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Schistosoma mansoni
cluster # 6836 cluster # 6836       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6836#0 length = 1130 sequences # 4  

consensusID : consensus_6836#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1130
fasta sequence
                              [CANAATCGGCACGAGGACGGCACTCAAGACCACCGAAGTGCGCTCTTCCTATTGAGTATACTGCAGTGAGTTTATTACATTCCTAAATCTAGTCAGTCTTCCTACTGGGATTGGCCTTGAAATGCTTCGCTTTTGATCGCCCGTTTGTGTATAGGGATTTACCAACTGAATTTTTACACAACTCTGCCACTTGCGTTTTGCTACCTCCATTTTGTATTCACTGATTCCGTTTCAAAGTGTTGTAACGTACATACCGCAAATAGGCAGTGATGAGTCTTTATTTAACGCCAGTGAGCTTCAGTATACTTAGTCCGGTTTAGTTGTTAGTCCATGGTGAATGGTAGCGCAGATAAGTGCAATCAAATAAAGTTATATAGAGCGATGTAAAAGCAGTTCTATGCCCTCGAGATATGTTCCCTTGACAGATCTTGAAAAACAATCGAAAATTTTCCACCTTAAAAACCTGGTGTTAACACGCCAAGCTAATGTGAACACTATTAGGTCCAAGGAGCTCTTCACTCTTGCCTGATAAACACTTCGAACAGTCCCAGCAGATAGTCGATTCTTTAAGAGTTCTTATTTTGAAAACCACAGTCTTCGTGTACTGGAAACTACGTCATTCAAAAATAATCAGATGTGCCGTAGTCTT-ATCAGTGGTCATGTGGCCGAACACCTCAGCGGCCACTAGGATTTCGTTACTTGATACTCGAGTTGTTCAATATTTCATTAACATCAAAGAACCCTTTGTGGAACCTGACTTTGTCGTCTTCATAAACGAGATAGTTCGCTCAGCATTTGTGCAACGCCTTTCAATAACGCCGACTTGTGTTATCACTTCTATCTGCTTCACTTTGCCAAAAGAATAATACATCCTGGATTCCTGGTACAGGTTAGTTAGATTCAGTCCAGACCCCGTGACAATAACTCTATATTGTTGTATATTGCTTAAATAATCGGTTCAAATGTCAAAGCTAATGAACGAAACTTAGCGTGAAAACCAAATGCAGTGAGCTAAAATCCCCGCAAGTCTTTTTCAGTTGTTTTTCCAGGTGTGTTTTTTTACAAGTAATAAACTCACGAGAATCTGTACACTTAGCATTCAATATATAATCTTCACCAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD083158             [CANAATCGGCACGAGGACGGCACTCAAGACCACCGAAGTGCGCTCTTCCTATTGAGTATACTGCAGTGAGTTTATTACATTCCTAAATCTAGTCAGTCTTCCTACTGGGATTGGCCTTGAAATGCTTCGCTTTTGATCGCCCGTTTGTGTATAGGGATTTACCAACTGAATTTTTACACAACTCTGCCACTTGCGTTTTGCTACCTCCATTTTGTATTCACTGATTCCGTTTCAAAGTGTTGTAACGTACATACCGCAAATAGGCAGTGATGAGTCTTTATTTAACGCCAGTGAGCTTCAGTATACTTAGTCCGGTTTAGTTGTTAGTCCATGGTGAATGGTAGCGCAGATAAGTGCAATCAAATAAAGTTATATAGAGCGATGTAAAAGCAGTTCTATGCCCTCGAGATATGTTCCCTTGACAGATCTTGAAAAACAATCGAAAATTTTCCACCTTAAAAACCTGGTGTTAACACGCCAAGCTAATGTGAACACTATTAGGTCCAAGGAGCTCTTCACTCTTGCCTGATAAACACTTCGAACAGTCCCAGCAGATAGTCGATTCTTTAAGAGTTCTTATTTTGAAAACCACAGTCTTCGTGTACTGGAAACTACGTCATTCAAAAATAATCAGATGTGCCGTAGTCTT ATCAGTGGTCATGTGGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD194426             [                                                  