCGCTTGTGGTGCTCATACGGTCGTTGGGCCTATGTTTCTGTCGGAAATAGCTCCAGTTAATTTCCGCGGAGCTGCGGGAACTTTCAATCAGTTTGTGATTGTTTCCGCTATATTGTTGTCACAAGTACTTAGTCTGCCTGAAGTGATGGGGACAACGGAATTATGGCCATATCTACTTGCTTTATGTACCGTTTCCAGCGTCATACATATTCTACTCCTGTTCACTTGTCCTGAAAGTCCTACTTACTTATACATTATTAAAGGTGATCGTCGAAGGTCAGAAAATGCATTAGTTTACCTTCGAGGGCAAGATTGTGATGTACATGCTGAATTAGAACTACTAAAATTGGAGACGGAACAGTCATCTACACACAAATCAAATGTTTGTGACCTACTGCGTATTCCATACTTGCGGTGGGGACTGATTGTAGCTTTGGTACCACATATTGGCCAACAGTTTTCCGGTATAAATGGAATTCTTTACTACTTTGTAAGTTTATTCATATCGAATGGGTTAACAAAACAAGTTGCAAGCTATGCAAATCTTGGAACTGGAGTTACAATTCTAATCGGTGCATTCGCATCCATATTTGTTATCGATCGGAAAGGCAGACGTCCTTTATTAATGTTTGGAACATCAGTTTGCCTTTTTAGCCTCTTACTATTCACCTTAACTTTGATTATTAAACAAGTGACTGAAATCAATAAACTTACAATTCTATCTATTGTACTGACGTATACGTTTTTATTTGGATTTTCAGTGAGTTTAGGTTCTATCCCATGGTTTTTGGTTTCTGAATTGTTTACGCAAGAAAATCGTGATGCTGCTGTCTCTATTGCTGCAGCAACTAACTGGTTATGCAATGCAATTGTAGCGTTAATATTCCCTCAGTTAGTTATCTATATTGGTATTTATGCTTTTATACCGTTTATATGTGCATTGTTAGTTGTATTAATATTTGTCGGATTGTATCTACCCGAAACGAAAGGAAAAACGCCGGCTTCCATCGAAGATTACTTTATGCGTGTTTGTGGTTTTCGTGGGACAGAAGCACATGAAAATCCAACATTTACAGATATAATAGATGATACAACACAATATTAGCTTAGCAACAGTCGCACTGGTAACTCAATTCATAATTCACATTGACAGGAATATATATATACATATGCACCAAATTAATCATTACTCATACCGAGTACTATCACTATTATTACTATTACCATTATTATTAATTTTATTATATACCACTACCTTTTTGTCTTACCTACATATTTCCATACTTTCTATATATACATATATGCACAAGATTATCAAATGTTTCAACATTGTTCTATTTTGTTTTATTTCCCATATAAATTATGTCAGTATATGTGAATATTCTTTTATTTTGAATTTTTCCCTAATTTCATTGATTCACTGTAATATCTTGTTGTTGTTGTCGTCGTCGTCATCTATCCAGTTATTATTTTCTACTCAGGGTTTATCTTATTATTTAAAACCATTACATCATATCTATTTCAATTGTATTCATTGATTTTCTTGTTTGAATCTTGATCG TTTTTC TTGGTGTC TTCTGTTCCATCTCTCTAATATCTAGAA TTTTTTCCTGGATTTTGTTTTAATAGCTTATATAACATTACATGGAAACGATACATCAAAACGGTACTTATTTTTTTTATCTTCTTTTGTCTTAATATTCAACATACAACAAGTGTATTAATAATAATTCTGATTTCCTTTCTGTGAATTACTGATAACAGCTGATAACTGTTTTTTTCAGGCGCTCGTGTTTCATTCTCTTATTTTCATTGAAATAA ] [+] EMBL CD082863 [ GCCTCTTACTATTCACCTTAACTTTGATTATTAAACAAGTGACTGAAATCAATAAACTTACAATTCTATCTATTGTACTGACGTATACGTTTTTATTTGGATTTTCAGTGAGTTTAGGTTCTATCCCATGGTTTTTGGTTTCTGAATTGTTTACGCAAGAAAATCGTGATGCTGCTGTCTCTATTGCTGCAGCAACTAACTGGTTATGCAATGCAATTGTAGCGTTAATATTCCCTCAGTTAGTTATCTATATTGGTATTTATGCTTTTATACCGTTTATATGTGCATTGTTAGTTGTATTAATATTTGTCGGATTGTATCTACCCGAAACGAAAGGAAAAACGCCGGCTTCCATCGAAGATTACTTTATGCGTGTTTGTGGTTTTCGTGGGACAGAAGCACATGAAAATCCAACATTTACAGATATAATAGATGATACAACACAATATTAGCTTAGCAACAGTCGCACTGGTAACTCAATTCATAATTCACATTGACAGGAATATATATATACATATGCACCAAATTAATCATTACTCATACCGAGTACTATCACTATTATTACTATTACC ATTATTAATTNTATTATATACCACTACCTTTTTGTCTTACCTACATATTTCCATACTTTCTAT ] [-] EMBL CD076449 [ CTTACCTACATATTTCCATACTTTCTATATATACATATATGCACAAGATTATCAAATGTTTCAACATTGTTCTATTTTGTTTTATTTCCCATATAAATTATGTCAGTATATGTGAATATTCTTTTATTTTGAATTTTTCCCTAATTTCATTGATTCACTGTAATATCTTGTTGTTGTCGTCGTCGTCGTCATCTATCCAGTTATTATTTTCTACTCAGGGTTTATCTTATTATTTAAAACCATTACATCATATCTATTTCAATTGTATTCATTGATTTTCTTGTTTGAATCTTGATCGTTTTTTTTCTTTGGTGTCTTTTCTGTTCCATCTCTCTAATATCTAGAATTTTTTTCCTGGATTTTGTTTTAATAGATTATATAATATTACATGGAAACGATACATCAAAACGGTACTTATTTTTTTTATCTTCTTTTGTCTTAATATTCAACATACAACAAGTGTATTAATAATAATTCTGATTTCCTTTCTGTGAATTACTGATAACAGCTGATAACTGTTTTTTTCAGGCGCTCGTGTTTCATTCTCTTATTTTCATTGAAATAAAACACTTTTTCCACCG] [-] EMBL CD146061 [ CTTGTTGTTGTCGTCGTCGTCGTCATCTATCCAGTTATTATTTTCTACTCAGGGTTTATCTTATTATTTAAAACCATTACATCATATCTATTTCAATTGTATTCATTGATTTTCTTGTTTGAATCTTGATCGTTTTTTTTCTTTGGTGTCTTTTCTGTTCCATCTCTCTAATATCTAGAATTTTTTTCCTGGATCTTGTTTTAATAGATTATATAATATTACATGGAAACGATACATCAAAACGGTACTTATTTTTTTTATCTTCTTTTGTCTTAATATTCAACATACAACAAGTGTATTAATAATAATTCTGATTTCCT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||