ATTGAGTATACTGCAGTGAGTTTATTACATTCCTAAATCTAGTCAGTCTTCCTACTGGGATTGGCCTTGAAATGCTTCGCCTTTGATCGCCCGTTTGTGTATAGGGATTTACTAACTGAATTTTTACACAACTCTGCCACTTGCGTTTTGCTACCTCCATTTTGTATTCACAGATTCCGTTTCAAAGTGTTGTAACGTACATACCGCAAATAGGCAGTGATGAGTCTTTATTTAACGCCAGCGAGCTTCAGTATACTTAGTCCGGTTTAGTTGTTAGTCCATGGTGAATGGTAGCGCAGATAAGTGCAATCAAATAAAGTTATATAGAGCGATGTAAAAGCAGTTCTATGCCCTCGAGATATGTTCCCTTGACAGATCTTGAAAAACAATCGAAAATTTTCCACCTTAAAAACTTGGTGTTAACACGCCAAGCTAATGTGAACACTATTAGGTCCAAGGAGCTCTTCACTCTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD076731             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGATAGTCGATTCTTTAAGAGTTCTTATTTTGAAAACCACAGTCTTCGTGTACTGGAAACTACGTCATTCAAAAATAATCAGATGTGCCGTAGTCTTAATCAGTGGTCATGTGGCCGAACACCTCAGCGGCCACTAGGATTTCGTTACTTGATACTCGAGTTGTTCAATATTTCATTAACATCAAAGAACCCTTTGTGGAACCTGACTTTGTCGTCTTCATAAACGAGATAGTTCGCTCAGCATTTGTGCAACGCCTTTCAATAACGCCGACTTGTGTTATCACTTCTATCTGCTTCACTTTGCCAAAAGAATAATACATCCTGGATTCCTGGTACAGGTTAGTTAGATTCAGTCCAGACCCCGTGACAATAACTCTATATTGTTGTATATTGCTTAAATAATCGGTTCAAATGTCAAAGCTAATGAACGAAACTTAGCGTGAAAACCAAATGCAGTGAGCTAAAATCCCCGCAAGTCTTTTTCAGTTGTTTTTCCAGGTGTGTTTTTTTACAAGTAATAAACTCACGAGAATCTGTACACTTAGCATTCAATATATA                     ]
[-] EMBL AI395630             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CACTTCTATCTGCTTCACTTTGCCAAAAGAATAATACATCTTGGATTCCTGGTACAGGTTAGTTAGATTCAGTCCAGACCCCGTGACAATAACTCTATATTGTTGTATATTGCTTAAATAATCGGTTCAAATGTCAAAGCTAATGAACGAAACTTAGCGTGAAAACCAAATGCAGTGAGCTAAAATCCCCGCAAGTCTTTTTCAGTTGTTTTTCCAGGTGTGTTTTTTTACAAGTAATAAACTCACGAGAATCTGTACACTTAGCATTCAATATATAATCTTCACCAAAAAAAAAAAA]


>consensus_6836#0 CANAATCGGCACGAGGACGGCACTCAAGACCACCGAAGTGCGCTCTTCCTATTGAGTATA CTGCAGTGAGTTTATTACATTCCTAAATCTAGTCAGTCTTCCTACTGGGATTGGCCTTGA AATGCTTCGCTTTTGATCGCCCGTTTGTGTATAGGGATTTACCAACTGAATTTTTACACA ACTCTGCCACTTGCGTTTTGCTACCTCCATTTTGTATTCACTGATTCCGTTTCAAAGTGT TGTAACGTACATACCGCAAATAGGCAGTGATGAGTCTTTATTTAACGCCAGTGAGCTTCA GTATACTTAGTCCGGTTTAGTTGTTAGTCCATGGTGAATGGTAGCGCAGATAAGTGCAAT CAAATAAAGTTATATAGAGCGATGTAAAAGCAGTTCTATGCCCTCGAGATATGTTCCCTT GACAGATCTTGAAAAACAATCGAAAATTTTCCACCTTAAAAACCTGGTGTTAACACGCCA AGCTAATGTGAACACTATTAGGTCCAAGGAGCTCTTCACTCTTGCCTGATAAACACTTCG AACAGTCCCAGCAGATAGTCGATTCTTTAAGAGTTCTTATTTTGAAAACCACAGTCTTCG TGTACTGGAAACTACGTCATTCAAAAATAATCAGATGTGCCGTAGTCTTATCAGTGGTCA TGTGGCCGAACACCTCAGCGGCCACTAGGATTTCGTTACTTGATACTCGAGTTGTTCAAT ATTTCATTAACATCAAAGAACCCTTTGTGGAACCTGACTTTGTCGTCTTCATAAACGAGA TAGTTCGCTCAGCATTTGTGCAACGCCTTTCAATAACGCCGACTTGTGTTATCACTTCTA TCTGCTTCACTTTGCCAAAAGAATAATACATCCTGGATTCCTGGTACAGGTTAGTTAGAT TCAGTCCAGACCCCGTGACAATAACTCTATATTGTTGTATATTGCTTAAATAATCGGTTC AAATGTCAAAGCTAATGAACGAAACTTAGCGTGAAAACCAAATGCAGTGAGCTAAAATCC CCGCAAGTCTTTTTCAGTTGTTTTTCCAGGTGTGTTTTTTTACAAGTAATAAACTCACGA GAATCTGTACACTTAGCATTCAATATATAATCTTCACCAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)